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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录

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    [LV.7]常住居民III

    自我介绍
    数学中国浅夏
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    1#
    发表于 2021-11-24 16:50 |只看该作者 |倒序浏览
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                                                                【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录8 Z- \5 S1 o* v3 l& ^6 D8 y- G
    书籍:《R语言与数据挖掘》6 j5 d8 o0 L" {  x7 M! J
    #(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat' L' y6 v8 k) w9 E+ U
    library(reshape)
    ) S. q6 N  d+ f* I2 XCO2
    7 X4 F% X4 g/ T/ E# z/ V! E& [2 Y  oCO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat")), q. ?- S& {! s7 C

    % `& l" k' P- J; {#(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行4 \0 L9 F, s& {4 K" v2 a( n# \/ U
    > anyNA(CO2)
    0 e% E- G0 M" X- W[1] FALSE3 i8 i/ Y/ U5 m/ V. e
    #检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]% j& Q, z$ y+ G' t  y) s
    % t, u! U3 U% n* Y* t
    #(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)
    ; U. ]) T' `) L  j- h* W#篇幅问题删除部分输出数据
    , m+ [% P, M9 ^! d5 h7 e# L3 y. ]> sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小6 E' ~: E" O' y/ p$ q
    [1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.7( v* n! i/ q& G3 j
    [13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.4
    5 ^. p0 o0 @4 v/ X; e+ n[25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.1
    2 Y- m+ q" f* \7 {% L5 N* h[37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2
    1 k. R. j, [3 s( v1 f[49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.9! ]& L4 F* d2 R( F
    > sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)- t9 F3 K9 r" d, m  w& W' `
    [1]  7.7  9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.65 h' y. `' b2 w0 ]  a6 E, N
    [13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.1- z. L9 R- J) n8 q( `9 ~; M
    [25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.8
    8 R5 s, J9 n3 }6 a[37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.9
    , g' l  @/ k+ W7 j[49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.3
    , [5 @" [  g0 S$ ]# f1 N# h) j" ~2 m9 b4 R
    > CO2[order(CO2$uptake),]
    * d, g- t  R) `% J# H   Plant        Type      Treat conc uptake% l. W3 R4 M- F& }& z3 V
    71   Mc2 Mississippi    chilled   95    7.7
    % N3 {8 M: }' _5 n4 l% i* p* k29   Qc2      Quebec    chilled   95    9.3& g& }' u. h. Q% V) l# ?# p9 l
    64   Mc1 Mississippi    chilled   95   10.5. `: R  c$ I  \/ g- F4 B. c
    43   Mn1 Mississippi nonchilled   95   10.64 h) [% m( a: z+ S
    78   Mc3 Mississippi    chilled   95   10.6
      I5 K$ g6 B! i57   Mn3 Mississippi nonchilled   95   11.3
    / h7 {& V1 l2 i: b8 g' I
    3 _! {8 F/ A, ~! M' V> CO2[order(-CO2$uptake),]6 H" r) {/ u) a
       Plant        Type      Treat conc uptake+ Z) w  e5 }, U, }
    21   Qn3      Quebec nonchilled 1000   45.5
    2 _3 a  @/ g* _: Q7 J* o: j$ f$ i$ H14   Qn2      Quebec nonchilled 1000   44.37 i9 b; u7 H7 ~1 H5 i
    20   Qn3      Quebec nonchilled  675   43.9, N1 g# G& j- |
    19   Qn3      Quebec nonchilled  500   42.9* L" B) d/ {3 T
    35   Qc2      Quebec    chilled 1000   42.4/ u+ `2 l  \0 M3 s! z/ b& t

    5 a% e) w! m3 K% y2 m7 o2 b#(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:4# R4 Z% t& C; T& G: V
    n <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4))) V. ?' O/ ?2 U
    (sample1 <- CO2[n == 1,])
    ) m# ?7 D! C) \; v7 W(sample2 <- CO2[n == 2,])
    : D4 }, j) D  U- j; L
    , c" F9 m* o$ w, }9 f#(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值* q- ?- h, @7 d
    tapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)2 R: v: r8 C% _8 d; [. N

    7 g0 K( r/ x( q( x7 f#(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值
    6 z. M# \2 P/ y' raggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)
    ! v/ @! i' K3 ]6 g% t6 {8 U9 m  f1 n! e9 D
    #(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值  ~: ?# F$ m8 y) m6 y5 u9 s
    lapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean)( p5 D$ E3 [) I/ [. d# {

    0 j; W" \* u2 d  |4 ]#(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中
    ; }- W4 i- b! Y; d) W, N+ \Plant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)' `+ }& S$ F5 r8 E5 h1 G5 g# U
    Plant_Qn( Z# g. j+ o+ F- F# {6 t' q

    3 K% _1 ]3 v" _4 p8 I% K' U#(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“
    1 R# K% u# V/ e% h
    7 Y0 l! [  i0 ?4 t+ d' U; @* o
    7 h9 d' Z0 s+ a! R1 P' T( e" _#编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度
    " ?+ t0 g9 R' p/ o9 w#生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……
    9 F( `$ f3 W/ N- h6 c" xgsub("[t]","t",CO2$Plant)7 j( {& m$ x: X) Y4 v

    % \7 @- z3 s6 k1 h7 V5 R& H) flibrary(fBasics)' g+ j  [7 a& D% c
    stat <- function(x)0 Y& v: o7 w2 m9 D/ G
    {* x* k) q2 k' j# d, }
      if(!is.numeric(x))
    3 X$ x+ q+ w4 J# j3 m; k: M9 D( b  {
    : S; }3 H' I2 A    stop("the input data must be numeric!\n")
    % W* Q3 N; k3 {# K! _; C  }
    7 K1 O2 n4 C+ i) ~$ D6 ?) T  if(length(x) == 1)
    + t: v  }( l" o( `1 k# L  {
    6 D4 g& P1 g- V2 _  E5 @2 w    stop("can not compute sd for one number!\n"): C* I$ m5 Z4 G' Y. a) ?
      }
    9 i: H% w: q' K0 u  max1 <- max(x)- e4 W5 \3 p! r) T! V4 D
      min1 <- min(x)
    - E! o$ N9 \* f5 s% ^  mean1 <- mean(x)$ s! J. I! j! q' U, w* n* N
      skewness1 <- skewness(x)
    + j) i1 Q* p, Y5 a+ l1 s2 R  K. O3 s  kurtosis1 <- kurtosis(x)
    * L+ s( K2 k# m1 E9 Z8 R) ~2 q7 F0 F  answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)( `; {, \$ h' |: {' U! u; C$ \0 i
      return(answer)
    6 |" R- J$ r$ _' c}+ h" z: ~( m' n$ R
    ! x. }7 U! k/ L
    t <- rt(100,2)
    8 J4 w1 n( @" ?$ h. Ystat(t), r  z: l) T/ ]6 ^) T' _$ w

    / I4 R% o( {! W' @5 O8 Q" z  J
    $ s" e* c/ N' @, i0 x2 l/ Y% h7 J8 x4 X' c0 G$ y/ w
    - N5 d' q! t# v: j- m7 i
    zan
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