美赛F题 缉获野生动物及其预期用途数据集

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此readme.txt文件由Oliver C. Stringham于2021-06-16生成

数据集标题:缉获野生动物及其预期用途数据集

作者:Oliver C. Stringham*， Stephanie Moncayo, Eilish Thomas, Sarah Heinrich, Adam Toomes, Jacob Maher, Katherine G.W. Hill, Lewis Mitchell, Joshua V. Ross, Chris R. Shepherd, Phillip Cassey

*通讯作者liverstringham@gmail.com，澳大利亚阿德莱德大学

数据收集/汇编日期:2020年10月至2021年6月

目录结构

| -数据

| |- 01_taxa_use_combos.csv

| |- 02_gbif_taxonomic_key.csv

| |- 03_gbif_common_names.csv

| |- 03_gbif_common_names.rds

| |- 04_db_generic_common_names.csv

| |- 05_use_search_words.csv

| -脚本

| |- example_search_phrases。R

| dataset_of_seized_wildlife_and_their_intended_uses。Rproj

| sessionInfo.txt

|固定

文件汇总

| -数据

| |- 01_taxa_use_combos.csv:包含捕获的分类组和报告的used-type的表。每行对应一个唯一的分类群/使用类型组合。

- 02_gbif_taxonomic_key.csv:包含每个捕获分类群的分类信息的表。分类信息收集自GBIF(全球生物多样性信息设施)。

| |- 03_gbif_common_names.csv:包含被捕获分类群的公共名称的表。从GBIF收集的通用名称。

| |- 03_gbif_common_names。rds:与03_gbif_common_names.csv相同的表，只是保存为R数据文件(.rds)，它保留了其他语言中通用名称的适当编码。当使用其他语言中的通用名称时，优先使用此文件而不是03_gbif_common_names.csv。

| |- 04_db_generic_common_names.csv。收集自i) TRAFFIC国际野生动物贸易门户网站和(ii) LEMIS(美国鱼类和野生动物管理局执法管理信息系统)的通用名称和通用名称表。

| |- 05_use_search_words.csv:每个使用类型的“互联网友好”搜索词表。

| -脚本

| |- example_search_phrases。R:生成在非法野生动物交易中查获的野生动物物种搜索短语的脚本。三个例子包括i)从GBIF数据库中获得所有被缉获野生动物的共同名称;(ii)获得与之相关的物种和共同名称的分类群和用途类型组合;以及(iii)记录为作为羽毛被缉获的所有鸟类物种的物种和共同名称的更具体示例。

sessionInfo.txt:描述计算机规格，R版本，以及用于example_search_phrases的R包版本。R

| dataset_of_seized_wildlife_and_their_intended_uses。Rproj: R项目文件，允许在RStudio中打开该目录作为R项目

要连接的字段/列(列名用反引号' '表示):

-通过' db '， ' gbif_id '， ' db_taxa_name '左连接到02_gbif_taxonomic_key.csv

—01_taxa_use_combos.csv左连接到03_gbif_common_names。通过' gbif_id '创建RDS

-通过' db '， ' db_taxa_name '左连接到04_db_generic_common_names.csv

-通过' standarzed_use_id '左连接到05_use_search_words.csv

—02_gbif_taxonomic_key.csv左连接到03_gbif_common_names。根据常见名称(' gbif_id '， ' id_genus '， ' id_family '等)，将其左连接到03_gbif_common_names.rds的' gbif_id '

字段/列描述(列名用反引号' '表示)

1. 01 _taxa_use_combos.csv

—“db”:记录从哪个数据库派生。“wtp”代表TRAFFIC国际野生动物贸易门户网站，“lemis”代表lemis(美国鱼类和野生动物管理局执法管理信息系统)，“cities”代表cites(濒危野生动植物种国际贸易公约)贸易数据库

- ' db_original_usetype ':数据库指定的使用类型的原始名称(TRAFFIC, LEMIS, CITES)

- ' standarzed_use_type ': ' db_original_usetype '中描述的使用类型的标准化名称

- ' standarzed_use_id ': ' standarzed_use_type '中标准化使用类型的唯一标识符。该列可以连接到05_use_search_words.csv数据表，以获取每种使用类型的搜索词。

—“subcategory”:“standarzed_use_type”所属的子类别

- ' main_category ': ' standarzed_use_type '所属的主类别

- ' db_taxa_name ':数据库指定的分类学名称(TRAFFIC, LEMIS, CITES)

- ' db_taxa_name_clean ': ' db_taxa_name '，但清理以删除分类学名称的无关部分，如:"species"， "spp."， "family"。

- ' gbif_id ':用于识别分类群的唯一标识符。该标识符由GBIF生成。使用此标识符连接02_gbif_taxonomic_key.csv数据表中提供的分类信息和03_gbif_common_names.csv数据表中提供的通用名称。

2. 02 _gbif_taxonomic_key.csv

—“db”:记录从哪个数据库派生。“wtp”代表TRAFFIC国际野生动物协会