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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录

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    [LV.7]常住居民III

    自我介绍
    数学中国浅夏
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    1#
    发表于 2021-11-24 16:50 |只看该作者 |倒序浏览
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                                                                【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录
    5 Q% X! Z0 p8 z: p, e: X  H书籍:《R语言与数据挖掘》
    " ]/ j7 |1 e/ D0 r2 B9 h4 D! U#(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat0 m0 _; u7 M/ |; |1 C
    library(reshape)2 ~2 _4 G! S* `0 s$ ?1 ~; @5 b. _
    CO2! Z" `& _- F, S' e
    CO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat"))) G9 f( [& p  ^& j% j5 _& |, V
    # m2 W% o: D+ C/ k+ m! T, T4 y
    #(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行+ ]. X8 M! m  G" \
    > anyNA(CO2)
    9 s2 a% b' Z5 ~# {0 }; n7 y[1] FALSE
      P+ k0 q2 Q! [0 K* B7 N8 j4 O#检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]  R1 N% C: V2 B) |( T

    3 }, a; g5 `; ?9 H6 r' N9 @9 }% u#(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)  U. I& d$ j& w, |, N
    #篇幅问题删除部分输出数据* Q" g% e" D, n9 J. n
    > sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小
    % e; |+ |1 G; X8 C- b3 l [1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.7; _6 N4 C4 {( K! e7 p' C1 V
    [13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.4
    / `) `+ B- |8 a[25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.1
    + D( G; u# ^. `6 W# {2 p! Z[37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.22 _9 C, k9 a- M
    [49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.9, ^5 L5 j" n  S- B
    > sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)
    ! n( t- U3 g: ?+ Z- ? [1]  7.7  9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.6* E4 M1 ^# f: p
    [13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.1% s7 |% x+ J' t0 b' {, m7 [
    [25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.8
    6 W$ ?5 {( E# X0 [5 B) W[37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.9# M5 j) z  X/ t) p/ L9 J: n
    [49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.3
    2 C+ v9 u8 V8 R3 e
    , x8 n( Y: b. w6 g$ ~( `, s> CO2[order(CO2$uptake),]
    $ ^6 `5 u' A+ i; S4 t   Plant        Type      Treat conc uptake
    . O/ p! z$ D" a: C* z0 t1 x, J71   Mc2 Mississippi    chilled   95    7.71 S9 k; Q2 f2 ?; X  V6 g+ Q
    29   Qc2      Quebec    chilled   95    9.3
    & i" r3 I0 R2 G4 N# w7 a4 z6 ^- ^5 T" V7 `64   Mc1 Mississippi    chilled   95   10.5: C( e7 n4 L+ m! K7 J1 D
    43   Mn1 Mississippi nonchilled   95   10.66 L& z  Z3 @% y) J! m! S5 N8 X
    78   Mc3 Mississippi    chilled   95   10.65 R- K' q7 W+ H- U6 u/ a# d" Z
    57   Mn3 Mississippi nonchilled   95   11.3
    0 R: q; b7 r$ D7 k
    8 E% h. W7 t- d" B9 l5 r2 z> CO2[order(-CO2$uptake),]
    % Y! \/ `' W) l. A   Plant        Type      Treat conc uptake
      O0 B4 c/ _: }! }21   Qn3      Quebec nonchilled 1000   45.51 v% D! I* d( c% w  I5 u
    14   Qn2      Quebec nonchilled 1000   44.3
    ' E$ h2 M* a, j9 p20   Qn3      Quebec nonchilled  675   43.9
    / ^  _! p; S1 C* z( {7 }4 p19   Qn3      Quebec nonchilled  500   42.91 f' H) w; c- D% j
    35   Qc2      Quebec    chilled 1000   42.40 y: [% Y1 Z/ f, H% W/ g

      h1 |/ Z8 F% F) }$ y7 l. l#(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:4; _1 \5 Q0 t3 O6 f
    n <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4))1 t+ i' o2 |9 G5 U1 U
    (sample1 <- CO2[n == 1,])8 A# A$ p* W4 ^0 b: l0 i; y% w
    (sample2 <- CO2[n == 2,])) X0 h( ~" W! s: o; F! _: w

    . I/ E; N( a3 `6 d; e6 f3 l$ [#(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值
    ) `' V% @3 r' ?1 `7 ]/ ]tapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)4 s* F" U" w; A7 {, e2 Q- K& d

    7 m7 e: |3 V9 G8 b5 ^1 T. I; C. C#(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值
    3 c1 E. V! ?/ C. D/ c3 g+ ~0 y( yaggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)8 R6 q' q* i, R/ t$ G
    9 x# r6 h9 l/ n# ]8 |
    #(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值4 s. V+ D; [% F2 m3 A+ i9 w
    lapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean)
    3 Q; ]0 D0 Q( y8 d; c5 T* Y
    ! {  g# e* d$ Q2 Q' ]1 H2 _6 L% ~2 L#(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中+ Q* `. t$ ~: z9 X$ g
    Plant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)
    1 |4 C! O% f6 z& g9 gPlant_Qn0 w9 D+ P* ?& u1 D

    , j1 `. h/ n2 T#(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“/ r! s' y9 o2 \4 Z" `; e" G3 u

    ) D5 T9 r* d# e2 `* Z) v+ P8 q; Y- q8 h9 V
    #编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度
    9 s: h- G7 j: V( C3 Y#生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……
    ) W% w4 Z4 d  Wgsub("[t]","t",CO2$Plant)
    7 Y4 m9 Y/ k8 X6 q( e: Y
    1 |  @+ H) ^! y- e6 ]( _- o+ Zlibrary(fBasics)& l% |, i) p1 r, \% D- r
    stat <- function(x)
    7 \, y5 ]* ~% A0 }3 H# u' j{
    9 W, F; a; V4 Q5 ?/ T  if(!is.numeric(x))+ e9 D7 t. Q8 J  U2 q; A* D+ s
      {1 ~' M! D* K' Y0 m! [& @  U9 B3 a  W
        stop("the input data must be numeric!\n")
    $ b* w5 Y7 L: e  O" O. P1 g  }
    * v) h4 f' e8 L- f3 j6 P  if(length(x) == 1)
    8 s5 R* d% G* ~+ ~+ a9 \: B# ?1 }  {
    , \  m2 E) l1 h9 w& U) ^+ v: Y    stop("can not compute sd for one number!\n")9 k5 m- }* x! W7 u% P3 D
      }" _$ p  ~# S) ~4 l; u" Y  U
      max1 <- max(x)
      n$ x3 M1 k4 B5 P, {  min1 <- min(x)5 s3 o# g5 K# M. o! ]2 Y' x2 {
      mean1 <- mean(x)+ I) m  {% j1 F
      skewness1 <- skewness(x)
    % ~, A# e& u! I0 v0 m- B  kurtosis1 <- kurtosis(x)
    ; }5 [5 i/ U$ G0 m8 }# i  answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)4 Y) C+ \" `' |3 }) C
      return(answer)7 Y' o. T. G! r6 ~+ z! S" d
    }% P8 W1 D4 m8 Q: Q$ C! B! j# r

    3 ]1 }$ o/ u* r) Jt <- rt(100,2)4 j8 J7 r5 t5 j7 \) \) G
    stat(t)0 R2 r( @) m  g$ X

    - l; `6 U& U; z( E
    9 Y5 E. H" G3 I$ P/ }
    # v6 D+ S/ p3 \
    * A  x; A$ c2 \: c% B6 G0 N
    zan
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