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TA的每日心情 | 开心 2023-7-31 10:17 |
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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录9 _# G J0 m% J4 C. O9 p H' |6 I
书籍:《R语言与数据挖掘》
+ n4 W$ r% ^: I9 ~0 }#(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat4 u, d5 W- a. d( ?
library(reshape)
+ i6 P* q% D2 o9 w; @CO2
5 u3 s Z: s5 V" f, }, Q+ d5 U7 |CO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat"))
% Y1 p7 {4 m" `$ |* p& C
% Y0 O9 J) |- } D5 n( [#(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行
9 Z( \6 B/ n- F% C2 u& v0 v! w> anyNA(CO2)/ H! ~. }- p* q: v+ S6 J. V
[1] FALSE
2 p" m* X- W; ^( T+ V#检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]
+ y1 }( \1 n+ S/ B/ t) w" v0 U) t
: _+ \, _/ b ~' L- |' T- o4 y* S#(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)* R5 A% B# {/ I: ` }" o$ |$ U, f
#篇幅问题删除部分输出数据
# L( ~ V$ A% Z) B7 w; w& u> sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小$ J* S$ c2 G8 F p1 M; o% v
[1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.7
5 R# e m: b3 C$ a7 J0 P[13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.4
' X5 I# J4 t) h7 z" ?[25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.1
9 w# X* t& D! B. q7 I[37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.26 v+ i5 o/ A1 F& q
[49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.92 O$ V2 N" P/ _3 f
> sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)
# G" X" M/ N9 G2 T5 l5 H, n [1] 7.7 9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.6
# e- c+ L2 l" N[13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.1% d# ^. d2 k- z+ w
[25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.8
) a! J5 z6 ?9 O) C2 g: d' c[37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.9
0 y5 `% Y$ u( d7 T[49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.3
/ k# v% E2 `0 I" ]7 h, \. f9 F1 ~1 X @ r8 `) [ g% E5 ]
> CO2[order(CO2$uptake),]
2 o+ Y2 }4 ]* l Plant Type Treat conc uptake' Q2 e7 h7 k7 U4 C5 d+ z
71 Mc2 Mississippi chilled 95 7.7; a) _/ v- I; u1 C* \+ x( j$ e
29 Qc2 Quebec chilled 95 9.3
2 A" w9 j0 { [- g# V64 Mc1 Mississippi chilled 95 10.5" S7 p- d4 U% D# z
43 Mn1 Mississippi nonchilled 95 10.66 t( L% S- Y1 G% }
78 Mc3 Mississippi chilled 95 10.6% }6 y: v N* e) q
57 Mn3 Mississippi nonchilled 95 11.3
" }1 u: h2 Z D/ k! f
* B, F- n* x5 `/ S7 Z> CO2[order(-CO2$uptake),]
+ ^* e( P, _; {: b4 M# q5 i" |' k( f# q Plant Type Treat conc uptake1 m9 F v7 @# J9 `8 t
21 Qn3 Quebec nonchilled 1000 45.5% A0 G: a' C0 r: Q6 [6 y# f3 f
14 Qn2 Quebec nonchilled 1000 44.3
- c! Z& p, }4 I7 h* ?8 P20 Qn3 Quebec nonchilled 675 43.9) R' }, x, p' M" F
19 Qn3 Quebec nonchilled 500 42.9; u% |5 ^$ ~6 k4 {4 E
35 Qc2 Quebec chilled 1000 42.4
" c8 O) C) ?9 r V9 T
/ d! d$ g- v3 E/ p: @/ Q) V#(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:4: v0 T2 {# U' K+ D% [; _, |; M
n <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4))7 V6 u# e8 U0 Q
(sample1 <- CO2[n == 1,])! ]! D' N- r. Q0 k% A7 Z
(sample2 <- CO2[n == 2,])% G8 n% r1 x. ~' b5 q, B8 A' r' n
! g; i; @- U, I' `' }#(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值1 u3 d" h/ E. {* N: ~
tapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)( l, X1 R; Y7 W# z5 q' |
_" C9 W3 S. E% r$ J1 k0 P
#(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值. q/ E! R$ M# x' y9 H4 G' e& \
aggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)' y! {5 }4 b6 d1 f) n; C: P7 n. s
% O& L* n: e. ^8 h7 J0 A
#(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值
8 k& [( g& y5 A0 Zlapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean)$ D6 v& r9 F/ n4 \ e
( K/ e! ~$ x- [& }8 O# ?+ @( h1 W
#(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中' T2 Y9 I/ U+ {/ g+ W3 `
Plant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)! K. a0 \6 H, V% \
Plant_Qn5 w, U+ m! R2 L& n+ E+ N
% m9 r& l. l/ c: @. B, m- m
#(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“& Q T6 g% N o8 F
( U* s% G( l5 c; G f
. b/ ^& q6 [6 N K9 {! }% V' I#编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度+ T; N ~5 o2 ^* h" o; I. V
#生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……* [" I2 [; t W3 H8 ^, H
gsub("[t]","t",CO2$Plant)% u: r' w' K" `3 \, m9 W
* u% ^, A+ O" N# {. l
library(fBasics)
. ^; y8 V: l7 fstat <- function(x)
3 j" u% F" `2 T& P5 C4 @5 D [{1 t& Y+ I9 [( {5 ?5 K7 V% N
if(!is.numeric(x))
& L2 u: h i- P3 T' ]! I {6 r: M( `) ?; }) Z+ q; \
stop("the input data must be numeric!\n"); E5 ]* a3 Q# I- @6 M
}
$ E2 f& N: D6 q8 p6 k if(length(x) == 1)! \. F+ {) O2 i2 r2 g l9 {
{
9 u7 I3 m4 a8 H/ @3 ~% D; l stop("can not compute sd for one number!\n")- f# q0 i+ R$ V% [7 P( r6 |
}- H& P/ \) m4 g$ s5 w
max1 <- max(x)" [) W E3 Z3 u1 x$ I
min1 <- min(x)
2 a+ A" D: u7 E2 J! x mean1 <- mean(x)
2 U( C6 m& q% z% U0 r# g1 @5 ? skewness1 <- skewness(x)) ^% |( |6 B1 R; m ^
kurtosis1 <- kurtosis(x)
2 [$ c# I# U6 p( f& @% U answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)6 P: `' I2 D! L: _/ a
return(answer)2 g! x! c+ \5 ]" T. H4 w; ]- w
}, j4 r1 m l+ E7 a9 t6 f* ^
. u+ F6 n c2 D# c. B p3 O( X! pt <- rt(100,2)
' L7 ^# j8 X- L$ p2 D, a' qstat(t)
+ |1 ]9 H! i/ K$ g; }- K' n; Z' b: m
3 ^8 r5 Z8 u+ m9 u, G- Q' _8 m& O8 W
. k' }. K1 {1 H
- V3 A2 j* E- \% b& E5 Z3 F |
zan
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