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标题: 这个怎么求统计显著性了 [打印本页]

作者: chuchumaolu    时间: 2011-8-1 10:26
标题: 这个怎么求统计显著性了
数据结构如下
. f7 b3 a; I: Q4 I& L9 j1 ^6 l     A     B     C
$ Q' R7 K+ \! K2 i9 P3 wf1     f1a   f1b  f1c
# S  N, f4 G* xf2     f2a   f2b  f2c" u! n: ^5 A$ t: i
f3
1 @% S) Z6 \' {.
" r( r  @2 B5 P6 L% n+ E% z.
6 q, H4 C0 l6 t4 U( s) D; s# b* G.4 L" f0 o6 i5 k; ?9 Y# ~$ h% z
请问怎么求每一行的显著性了" {3 B' \# V+ E/ ^9 g3 M
1 M: {$ o* _" B' W0 f( [% A1 N' d# E3 J1 t

, e& R2 o7 z$ Y4 i: zps:
) W" @# h6 o9 r- L本人不懂数学,是学生物的,' V9 a1 W; Z% ^* q; q1 {9 T" p
在文献上看到这样的问题,需要了解,求高人解救& |' ?0 @; u5 M; {

, B/ r# Q6 v; g7 B本人邮箱:jingyc01@163.com
. m4 N3 K+ N* Q% ?" s6 w, Y- |) R; g& q0 W, C6 e, n
3ku
作者: 钟荟萃手    时间: 2011-8-1 10:32
这些不是数据吗$ O' D0 w5 o1 ?& n8 t

作者: 钟荟萃手    时间: 2011-8-1 10:33
我学的求一组数据的显著性是用sass
作者: chuchumaolu    时间: 2011-8-1 13:56
中间的矩阵是数据/ O  n% [7 _7 M% m% R
A B C 表示3个物种+ h2 f, t- r" T/ K
f1  f2 等表示不同的基因家族/ i; ], [$ K3 \1 G  o/ |. Z

作者: 林豆豆    时间: 2011-8-1 14:51
用卡方检验拟合优度:
, i5 X% H$ n1 D  q. g% \- y7 u1 x3 |9 w& y" b* S. o
bin:有n组数值则:bin=0:(n-1);
; m- h5 |: J; P/ B6 V) b
% R$ N1 v. K8 Y# A  B3 ?obsCounts:观测值
1 _% I2 \" |+ J" H" ]0 J, F& E/ q1 H! }* O' J
expCounts:期望值
; |( n- E9 y) ], j
1 o* O. `0 L. Kh,p,st:返回值,自己查帮助就可以明白- P: t7 h3 T( j8 H
5 y, s& `  y6 K0 {* t
[h,p,st] = chi2gof(bins,'ctrs',bins,...9 k' O9 R2 |/ E# g: e4 X8 D
                        'frequency',obsCounts, ...) I1 D  R/ {* B$ p& x6 F' a
                        'expected',expCounts)* q' x9 P8 Q* y6 |: C* F4 q

作者: chuchumaolu    时间: 2011-8-1 16:58
感觉上卡方不太适合  h. r1 y3 r  n/ \  L% p* f5 y2 w# h

+ O* j6 D3 O" I) O5 Q我的实际问题是:
' ?( v" ^% k1 p
$ R& u  m' N% o. I+ B! j4 M: G0 ^2 `0 {我的3个物种其基因分为了fn个基因组家族,我想找到其中哪些基因家族在3个物种有显著差异的。
作者: alair005    时间: 2012-2-7 13:00
囧了,下了无数不知道用哪个有用9183898554663038




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