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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录

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    [LV.7]常住居民III

    自我介绍
    数学中国浅夏
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    1#
    发表于 2021-11-24 16:50 |只看该作者 |倒序浏览
    |招呼Ta 关注Ta
                                                                【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录2 K  D# \0 m( H5 Y- o  y2 \$ t
    书籍:《R语言与数据挖掘》
    8 u# o' d. g1 N' l% F7 W6 \#(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat
    & I' B. Q: B( K3 a$ i% I( Nlibrary(reshape)4 i( a1 A% o5 D1 l7 V0 F
    CO2& @: h7 G8 T$ R; r3 z3 g$ ]
    CO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat"))/ G9 F2 ?2 f# A, r
    ; Y$ q+ l+ U' q5 N; [- N4 N/ p
    #(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行
    & ~9 M! l( E: j- W> anyNA(CO2)
    / `; C8 A! S' \% c, J1 M[1] FALSE
    2 O- I' v  m* J: M! e$ p  Z, v7 f#检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]& i) L; I8 e* R# L7 a+ |

    0 E$ d$ o$ Z( I: J+ P#(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)( r3 U' y: w! L# L3 c, P
    #篇幅问题删除部分输出数据
    & O  F7 J, X' O# @( t> sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小
    - B% n. O- Z9 W [1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.7
    # |* [: Y( L- |- {5 D+ x[13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.43 q1 ^  @) N7 o/ o1 G
    [25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.1' `1 L" r0 X6 X+ @3 J2 H) t# c$ G
    [37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2
    - u1 {% f/ A( m+ v% i3 a- h[49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.9
    ( G. |3 V* Y* I1 @* G* R7 s" r> sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)9 N1 o3 K) B# k6 O. W* O' S
    [1]  7.7  9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.6
    . t0 F) H) ]( G- Z' f) Z5 h[13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.1+ C9 c  G: Z/ W4 F, K
    [25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.8
    7 s  x1 P, k$ |& u[37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.9
    ( e7 S( A; g0 V[49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.3
    - @" F& Z+ }* C- x- y# k/ w' p0 O) P4 j7 d, u
    > CO2[order(CO2$uptake),]- L* e4 m2 D' {" z$ H& ~. p; Q3 A
       Plant        Type      Treat conc uptake3 z7 y3 p& C. F* g
    71   Mc2 Mississippi    chilled   95    7.7
    % U& _/ l* L, `29   Qc2      Quebec    chilled   95    9.3/ g* S) \: Q5 ]9 I
    64   Mc1 Mississippi    chilled   95   10.5
    , D. `8 }2 _0 b2 d4 W$ B1 c43   Mn1 Mississippi nonchilled   95   10.6
    " r' J) I4 J( z! D4 X( F78   Mc3 Mississippi    chilled   95   10.6% e& ^1 ], P, Y4 Y  Y2 O
    57   Mn3 Mississippi nonchilled   95   11.3
    / _8 x/ k& Q! a# s: j' v' K/ w/ u* G8 p8 L! {
    > CO2[order(-CO2$uptake),]. w8 J4 I* {; G
       Plant        Type      Treat conc uptake0 M; P& J: m. o( x) ]# c, g4 E
    21   Qn3      Quebec nonchilled 1000   45.5" J- _4 |# B* |$ B1 E* \! f; t# [% `
    14   Qn2      Quebec nonchilled 1000   44.3
    / [9 Q* z; S/ l! X20   Qn3      Quebec nonchilled  675   43.97 A  ^$ y4 m4 W! P' N
    19   Qn3      Quebec nonchilled  500   42.9, ]) n+ h+ C$ K+ e. d; [  x  N0 a
    35   Qc2      Quebec    chilled 1000   42.4
    6 a3 M; c9 B& `  N3 J; n
    7 D% c6 u; ?4 G) `+ C0 [#(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:4' _' X" T' e: ]+ F' w! v
    n <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4))- Q1 X& `1 l0 A$ p0 f
    (sample1 <- CO2[n == 1,])  P8 K- Y& w7 Z5 R
    (sample2 <- CO2[n == 2,])0 Q) ]6 c( `6 D& b
    & w/ R  ?$ m; R2 v; k
    #(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值
    ) Z8 R) _# M4 U8 j1 w+ Q4 Xtapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)
    / d8 X8 ~" B  H2 _" }& R9 p/ L! \8 L5 H
    #(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值
    # v* a6 E, q$ n  Oaggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)8 f& v1 @& p7 g4 c
    ) ~) P) S, T* {6 E
    #(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值
    5 H+ h& Y. X* R; q2 y# qlapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean)2 E8 K) {+ \: D$ r# V2 p) j

    ' ^( ^7 A$ p1 j9 {$ \: a#(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中
    ! v* W. f% Z* D" c( p! ePlant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)
    * [9 e: @( K0 O4 R" y7 Y" zPlant_Qn1 L4 n6 Y7 H+ }3 M# w& S
    * z' E& I6 W8 c0 @8 h6 T8 f
    #(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“& y% V8 \- F$ @$ g8 b' s
    " x/ b( a! @$ ]3 k6 {
    & i+ Z; n9 G* {  Y, U
    #编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度+ w& H3 s7 j/ B- r' G
    #生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……
    + W0 A$ v1 n; a9 M; ~gsub("[t]","t",CO2$Plant)
    . Y" d5 s$ l) K0 v2 {: J$ ]6 J( O# q" X
    library(fBasics)' g/ f' c3 o2 z
    stat <- function(x)' s0 h: J  @% L( g) a+ b# I. Y
    {
    $ K* H$ _- u' J) G  if(!is.numeric(x))
    5 [/ Q0 s2 C" U9 p" W1 G: X6 |  {. L* L3 y9 H2 ]2 m) j5 M' a
        stop("the input data must be numeric!\n")1 i1 o& K* Z1 p! E3 O
      }: G, l2 W+ g6 d5 O) C9 _
      if(length(x) == 1)
    - C) D7 f$ |9 K1 d  {2 T+ E/ D' I8 g' G7 i0 }
        stop("can not compute sd for one number!\n")
    5 \! J1 a3 O3 e0 I, W6 t! b  }4 x1 J2 I  [5 i/ Q5 P  |
      max1 <- max(x)
    " k, D4 m2 m* a- w. c  min1 <- min(x)
    5 C" l( |6 c8 n/ j5 n  mean1 <- mean(x)
    : J5 ], N/ N6 q$ u3 R+ f  skewness1 <- skewness(x)' z- k: m' F8 x' v+ I/ X
      kurtosis1 <- kurtosis(x)$ X% u" R3 m* \2 b
      answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)
    & t7 N) h  `  p) O0 J  return(answer)6 [& G: H  j+ `
    }7 [! E+ s3 H9 g  x2 t

    # w, f: L2 k  r3 Z1 rt <- rt(100,2)
      s# C) I5 J* F( [, P4 a) hstat(t)- F2 g  x& a' ?5 P2 Q2 a

    9 g3 g# m3 _! e$ ^9 Z7 N
    8 H) G- `; `, e% W6 P6 F  x1 L; ]& w! j' G( o& V3 c
    8 W* ?1 N; E/ o, v
    zan
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