% [2 B5 f0 B+ b) y* s. S1 基本思想及方法4 @6 |" F' {! [* E6 ? / @. x1 F3 ~) |
; ^' f8 b! Z' x5 p
* f$ d: p2 @" g
1 确定各个主成分的方法 6 e) N5 {+ F. k6 F一个主成分不足以代表原来的 p 个变量,因此需要寻找第二个乃至第三、第四主 成分,第二个主成分不应该再包含第一个主成分的信息,统计上的描述就是让这两个主 成分的协方差为零,几何上就是这两个主成分的方向正交。具体确定各个主成分的方法 如下。 0 M0 h* s0 c+ \9 z; _/ M; {$ q
/ ^ D% P: f, W5 @8 | 9 O/ {! K5 Z( V. n9 ?) j- [9 r% a! C* `2 T
2 注意事项 8 T& X+ g& Y R7 D- V' G# n 1)主成分分析的结果受量纲的影响,由于各变量的单位可能不一样,如果各自改变量纲,结果会不一样,这是主成分分析的大问题,回归分析是不存在这种情况的, 所以实际中可以先把各变量的数据标准化,然后使用协方差矩阵或相关系数矩阵进行分 析。) i ~6 i! c7 F+ M1 {
; v) l6 I) ~- P3 ~* h+ _/ E 2)为使方差达到大的主成分分析,所以不用转轴(由于统计软件常把主成分分 析和因子分析放在一起,后者往往需要转轴,使用时应注意)。& O% R, Z; `& G4 k" e1 O' v
T7 s0 Y) G/ F s& n5 T1 x
3)主成分的保留。用相关系数矩阵求主成分时,Kaiser主张将特征值小于1的主成 分予以放弃(这也是SPSS软件的默认值)。7 p2 i. K: D. g( a8 ]7 P3 ~
3 T4 f& ?! A' D! R' X/ X
4)在实际研究中,由于主成分的目的是为了降维,减少变量的个数,故一般选取 少量的主成分(不超过5或6个),只要它们能解释变异的70%~80%(称累积贡献率) 就行了。 下面我们直接通过主成分估计(principle estimate)进一步阐述主成分分析的基 本思想和相关概念。 9 ]9 h, n1 ^- r# i7 s" X* a4 w2 {( v1 @9 G. |0 x$ N
2 主成分估计 : \, G7 S. y- W* n! H+ Y4 I' H 主成分估计(principal component estimate)是Massy在1965年提出的,它是回归系数参数的一种线性有偏估计(biased estimate),同其它有偏估计,如岭估计(ridge estimate)等一样,是为了克服小二乘(LS)估计在设计矩阵病态(即存在多重共线性) 时表现出的不稳定性而提出的。 ( {: V( x! {3 z5 P. m( J2 U, Q
) M- c. V) H) y! ^2 c
主成分估计采用的方法是将原来的回归自变量变换到另另一组变量,即主成分,选择其中一部分重要的主成分作为新的自变量(此时丢弃了一部分,影响不大的自变量, 这实际达到了降维的目的),然后用小二乘法对选取主成分后的模型参数进行估计, 后再变换回原来的模型求出参数的估计。 + e- u* \9 A+ l9 Y% y: k4 T; h! K( [% `0 U* `, n 0 Q9 e) u, f/ ^ 8 o6 Y, S; Z2 c. i1 U* i 5 b9 q# |& S: R& T+ v0 a8 `单参数主成分估计 " ?' l( v, M- y7 X8 m$ ]0 b8 Q2 D理论上表明:主成分估计在设计阵病态时优于LS估计,但(31)在特征值为1的附 近存在跳跃,会影响计算的稳定性,杨虎在1989年给出的单参数主成分估计解决了这个 问题。 1 E7 V/ W* T& r! i# n 0 \# p2 }" o {7 Z1 {
. D4 ~, H# b8 V4 {2 ~例3 Hald水泥问题,考察含如下四种化学成分 1 M# h( n' s; E8 _" k- s
" Z( l+ o( c4 e' L8 H m& q2 G1 j+ [: T3 f& a3 S3 a
* I1 s3 Y1 W. d( J( _8 }7 g
( E0 R/ R; q( @1 c8 E相关系数阵的四个特征值依次为2.2357,1.5761,0.1866,0.0016。最后一个特征值接近于零,前三个特征值之和所占比例(累积贡献率)达到0.999594。于是我们略去 第4个主成分。其它三个保留的特征值对应的三个特征向量分别为 1 y! @& f6 V# Y) Y4 N9 h) D% d3 d) f+ i; y$ V 1 b3 k' d6 Y" u9 d2 C- `" B# E# M 6 \+ i; h1 `4 a, n1 Q对Hald数据直接作线性回归得经验回归方程 : l; I. O# d: X4 F+ s) D/ U $ A+ }% k% \# @# @1 q- G ' x1 S, |1 L8 e6 [+ \/ C, V2 C 8 \& E0 K& K( d再由(31)式计算出主成分估计,即可获得如下主成分回归方程 ) ?2 @0 `* y3 a % p+ q- t( i$ I1 T; U! {+ l & n' h$ c) K! G' Z: [1 c2 y4 `9 {) \' l7 _& T8 b, |
两个方程的区别在于后者具有更小的均方误差,因而更稳定。此外前者所有系数都无法 通过显著性检验。 计算的MATLAB程序如下: " w1 q: c6 j. G3 H6 Wclc,clear & b0 `' m" f2 G# a$ c load sn.txt %把原始的x1,x2,x3,x4,y的数据保存在纯文本文件sn.txt中 4 c6 ]" l( f6 } [m,n]=size(sn);num=3; %num为选取的主成分的个数 2 A, k7 o! L: N7 U- f mu=mean(sn);sigma=std(sn); $ g G3 O6 w5 S2 y: C( l0 Gsnb=zscore(sn); %数据标准化 + I( L# I0 Q2 Z( Vb=snb(:,1:end-1); %x1,x2,x3,x4的数据赋给b 1 D, G9 o; a4 ?9 m4 C# u; R r=cov(b); %标准化数据的协方差阵就是相关系数阵 {" Q N( |- Z! t: X$ A" ]0 I [x,y,z]=pcacov(r); ; A! e( a: ~$ I" P% a f=repmat(sign(sum(x)),size(x,1),1); : ]1 A* P+ h, b7 p+ I0 L6 _# G x=x.*f; 8 l9 F1 W f, }- ~%以下是普通的小二乘法回归 ! ?' {! |( \6 Rr=[ones(m,1),b]\snb(:,end); %标准化数据的回归方程系数 / n4 F7 G- p: V, hbzh=mu./sigma; / W$ n, a0 o) |, S8 ]6 u) j g2 Y0 ech10=mu(end)-bzh(1:end-1)*r(2:end)*sigma(end) %原始数据的常数项 4 N+ n1 H" l. K4 l4 m( V3 V fr=r(2:end);fr=fr'; . A! F: a1 i: ~ R/ g6 [% {' a ch1=fr./sigma(1:end-1)*sigma(end) %原始数据的x1,x2等等系数 3 f8 @4 U ?: K& ~* G. p$ N8 v6 v%以下是主成分回归 % ?0 f8 E3 l" opval=b*x(:,1:num); , |0 c2 {' y) N6 f5 P6 [- A# P8 h; Lrp=[ones(m,1),pval]\snb(:,end); %主成分数据的回归方程系数 6 W$ `! @+ m) `2 Nbeta=x(:,1:num)*rp(2:num+1); %标准化数据的回归方程系数 n- A4 ~8 F. f7 Nch20=mu(end)-bzh(1:end-1)*beta*sigma(end) %原始数据的常数项 6 r9 @; c$ y: ^' U/ s; b fr=beta'; $ W: w$ x+ m, Y w+ Wch2=fr./sigma(1:end-1)*sigma(end) %原始数据的x1,x2等等系数 9 X: o/ R2 N1 t2 o9 u' Ycheck1=sqrt(sum((sn(:,1:end-1)*ch1'+ch10-sn(:,end)).^2)/(m-n)) . {1 g, c4 @& scheck2=sqrt(sum((sn(:,1:end-1)*ch2'+ch20-sn(:,end)).^2)/(m-num-1)) ' W$ g7 D1 w d) S6 p i 7 S4 d/ v/ P! ^8 v$ G' b( x3 a; j) o' p3 ~& Z. L) S
% i+ T5 q" k$ U3 e4 }) q
! s. ^4 B$ P+ y, K
) ], K" j& ~( c2 a m- y6 l主成分分析法(二):计算步骤) j) K/ L. y0 L2 g
主成分分析法的步骤 1 l# h( d4 O5 {" p/ }
1)对原始数据进行标准化处理 . M7 E2 r6 ^# h7 n8 B: a; A ) _# y6 ^" T0 S, S 3 x: |/ J$ X5 Q* H' S" Y3 |1 `8 F' I 其中 , 即分别为第j个指标的样本均值和标准差。: p9 o6 H' a5 z0 v# h( a
8 A* ?7 V1 F& a/ J( P9 y 7 i: X+ k" [1 b) O. e }/ l; \* X
4 \7 B) _& o2 q2 W+ T2)计算相关系数矩阵R , w4 l K+ A8 _7 b1 b ' O2 p q9 x* m; c2 ~* S * S+ \ E; c6 s1 E {3)计算特征值和特征向量 ' o' D/ ]8 u# C$ \3 K
特征值要由大到小排序 " a. `& m- _! n - }' N, r- [ j/ w& \8 F1 E+ t( m1 C. |5 x# e: f
5 f* t* q2 W7 |4)选择 p ( p ≤ m )个主成分,计算综合评价值 8 W* w0 Y( ~& x5 T: R# n0 F* W+ ], m- e# J# ?' X% K , s3 V7 v3 K F/ F9 y% d3 V
/ C7 H7 F6 w/ U! V5 Y1 W O; q- x c* M% v% W
h % y( I4 }8 v2 A, {; N0 f% m/ {* _# B
matlab实现主成分分析的pcacov( )函数 # Z- U- {1 j5 j" |8 `5 k7 i- e/ Eclc,clear 2 d6 U6 |; Y' a C X) n2 @' s. x8 n% xload gj.txt %把原始数据保存在纯文本文件gj.txt中 2 Y: G& F( m- T& O) ~: r- Y$ Ugj=zscore(gj); %数据标准化 7 Q! G9 P- o7 @# [; Xr=corrcoef(gj); %计算相关系数矩阵 ' U5 N. |% H) t. C[x,y,z]=pcacov(r); 8 m) S3 m1 {" E6 u) m; df=repmat(sign(sum(x)),size(x,1),1); @ _7 u D, q( N
x=x.*f; 2 \( K; a0 @3 }; [- E. {df=gj*x(:,1:4) " M0 @; J1 W q4 etf=df*z(1:4)/100; : |) i+ ]1 Q, L# c$ l
[stf,ind]=sort(tf,'descend') % J. z- C1 v# L0 k+ \4 R1 V# m 1 D9 a6 [6 [* A, w2 ~, H; J) w& x- ]4 k# Z I
6 x s4 T( o. f2 X( `————————————————* r+ D+ M- `" y! U1 p- g& |
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5 K! w O" `, e; ]5 X, J8 v2 j9 M. B% {2 W/ \% U- I; I; M