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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录

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    [LV.7]常住居民III

    自我介绍
    数学中国浅夏
    发表于 2021-11-24 16:50 |显示全部楼层
    |招呼Ta 关注Ta
                                                                【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录
    2 ~) K( E9 [1 s, W& V8 `2 b书籍:《R语言与数据挖掘》
    % ^; n9 ^  v; X% e9 k' g#(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat/ B# `# b# j+ I. u6 U# ]
    library(reshape); ~8 |( {  m0 `: _, H! d, L9 Y8 {! J
    CO2
    ; n3 M$ K' ~7 N! qCO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat"))
    1 o7 W3 A, I4 b- u" s" N) v* ?4 Q' ~8 t- L2 F* d
    #(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行1 f( R# Z# ^) V& ^& B, c
    > anyNA(CO2)
    $ B- @% a4 R8 J& \/ }[1] FALSE. `$ b7 e+ W/ x( x) `+ O* J
    #检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]
    4 G3 d- G! S, l% Y  \" D) p/ B7 V1 h5 }: g( V
    #(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)
    8 m6 y1 `4 o' G/ `#篇幅问题删除部分输出数据
    0 M9 w, h) C. U( I) b: N> sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小5 m& {4 M  H& n/ p  U2 {: {' Z8 c
    [1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.7
      m' R/ G6 I. \[13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.4
    # e, M2 Z: ^& _2 _( a8 K[25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.1( s" ~4 V# \% w, d% R
    [37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2% W( |, P- p4 P0 s9 S4 \' S' ?
    [49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.9$ I/ Q/ ~4 L$ V; H& w8 g8 Q
    > sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)
    ( e0 F+ t5 w; k0 G; p [1]  7.7  9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.65 i9 D8 x0 s' J
    [13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.1
    6 u/ E- x' P3 H+ l9 O/ b  G[25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.80 n1 S9 V) W" b( Q
    [37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.95 \: `' k# a% E( }  M% p
    [49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.3
    7 S4 B$ G3 N0 C4 t4 ?: q, c
    ' u  ~$ i; D& d  V> CO2[order(CO2$uptake),]" @6 T. Q: b8 V- `9 `9 N
       Plant        Type      Treat conc uptake
      Y  J% L/ P* V, ^9 r  X71   Mc2 Mississippi    chilled   95    7.7( C* h( F3 Z2 P5 j9 i% m
    29   Qc2      Quebec    chilled   95    9.3  m4 V1 U& }0 [3 ~; v, Z  g3 R
    64   Mc1 Mississippi    chilled   95   10.5
    * {3 j1 p; U1 r! e7 W* d( R4 g% _+ I43   Mn1 Mississippi nonchilled   95   10.6
    6 P' i. r& a/ g1 o' [" o# b78   Mc3 Mississippi    chilled   95   10.6
    3 h/ b' ~- `! c57   Mn3 Mississippi nonchilled   95   11.3
    " i$ i/ |. e# I0 l6 z7 J% z) q( g! W# \4 b( o/ e
    > CO2[order(-CO2$uptake),]
    9 }5 ^+ p* c, s+ p! c7 A' W   Plant        Type      Treat conc uptake
    7 N0 }8 f; }( \. i; s9 e21   Qn3      Quebec nonchilled 1000   45.5
    3 b- L- x+ s. c% [: g* G0 k* K14   Qn2      Quebec nonchilled 1000   44.3
    8 K7 A; u, S# \2 P: {& |0 y6 O20   Qn3      Quebec nonchilled  675   43.98 C! Z5 \! C2 {. ?
    19   Qn3      Quebec nonchilled  500   42.9
    / o% y& z( @, q9 ]& A35   Qc2      Quebec    chilled 1000   42.4, w) f: ~5 {. E+ Z/ K& j
    & ~* ~, o+ I) z* n7 i
    #(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:4
    $ a8 y' W& |3 U# D" vn <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4)); f& G- m4 o: [- y8 q. }0 B9 D: r2 Q
    (sample1 <- CO2[n == 1,])% ]+ L3 o# j! @5 l
    (sample2 <- CO2[n == 2,])( p! X5 c1 S% @4 G* ?/ w0 R* A& i

    8 T) d" q5 G6 j: N. y#(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值
    7 w" b1 a/ N* T/ a% f  f& k0 ?tapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)0 h0 P8 F1 a9 y" i
    ) V" n& U' }3 o& t, H
    #(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值
      |2 o) ^# H1 g' P  r/ \: f+ T2 vaggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)
    . |9 x9 d7 b1 D8 t, |# U3 |
    ; M( K7 k+ P5 }#(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值0 @# ~% |2 d8 y' P9 y4 H
    lapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean)
    / @+ T, d: \. t  S1 K" c3 M( ]1 I7 n2 i, Q3 Y2 \
    #(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中
    : P4 q/ Q) M- |5 r) f$ V0 q) IPlant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)
    7 k7 P6 b5 ~0 o% N0 GPlant_Qn, }, p$ `2 P7 u+ y4 v

    + z' ?" v& `6 O/ e#(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“
      s4 E% N: r) K, l9 N, @2 x3 Q4 G5 \/ Y- V$ s
    % k6 o/ }' w& N$ J* W2 o
    #编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度! @) `. {7 F* i. W
    #生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……
    9 g; l  M% `9 p: \gsub("[t]","t",CO2$Plant)% ~+ v; W$ _$ M: S( K$ J) c9 V

    9 ~. O3 m0 v8 W' n0 k* V0 G) w2 nlibrary(fBasics)" J( u8 L& a/ @3 _' d: r
    stat <- function(x)
    0 A$ ?3 _5 Z9 Q, N7 A0 \7 }0 B" j{5 ^6 B( r, b  k( [6 w
      if(!is.numeric(x))* ]& s  }( d" Z
      {2 M1 r# s0 W7 E% f
        stop("the input data must be numeric!\n")" `5 D7 v0 {9 {. u3 a0 v9 c. M
      }
    / A/ m+ ^; n3 d4 U: `+ w# F  if(length(x) == 1)
    8 `0 D. B" B: B0 R  z% @8 D3 T  {
    / L- t$ r% x( V  q) h0 {    stop("can not compute sd for one number!\n")
    ; R. N: c) k( u8 Y( T3 w$ K7 ?8 A  }* T* _/ n% H9 O8 ^, o8 Q" Q
      max1 <- max(x)
    ' L6 w9 b2 i3 {) J; D  min1 <- min(x)
    3 p# z! V) ?: h) O! x& `  mean1 <- mean(x)) r/ K! C( ?: t: Y9 i) t
      skewness1 <- skewness(x)6 q0 D% m, q  f" _% R" _
      kurtosis1 <- kurtosis(x)* c" S1 _9 h- ?+ w8 {2 E- o
      answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)4 n0 ~; S) d& c* A
      return(answer)
      ^7 {% m6 T3 [' d: b3 D}
    ! M# ~! h* h+ }  }7 H! B! t
    + m# _- d" s, e1 Xt <- rt(100,2)% g' e- ~) [" w7 v9 I) E" s
    stat(t)
      Q' W; {3 f7 f8 o6 y1 h
    7 G. Z: _$ w9 n% O& r* e  \( k+ v9 @2 Z8 A" w2 ?
    % t. V, V: K2 g  h$ e9 d% \( d

    , N0 `* O# X4 L
    zan
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