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TA的每日心情 | 开心 2023-7-31 10:17 |
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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录5 T, S2 O B5 x8 g5 U
书籍:《R语言与数据挖掘》
4 B: E, J1 g( _4 G- N#(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat
; l2 V* b ~9 d% M4 Klibrary(reshape)" C$ b k& Q- G: X- J, X
CO2
4 Y) k+ C6 L# [# K$ A( ?CO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat"))
; U3 z- e# j# w2 [' h8 h3 ?7 D5 b# U
#(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行
! U6 V# i0 Q5 x/ f9 _> anyNA(CO2)& `! t8 g0 t! F8 |! }: P% d5 X
[1] FALSE& w$ C; L$ V* B
#检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]5 l& l9 g8 {0 y) k
7 j7 B! a' N6 S3 o#(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)
g, J: L5 l. r! d; v0 d. |#篇幅问题删除部分输出数据- N' R; C9 M: y9 Z; }
> sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小
7 b: S' Q6 P- A# A5 _* |- }. ?( o [1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.72 Z6 G/ O2 W+ T; @3 g* i' H
[13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.4! @- Z( R# L6 c! G0 q
[25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.1
9 i( V2 a7 V! w& Y% g0 m& J: F[37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2" O( _; u! C. U/ S2 o" y+ ]! m
[49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.9
& }3 `+ F4 ^3 Z& z/ D8 f/ \1 i> sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)& N' b7 D$ R4 p0 L# ^9 a
[1] 7.7 9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.6, \' k1 b9 r$ a3 V
[13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.1
9 U' }- y0 m( ]5 r. G[25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.8( L7 H) R; B) B0 ]/ S
[37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.9
) ~0 ?) e J* H7 m d% O" \3 L[49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.33 i: r4 w) k# }0 G
+ D5 H5 @$ U8 l$ k> CO2[order(CO2$uptake),]
/ Y% t* h5 _* L. i; |7 X+ E7 p' q Plant Type Treat conc uptake0 g* F L& e: F6 p. T: u( m- \; \
71 Mc2 Mississippi chilled 95 7.7
/ v* G/ ], S4 B- Q29 Qc2 Quebec chilled 95 9.3
; N( p8 Q, Q9 `1 ^8 e; W Y& K64 Mc1 Mississippi chilled 95 10.5
( b7 V! z2 `6 N }43 Mn1 Mississippi nonchilled 95 10.6( O6 D* J+ `( i! z8 E; t" @
78 Mc3 Mississippi chilled 95 10.6! s0 w& n* |/ K
57 Mn3 Mississippi nonchilled 95 11.37 z9 \1 B, n9 w
. \+ m4 x) N# |# i M" g! z8 P# G
> CO2[order(-CO2$uptake),]
$ K( y9 {4 x- K# ?* ?4 x Plant Type Treat conc uptake
. k! [3 ]6 t3 U; F: r% N21 Qn3 Quebec nonchilled 1000 45.50 X+ r' V4 l# i: y
14 Qn2 Quebec nonchilled 1000 44.36 V+ P" y; A; w f3 C
20 Qn3 Quebec nonchilled 675 43.9
2 R9 W* h( S1 |0 K) ]19 Qn3 Quebec nonchilled 500 42.9
9 K/ _. e( F& l6 q% ?35 Qc2 Quebec chilled 1000 42.44 q1 a. {( M" l |8 m' I' Z
- A3 G' W' K# `#(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:4 p. a5 O- v, a0 @
n <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4)); ~- j( \# b. E' E
(sample1 <- CO2[n == 1,])" l" O% d7 x9 f) u
(sample2 <- CO2[n == 2,])
, y& [( H! ~" a0 U3 e9 z
7 D* C5 A9 ] q#(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值
+ O: \5 i4 v2 Y6 a6 Ztapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)
4 a2 N* \- s9 L' D3 Z8 h6 T6 p: J- B% o
% A, J; H H# u! K#(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值* A- E$ S! t8 q2 i, \9 u% k% u% K
aggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)
. s3 C8 b2 h3 B3 \$ q5 |5 y. O) n. N# c' F3 h5 h. ^
#(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值$ S6 O$ a; d5 P* b6 w6 O
lapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean): M* t9 o: s8 u' a
7 _( O1 i4 r: U; J- k1 r#(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中
, ~- e9 W5 k1 l0 c& NPlant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)
+ N% Q: h2 Z" i3 O2 o6 W* D8 q/ GPlant_Qn
# j3 ^% i, D t( l
9 y. K$ P; v: D, S' u7 h3 _, e; ^#(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“
6 c2 t$ D3 q+ c2 S( @- E8 a$ m" x' l1 N, q7 I
3 ~0 _6 x: k: m/ c1 z ~
#编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度) k; n/ A, N' L$ |$ l B
#生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……
/ Q: y; ^! ^8 R' dgsub("[t]","t",CO2$Plant)
% b6 _, R% O7 w! Z
3 Y6 k4 j+ v8 O: a# D# }0 Zlibrary(fBasics)' l* G' I# U% E/ s7 b- e
stat <- function(x)% ^# Y X2 Y+ B1 B. D
{/ u* `* E, `9 ^
if(!is.numeric(x))
. K. W# a3 w7 i9 h( S8 v. m( x: ^ {
% i; H1 z1 c8 Z/ W% \ stop("the input data must be numeric!\n")" r% f: V9 g/ \: j6 o2 L( i
}
9 y$ `. k. _, M, g# o6 q3 n if(length(x) == 1)
7 i" e4 n0 _) O- o8 y, m8 H) U {
9 g$ K6 m4 P5 o2 Y( y stop("can not compute sd for one number!\n")
7 c- A. s5 K8 u0 T2 a6 f( I- b }
+ o: w6 q# V& |# X1 t max1 <- max(x)6 A6 W, K- D" g0 t& W& |! p; ]
min1 <- min(x)" ^' d0 e2 o1 B. c
mean1 <- mean(x)
1 [ ]+ L7 Q5 |! q( k; r& h! g, O skewness1 <- skewness(x)
3 d* _. J) D. }1 [ kurtosis1 <- kurtosis(x)8 g8 R0 Z& j8 ^9 [' v4 p+ Q o
answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)4 P+ [8 R/ u o6 ]5 S* y
return(answer)
" n z+ p. _2 `$ X: [}
0 x/ h7 `$ M- x3 b$ Y! m
2 p/ c& Z* e6 u2 F% nt <- rt(100,2)6 |- Z4 c h# X% a
stat(t)
. p" e$ D% {6 l/ \) J
9 d" L' X9 m, c0 G' c
* B& r+ s) e6 n5 `
9 k% M( g5 x8 n# ^5 p' v3 D! ^/ J) ^- H; M
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zan
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