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标题: Logistic回归实例2 [打印本页]

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作者: 2744557306    时间: 2023-11-30 17:34
标题: Logistic回归实例2
# logistic回归
2 r& T# x2 S0 W7 p! N7 @实际上线性最小二乘回归和Logistic回归都是广义线性模型的一个特例。当随机变量Y服从高斯分布，那么得到的是线性最小二乘回归，当随机变量服从伯努利分布，则得到的是Logistic回归。
3 q9 N8 k+ i$ T
& U( ^+ ?0 h# @* U" t5 vR软件提供了拟合计算广义线性模型的函数glm()，其命令格式如下：fitted.model <- glm(formula, family=family.generator, data=data.frame) 其中，formula是拟合公式；family是分布族，即前面讲到的广义线性模型的种类，如正态分布、Poisson分布、二项分布等。

" T7 b1 M. o, i. U/ H1 s
* n( W, m3 ]3 M1 l有了上面这些分布族和连接函数，我们就可以完成相应的广义线性模型的拟合问题。
# w# F& B9 n- E+ R
3 f; k! N/ l4 b5 r" k! c' t' w5 M1）正态分布 正态分布族的使用方法： fm <- glm(formula, family=gaussian(link=identity), data=data.frame) 其中，link=identity可以不写，因为正态分布的连接函数缺省值是恒等（identity）。事实上，整个参数family=gaussian也可以不写，因为分布族的缺省值就是正态分布。 注意：正态分布的广义线性模型实际上与线性模型是相同的，也就是 fm <- glm(formula, family=gaussian, data=data.frame) 与线性模型 fm <- lm(formula, data=data.frame)有完全相同的结果，但效率却低得多。

2）二项分布

; {( j8 e9 j5 r3 v) }2 c
logistic回归模型是一个非线性回归模型，自变量可以是连续变量，也可以是分类变量，或哑变量。但可以使用线性回归模型对参数进行估计，所以Logistic回归模型属于广义线性模型。
0 E# {( c6 K' ~) n1 A! c4 m
% V$ |& z+ t* j, I( y/ WLogistic回归模型的公式为： fm <- glm(formula, family=binomial(link=logit), data=data.frame) 其中，link=logit可以不写，因为logit是二项分布族连接函数的缺省状态。
实例一、Norell实验，高压电线对牲畜的影响

1. #1、加载数据
   + i/ k" }! L  C$ U, Y" N
2. norell<-data.frame( x=0:5, n=rep(70,6), success=c(0,9,21,47,60,63) )
   
3. norell$Ymat<-cbind(norell$success, norell$n-norell$success)  
   
4. 
   3 ?. n$ E" B, R
5. #2、建模
   
6. glm.sol <- glm(Ymat ~ x, family=binomial, data=norell)
   
7. 
   
8. #3、模型评估
   
9. summary(glm.sol)

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1. ##
   " V5 @0 v  h1 {6 u) x3 h
2. ## Call:
   
3. ## glm(formula = Ymat ~ x, family = binomial, data = norell)
   
4. ##
   # A7 q& e( Z5 g7 d" R7 Z
5. ## Deviance Residuals:
   
6. ##       1        2        3        4        5        6  
   
7. ## -2.2507   0.3892  -0.1466   1.1080   0.3234  -1.6679  
   $ L" L4 C% r8 D- Y
8. ##
   # e( m. t4 W( \: y. z
9. ## Coefficients:
   
10. ##             Estimate Std. Error z value Pr(>|z|)   
    # {; |8 g. j- P: U1 Z
11. ## (Intercept)  -3.3010     0.3238  -10.20   <2e-16 ***
    
12. ## x             1.2459     0.1119   11.13   <2e-16 ***
    
13. ## ---
    
14. ## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
    ) p7 ~8 X' r' M7 Y& h8 i
15. ##
    
16. ## (Dispersion parameter for binomial family taken to be 1)
    
17. ##
    
18. ##     Null deviance: 250.4866  on 5  degrees of freedom
    ; v! i4 k) z; }7 H4 k+ E- W+ W
19. ## Residual deviance:   9.3526  on 4  degrees of freedom
    + X* ~: k- J2 y' |! ?; a
20. ## AIC: 34.093
    
21. ##
    : G& b( n; W- E' ?
22. ## Number of Fisher Scoring iterations: 4

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1. #与线性回归模型相同，在得到回归模型后，可以作预测：电流强度为3.5毫安时，有响应的牛的概率
   
2. 
   
3. #4、预测
   1 E* P0 O3 w2 ]& \
4. pre <- predict(glm.sol, data.frame(x=3.5))
   ) C1 }. T$ K. K" U6 L, M! A) b( r
5. (p <- exp(pre)/(1+exp(pre)))

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1. ##        1
   8 V/ I& d% D  H1 f- P3 J& {4 H& O& e4 x
2. ## 0.742642

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1. #求有50%的牛响应时的电流强度：当P=0.5时，ln(P/(1-P))=0,所以X=-b0/b1
   
2. glm.sol$coefficients

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1. ## (Intercept)           x
   
2. ##   -3.301035    1.245937

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1. (X <- -glm.sol$coefficients[[1]]/glm.sol$coefficients[[2]])

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1. ## [1] 2.649439

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1. #5、画出响应比例与logistic回归曲线：
   
2. d <- seq(0, 5, length=100)
   
3. pre <- predict(glm.sol, data.frame(x=d))
   
4. p <- exp(pre)/(1+exp(pre))
   " P- d) d( |3 S- m9 F
5. norell$y <- norell$success/norell$n
   
6. plot(norell$x, norell$y)
   
7. lines(d, p)

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1. #其中，d是给出曲线横坐标的点，pre是计算预测值，p是相应的预测概率。用plot函数和lines给出散点图和对应的预测曲线。

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% D6 @/ {. O4 W9 e+ F

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