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[转帖]加速matlab运行的三重境界

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发表于 2005-1-20 10:27 |只看该作者 |倒序浏览
|招呼Ta 关注Ta
信人: fork (撒哈拉沙漠的沙), 信区: Matlab
9 g* U( ^4 \2 v2 K3 P& S标 题: 加速matlab运行的三重境界
# d3 t" K' t) l3 {发信站: BBS 哈工大紫丁香站 (Thu Jul 1 14:27:30 2004)
0 o. v2 V8 f8 T/ X; ^2 U) g3 h4 \7 u2 L. \9 a+ Y" y" ^
加速matlab运行的三重境界8 W# r& n) v; c4 X: ]
, P  S9 v. M+ p) O$ _5 c
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
+ K; T1 y7 j( V% ~1 Z0 F%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
, g0 u+ ]0 w) f) K3 G) F0 H# ?一、 遵守Performance Acceleration的规则
6 T9 H2 A/ V- X2 U  t! K5 A9 W% S' _二、 遵守三条规则' G4 \$ t7 |6 s, a! e" ^* x$ j
三、 绝招
% Z0 _. _6 S6 K3 q: e! T( I. A0 J! c. ^: t8 C8 x& J
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
  P$ X; @$ k! ^%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
2 `4 C, \* E7 b" P一、 遵守Performance Acceleration的规则  h' s- q# Y- k: k8 ?
  R0 k* Q, R' L6 `( Z/ [
关于什么是“Performance Acceleration”请参阅matlab的帮助文件。我只简要的将4 W* g: M+ w" j0 C/ O& p
其规则总结如下7条:
/ y* [* s" K7 [/ C7 g: j6 s1、只有使用以下数据类型,matlab才会对其加速:
( u4 g- J7 H. i$ Q+ Ological,char,int8,uint8,int16,uint16,int32,uint32,double/ g+ A, Q; x; l, l( `/ j
而语句中如果使用了非以上的数据类型则不会加速,如:numeric,cell,structu
# f- u# T6 a1 ?2 h# T0 u" ~! ure,single,9 @" @" B* N$ \
( o. v# f' G: ^2 n8 P* Y, E" R
function handle,java classes,user classes,int64,uint64! `- u) f7 U& Y: r
2、matlab不会对超过三维的数组进行加速。
1 e" n; ]3 n5 b$ U0 Q* R8 w3、当使用for循环时,只有遵守以下规则才会被加速:a、for循环的范围只用标量值
( u6 Y( ~+ h$ }7 S' {来表示;
1 H' o/ F, Q/ q8 B& A; ?  rb、for循环内部的每一条语句都要满足上面的两条规则,即只使用支持加速的数
/ s# \1 T" a3 A& I7 H) v+ P据类型,只使用
! q  U# v! `! Z  U0 m三维以下的数组;c、循环内只调用了内建函数(build-in function)。
6 P" F" K1 W; L( [5 y' c3 O4、当使用if、elseif、while和switch时,其条件测试语句中只使用了标量值时,将
' m. M% k. `7 B. p6 f& Z6 F/ p加速运行。0 Z% U# s: w' ]5 [  Z# U. C
5、不要在一行中写入多条操作,这样会减慢运行速度。即不要有这样的语句:2 [+ P3 x3 l, C% d" l) e+ I
x = a.name; for k=1:10000, sin(A(k)), end;% F3 w! c- Y) Y! R9 }
6、当某条操作改变了原来变量的数据类型或形状(大小,维数)时将会减慢运行速" n8 a7 B( k& M, l/ W3 P% U2 P
度。
) l) ~/ @& v/ d6 w) f7、应该这样使用复常量x = 7 + 2i,而不应该这样使用:x = 7 + 2*i,后者会降低
4 s) S: g$ S/ Q1 O' a运行速度。
1 v0 e& I5 V9 @, T/ G  A0 G$ s7 u3 b5 _
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
$ q$ ~3 J' X2 q%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%, B$ S, t  o5 R
二、 遵守三条规则5 [/ ~. v1 |" |$ K
+ r6 x$ l0 H4 O: Y. U$ a: N: f4 d
1、尽量避免使用循环,MATLAB的文档中写到“MATLAB is a matrix language, whic* D" n. S1 z1 r7 K$ O* p& L
h means it is designed' @- j) v/ i: q; X  f

7 F  N/ P8 H0 h& `for vector and matrix operations. You can often speed up your M-file c
( c5 i: t% W( `% f5 u" V1 {) lode by using
1 Q* J8 k, a  Q+ D7 q* Rvectorizing algorithms that take advantage of this design. Vectorizati, T) t$ m3 `* Z5 f
on means converting0 F( l$ Z! o- o$ ~! d/ `: {( {7 c) s
for and while loops to equivalent vector or matrix operations.”。改进( p$ W- d' Y$ c
这样的状况有两种方法:
1 Q9 r0 }& g9 x/ l) {& n$ H0 v" [; E; C1 O9 ]' G
a、尽量用向量化的运算来代替循环操作。如将下面的程序:5 K5 u8 j. `( m
) [8 Y5 K( d9 P1 V
i=0;
, J: t9 Z$ V! X5 J! }for t = 0:.01:10  C- ~/ g1 }8 V( ~
i = i+1;
' f8 c! ^% D- L. T$ Hy(i) = sin(t);
; Z0 T: _4 l7 @* i8 V5 L9 \end  q6 L; {: _" |9 A4 l
替换为:
4 t: W: ~* J, q9 D/ ?- k) qt = 0:.01:10;, K9 \. {, t; N0 t1 N
y = sin(t);
6 z+ N2 F% n& [6 k. H速度将会大大加快。最常用的使用vectorizing技术的函数有:All、diff、i& L( X9 d  j" O5 q1 @% c) z3 l+ d
permute、permute、
5 }- V  S6 k* x; s8 Z1 ~' rreshape、squeeze、any、find、logical、prod、shiftdim、sub2ind、cums
+ D. O+ t8 \, q$ k$ @9 f+ K6 {! Xum、ind2sub、  [1 `' d" C! H( N0 B& X" l: t
ndgrid、repmat、sort、sum 等。' r! A7 [, {% e4 K+ Z% y
: l+ e( j8 [8 h5 @& ?) d
请注意matlan文档中还有这样一句补充:“Before taking the time to% G/ C+ ?1 C0 n  Z+ Z6 g7 f
2 `+ s$ a  b. e. I$ {
vectorize your code, read the section on Performance Acceleration.
. R3 n' ]; N: \You may be able to" d) k9 [8 b- k
speed up your program by just as much using the MATLAB JIT Accelera
! P: w+ w2 O' y( }# x4 A* Gtor instead of
- a9 N% Q6 b' l8 p7 z& Gvectorizing.”。何去何从,自己把握。( F/ C& I5 F6 B8 k1 R
2 i( ^, ^1 t+ v
b、在必须使用多重循环时下,如果两个循环执行的次数不同,则在循环的外环执' w8 g9 r  c, p4 ?+ T
行循环次数少的," h# T* R5 j+ V3 p& @, j
内环执行循环次数多的。这样可以显著提高速度。4 V8 k8 [! n( u6 Z% T

/ P/ z. X. W' L6 C: f2、a、预分配矩阵空间,即事先确定变量的大小,维数。这一类的函数有zeros、on6 a- j: c# ~% [1 S1 v
es、cell、struct、
  }$ m* @+ d' z' J5 O8 Hrepmat等。
5 ?5 L' r' X' X5 x* Z4 D% T$ Zb、当要预分配一个非double型变量时使用repmat函数以加速,如将以下代码:. o; A# L3 e3 g0 Z# I- j+ P) Q
0 n: }) h6 q( O( S
A = int8(zeros(100));. o. d1 ?" ]* S6 q0 i
换成:7 w* F1 z- Q1 n1 s
A = repmat(int8(0), 100, 100);, p3 v# b" J! M; x/ a
c、当需要扩充一个变量的大小、维数时使用repmat函数。7 r3 U( v  D* V; \* ~' X% N

% ]% ^$ T2 d7 f1 }0 Z4 ]& w3、a、优先使用matlab内建函数,将耗时的循环编写进MEX-File中以获得加速。* _8 r# Q6 l" `7 }  m# E
b、使用Functions而不是Scripts 。: H6 v- _; S. Z  u

7 V/ t+ E0 k& i+ c; O' _%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
% z( ?4 u% K1 b- i! [9 g%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
* ^* E$ m5 a3 N! q8 J% h2 p三、 绝招, P/ L8 l$ k; S7 ]4 h
% R4 B/ {0 z& t3 l
你也许觉得下面两条是屁话,但有时候它真的是解决问题的最好方法。& r# h$ X8 s& f3 _( Q
1、改用更有效的算法
! }( Z" Q+ a/ ~7 Z3 i2、采用Mex技术,或者利用matlab提供的工具将程序转化为C语言、Fortran语言。+ ?9 G4 i/ S# u9 b

  K# u) A# L5 V* Y$ X: z5 f# R关于如何将M文件转化为C语言程序运行,可以参阅本版帖子:“总结:m文件转化为c/c++
4 A$ Z1 K! Q; P% F4 a语言文件,VC编译
zan
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如果我没给你翅膀,你要学会用理想去飞翔!!!
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