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标题: 这个怎么求统计显著性了 [打印本页]

作者: chuchumaolu    时间: 2011-8-1 10:26
标题: 这个怎么求统计显著性了
数据结构如下' a5 c- G, h6 L
     A     B     C
+ |+ ~9 u3 L2 Y! {3 ^7 ^f1     f1a   f1b  f1c
1 H- f/ l: P; p  g- A; Z- m& kf2     f2a   f2b  f2c9 o% f5 f1 n% p: Y- b! m
f3
* T- j9 i5 A8 t- F; Y.5 K7 u; y1 p$ K8 e5 c& I
.2 ~$ _, ~- }' P, {
.
. \9 s& D) Q- \$ @7 X$ a请问怎么求每一行的显著性了
) z( P( Z% k; Z7 ~6 W5 i8 A
- s$ L8 J! Q5 l7 ?/ `" |
4 a" S2 r  x4 E7 D% }# Rps:
( c- I* a. j3 o: a/ P$ x) D4 C本人不懂数学,是学生物的,6 f$ Q; E: G. |* j
在文献上看到这样的问题,需要了解,求高人解救5 S. s, ]% |' K; a5 [
$ F  P) y/ N# O7 @; W
本人邮箱:jingyc01@163.com
" m% A- @' T: U% M, y3 A1 L% Z; M" N
7 E4 x' k. s( \) u* t0 j, F3ku
作者: 钟荟萃手    时间: 2011-8-1 10:32
这些不是数据吗. a  t! m7 B" I# A; s

作者: 钟荟萃手    时间: 2011-8-1 10:33
我学的求一组数据的显著性是用sass
作者: chuchumaolu    时间: 2011-8-1 13:56
中间的矩阵是数据
/ ^/ x% c! y4 [+ zA B C 表示3个物种8 ?3 p1 @0 l9 S
f1  f2 等表示不同的基因家族: s9 T5 |8 A' ]5 F9 T4 Q$ k

作者: 林豆豆    时间: 2011-8-1 14:51
用卡方检验拟合优度:
+ i$ B% Y& c9 P" w& T0 G+ j: m" N
4 [3 m! \: A  A3 j% P8 Pbin:有n组数值则:bin=0:(n-1);
" g/ |/ d" k- y  N* O9 c0 U: l" ]/ g# `' f$ s
obsCounts:观测值# H& i7 k% k! i+ P2 [

6 i" a9 P( D1 Q. \# @expCounts:期望值
7 ~7 a! B; m5 D' k; E6 X
  d4 j. w) {- A  j' g( ?  Wh,p,st:返回值,自己查帮助就可以明白- V* F: J. e' T# k

8 Z3 W' M( a! e6 Y" M" n$ c[h,p,st] = chi2gof(bins,'ctrs',bins,...
  m7 |9 x8 m" d/ D* B                        'frequency',obsCounts, ...8 x) D# v0 O: [7 G# t/ h( G
                        'expected',expCounts)' t& S; i0 V3 g  b) k! S! x( u, l. g

作者: chuchumaolu    时间: 2011-8-1 16:58
感觉上卡方不太适合
/ P! q6 G6 T+ q( l
' z# M' v% R3 v6 f. M我的实际问题是:) ^; O, d+ D  [6 J  n; }

3 y, w$ S- t6 Y( x6 O我的3个物种其基因分为了fn个基因组家族,我想找到其中哪些基因家族在3个物种有显著差异的。
作者: alair005    时间: 2012-2-7 13:00
囧了,下了无数不知道用哪个有用9183898554663038




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