数学建模社区-数学中国
标题:
数学建模中的传染病模型及其编程求解
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作者:
浅夏110
时间:
2020-5-17 09:59
标题:
数学建模中的传染病模型及其编程求解
问题的提出
# L% F$ `# F" ?1 [
医生们发现,在一个民族或地区,当某种传染病流传时,波及到的总人数大体上保持为一个常数。即既非所有人都会得病也非毫无规律,两次流行(同种疾病)的波及人数不会相差太大。如何解释这一现象呢?试用建模方法来加以证明。
4 f' c% k( d# v: b
" d, {9 ]6 D5 o8 C, q- j9 f
指数模型
# k* {; V. F6 }
定义已感染人数为i(t) i(t)i(t),假设每个病人单位时间有效接触(足以使人致病)的人数为λ \lambdaλ,那么,在时间段Δt \Delta tΔt内,病人的增量可以用如下的公式进行计算
3 k4 l2 ^5 @% u, Q
i(t+Δt)−i(t)=λi(t)Δt i(t+\Delta t) - i(t) = \lambda i(t)\Delta t
9 M" C0 q$ |4 n( K D; _8 t
i(t+Δt)−i(t)=λi(t)Δt
4 T! l1 }3 [1 y6 {9 x8 ?; p
, I9 G8 w% M2 z* R' b
将i(t) i(t)i(t)移到等式的右边,我们得到如下的递推公式
- f' L, v" S! i: K
i(t+Δt)=i(t)+λi(t)Δt i(t+\Delta t) = i(t) + \lambda i(t)\Delta t
: h0 z1 B; \" E0 y
i(t+Δt)=i(t)+λi(t)Δt
+ i9 _, U8 n+ f, S, s, P5 E5 w& q
! \" U; v* g/ m7 R% c: E
以上递推公式意味着,我们可以通过当前时刻的病人人数和致病参数λ \lambdaλ,计算得到Δt \Delta tΔt时间后的病人人数,将以上思想在Python中进行实现,代码如下。
- }6 {# h2 c2 L% f
+ r# T6 {9 g. p8 T1 [
import matplotlib.pyplot as plt
1 V9 G5 a1 c4 J
%matplotlib inline
7 k7 H5 Y0 a5 e
deltaT = 0.01
9 b# ^2 g; `# G4 \0 E
lamb = 2
& u% B5 o' S4 V
i_list = []
( U2 m) U$ U# N: E0 }: ]
i0 = 0.08; # 初始有8%的人患病
' X$ X% q. v9 ]
i_list.append(i0)
) F3 Z" R# c1 I% H+ g) s
Tot_Time = 10
; t7 s) G0 Y3 g7 l8 i7 f
TotStep = int(Tot_Time/deltaT)
. r. d B' w+ Y' h8 J
##
0 m: V- h [& c6 y. ^9 X& G) d( E
for i in range(TotStep):
( Z: E& ^6 m; m2 s% j2 X" ?
i_new = i_list[-1] + lamb * i_list[-1] * deltaT
! x8 W3 }* D+ y0 O: C
i_list.append(i_new)
8 C8 Q3 N" L/ ?$ i6 G8 [
plt.plot(i_list)
! ^/ b" f% s6 B! f, a
; m9 r& h5 s M0 N) l% c
将以上代码在Jupyter Notebook中运行,得到病人人数的变化趋势见下图,从中我们可以看到病人的增长是指数级的,在短短十天后,已经有3000万人患病!这显然不符合实际情况的,那么问题出在哪里了呢?
3 J% g) A! X* }& K. [& O! h
- v7 A+ n. ?1 s5 L3 b: r
% ]- P! R% A- j7 R
实际上,若病人解除的是病人,并不能够使病人再次患病,实际上以上的算法导致了重复计数现象的发生。解决办法:必须区分已感染者和未感染者。
& J+ k- s- H, G3 o9 j) {0 P, N9 x1 Q0 d
8 y+ P p% I* i" Y
SI模型
6 P) Y! O* D- J+ h
现在我们将人群分成两个群体:已感染者(病人,Infected)和未感染者(健康者,Suspect),该模型称为SI模型,模型假设:
$ K0 f7 m+ t7 r: A; M3 s$ i
( O, m, X, `6 _1 I
在研究时间内,不考虑死亡率和出生率,即总人数N NN不变,病人和健康人的比例分别为i(t) i(t)i(t)和s(t) s(t)s(t)
( Z, S: ~4 O% V( N; z
每个病人在单位时间内有效接触并致病的人数为λ \lambdaλ,且只有接触健康人才会致病,称λ \lambdaλ为日接触率
: M% z9 G" o8 F1 Z
仿照指数模型里面的建模方法,在时间段Δt \Delta tΔt内,病人的增量可以用如下的公式进行计算
/ K* n+ R/ |3 o: c& }4 b7 F
- j+ @6 P7 O' V- o I
N[i(t+Δt)−i(t)]=[λs(t)]Ni(t)Δt N[i(t+\Delta t)-i(t)]=[\lambda s(t)] N i(t) \Delta t
" [: U5 ?' o' ^5 S7 a2 T0 }
N[i(t+Δt)−i(t)]=[λs(t)]Ni(t)Δt
* |* ?$ B! [+ [+ T9 U8 x b
/ ~( ~& X7 ]/ _4 t' P( D
消去N NN,再将i(t) i(t)i(t)移到等式的右边,我们得到如下的递推公式
; z8 W1 ]8 h# @5 z2 M/ i
i(t+Δt)=i(t)+λi(t)s(t)Δt i(t+\Delta t) = i(t) + \lambda i(t)s(t)\Delta t
" {( T+ |' \. t' r7 e" f
i(t+Δt)=i(t)+λi(t)s(t)Δt
/ ?) w5 z9 N" g* H( C {3 D
' a) N8 Z6 H1 J) A6 n6 K: v
同样地,我们可以通过当前时刻的病人人数和致病参数λ \lambdaλ,计算得到Δt \Delta tΔt时间后的病人人数,将以上思想在Python中进行实现,代码如下:
' b" u5 \1 p/ W! q7 y# E9 C
' K1 y; k2 F t- C6 i" Y4 m
import matplotlib.pyplot as plt
- e! Q9 {' J5 V! b# M% v
%matplotlib inline
/ P) U e _- D! X* Z" e
deltaT = 0.01
# X2 q. m: e3 X7 _
lamb = 2
; X a! W% u; C" o- R: n4 R
i_list = []
p1 e+ J6 [! P+ H% |" A
s_list = []
5 @- O( A; f Z% J$ N5 ]5 m1 ?
i0 = 0.08; # 初始有8%的人患病
7 D' J& i- s; o% h' Y* S9 J* m) c
i_list.append(i0)
+ z- s( ]# Z4 y, ~: ^
s_list.append(1 - i0)
H: n `8 S/ O5 g+ A
Tot_Time =5
" e# F7 }% L0 f5 `! ^
TotStep = int(Tot_Time/deltaT)
5 V0 R9 W% g( x
##
2 [/ J' g0 d$ b3 c$ {2 A& d
for i in range(TotStep):
_2 |9 v' D/ y' h8 R( P
i_new = i_list[-1] + lamb * i_list[-1] * deltaT * s_list[-1]
4 j7 h8 I' d R7 s
i_list.append(i_new)
9 f9 e3 Y0 a) |6 i
s_list.append(1- i_new)
' k* _+ T6 x# p8 y; T" [
Time = [i * deltaT for i in range(TotStep + 1)]
5 { _2 B! q5 q# }
plt.plot(Time,i_list)
- o' m ^. U& Q8 z: R5 t) A
plt.plot(Time,s_list)
/ t& M- I( N5 a$ x# i! [
plt.title("SI",fontsize = 20)
& v+ [4 S2 O p9 B1 s- H1 g3 T) W: V
plt.xlabel("Time")
# ~$ V2 d3 U' K( {/ v$ q
plt.ylabel('i(t)')
$ _6 l# \2 K: _5 `& @ S" v6 u
2 Y" K" W9 N, K! g( e
从SI模型我们可以看到,病人比例不再会出现"指数爆炸"的情况,在t→∞ t \rightarrow \inftyt→∞时最大患病比例为1。在SI模型中,病人数量的增长曲线是一个典型的S型曲线,又称为Logistic曲线,该曲线在生物学上经常被用来描述物种的增长模。
: K$ X4 P& d" ]: m# C
4 g7 }' f# s' D0 l
然后,SI模型的结论告诉我们,无论λ \lambdaλ多么小,最终人群都会患病,这显然也是不符合实际情况的。
w0 A. y' C, Q" _# b9 y
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. J! V( r( S P1 F8 H& L) c
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/ ^' t; ]- N- l. U
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* L; j' g2 [% G# G# t
+ P% x' O$ R: Q4 v2 T. n+ l1 K
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