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TA的每日心情 | 开心 2023-7-31 10:17 |
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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录
0 g0 T# j3 s) Z* C) s! d) V2 W( Z书籍:《R语言与数据挖掘》
0 L. J% D. |; q/ N9 Q$ a2 H#(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat6 H5 e) H4 i- J, X/ M
library(reshape)
* ]4 i3 `7 o2 J2 vCO2
2 U5 T- g! c% K8 ^. @CO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat"))
o0 e; b1 ]( r+ W
7 K& \. a, X% ?& p! N#(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行
6 [4 Y3 s+ b- }> anyNA(CO2)) g5 J$ L. |; b+ ?& ^
[1] FALSE
" ]$ ` `3 f7 M, { ?. O' V4 X* H#检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]7 ~4 e3 [6 [- H9 r
- H) J) M2 j( L! q8 N
#(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)5 ]$ t; M, w3 d5 D/ K
#篇幅问题删除部分输出数据
; W* `8 R) X; a2 w6 e> sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小# Y' [' t7 I8 Z$ P* k: r! i
[1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.7
- R3 j" A# ?( M6 J9 A1 N, z[13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.4' M- n1 j: E w7 h0 K
[25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.1
+ c. j! p4 c5 E( v4 v" B) n[37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2
* |: G; I, c5 z p: S t[49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.9
' P/ x! }3 D n& B! m6 b' g> sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)
5 |5 `6 v' r( J; F# q [1] 7.7 9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.65 C. M0 d* A7 N) g
[13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.1) J# u+ K5 u' i8 f; Q. l7 ?6 Y
[25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.8
' K, O( E2 q4 w[37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.97 |: w' x% x7 D/ p, u* I
[49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.3
1 b) m6 {! [# u% r7 ?& f$ {- J) l3 S' ]# i4 G" f/ S& _
> CO2[order(CO2$uptake),]
$ @ B8 W; N4 Y6 Q Plant Type Treat conc uptake1 q1 _. _) a( n4 I- J
71 Mc2 Mississippi chilled 95 7.7
! G* i3 ?; k0 x: ^3 F) G8 o29 Qc2 Quebec chilled 95 9.39 v" `! I% @7 E2 d5 C/ C
64 Mc1 Mississippi chilled 95 10.5" u2 h- K8 x9 h8 G
43 Mn1 Mississippi nonchilled 95 10.64 F7 X9 O- w7 B. N! o# w$ k
78 Mc3 Mississippi chilled 95 10.63 ]1 ]: L6 o$ g) S3 n" W5 F1 F; J. g
57 Mn3 Mississippi nonchilled 95 11.3; z5 {8 r7 r1 N! k v+ I
8 n. e+ r9 J6 T> CO2[order(-CO2$uptake),]
0 J% c$ v& b0 q Plant Type Treat conc uptake
% ~. I! Y/ P( W! p! ?5 T21 Qn3 Quebec nonchilled 1000 45.55 }6 I/ |2 O- ~0 ]4 J
14 Qn2 Quebec nonchilled 1000 44.3
1 z( F# p5 U" N7 b$ T20 Qn3 Quebec nonchilled 675 43.9; G; k) l* V' ^& A; o& \
19 Qn3 Quebec nonchilled 500 42.9, Z1 Z4 z" [ f. ]
35 Qc2 Quebec chilled 1000 42.4
% `( \6 A) s1 G3 @1 T7 C
5 U/ H3 `# l7 M: p/ { Z0 [5 n#(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:4
- S# O3 t* z* X3 T; ^4 x A `n <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4))5 f) S' R" o/ X* Y. W; Q$ B
(sample1 <- CO2[n == 1,])' T6 j& o; Q3 v- R
(sample2 <- CO2[n == 2,])
9 R% o/ P. Z3 g4 {# W' l G9 h+ u( A* k1 V- Z' [
#(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值+ n; p4 D( k) P7 X
tapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)+ x- o2 v) L, {# I* ^4 f
" y) y! c" X( j5 R' v#(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值- Q8 \+ l1 v$ b0 D) u. k
aggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)
% w4 |9 |3 r3 A6 i5 g U2 t7 c# p$ W
#(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值
% }; V& \3 A. a6 h& Llapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean)
3 K4 M) E1 J* U9 J
! Z, O0 l7 D. I#(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中4 \- i8 `# y; E' c8 K
Plant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)
+ y8 p1 `" D+ v, {( a, o. F$ GPlant_Qn
1 e6 t- s7 _9 G9 j: `2 P$ r0 r/ O' h, ]$ Q
#(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“/ M7 Y+ N# M5 ?. T( g3 G/ d
- L7 k: l/ x) `6 t
1 D8 m' Y( l5 l) S) i" h0 O. x% r8 K
#编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度
; y8 O7 K' n5 D+ Z7 h#生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……
; ]# B7 g1 Z' Fgsub("[t]","t",CO2$Plant)
9 K" W% R% x& N t$ s' q
5 ?8 F* @) Q jlibrary(fBasics)3 w' O4 d) u5 R, r) U
stat <- function(x)( k2 ?. V5 f, c/ \* I; }, i9 u" N9 L
{
; y2 A- c- `" R4 } if(!is.numeric(x))
9 [/ {2 M1 ]) A {
) x/ N0 h0 k' F& S stop("the input data must be numeric!\n")6 q1 Y; O9 w; A, J; \) _
}- C! N* l8 C- ~ y6 ?
if(length(x) == 1)
& z' `+ A4 k9 F/ l {
7 ^! v) x% J0 e+ `6 U, F stop("can not compute sd for one number!\n")6 r1 L1 L7 w2 l8 C4 m% U
}
+ K. [( L4 {/ B8 Z' z5 j max1 <- max(x), S8 v4 S# x3 c
min1 <- min(x)# o) f6 b4 c0 i/ @
mean1 <- mean(x)6 j% p/ C' ], j5 c0 ]2 R r4 f
skewness1 <- skewness(x)
$ o2 T0 D% U- `( C- s2 n3 t4 X kurtosis1 <- kurtosis(x)6 T3 |8 H o8 o* ^# F- W- {
answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)
0 x( E; Q( ?( _1 p' Q) ^! m return(answer)
% u/ B: S6 d1 o% ^/ A; w" H}
( _" i, d( B) ?" d
8 @! F# n. k+ l B; V" Bt <- rt(100,2)
; v5 ^# J9 t( U( `stat(t)
6 u. f$ b* D; u& \. z) Q/ h& p+ l: d
$ Y- l4 s. _* A# d$ e. A, o8 K$ ^
: c! }4 g6 t: o# _, U; Z
8 ^2 \3 N( C/ u$ G6 m |
zan
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