[求助] 二维凝胶图像的蛋白质点匹配问题，请大家给点思路

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发表于 2005-6-23 15:29 |只看该作者 |倒序浏览

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二维凝胶图像的蛋白质点匹配问题
这是我在做课题时遇到的问题，请大家给点思路。

我们的目的是通过蛋白质电泳来研究蛋白质的表达与差异。在K562细胞中分别加入药品STI,A4S4以及这两种药品的混合STI&A4S4做三组实验。对每组用药都取5个时间点，3小时，8小时，12小时，24小时，48小时。再加上0小时不加药品一共16张胶片。
每张二维凝胶图像上有一些蛋白质点组成，如果某个蛋白质点在几张胶片上都存在，则它们在空间位置，几何形状，光学性质方面都相似。由于药品不同，药品作用的时间不同，每张胶片上的蛋白质点都不完全相同。蛋白质点可以通过图像处理的方法检测到。在检测到蛋白质点后，我们可以使用已有的软件对这些胶片进行对比，找出其中匹配的蛋白质（即不同胶片上的同一个蛋白质点）。如果只对两张胶片进行比较，匹配的准确度可以达到90%。但如果对16张胶片一起进行比较，则匹配的准确度不到10%。现在的问题是怎样来提高16张一起匹配的准确度？是否可以利用两张匹配准确度较高的结果，设计一个胶片之间比较的方案来提高多张比较的准确度？附件1为一张已经检测过的胶片，绿的+表示一个蛋白质。