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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录

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    [LV.7]常住居民III

    自我介绍
    数学中国浅夏
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    1#
    发表于 2021-11-24 16:50 |只看该作者 |倒序浏览
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                                                                【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录
    2 B& \# l5 R/ c4 g4 r" `书籍:《R语言与数据挖掘》
    - o" C& x; t# s; ^#(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat$ H- ^1 v, s! D4 a9 p  a0 s7 {
    library(reshape)
    # _0 K" H# F2 \5 _CO2
    8 z( [4 ^: f3 W8 c" L8 }CO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat"))/ B6 f6 ?) ^6 g: z

    " j( K  q$ H' w8 v( }6 n; x#(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行
    4 @% K: T( _0 y1 H> anyNA(CO2)
    6 L0 p0 H% g6 }4 {8 [' e[1] FALSE8 w! K; K+ d# J6 o& U7 F5 f8 U
    #检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]" u% H: D+ H$ O; P$ c: b% K0 R
    * n& B( e1 Q1 a! b4 t; [
    #(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)4 ?3 U$ Q8 C5 h- z: Q8 h
    #篇幅问题删除部分输出数据  \+ w4 T+ H5 H# [4 H0 D; W: l3 t
    > sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小4 }; |  d$ ?, O* }8 c
    [1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.7
    , }& a% e. _+ E5 l' e[13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.4
    4 c9 j7 S7 D$ r! ]7 v' D8 m[25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.1
    ) q# i+ F2 Y/ Z3 `: T4 m8 q* a% D[37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2
    4 P7 m0 i- w: ]0 B[49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.9
    0 F) \. b9 j+ j$ W3 r8 t( N4 ?> sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE). c2 _$ t! J3 i
    [1]  7.7  9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.6
      ?6 R# X( ^% U( @1 t$ W[13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.1  @6 _* L# e9 C( e
    [25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.81 U% ^1 X* _4 p+ z$ y' {
    [37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.9
    8 N$ z5 u, b5 L1 E9 r- K2 X, P[49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.37 U! r. z6 L6 B2 p( x
      N' {, u6 G6 F
    > CO2[order(CO2$uptake),]/ \5 ^7 s% W5 x8 m. o: |" ]
       Plant        Type      Treat conc uptake* V& Z0 v+ W- z3 b$ P
    71   Mc2 Mississippi    chilled   95    7.7* T" V+ w: T3 Q+ F# y/ j
    29   Qc2      Quebec    chilled   95    9.31 q% w7 R5 H/ S5 {3 R: x
    64   Mc1 Mississippi    chilled   95   10.5( {/ j5 H7 U. B1 s! M% ]; W( ~/ x5 t# [
    43   Mn1 Mississippi nonchilled   95   10.6
    . ~6 H5 X9 x& H5 B0 @& I78   Mc3 Mississippi    chilled   95   10.6) X* d! q. Z. v0 }6 m! |
    57   Mn3 Mississippi nonchilled   95   11.3
    # y. R7 R4 }  M9 t3 d5 }+ x0 J3 e' d1 y: o0 ?
    > CO2[order(-CO2$uptake),]
    3 T. o1 `% k4 P   Plant        Type      Treat conc uptake4 y2 z8 V" G8 C! I
    21   Qn3      Quebec nonchilled 1000   45.5
    : |4 J4 F. i5 t4 x14   Qn2      Quebec nonchilled 1000   44.39 m/ K7 H8 t% m, {8 q" ~
    20   Qn3      Quebec nonchilled  675   43.9( O" A; W; [2 J' |  s4 Z! A
    19   Qn3      Quebec nonchilled  500   42.9- t* L; q) r; I6 o
    35   Qc2      Quebec    chilled 1000   42.4
    6 V( o. r2 R) z# O8 V1 i+ P; o3 {
    ! S5 {, r+ O1 S7 [7 w4 j#(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:4
    $ s( K% I: U" X- An <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4))" [+ M) e* H* e
    (sample1 <- CO2[n == 1,])
    - G3 u) {5 ^+ u' u. r(sample2 <- CO2[n == 2,])
    $ n( T7 v) r! G+ Q; p' B
    4 s3 D: w  T% x9 D1 U% I#(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值& T% ?+ K+ i% i& q" x. `6 M
    tapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)9 ~2 N. d3 R! h* ]8 L
    % u; g: B* a; u3 y7 |0 i9 B
    #(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值
    & Q" a  o/ T: l! T# u5 Yaggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)
    , T9 c: ?, {1 S- U* r
    5 |% C: I5 F' G& ~#(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值
    / G3 S, R& {$ T+ W* M) a. Wlapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean)
    * ~6 R' G' @1 c- N3 b% s: Q7 d$ y
    / X0 u4 g- c! c/ ]; a* g, n/ Q#(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中# V3 r8 t% v0 ~1 E
    Plant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)7 L: ~) }" L2 J& y2 H  H7 k' b
    Plant_Qn* @0 i6 m; _- P# l' _

    ) n) J5 M# L; Q; |' c& {9 [#(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“, L! L2 X- x$ ?! `: `+ ~8 L
    ) |/ A+ f0 N( k6 N

    - e- o& f% E$ f" u& x3 l#编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度; b. v$ D0 s9 X) s9 ]# r
    #生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……. n- W5 d5 O8 d0 w( t
    gsub("[t]","t",CO2$Plant)* x0 C6 y& _6 K# C

    ! @0 F* U0 V( @. A$ @8 r3 hlibrary(fBasics)
    ) S( i+ M& ]3 A. U4 T1 Pstat <- function(x)
    7 M$ C' u- o! R& N" H) {- Q9 K3 a{. Z5 E7 P9 R3 U" T9 Y# a2 r) O
      if(!is.numeric(x)): J. x+ S1 r# f' y
      {
    ; z6 T- u0 V) h- D    stop("the input data must be numeric!\n")  w* y9 V6 \0 i1 ^6 T
      }
    1 A* z8 W$ l# l9 k" I: b  if(length(x) == 1)
    , ]( J( U/ X" L1 F  {
    / m2 o9 A1 [: F( s    stop("can not compute sd for one number!\n")5 ]0 B' Q) i0 ?: R
      }+ e" O! w/ H. X- G& O+ s# N
      max1 <- max(x)  F/ n1 D5 R  p' b
      min1 <- min(x)% q- x( G* W" [. p& a0 X' ]1 \
      mean1 <- mean(x); F) k6 k$ [6 [9 B. k
      skewness1 <- skewness(x)
    8 g/ j- k$ K4 Q8 p) {! P. ?$ |% s  kurtosis1 <- kurtosis(x)
    / B+ B, m6 j; [! y. I2 i# R: h  answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)% s* H2 |" Y0 F1 s
      return(answer)$ _7 Y3 O3 Z; P; \6 z, v3 P' B
    }- `6 y/ v. b* g
    & y9 q1 |* l7 ]1 d& y" N
    t <- rt(100,2)
    2 C- Z1 N2 s1 I1 B( [stat(t)
    * X% Z+ t$ H9 P4 c, O7 H
      a7 V8 l  M7 s6 M& F- J& y; g8 a( p7 U

    # X. L& f7 K. b  _/ T8 k
    . T0 S+ `2 d$ r& d# v
    zan
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