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加速matlab运行的三重境界

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发表于 2004-12-21 11:00 |只看该作者 |倒序浏览
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发信人: fork (撒哈拉沙漠的沙), 信区: Matlab. u8 s1 [+ ~; |8 \( J4 o 标 题: 加速matlab运行的三重境界 1 J. K7 w8 { h0 W( n5 J发信站: BBS 哈工大紫丁香站 (Thu Jul 1 14:27:30 2004) 6 K3 ~$ z! `* e& X5 H 1 \% T# T3 N4 H加速matlab运行的三重境界

8 a1 p4 N+ e( [( v. X3 K6 W 3 Y) ~ H: n! A6 S

一、 遵守Performance Acceleration的规则" n4 |0 z$ |* P5 {2 U2 P' m 8 }8 T7 o: b3 j" n关于什么是“Performance Acceleration”请参阅matlab的帮助文件。我只简要的将5 x+ d' g! A, y( I5 w 其规则总结如下7条:7 h3 i9 s7 }4 g% P B: |/ I 1、只有使用以下数据类型,matlab才会对其加速: / m! M. V; d, I. t/ rlogical,char,int8,uint8,int16,uint16,int32,uint32,double' [* G( G% ?: }& q 而语句中如果使用了非以上的数据类型则不会加速,如:numeric,cell,structu- F1 h4 _( V6 P5 S re,single,3 Q1 j, V& _) p. a: W$ a+ O ) p5 |! n) z* e# mfunction handle,java classes,user classes,int64,uint64 / `5 j' U8 n9 U4 X0 a9 y2、matlab不会对超过三维的数组进行加速。 $ s! Q! p0 Y, l1 @3、当使用for循环时,只有遵守以下规则才会被加速:a、for循环的范围只用标量值 * W* q+ d1 t$ a* {/ |- L$ I来表示;8 K8 A9 ^% X$ o* } b、for循环内部的每一条语句都要满足上面的两条规则,即只使用支持加速的数# t4 U4 f" ^( R, c0 Y$ {$ } 据类型,只使用 9 p4 {, M: C, p9 h$ _2 ~; D三维以下的数组;c、循环内只调用了内建函数(build-in function)。) n" A! R+ Y% J7 G4 `( r4 h 4、当使用if、elseif、while和switch时,其条件测试语句中只使用了标量值时,将 * _, n: G# h2 o0 S/ [/ R, i加速运行。 9 B# q) H1 M$ u$ v5、不要在一行中写入多条操作,这样会减慢运行速度。即不要有这样的语句: * u: l; Y$ E; z- A: hx = a.name; for k=1:10000, sin(A(k)), end;' K, L& \% m4 w5 ]6 b 6、当某条操作改变了原来变量的数据类型或形状(大小,维数)时将会减慢运行速& D P' d4 o4 D* C$ G% p 度。4 @2 Z9 h3 o* m# O6 y 7、应该这样使用复常量x = 7 + 2i,而不应该这样使用:x = 7 + 2*i,后者会降低 + l9 W; k) V1 B$ y; W6 d4 E; n运行速度。9 Z9 c, l) i7 I8 Y! Y# O

( _. o7 r* V/ k( R/ ~8 R* `* \0 H

二、 遵守三条规则; r5 G/ t% h4 n % R7 d. s" g1 [, t7 X1、尽量避免使用循环,MATLAB的文档中写到“MATLAB is a matrix language, whic 6 O; b+ _- q2 ~% O; S0 O- A3 z) `h means it is designed " e: B% A/ _6 V4 v' ^ # S+ J3 ]" e. ]) c: z7 g* [for vector and matrix operations. You can often speed up your M-file c6 |+ c8 ~6 C3 [+ s& d, ] ode by using# D. z, [) A! }; [0 R vectorizing algorithms that take advantage of this design. Vectorizati2 N; A, ]8 w* K- _6 Q on means converting2 p2 c9 S, c- i/ V, k for and while loops to equivalent vector or matrix operations.”。改进 3 o3 v a" V" u% y这样的状况有两种方法: 6 b7 e' o. y% o0 m ; Q0 ?) X( `# ra、尽量用向量化的运算来代替循环操作。如将下面的程序: ' W! `/ c3 m! E9 R- N# T 6 M/ s9 o* e' m3 m& H0 ?7 Oi=0;9 V: w+ ]4 D! E; d- R0 d for t = 0:.01:10 0 g) ]" ]& I n1 s& {! f: yi = i+1; " k1 h" t4 e% y9 Z* H) G1 @y(i) = sin(t);* l5 q# `( a6 e( | end- w" X/ L4 R% U9 x 替换为:$ a: Y; }3 |0 d# \* ` t = 0:.01:10;# M* D" E# F' e& c* o+ _ y = sin(t); / h$ ]9 s/ y/ }) I' o& {' E2 j' d速度将会大大加快。最常用的使用vectorizing技术的函数有:All、diff、i + I6 [) |9 U% @$ o% Zpermute、permute、 . w/ Q8 O; U. E0 _; z6 ?) Wreshape、squeeze、any、find、logical、prod、shiftdim、sub2ind、cums8 x7 ?* A& m& f um、ind2sub、 9 v0 S }/ z/ d% R5 B0 cndgrid、repmat、sort、sum 等。 0 J( l" F, x! U7 W6 Y! g % g Z; y \0 G请注意matlan文档中还有这样一句补充:“Before taking the time to : D3 k$ a H* s % u& j9 r" n; o9 M% N1 d) a0 Avectorize your code, read the section on Performance Acceleration. ) z2 v9 Z p# @0 ~' E' \. Y. XYou may be able to / ~/ H9 m% Z O+ z6 n Zspeed up your program by just as much using the MATLAB JIT Accelera 7 C9 n# [3 v/ }' p+ Utor instead of ( `3 f( @7 M Q9 ^+ w- x9 tvectorizing.”。何去何从,自己把握。. K f1 t: s. _- H4 v ( C* y+ x/ d( M# u% ?% t7 _9 Hb、在必须使用多重循环时下,如果两个循环执行的次数不同,则在循环的外环执 , v; o) S% I1 ?8 l+ m3 `行循环次数少的,6 [2 p8 @' M3 X/ ]- A5 m 内环执行循环次数多的。这样可以显著提高速度。 ) s' b6 t/ e" r8 c& r6 d" C& ]. x+ y4 ` 2、a、预分配矩阵空间,即事先确定变量的大小,维数。这一类的函数有zeros、on0 s; d& [* }) O, Q4 N. A4 q es、cell、struct、5 P) _$ [ u1 G$ b repmat等。 . N# m; J& I& b$ k" e% ^8 m$ Ib、当要预分配一个非double型变量时使用repmat函数以加速,如将以下代码: 1 ]' ?$ w3 k( L) [! d% r1 V5 Q0 M A = int8(zeros(100)); # ?7 h+ |+ r+ c, j换成:3 w L* R3 u9 ` A = repmat(int8(0), 100, 100); 5 c) R0 }+ K8 U1 w. Xc、当需要扩充一个变量的大小、维数时使用repmat函数。) V7 y, v' p8 ^ 4 N# u$ w" C$ u+ ?: j3、a、优先使用matlab内建函数,将耗时的循环编写进MEX-File中以获得加速。7 d' B" x8 K ^: b% }9 N% D( G! R* E b、使用Functions而不是Scripts 。3 d2 w' q) H/ r% O! v

# F% A" x* j. X0 v

三、 绝招. W D9 h* g4 q4 _& b/ Q 9 w2 [0 [+ M( K6 Y 你也许觉得下面两条是屁话,但有时候它真的是解决问题的最好方法。 & v" h3 }* f9 o6 ?5 m. {1、改用更有效的算法 * M8 i0 ]4 g; Y. H# U2、采用Mex技术,或者利用matlab提供的工具将程序转化为C语言、Fortran语言。 ; O" M2 \$ H4 i# @ ~! Z0 k( b% X7 S% v% Y 关于如何将M文件转化为C语言程序运行,可以参阅本版帖子:“总结:m文件转化为c/c++ ) g7 [- ^* d$ `; {4 t% ~4 v+ u语言文件,VC编译”。

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注意

1 K7 I! [: u0 @

加速之前应该先测试9 A; K6 }+ o5 v 使用profiler可以获得程序各个部分的耗时, ?7 C! D i" y# X4 q7 Z$ c1 a 如此就能高效的加速 1 w. [" B% G+ H1 |0 S/ f( X

9 x0 l6 F' {1 c' ^5 D5 W* O

因为有的时候导致速度变慢的原因是逻辑结构不合理, % |7 y6 N7 h0 k9 B4 T9 k5 S而不涉及程序技术

& q7 [( h7 i# T- U

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