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标题: 这个怎么求统计显著性了 [打印本页]

作者: chuchumaolu    时间: 2011-8-1 10:26
标题: 这个怎么求统计显著性了
数据结构如下) [) z4 a0 l5 m6 G; S) G
     A     B     C2 Z% Y" @2 L4 D" \" o
f1     f1a   f1b  f1c* }* T- Y6 Y+ e! g& m2 J
f2     f2a   f2b  f2c
5 k# o+ z  A$ C: U4 m" a: ff3
# m( q7 p2 J% [  H& t+ C- ^* c7 X$ z.
+ O5 _2 `& K2 |.8 C. i. u5 M' N9 m4 S" L
.
! a' ?0 ^- `9 q5 _* @请问怎么求每一行的显著性了, _' T2 y" o4 Z  O& t2 E6 V1 x3 t  y

5 N# {3 }( c- Z9 k( {, s# M& z9 L. E: F, r8 H9 m4 N
ps:) N0 Y5 Z" a' Y4 r
本人不懂数学,是学生物的,  G# X- v* t& F# V; @
在文献上看到这样的问题,需要了解,求高人解救& a" N0 I& r/ Y) F

5 ?3 {$ w7 P) i' @1 g# q0 Z1 k本人邮箱:jingyc01@163.com
7 Y2 u4 g! e  u) _1 J% J5 a- q2 l+ Z" E; i% ?& C0 s# k& t. ~/ i+ z
3ku
作者: 钟荟萃手    时间: 2011-8-1 10:32
这些不是数据吗6 C! Y/ c& `1 W$ F2 u

作者: 钟荟萃手    时间: 2011-8-1 10:33
我学的求一组数据的显著性是用sass
作者: chuchumaolu    时间: 2011-8-1 13:56
中间的矩阵是数据
7 p6 p( O% i& A# w) E& E9 l- B7 kA B C 表示3个物种
0 K$ L! \: m4 g8 H& e* e. ^f1  f2 等表示不同的基因家族
- s0 r' A# Y$ Q; {! F/ I2 x% Q. z
作者: 林豆豆    时间: 2011-8-1 14:51
用卡方检验拟合优度:
% s! ~& {4 L1 u' X' M9 _3 ?" \2 D( G
bin:有n组数值则:bin=0:(n-1);8 e9 U0 S3 B. ?0 n7 e; K

& Y1 F! ]+ r/ N) I- M9 Q5 }obsCounts:观测值
' [& V, W4 c1 z6 i: q7 L
0 o4 o9 x; ~8 K! s: w: @+ vexpCounts:期望值
2 m$ O  v7 ~& E# y- B5 D' [' \, U. [
h,p,st:返回值,自己查帮助就可以明白
& X1 U4 m( q! `& `" x  N$ f) v8 ~% r, s  [5 j. O
[h,p,st] = chi2gof(bins,'ctrs',bins,...
/ o$ I. s3 r7 l                        'frequency',obsCounts, ...
" q3 }, D4 i1 k7 V$ ~' m                        'expected',expCounts)
: E! A5 y/ {% _9 @
作者: chuchumaolu    时间: 2011-8-1 16:58
感觉上卡方不太适合
+ |3 M& ^: H; E8 r; O  w
" }  s4 h# [' E) Q* J0 @+ l1 h我的实际问题是:
7 o9 O: K. K0 v1 ]8 ^% n; ^
4 W; Y# n, z0 f8 N5 K/ T8 R我的3个物种其基因分为了fn个基因组家族,我想找到其中哪些基因家族在3个物种有显著差异的。
作者: alair005    时间: 2012-2-7 13:00
囧了,下了无数不知道用哪个有用9183898554663038




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