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标题: 这个怎么求统计显著性了 [打印本页]
作者: chuchumaolu    时间: 2011-8-1 10:26
标题: 这个怎么求统计显著性了
数据结构如下  P$ X% r8 u8 k: B5 m
     A     B     C( A: u# H% i3 M# P1 N+ @0 H
f1     f1a   f1b  f1c
* a) x* i& W4 g- x! B) _f2     f2a   f2b  f2c
& [: [& [1 o. F& M9 if33 l  ~9 A4 ?# W" G0 y% H' d, c
.
2 `# z  d1 k9 B1 B' l.
5 p5 \( i) f9 p- S.  K: \8 A/ F) D7 A
请问怎么求每一行的显著性了
- d; [" L- ]: F; D2 k- T$ Y( P6 _0 o* w& f. {( [. R6 r* J. C

- o5 V# |- _$ M  hps：
, z' Q; b' C( k0 U1 D3 [本人不懂数学，是学生物的，
% b2 ^  Q; k% _4 l. I在文献上看到这样的问题，需要了解，求高人解救* u9 F4 w+ G  ^  q4 Z$ w

* Z. d( k' F$ z5 l3 n6 A9 o) p9 W/ ^) B本人邮箱：jingyc01@163.com1 m) z0 {1 i2 A" ^' k4 h" b" a
4 i3 f1 z7 }5 ~
3ku
作者: 钟荟萃手    时间: 2011-8-1 10:32
这些不是数据吗
( }1 c- ?. L1 D
作者: 钟荟萃手    时间: 2011-8-1 10:33
我学的求一组数据的显著性是用sass
作者: chuchumaolu    时间: 2011-8-1 13:56
中间的矩阵是数据' _3 d* ^5 v3 I- ^% M9 z. f. x; m
A B C 表示3个物种, l' C3 H8 u( e- J5 [& B! c* S+ H+ a
f1  f2 等表示不同的基因家族
7 j, L. p. {: h- K& D6 m
作者: 林豆豆    时间: 2011-8-1 14:51
用卡方检验拟合优度：0 f8 ?: F" j1 F

; M. j& J6 u. g) C1 Bbin：有n组数值则:bin=0:（n-1）；
/ W3 w: k' v& m
+ n& L& z2 ^# ^. s( T# ?5 M' KobsCounts：观测值
( c/ P0 A/ s; r: ?
+ Y2 R) b& F7 [expCounts：期望值
& Z& X1 V3 L- N! Z6 m. ?; m- a$ |- I  T: ^+ W
h,p,st：返回值，自己查帮助就可以明白
! x) I/ E0 o8 z/ |# ]+ ^% n& n' ]# m) V. T
[h,p,st] = chi2gof(bins,'ctrs',bins,...; A6 w, u  K9 D. [  W! E8 A
                        'frequency',obsCounts, ...
( }  V/ f% n! L* w: m                        'expected',expCounts)  q& i$ i% i# \& ^( _" E! D  t. h
作者: chuchumaolu    时间: 2011-8-1 16:58
感觉上卡方不太适合
/ n/ D" J& i/ s2 L0 s: z' r; E7 i: g' [2 \5 ?& Y
我的实际问题是：3 f! n6 L+ c+ _* R4 T

5 {, w3 h2 b& N: g; r我的3个物种其基因分为了fn个基因组家族，我想找到其中哪些基因家族在3个物种有显著差异的。
作者: alair005    时间: 2012-2-7 13:00
囧了，下了无数不知道用哪个有用9183898554663038



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