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标题: 这个怎么求统计显著性了 [打印本页]
作者: chuchumaolu    时间: 2011-8-1 10:26
标题: 这个怎么求统计显著性了
数据结构如下5 v4 @; E! H9 _0 Q4 y# l" P/ `/ p
     A     B     C
, g! C' V5 h% p/ Hf1     f1a   f1b  f1c* k3 O& {  P4 S# x3 i! [
f2     f2a   f2b  f2c5 u, m7 _) ^6 u9 v
f3% U+ ?9 J* X. l2 s" G$ p3 J
.6 E2 W( s5 Y% b: H  z/ W' `
.- k% d2 T+ u) y2 W, e9 F5 ?2 w
.
- [; P( B1 b8 X6 Q0 H2 Y) i请问怎么求每一行的显著性了: h; A* u  C, ^/ X7 S# ?* T8 l* j5 U
1 U5 I1 M7 c3 @( ~
' K. `1 ~5 D9 K( c, U' V
ps：
( K; j1 P! y; i% l% C6 S, K本人不懂数学，是学生物的，
3 _6 s$ j: w* @" H在文献上看到这样的问题，需要了解，求高人解救# F) ~( o. k6 F1 ]

  z' d7 F/ B3 Y$ _本人邮箱：jingyc01@163.com
; G* j6 b- i8 {8 @$ c; B4 p# ~. ]
5 k1 N- V, ?' L$ P3ku
作者: 钟荟萃手    时间: 2011-8-1 10:32
这些不是数据吗
  x* p, r* ]( G7 ]$ ^* i0 z( C
作者: 钟荟萃手    时间: 2011-8-1 10:33
我学的求一组数据的显著性是用sass
作者: chuchumaolu    时间: 2011-8-1 13:56
中间的矩阵是数据( Y/ }  c$ p! Q* o; h
A B C 表示3个物种; {+ P4 d8 W; e1 S0 A
f1  f2 等表示不同的基因家族. G: }7 }+ G5 }& ~6 K# m
作者: 林豆豆    时间: 2011-8-1 14:51
用卡方检验拟合优度：9 f8 q6 L9 K% S

$ y& i+ V) I' t9 G! y% C% a0 ^! xbin：有n组数值则:bin=0:（n-1）；6 |: \/ C& Q1 U* R! N5 g: d% A

. P& J' o' j; a; @3 a) {obsCounts：观测值
8 p* ]8 t) Z9 T( Y4 @
# f6 U# r( i) _( r: t7 o/ Q- @expCounts：期望值! _3 s! T6 B7 i$ l6 {4 ~" u& |
% `0 N! I0 b6 |( U- V
h,p,st：返回值，自己查帮助就可以明白
" V0 g8 I) e8 e& e$ g
  _  J& \$ U, M( y[h,p,st] = chi2gof(bins,'ctrs',bins,...( F" e" Q3 \9 k
                        'frequency',obsCounts, ...
$ w0 ~! n& @9 v, C! a7 ^                        'expected',expCounts)6 s* i- l$ P. x0 e3 }* O
作者: chuchumaolu    时间: 2011-8-1 16:58
感觉上卡方不太适合
' N- E- N; k2 A: ^+ F; P/ y) c$ y% q( L: T$ a/ E4 D% S  p  G
我的实际问题是：* D# n- r3 e& J8 W0 s0 ?

' I" z, r; L2 Y我的3个物种其基因分为了fn个基因组家族，我想找到其中哪些基因家族在3个物种有显著差异的。
作者: alair005    时间: 2012-2-7 13:00
囧了，下了无数不知道用哪个有用9183898554663038



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