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[转帖]加速matlab运行的三重境界

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发表于 2005-1-20 10:27 |只看该作者 |正序浏览
|招呼Ta 关注Ta
信人: fork (撒哈拉沙漠的沙), 信区: Matlab2 O0 z) j5 }  |, b4 W/ D: L
标 题: 加速matlab运行的三重境界
/ G; |0 m) N3 T& G+ ?' t" m3 y  x发信站: BBS 哈工大紫丁香站 (Thu Jul 1 14:27:30 2004)
6 F! W- |4 J& w9 \  [* S6 w/ M3 a# [8 e8 B) p& T: j0 B+ v; {. A  o! y
加速matlab运行的三重境界
# v7 l' x9 a/ _7 I: ~
1 `* `1 |& @0 Z" ?, j3 s%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
3 d3 G, V% w; p% a# w4 V& k- p%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%# ^" G9 b3 f/ J% X, w7 |( T5 x
一、 遵守Performance Acceleration的规则
6 f# F* v1 b4 H9 L$ B二、 遵守三条规则# W. t/ Y! M9 h1 B1 X+ m% K/ Z
三、 绝招
; r0 m2 }$ M0 u: t: b' D0 k& d, b% T  j) z
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
3 F% z) J1 U* w* V, V%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%" E; ]9 z- ~1 ~) g; B
一、 遵守Performance Acceleration的规则
, M9 j6 l4 X8 V: k, q- W% R, I5 a/ C- D# @: x3 X+ U
关于什么是“Performance Acceleration”请参阅matlab的帮助文件。我只简要的将
0 K$ l6 j* I+ v* r其规则总结如下7条:
$ t3 r. [% D: P# T8 t, G1、只有使用以下数据类型,matlab才会对其加速:/ z. p: r$ z" r5 u
logical,char,int8,uint8,int16,uint16,int32,uint32,double
6 f4 e: w% o; }! \0 S1 O3 p而语句中如果使用了非以上的数据类型则不会加速,如:numeric,cell,structu
2 B* h$ |" Y7 q3 [re,single,& p- z) F8 ~- [; h" w) Z
  w6 K% ^- W, J4 a4 _! x$ X0 z
function handle,java classes,user classes,int64,uint64) z0 ~6 \) ?8 Z2 Y: j5 g% b0 {
2、matlab不会对超过三维的数组进行加速。
1 [1 O6 l/ s# {; {/ v3、当使用for循环时,只有遵守以下规则才会被加速:a、for循环的范围只用标量值
+ k9 N& s4 F- X8 ^6 ]+ _# f1 p来表示;
; O3 k# `- z! L. I' ]; Yb、for循环内部的每一条语句都要满足上面的两条规则,即只使用支持加速的数) B- a# Q2 I* \/ a2 l6 Q1 G3 r
据类型,只使用
3 l3 c' k- b( u三维以下的数组;c、循环内只调用了内建函数(build-in function)。
4 B) L$ n/ ^; r2 V4、当使用if、elseif、while和switch时,其条件测试语句中只使用了标量值时,将
1 ^# k1 F' B' z: }$ m加速运行。5 Q8 \3 \) v; P. `
5、不要在一行中写入多条操作,这样会减慢运行速度。即不要有这样的语句:
. d+ ^/ [% f5 t; l/ `9 R$ {) v" px = a.name; for k=1:10000, sin(A(k)), end;
, e% Y- s& E$ G* F6 m! }6、当某条操作改变了原来变量的数据类型或形状(大小,维数)时将会减慢运行速0 Q  S* `6 ?0 ^7 M, l* O/ m
度。
: K4 @" Z, D5 S: j8 `9 [7、应该这样使用复常量x = 7 + 2i,而不应该这样使用:x = 7 + 2*i,后者会降低! x$ @  z$ v- T7 ?
运行速度。( ^2 c1 o2 J! p

3 j$ K4 K5 m' _/ |  m%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
& ]. k" z, \: A7 Q: @; l" e) k%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
4 {3 B- \- H& d- K二、 遵守三条规则( b2 P. c. V9 E* t% p
  R! [) E# t8 V- J* k
1、尽量避免使用循环,MATLAB的文档中写到“MATLAB is a matrix language, whic+ B. D2 l# t7 X# E) A5 U, e
h means it is designed/ Y/ Z. {. e  m3 z7 W- U
- e2 a; Y- m# C( @/ V- y
for vector and matrix operations. You can often speed up your M-file c0 ]0 `: Y. i5 k) t# f7 G# s
ode by using
! F  V  V! [9 H0 y$ t. Svectorizing algorithms that take advantage of this design. Vectorizati
% f3 X# Z  O8 Yon means converting" @3 w6 G- w: I- S$ J
for and while loops to equivalent vector or matrix operations.”。改进
8 c2 O- F, A! t  c/ q; ~1 m' \这样的状况有两种方法:
/ k3 f6 a0 l- s" z5 U5 @
, M  q& X+ R  }+ D& A# e! za、尽量用向量化的运算来代替循环操作。如将下面的程序:
+ S' m# j  D& ?$ d- E( h2 W* U" p  V" I& J9 O" `
i=0;- _" J  `& i' j) L
for t = 0:.01:105 D4 l0 N4 F& ]
i = i+1;7 [0 v  ]2 C6 d1 q* N8 W4 t
y(i) = sin(t);9 I6 D8 q1 O6 R) O4 c/ E3 N4 Q
end
: d3 ]: u3 |" V& M. @/ W" E替换为:
! ~8 y7 n$ i2 V+ it = 0:.01:10;
  R. G+ \6 [7 `6 Z: t  q( c' ly = sin(t);. \% p1 f, Y! k' p6 Q
速度将会大大加快。最常用的使用vectorizing技术的函数有:All、diff、i
0 n( f0 ^! P$ [permute、permute、3 t, e. ^) C& i) @
reshape、squeeze、any、find、logical、prod、shiftdim、sub2ind、cums
; B/ s1 ]4 \1 n9 tum、ind2sub、5 M) i9 B' B/ n5 r2 k0 ]
ndgrid、repmat、sort、sum 等。
2 J3 z( r+ I$ H2 z3 f1 {. F; U4 B9 ~6 k+ [* _
请注意matlan文档中还有这样一句补充:“Before taking the time to' v0 n$ z& g% {2 W
/ p9 j$ _8 A, j3 n' r
vectorize your code, read the section on Performance Acceleration.! l7 W1 Q. i) H5 E, A# |
You may be able to5 S. F2 h9 _. r, M6 C) Q
speed up your program by just as much using the MATLAB JIT Accelera2 `! @& x( w1 f  e/ z
tor instead of! S% E# t# Y0 S% Y1 s% f$ [& Z
vectorizing.”。何去何从,自己把握。
( u, p2 m5 V+ H6 |( w: t( m5 Z8 u4 ]& U4 y3 e2 A+ k+ a- K
b、在必须使用多重循环时下,如果两个循环执行的次数不同,则在循环的外环执
7 C* N4 @$ t4 y  E! I行循环次数少的,
# V; [  d) _6 Q; g内环执行循环次数多的。这样可以显著提高速度。
2 k! b, Z$ s+ a- E2 {6 x1 E5 ?" b+ V& ?8 }: e, q5 _9 \+ i
2、a、预分配矩阵空间,即事先确定变量的大小,维数。这一类的函数有zeros、on
; z! z2 p) L7 V  Hes、cell、struct、
4 \9 S, I+ z0 ]6 b& \: Q, g+ c$ orepmat等。) E- C8 N6 h. A) y% ~
b、当要预分配一个非double型变量时使用repmat函数以加速,如将以下代码:
0 \6 J' E/ m) ?; ]( e; T2 l  D) J* f  K
A = int8(zeros(100));  k' O0 ~0 g# s( y* O# d" r  c
换成:2 S5 {7 l! ?5 Y' L3 \/ A
A = repmat(int8(0), 100, 100);, r/ Z" E7 x* Q' g
c、当需要扩充一个变量的大小、维数时使用repmat函数。
# |$ N2 t$ i7 R* h5 Q0 c0 i6 O: L
3、a、优先使用matlab内建函数,将耗时的循环编写进MEX-File中以获得加速。
  m# k) u4 ]1 R& W6 Eb、使用Functions而不是Scripts 。/ T+ C% s8 Y* m

3 s5 x; p: }$ s4 K4 r& v%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%, y5 J& ]1 F$ d/ w/ S  D% g
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%6 R' ]! `; ]. Z
三、 绝招0 y9 J& t: [. E- i3 X4 p
& B' B4 \" w8 @# l5 I
你也许觉得下面两条是屁话,但有时候它真的是解决问题的最好方法。/ E7 P  M0 B2 a. ?2 m
1、改用更有效的算法
0 H+ G; n1 G, j" p1 k$ s3 E2 ]2、采用Mex技术,或者利用matlab提供的工具将程序转化为C语言、Fortran语言。- l+ z. k3 |# g% C8 x. r& v

0 z, w, c5 c7 \6 d5 X# R关于如何将M文件转化为C语言程序运行,可以参阅本版帖子:“总结:m文件转化为c/c++
: X7 z' n+ u: }, u. C6 A语言文件,VC编译
zan
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如果我没给你翅膀,你要学会用理想去飞翔!!!
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