杨利霞 发表于 2020-11-22 11:15

2020-2021美赛/小美赛题型预测相关文献——基 于 全 基 因 组 序 列 的 新 型 冠 ...

2020-2021美赛/小美赛题型预测相关文献——基 于 全 基 因 组 序 列 的 新 型 冠 状 病 毒SARS ⁃Co V⁃2多算法进化树分析傅奇,庄峙厦,黄华斌,何少贵,肖玉娟


新型冠状病毒(SARS⁃Co V⁃2)作为一种 RNA 病毒,具有高突变率的特征,自新型冠状病毒肺炎(COVID⁃19
)发生以来,病毒基因组已出现了一定程度的突变,可以通过进化分析对其进行分类,以辅助分析病毒感染源。由于时间较短,总体突变率仍然较低,利用单一算法构建的进化树结构可靠性不高。本文用 Paup、Mr Bayes 和 MEGA 软件,通过不同算法构建进化树,对目前 Gen Bank 中所有的 SARS⁃Co V⁃2 基因组进行了分析。不同算法所得到的多
个进化树中,部分序列分支结构相同或相似,且相应的病毒宿主间可能存在交集,通过比较分析多个树之间的相似
结构,可为病毒的来源提供参考信息。随着病毒的进化和基因组数据库的不断积累,预计利用多算法构建进化树去
筛选相同分枝结构的方法的有效性将逐步提升,可作为感染源分析的参考方法之一。



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