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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录

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    [LV.7]常住居民III

    自我介绍
    数学中国浅夏
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    1#
    发表于 2021-11-24 16:50 |只看该作者 |倒序浏览
    |招呼Ta 关注Ta
                                                                【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录) U1 \. r, k% V2 U/ @
    书籍:《R语言与数据挖掘》4 l/ O0 L% l- E9 C
    #(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat
    4 r  W% j$ h8 ?$ Xlibrary(reshape)
    8 i) G2 x4 I3 C! {9 w* tCO2
    / z$ L' j; O# A5 OCO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat"))
    7 S  c! H# m- O/ K  i' J  X' S0 I6 v  }1 i5 y+ `8 }
    #(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行& y* t! A4 v( v" T$ [: E
    > anyNA(CO2)
    % _# W! Y4 @) f: ~[1] FALSE
    ! m3 q" d7 C) t! I#检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]) ^' q& r* A0 {4 D

    - z; v3 E0 @! N2 e#(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)
    % v. m, {; x% B7 C#篇幅问题删除部分输出数据, p3 R; b4 w" B4 Z5 n. X
    > sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小
    ; ]% T$ D: s/ Z9 t/ h2 J! e [1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.79 d* ?% e6 I8 a) P
    [13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.4
    4 f8 w7 \) H9 X9 S[25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.17 ?& T. R! b* d; A, Q; D, n
    [37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2" C3 u! ~. {; C, N/ Y. t# Q
    [49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.9
    , ?* e$ A; c" T1 I> sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)% t% P" |4 l" U& d
    [1]  7.7  9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.6
    3 ~1 _& A. S9 V3 S1 ?[13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.1" }, V6 v4 K3 T. e1 H4 b5 K/ `( r& @
    [25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.8
    . O4 Z5 x2 M8 [" `* s# ~$ X8 d[37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.9% l& }0 B. R% H5 A# y
    [49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.3* s9 _0 U: I1 ]1 b, F; a

    ' `1 m% E" _0 z" J9 e( a6 a) i> CO2[order(CO2$uptake),]* g; O/ v& i$ u. |6 `1 M
       Plant        Type      Treat conc uptake3 g4 v7 U  C# |5 z, i
    71   Mc2 Mississippi    chilled   95    7.71 R- A5 A: \2 {6 s7 b/ w8 @
    29   Qc2      Quebec    chilled   95    9.37 G! X- _1 T% n# r# m
    64   Mc1 Mississippi    chilled   95   10.51 H' h' E, g  }* b4 y
    43   Mn1 Mississippi nonchilled   95   10.62 O% |( Y, T' x0 X
    78   Mc3 Mississippi    chilled   95   10.6
    " N0 N- Y5 z3 s5 ?4 x% A57   Mn3 Mississippi nonchilled   95   11.3
    + X6 J: }& b% O
    - I1 ]3 z: T' D4 F* C1 k# ]( p> CO2[order(-CO2$uptake),]
    7 }7 Q4 @8 c. F- x6 l   Plant        Type      Treat conc uptake
    ) u, F* l7 O+ f% W" n1 e21   Qn3      Quebec nonchilled 1000   45.5# X1 N) Z% p( D* g* F5 s
    14   Qn2      Quebec nonchilled 1000   44.3
    # M2 ?  b! i! M1 I. D- D5 ~20   Qn3      Quebec nonchilled  675   43.98 E- X0 {* A+ [" }3 x4 G. e7 k
    19   Qn3      Quebec nonchilled  500   42.9) W/ d$ H& [5 ]' ^- o) E$ |7 A
    35   Qc2      Quebec    chilled 1000   42.4
    7 H; E2 ^8 z/ R, e/ a4 [! X4 L* p# G2 _  r. }) p$ o9 d( q
    #(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:45 Y2 D: B2 ~8 U, z$ o# G, J7 B
    n <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4))
    8 R3 W7 m, t# V(sample1 <- CO2[n == 1,])
    * z7 F4 `# |2 v/ k2 q4 e(sample2 <- CO2[n == 2,])2 |$ K1 a! F4 |5 B, l

    2 n9 |+ G0 O: J$ F2 L. l$ V* t$ V#(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值
    ' `5 W6 G5 ]* H# F6 j& J9 s7 ntapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)" i! r( _( M! S( {4 T
    + o6 }+ f# w6 [
    #(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值
    4 V! y* ?- U* r9 S. Y" zaggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)
    0 D7 T$ ?9 z  d! H$ P. S( ^
    9 T8 _- ?/ e* O+ Q& l5 K#(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值
    ( M( G, v  F0 i2 v- Alapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean)7 [; y* O3 e. E
    0 h6 g4 c2 T$ L& M& Q% Q) n* Z2 n
    #(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中
    ; M$ A  S: N% r* ~Plant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)
    : w" g) y; [* a# uPlant_Qn8 w- |! \# u: R. w# q& m

    + t6 T; n! O( N0 N* A9 I; M( I#(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“. u3 P% m% W+ b* j  p. p

    0 ~  [2 H' A2 I) U- [% I7 a0 H9 T$ h6 Y, R2 l1 m1 [* f  g
    #编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度
      _( S1 _; c8 p9 T! a( E( C#生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……1 Q( h  `, m9 m7 q0 t
    gsub("[t]","t",CO2$Plant)3 k) t; N. t+ `2 s4 g1 u( p0 a
    0 x! g' [: F' z
    library(fBasics)
    * e. P* O: e# A, @stat <- function(x)4 Y* B  f3 T: \* {0 k1 Y$ t
    {
    , \  `5 P: v& D5 L1 d0 @  if(!is.numeric(x))
    ( \3 y' I4 n2 X% ^7 W  {; E7 l# A4 s3 ~1 N  j+ z
        stop("the input data must be numeric!\n")
      G5 ]' ^* u; f( y. z4 D; M( Z  }
    7 B2 M& g8 c% f3 S! V) |  if(length(x) == 1)
    ) i2 `# d# ~* a$ |  {, ]8 Y0 l* w: ?. F
        stop("can not compute sd for one number!\n")+ P: Q/ n. B+ W2 y/ k7 S: P1 @
      }3 b( F# @* n4 u9 X7 O
      max1 <- max(x)
    , W7 a0 R% U) Y' g8 d* C  min1 <- min(x)
      g( k* F- G, `. x* A3 r7 b  mean1 <- mean(x)" z* w+ j5 H, m) ^
      skewness1 <- skewness(x)
    + [* ~& D. G9 x- ]+ Z, b  kurtosis1 <- kurtosis(x)1 d/ N& |2 A; E1 v. l
      answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)
    " n; X7 v  D4 r6 w  return(answer)
    * B% h. ]/ N8 U* ?- X8 n}
    ! s  j# O# p7 j. w* f& C
    8 M7 G2 O# N& g4 ?: P. st <- rt(100,2). J! ~1 k9 L; @' A' \' p% f
    stat(t)
    & c# P' e/ `% B" e4 \' r% [& X7 R( z# N2 {6 B$ K3 O% s; K
    $ ^5 P6 Q* ]; j6 o$ Q" e3 S
    * Q* j7 v% L/ P- s* Y. Y, `) V8 j' b* [
    ) R4 w* B7 h) t; H# G8 h* z9 X
    zan
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