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标题: 基于DAE的单细胞RNA测序数据聚类研究 [打印本页]
作者: 雩风三日    时间: 2021-1-18 17:10
标题: 基于DAE的单细胞RNA测序数据聚类研究
基于DAE的单细胞RNA测序数据聚类研究* {# A/ P& A0 y- l, G; ?' S6 z

" p. c( ^$ \. s3 a       传统数据降维方法处理单细胞RNA测序数据存在特征提取能力较差、聚类精度较低等问题，有必要引入深度学习方法以提高对复杂数据特征的提取能力。在对数据不进行任何人工筛选的条件下，利用DAE提取表达能力更强的数据特征，分别以K⁃means和DBSCAN聚类作为DAE的顶层设置形成DAE+K⁃means和DAE+DBSCAN组合模型，将这两种深度学习组合模型在Deng 数据集上与传统聚类模型SC3 进行对比。与SC3 的0.73 聚类精度相比，DAE+K⁃means 和DAE+DBSCAN的聚类精度分别达到0.93和0.97，分别提高了0.2和0.24。实验结果表明，DAE在单细胞聚类领域具有广阔的应用前景。4 T( t' r6 e6 a8 B- S  O

0 Z9 ?3 x+ d" i. a" d* r1 r& N4 S关键词：单细胞聚类；深度自动编码器；深度学习；K⁃means聚类；DBSCAN聚类；结果分析
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基于DAE的单细胞RNA测序数据聚类研究_何慧茹.pdf

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