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标题: 帮忙做下统计显著性检验和K值的误差以及灵敏度分析 [打印本页]
作者: 箫剑→残念    时间: 2016-10-25 16:53
标题: 帮忙做下统计显著性检验和K值的误差以及灵敏度分析
function parafit
# t1 _$ ~- L5 U4 c: }" W%  k1->k-1，k2->k1，k3->k2,k4->k3,k5->k4
  B& L6 y  L/ b6 i- ^+ R+ D# C3 v% k6->k6 k7->k7
% A6 B2 ]1 u) {% dGlcdt = k-1*C(Fru)-(k1+k2)*C(Glc);
- z3 L; a! J+ L$ x' I- ]6 }$ W( \( P% dFrudt = k1*C(Glc)-(k-1+k3+k4)C(Fru);
0 b8 H  ]; b6 ]) ~: H$ l% ^9 e% dFadt = k(2)*C(Glc)+k4*C(Fru)+（k6+k7)*C(Hmf);
* p6 D/ f+ M, m: J4 @/ q' F3 z% dLadt = k(7)*C(Hmf);% H6 y& B" N" ]
%dHmfdt = k(3)*C(Fru)-（k6+k7)*C(Hmf);
9 U2 J/ _  p) _" j1 S4 ?! @! qclear all
; J3 E/ u/ G3 n$ o4 k) @6 J4 W/ G- iclc. L* n1 w# r3 m0 i
format long
) ~  C+ r" L! _- |%        t/min   Glc    Fru        Fa   La   HMF/ mol/L   f4 y( e$ L! L3 Z# Q
  Kinetics=[0    0.25    0           0    0       01 `1 [1 |4 V# M5 b
          15    0.2319    0.01257    0.0048    0    2.50E-04
  U; g) E1 H5 Y# n4 n  s$ h3 b          30    0.19345    0.027    0.00868    0    7.00E-049 y8 R/ d4 U/ z' ?2 q
          45    0.15105    0.06975    0.02473    0    0.0033* K! Z# H0 S# ^4 R1 V' L
          60    0.13763    0.07397    0.02615    0    0.00428$ L8 X% d% V' z8 E; F9 W
          90    0.08115    0.07877    0.07485    0    0.014052 w1 q0 S- p* ^$ N
          120    0.0656    0.07397    0.07885    0.00573    0.02143; h% d& i5 F' U$ I* N1 ?
          180    0.04488    0.0682    0.07135    0.0091    0.03623
; O; S8 y1 R/ w" z! Z( ?: k6 }" L          240    0.03653    0.06488    0.08945    0.01828    0.05452
. j4 m: |6 F- e6 g5 h! f4 L          300    0.02738    0.05448    0.09098    0.0227    0.05977 |6 M5 Z2 Y! E8 {2 F9 q3 b9 q! J' v
          360    0.01855    0.04125    0.09363    0.0239    0.06495];8 H0 Q) f7 b/ ?
k0 = [0.0000000005  0.0000000005  0.0000000005  0.00000000005  0.00005  0.0134  0.00564  0.00001  0.00001  0.00001];        % 参数初值
' s3 M0 a* k* z% x2 u# P4 E# t. zlb = [0  0  0  0  0  0  0  0  0  0];                  % 参数下限3 m! L8 N  O' j3 j& Q
ub = [1  1  1  1  1  1  1  1  1  1];    % 参数上限
% o, X9 n3 W+ M& c1 v1 qx0 = [0.25  0  0  0  0];4 C/ N) N9 N: ~- d5 i. [3 y6 Z
yexp = Kinetics;                 % yexp: 实验数据[x1        x4        x5        x6]/ w/ o6 w" k6 F8 h8 u
% warning off) F$ I3 c7 W) {5 Z# N7 T$ I
% 使用函数 ()进行参数估计  n  L: Z3 y$ e
[k,fval,flag] = fmincon(@ObjFunc7Fmincon,k0,[],[],[],[],lb,ub,[],[],x0,yexp);
; O! n# X. a  T* e3 `fprintf('\n使用函数fmincon()估计得到的参数值为:\n')5 l! I1 _9 S% Q6 |5 {2 ?
fprintf('\tk1 = %.11f\n',k(1)), Q; g. N2 G. k+ \2 O2 F! h
fprintf('\tk2 = %.11f\n',k(2))
% q$ d/ [$ h7 {* p- O! k+ ~fprintf('\tk3 = %.11f\n',k(3))
. ?  {8 W0 P! e  u2 ffprintf('\tk4 = %.11f\n',k(4)); j, G7 q. k' O; u+ `  j* w# g
fprintf('\tk5 = %.11f\n',k(5))2 x- f% a* O/ G6 k. s$ g
fprintf('\tk6 = %.11f\n',k(6))
# C, U$ b! H! b6 o1 s# A4 \, _fprintf('\tk7 = %.11f\n',k(7))4 ?' o$ x$ g: E6 C1 e! K& S
fprintf('\tk8 = %.11f\n',k(8))
* b4 p& ?. n; f' u1 j  Q  ~fprintf('\tk9 = %.11f\n',k(9))
# j. m# z8 c8 f6 i( x. lfprintf('\tk10 = %.11f\n',k(10))
; r, Z$ r( u2 s8 K2 Pfprintf('  The sum of the squares is: %.1e\n\n',fval)9 k- N7 _# M% X: t0 Q
k_fm= k;. ^& G. O0 u. B: K
% warning off# w! W: X; g5 {8 n2 I. C- O
% 使用函数lsqnonlin()进行参数估计4 ]3 |% U0 r3 x7 n& ~, A& S  B
[k,resnorm,residual,exitflag,output,lambda,jacobian] = ...
# d4 I) a, R9 G# b& ?    lsqnonlin(@ObjFunc7LNL,k0,lb,ub,[],x0,yexp);      
" T6 F0 I7 G" G  h  U2 y2 I. Tci = nlparci(k,residual,jacobian);
$ `; O7 U) m- E( M5 {& `" v" S/ D; W- Ffprintf('\n\n使用函数lsqnonlin()估计得到的参数值为:\n')0 a1 n1 `' M7 z  L
fprintf('\tk1 = %.11f\n',k(1))) H1 P* E8 W1 G1 o( c
fprintf('\tk2 = %.11f\n',k(2))
3 O- u" T1 k! u1 \fprintf('\tk3 = %.11f\n',k(3))
( h, ?" v& o3 K) ?. B" i8 e" ]% Wfprintf('\tk4 = %.11f\n',k(4))
; E+ I7 k- ?; I  G/ t% V) r/ j' bfprintf('\tk5 = %.11f\n',k(5)): N# ?8 e* W: ?: G: M( a
fprintf('\tk6 = %.11f\n',k(6))
: K$ v% g/ D1 Nfprintf('\tk7 = %.11f\n',k(7))& O* P) N6 }3 n3 H7 r; C' O
fprintf('\tk8 = %.11f\n',k(8))' j# g+ C2 X& Y. M. F& ^+ e
fprintf('\tk9 = %.11f\n',k(9))/ X- i+ B1 O7 u2 _( P( o7 g) F3 m
fprintf('\tk10 = %.11f\n',k(10))( K0 r' i3 w3 ?4 i6 s8 u( Y/ d
fprintf('  The sum of the squares is: %.1e\n\n',resnorm)
5 ^- m1 P8 n* t9 U% }, ~k_ls = k;
/ h  s: Q' Y: }' eoutput, a  }; ^4 {: n) u" ^% P
warning off7 x# [  j$ \4 u# J1 _, }! B/ y
% 以函数fmincon()估计得到的结果为初值，使用函数lsqnonlin()进行参数估计/ m1 F- ?' p/ c, \2 }
k0 = k_fm;
7 g5 R" a1 [- Q; x7 |. i[k,resnorm,residual,exitflag,output,lambda,jacobian] = ..., T- s( k  k1 ^% U/ r
    lsqnonlin(@ObjFunc7LNL,k0,lb,ub,[],x0,yexp);      & Q5 q2 {% v4 z0 l2 P8 e7 U7 L
ci = nlparci(k,residual,jacobian);
6 q% \  k# j) V6 z- W3 j% F  N0 Efprintf('\n\n以fmincon()的结果为初值，使用函数lsqnonlin()估计得到的参数值为:\n')1 \0 I; L0 Q$ T* E
fprintf('\tk1 = %.11f\n',k(1))
; v2 S. E$ y/ o: @- Ffprintf('\tk2 = %.11f\n',k(2))
1 T: p5 C$ O7 i: Ofprintf('\tk3 = %.11f\n',k(3))
- u% g  }  K% q& H5 I7 L, E% dfprintf('\tk4 = %.11f\n',k(4))( Q# _& W) y. x# o: E4 s" I: b/ y
fprintf('\tk5 = %.11f\n',k(5))8 u1 P& _, y) F6 P4 M
fprintf('\tk6 = %.11f\n',k(6))
6 n/ \# n3 Q$ X& g$ F9 Y& Ofprintf('\tk7 = %.11f\n',k(7))( j2 y* R: _. M9 p
fprintf('\tk8 = %.11f\n',k(8))& k1 h, v( H4 F' T
fprintf('\tk9 = %.11f\n',k(9))
# |. |( s3 v7 M4 o. _9 M( o9 {5 v2 E& zfprintf('\tk10 = %.11f\n',k(10))
9 ~, E2 v  ~* a5 E3 y) B' `fprintf('  The sum of the squares is: %.1e\n\n',resnorm)2 R$ y1 L! H; y5 U
k_fmls = k;
  M% V, f  E$ xoutput! r  E3 g) Z# E) O
tspan = [0 15 30 45 60 90 120 180 240 300 360];+ B$ [0 G( C; I! Y6 ]6 o) z  x* k
[t x] = ode45(@KineticEqs,tspan,x0,[],k_fmls); 0 Q) I3 h: {0 E0 U
figure;
  U+ Y8 K( m# |- A  z9 v  }plot(t,x(:,1),t,yexp(:,2),'*');legend('Glc-pr','Glc-real')$ }- k, v6 j6 M
figure;plot(t,x(:,2:5));1 ]5 \' o: z1 k. g  A
p=x(:,1:5)
8 A8 n* v5 q- I! R  _, nhold on
* r& A6 O" s( Xplot(t,yexp(:,3:6),'o');legend('Fru-pr','Fa-pr','La-pr','HMF-pr','Fru-real','Fa-real','La-real','HMF-real')/ s% L- ^( ~  H

) k' c/ W8 w4 k; a3 d9 Q' M$ i1 L. Z6 L2 S: j
% N$ q! S0 }7 O9 i' }- p; p0 g
function f = ObjFunc7LNL(k,x0,yexp)' M4 C( @: n3 w* U
tspan = [0 15 30 45 60 90 120 180 240 300 360];
  d. F8 w$ q% `( _[t, x] = ode45(@KineticEqs,tspan,x0,[],k);   
  h& |2 |/ w  c4 s7 R# v; B, M8 By(:,2) = x(:,1);
! l5 f# \  S% h) Cy(:,3:6) = x(:,2:5);, Y1 h5 x% T, c* k) d1 M" G; V
f1 = y(:,2) - yexp(:,2);$ f% x$ Z* e" ]! ~, |
f2 = y(:,3) - yexp(:,3);8 a+ N: {' ^8 C- {* i% Q# l
f3 = y(:,4) - yexp(:,4);2 B$ g' R$ Q, f9 k$ s4 ]. w4 \
f4 = y(:,5) - yexp(:,5);; M# c$ h' H% D9 s% K% q1 c1 z: t1 Q
f5 = y(:,6) - yexp(:,6);; f) |. }, l2 d6 g" w, ~
f = [f1; f2; f3; f4; f5];. L* n, `6 L9 V2 ^; U9 c
1 k' J# s: N1 l, T) d' q

$ J1 S: M: ^% q' {  ]2 H
6 C, U5 N6 X" efunction f = ObjFunc7Fmincon(k,x0,yexp)
& |3 [. B8 J( `2 Q" A! z) dtspan = [0 15 30 45 60 90 120 180 240 300 360];
7 o* Y) w- k' m9 N1 R* S[t x] = ode45(@KineticEqs,tspan,x0,[],k);   : x/ ^1 a( v1 E# N. i" p
y(:,2) = x(:,1);
, G3 a2 ^6 `$ G7 I) ky(:,3:6) = x(:,2:5);
* l9 L, k) r& l7 g6 F. H# D& `f =  sum((y(:,2)-yexp(:,2)).^2) + sum((y(:,3)-yexp(:,3)).^2)   ...
' g6 D- G9 r' G+ \    + sum((y(:,4)-yexp(:,4)).^2) + sum((y(:,5)-yexp(:,5)).^2)   ...; q- W8 C1 B+ a* T3 M2 K
    + sum((y(:,6)-yexp(:,6)).^2) ;
7 ]0 g, ]% Z* `' J4 e( T* a- _. j( S$ i( I

9 F# A1 y# e! Z1 [$ O8 y. ^1 F- W* \. y/ q

' ~# O. Q! U- J, ~function dxdt = KineticEqs(t,x,k)
( [! ~* l; W( A) k! u+ i) I; VdGldt = k(1)*x(2)-(k(2)+k(3)+k(8))*x(1);" L( d- @% G+ N: ?0 l
dFrdt = k(2)*x(1)-(k(1)+k(4)+k(5)+k(9))*x(2);3 m9 z1 i3 s( m
dFadt = k(3)*x(1)+k(5)*x(2)+(k(6)+k(7))*x(5);! D& K+ ^0 p+ A3 i
dLadt = k(7)*x(5);
2 V& D9 K, t& `3 D3 l7 Q% wdHmdt = k(4)*x(2)-(k(6)+k(7)+k(10))*x(5);
7 [& ?2 O3 o2 Adxdt = [dGldt; dFrdt; dFadt; dLadt; dHmdt];
/ f2 t/ v% ^# S2 q( g( k' j0 q% p, s5 J# S7 A2 |
+ ]5 W" ]1 z4 W: k
作者: 董事长之友    时间: 2017-2-16 13:48
蒙的一比 大哥! W4 ]. u! ]4 ]  ^) @- w# u  L




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