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标题: 帮忙做下统计显著性检验和K值的误差以及灵敏度分析 [打印本页]
作者: 箫剑→残念    时间: 2016-10-25 16:53
标题: 帮忙做下统计显著性检验和K值的误差以及灵敏度分析
function parafit
6 o& A# R" m6 p' }* m%  k1->k-1，k2->k1，k3->k2,k4->k3,k5->k4
3 s. d" c8 ~7 P! s% k6->k6 k7->k79 ?& R. ?; O: {# T
% dGlcdt = k-1*C(Fru)-(k1+k2)*C(Glc);
9 p5 m* S/ u/ u1 q$ F6 z1 l% dFrudt = k1*C(Glc)-(k-1+k3+k4)C(Fru);
. c8 q0 u+ Y; w" \- c# X% dFadt = k(2)*C(Glc)+k4*C(Fru)+（k6+k7)*C(Hmf);
/ {1 C# v5 R& s$ F. F; y% dLadt = k(7)*C(Hmf);8 ]" H  p" q. b6 h" N% @/ i# [
%dHmfdt = k(3)*C(Fru)-（k6+k7)*C(Hmf);
( x4 ~& a0 F2 z# |( R% Pclear all2 w0 E* i4 l: j, x
clc
0 y! p5 b8 K0 J3 p  sformat long9 \& P. N5 W1 ]' r0 Y1 {; ?
%        t/min   Glc    Fru        Fa   La   HMF/ mol/L ! K; F2 [) b" w4 b  B
  Kinetics=[0    0.25    0           0    0       0! K: Q& Z- K* n4 @
          15    0.2319    0.01257    0.0048    0    2.50E-04, ~' J% E* m9 \1 I& Q
          30    0.19345    0.027    0.00868    0    7.00E-043 X, ]* d( i& g! X. V, G, l
          45    0.15105    0.06975    0.02473    0    0.0033
2 }0 V4 d, z9 f0 O! _2 F- m          60    0.13763    0.07397    0.02615    0    0.00428
7 y+ H; f- u; O& Q+ ?+ }          90    0.08115    0.07877    0.07485    0    0.01405
% {1 G- V" o/ j2 C- b" M/ u          120    0.0656    0.07397    0.07885    0.00573    0.02143% S4 K* J) v: k# ]; h
          180    0.04488    0.0682    0.07135    0.0091    0.036234 j/ \/ R2 l/ M
          240    0.03653    0.06488    0.08945    0.01828    0.05452
0 K2 I+ y* n: h" ~          300    0.02738    0.05448    0.09098    0.0227    0.0597  ^: @/ m+ O; B$ |7 l
          360    0.01855    0.04125    0.09363    0.0239    0.06495];* w1 F0 U( [3 `9 ], R3 m1 ~
k0 = [0.0000000005  0.0000000005  0.0000000005  0.00000000005  0.00005  0.0134  0.00564  0.00001  0.00001  0.00001];        % 参数初值7 h) w% i# V7 G9 g
lb = [0  0  0  0  0  0  0  0  0  0];                  % 参数下限( P+ g4 p3 Y2 w' ~* b" y
ub = [1  1  1  1  1  1  1  1  1  1];    % 参数上限
* \5 Q5 a  s  d7 u- {1 ]$ ~% |+ Fx0 = [0.25  0  0  0  0];
. w* z+ L" u$ ayexp = Kinetics;                 % yexp: 实验数据[x1        x4        x5        x6]) A/ T. x" `$ C( l/ C, q% b
% warning off2 [+ Y, n2 f3 t! U& H" i
% 使用函数 ()进行参数估计0 P0 V) b- h- A5 x- Y- X
[k,fval,flag] = fmincon(@ObjFunc7Fmincon,k0,[],[],[],[],lb,ub,[],[],x0,yexp);; x! h# N9 J# j. Y
fprintf('\n使用函数fmincon()估计得到的参数值为:\n')
+ M, u) W  D8 m5 r6 n' |! o, Ffprintf('\tk1 = %.11f\n',k(1))% z) z; k- I& L8 Z0 L: t. F
fprintf('\tk2 = %.11f\n',k(2))
& v7 M! }$ m% cfprintf('\tk3 = %.11f\n',k(3))4 u! L3 k# W1 P$ L
fprintf('\tk4 = %.11f\n',k(4))) @/ M/ P3 f; w- v! z6 x; h( w' x
fprintf('\tk5 = %.11f\n',k(5))  M* U$ e/ k* Y
fprintf('\tk6 = %.11f\n',k(6))9 j* X% u. u, {3 l. J% h; i
fprintf('\tk7 = %.11f\n',k(7))
9 h: u: n# [  b/ ]1 }+ Wfprintf('\tk8 = %.11f\n',k(8))
3 ]& o' ?! r% V* J* [fprintf('\tk9 = %.11f\n',k(9))
) o3 N; b1 z9 W* c' K7 }5 O" o/ wfprintf('\tk10 = %.11f\n',k(10))7 Q7 R( s/ q$ J% d  [
fprintf('  The sum of the squares is: %.1e\n\n',fval)- f: d) H- a9 J3 `$ F
k_fm= k;
8 K3 A- x( p( ~* e0 c- R$ A& P% warning off5 m  v8 c. x0 H, V0 Z
% 使用函数lsqnonlin()进行参数估计
. z& d+ E6 o5 u[k,resnorm,residual,exitflag,output,lambda,jacobian] = ...7 b: q6 |. @/ |- h. o- s+ T4 B
    lsqnonlin(@ObjFunc7LNL,k0,lb,ub,[],x0,yexp);      0 S) p( I& d! X0 v* H2 G; a
ci = nlparci(k,residual,jacobian);: B& e( F/ s) Q! D6 \  U* U
fprintf('\n\n使用函数lsqnonlin()估计得到的参数值为:\n'). ~$ _. L, R$ {: }5 W
fprintf('\tk1 = %.11f\n',k(1))5 V% K. r2 Z3 o( z( F
fprintf('\tk2 = %.11f\n',k(2))
) ~% |8 x& N% d- Nfprintf('\tk3 = %.11f\n',k(3))
2 b( ?9 k7 l1 \fprintf('\tk4 = %.11f\n',k(4))' f. U* Q; z" m/ g& N( R/ V" z$ u$ K
fprintf('\tk5 = %.11f\n',k(5))
7 `* \" S$ \( R7 U7 S, pfprintf('\tk6 = %.11f\n',k(6))
# a4 z/ A0 |  V4 K( {fprintf('\tk7 = %.11f\n',k(7))2 O1 I" \6 ]% x* T  t% V1 L3 e
fprintf('\tk8 = %.11f\n',k(8))
. @* w  i- b7 C/ E) yfprintf('\tk9 = %.11f\n',k(9))
4 @; \. o; X, a- w1 J$ d4 ffprintf('\tk10 = %.11f\n',k(10)). F8 ~  H4 g1 b: [" ^4 |
fprintf('  The sum of the squares is: %.1e\n\n',resnorm)4 `0 W: c( n  o' F% S4 |0 p5 J' U7 z
k_ls = k;
. c, U; O5 P8 q; |output
# N$ C" ~* K2 E6 k0 G4 d8 x! E0 Bwarning off
  x5 l# E3 H, b4 q4 m. r1 n+ q; Z% k% 以函数fmincon()估计得到的结果为初值，使用函数lsqnonlin()进行参数估计  [; |1 A: i- X# c* L: i
k0 = k_fm;6 a3 A' t5 E( R7 ^
[k,resnorm,residual,exitflag,output,lambda,jacobian] = ..., N( w5 \) C1 ]4 V+ W
    lsqnonlin(@ObjFunc7LNL,k0,lb,ub,[],x0,yexp);      5 X1 E* R1 o5 x  }9 f8 a$ [( D
ci = nlparci(k,residual,jacobian);1 p" |) v  E0 q# {# P& p2 g
fprintf('\n\n以fmincon()的结果为初值，使用函数lsqnonlin()估计得到的参数值为:\n')* t! ^5 Q, X# t$ Y/ ?5 y
fprintf('\tk1 = %.11f\n',k(1))
9 p. X" h& ~, C7 [! L: r( Z8 ufprintf('\tk2 = %.11f\n',k(2))! [3 B6 i0 A3 C% F( t* a0 j  T% X
fprintf('\tk3 = %.11f\n',k(3))3 o0 }1 B  b. T  b  c
fprintf('\tk4 = %.11f\n',k(4))
. v7 Q0 K) \( r% o2 h, i# k  Z# w) xfprintf('\tk5 = %.11f\n',k(5))
% w' d, k8 n8 Rfprintf('\tk6 = %.11f\n',k(6))% ~( [+ j! W; C* X
fprintf('\tk7 = %.11f\n',k(7))/ X& D' Q3 c$ p. U3 K* H% K
fprintf('\tk8 = %.11f\n',k(8))9 Z9 V8 d$ G0 k# d- W% v/ e2 B6 u
fprintf('\tk9 = %.11f\n',k(9))9 y; A8 o4 N; @5 R- I, k' N
fprintf('\tk10 = %.11f\n',k(10))
- d/ H. `% X; K9 e" i! kfprintf('  The sum of the squares is: %.1e\n\n',resnorm)
" o9 `5 e$ w% Q& _" lk_fmls = k;
! S9 m4 z6 t: W0 x! q, ]output
/ c- ^1 W( e% z, rtspan = [0 15 30 45 60 90 120 180 240 300 360];& b- x% t7 R  G3 Q
[t x] = ode45(@KineticEqs,tspan,x0,[],k_fmls); ( F) E) c$ _" D' y, m2 R
figure;6 W( d2 M: h9 X) t! ?+ D
plot(t,x(:,1),t,yexp(:,2),'*');legend('Glc-pr','Glc-real')' T6 V1 ^7 e5 J8 m
figure;plot(t,x(:,2:5));" [) h' o" q! r
p=x(:,1:5)
/ m) [. `$ V% G# ghold on) x, p8 `* w! {% y% W
plot(t,yexp(:,3:6),'o');legend('Fru-pr','Fa-pr','La-pr','HMF-pr','Fru-real','Fa-real','La-real','HMF-real'). Q9 C$ f+ N* s5 y) g

0 K& \. R/ T, t. \: ?0 G
2 {$ `" P! _0 t! v
, e* M- m: s" H# c8 cfunction f = ObjFunc7LNL(k,x0,yexp)2 C5 `) |! ]9 @- @( v
tspan = [0 15 30 45 60 90 120 180 240 300 360];3 A5 T! l! J6 f6 \8 g
[t, x] = ode45(@KineticEqs,tspan,x0,[],k);   # A- f  z4 z: d
y(:,2) = x(:,1);: M( |7 g( J2 Z% b$ Q  g, x
y(:,3:6) = x(:,2:5);
4 ~' [+ h. U4 L2 v$ If1 = y(:,2) - yexp(:,2);
3 L& q. ]# y" r' b  c! x) k# yf2 = y(:,3) - yexp(:,3);
* p4 k6 k3 k& H  {f3 = y(:,4) - yexp(:,4);* [. _8 Z- b" S: P6 p
f4 = y(:,5) - yexp(:,5);) G; a0 o4 Q. T, ^" j
f5 = y(:,6) - yexp(:,6);
( b8 J' C4 P- D  ~* {f = [f1; f2; f3; f4; f5];6 j/ J  n1 j- F6 P( o# o8 M% }
: K+ u! D7 v; f( P% r( j
2 O4 U$ g* u. R; s

+ g. m& B2 F0 Z. I% @function f = ObjFunc7Fmincon(k,x0,yexp)
8 o5 r8 z; ]' x# b9 Ftspan = [0 15 30 45 60 90 120 180 240 300 360];
9 Z+ d* \* `$ f  S9 \8 I[t x] = ode45(@KineticEqs,tspan,x0,[],k);   ! q  X2 M7 V# d9 O+ t9 q6 T9 y. t
y(:,2) = x(:,1);
% R& i+ N8 ?; O# J0 r! py(:,3:6) = x(:,2:5);
  j) N" N4 h6 T5 _; |! I9 ef =  sum((y(:,2)-yexp(:,2)).^2) + sum((y(:,3)-yexp(:,3)).^2)   ...* _* N5 m8 a* W: t: i
    + sum((y(:,4)-yexp(:,4)).^2) + sum((y(:,5)-yexp(:,5)).^2)   ...8 z, L( h2 f/ q, T- ^
    + sum((y(:,6)-yexp(:,6)).^2) ;
4 @1 ^* |/ t+ G4 R& z  @) Q6 Q3 A. V4 w4 M- T  k
% B/ p2 P4 V( {7 E" \9 W, l

, D7 W' N9 N1 S0 R& s7 U6 q( E2 i5 E2 t2 n, @; I2 L
function dxdt = KineticEqs(t,x,k)
: x% c/ E( w0 W: ^# @dGldt = k(1)*x(2)-(k(2)+k(3)+k(8))*x(1);
" M' m7 D. i7 O/ EdFrdt = k(2)*x(1)-(k(1)+k(4)+k(5)+k(9))*x(2);
8 d4 i4 |/ w8 m% w* z, J2 ~dFadt = k(3)*x(1)+k(5)*x(2)+(k(6)+k(7))*x(5);! {7 C) M3 g0 S3 ~# s
dLadt = k(7)*x(5);/ [' B; [% K5 E
dHmdt = k(4)*x(2)-(k(6)+k(7)+k(10))*x(5);
- f3 r0 r/ N2 p+ p3 b5 Sdxdt = [dGldt; dFrdt; dFadt; dLadt; dHmdt];5 d1 l% b  a+ g0 U: [; S
, J3 B) S6 g- D: N

4 s7 `  B% s% p( x& Z
作者: 董事长之友    时间: 2017-2-16 13:48
蒙的一比 大哥
7 C+ t/ |& \# M$ `# D9 W; d



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