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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录

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    [LV.7]常住居民III

    自我介绍
    数学中国浅夏
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    1#
    发表于 2021-11-24 16:50 |只看该作者 |倒序浏览
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                                                                【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录3 s* S1 f1 n* C" m# x" h
    书籍:《R语言与数据挖掘》, m3 j5 i6 j; ?5 ^" V' ?
    #(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat4 q! G# i6 M" r; M* t
    library(reshape)
    # f0 J/ q$ T/ ^' @) T' RCO2
    ' l# T) N% u, z; o& |0 |CO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat"))' d5 a  S' f; [. L& S/ k4 }

    , }$ J; y. V1 \7 L#(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行
    + o: C. j+ u  `( s* K. f1 F> anyNA(CO2)3 U0 e! E7 e9 A, M
    [1] FALSE' S. T/ `% Y) F: W" X( V" ]
    #检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]
    , I+ d9 x4 K, S1 [; Y- L! u; Z8 J! N- R& c1 O- ~
    #(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)
    + G& p. o8 i  u/ _! [8 L6 V+ {#篇幅问题删除部分输出数据
    : E) ~+ N, [0 \/ _9 {/ m3 H" m1 X> sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小5 u- h5 g9 J& c+ Q
    [1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.7
    " G( {4 A% I- X0 g" ^# `[13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.4# H3 ]- M) T& }- V6 S2 p9 G
    [25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.1
    # n, c) x+ i8 o- {2 m' O[37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2
    8 k) X1 N! U# f[49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.9
    ; W: U& t8 C3 K( g0 ^> sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)
    , N: h1 Y7 E1 H; N$ [9 ~, k [1]  7.7  9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.6
    : U, [; S! }2 S4 [% G5 c[13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.1
    , k' g1 T. z) G[25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.8
    & c: A. ^0 R2 e' U. C, m[37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.95 T3 h, l0 m9 s4 \
    [49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.3
    0 q" c. ~- C. V+ C& }0 D, f+ P8 H
    ) h$ N' f8 P9 [( w> CO2[order(CO2$uptake),]
    7 g' P2 R* ]* a7 W+ h   Plant        Type      Treat conc uptake
    & T% J7 k6 c3 ~/ d; o" Y71   Mc2 Mississippi    chilled   95    7.7& S2 n7 }) a7 a% _* [  j) W
    29   Qc2      Quebec    chilled   95    9.33 Z& |. ?$ l% A5 I' ^- g- p( }
    64   Mc1 Mississippi    chilled   95   10.5, A5 Q, c' n' I" r' _, z$ B4 x  z9 S
    43   Mn1 Mississippi nonchilled   95   10.6
    1 r7 q! M+ z0 v, J8 [" J6 y7 G78   Mc3 Mississippi    chilled   95   10.6, c2 O4 }+ B# L+ l
    57   Mn3 Mississippi nonchilled   95   11.3
    % m7 `" k. R8 D
    ) r, N4 Y% T5 ^; |> CO2[order(-CO2$uptake),]
    $ v! I4 Y" G) {5 k3 c1 S: O   Plant        Type      Treat conc uptake
    # f/ O. F2 J+ r/ \' V21   Qn3      Quebec nonchilled 1000   45.5
    2 H& H& m4 }. ]8 \$ {+ ]" A. W14   Qn2      Quebec nonchilled 1000   44.3
    ! {' ]3 S- Z( t20   Qn3      Quebec nonchilled  675   43.92 {2 ], o4 J3 l9 d$ ?2 [
    19   Qn3      Quebec nonchilled  500   42.9) P  ?% X9 u' ^9 x
    35   Qc2      Quebec    chilled 1000   42.40 I, k+ m1 E) E' m. S
    * p! H% O9 O$ o) ~- [  p
    #(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:4
    " {& P/ [1 {0 I5 Mn <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4))
      `  H. F4 [3 u+ h% {8 @+ i3 |5 h(sample1 <- CO2[n == 1,])
    ) _) O7 {( Z7 f0 {$ F# a(sample2 <- CO2[n == 2,])
    & T' f# C) e; _; ^9 m$ K
    4 v6 i1 s0 i9 L#(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值& a3 K& u" P6 K9 t$ N# T
    tapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)$ W" ^/ ]& d5 V5 w3 A

    " z) Z2 G1 S2 l0 q7 t#(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值# `  n' D, a; j
    aggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)' W# V4 [% _% I1 S0 ^! X

    2 w& a" E5 x* P# N/ A3 W% _5 q& t#(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值
    # H% F" G+ k* k( R' Xlapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean)6 _. \0 W5 M1 }. ]( @0 W7 _8 d

    7 r" }# ~5 p& W, n3 d#(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中
    4 Q# h& {' X* B0 D1 O  [/ ePlant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)7 P3 h6 H! V( b; V8 |+ N1 q; Z
    Plant_Qn9 \; K; ^5 }" p  u  D; U/ ]+ P

    : E( Y3 j5 w- S; X7 @+ i& A; a#(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“
    & L8 w2 I: S) c, n6 Y% K; N& L
    5 F% P0 M3 Q& _# \7 I
    4 Z$ c# u! V) D  Y+ N#编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度& K  k; j  R0 s: Q. a/ `5 S
    #生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……
    7 l% k& A3 N6 o. x0 Q0 x: b4 @gsub("[t]","t",CO2$Plant)
    0 E+ L1 E8 t2 h9 h$ [- Q2 p8 F1 f8 k9 Q
    library(fBasics), B7 X  L" i' `" l
    stat <- function(x)
    & b$ U3 m" P- X; C+ G$ N) j' K) }: l{/ Q" {6 I3 h. G9 f0 }' N
      if(!is.numeric(x))) a' x* W( _6 O; z
      {) {/ [+ @0 Y9 {$ A# x5 c# Q
        stop("the input data must be numeric!\n"); G2 h+ R# t) u! W0 G- c
      }
    / Q2 P* F! N$ ^5 p0 i) V  if(length(x) == 1)8 J% @* f" F" H5 f
      {4 C/ x, |* L2 j8 O( C6 Z
        stop("can not compute sd for one number!\n")$ T* {! [( r  r6 X# |
      }
      y$ N5 k. Q6 ^" ~# S$ B  max1 <- max(x)# u6 U" {; Q+ L+ x: `
      min1 <- min(x)7 T1 w0 K, Y5 [8 E* W
      mean1 <- mean(x)& h' D4 K: I6 Y' c) k- q# t
      skewness1 <- skewness(x)
    " ^& x; u' d; x1 t6 A  kurtosis1 <- kurtosis(x)
    & {  e/ \' ^0 [  answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)
    & V6 k- s5 P, b& ~, B7 \: X- S( s) d  return(answer)
    ; p2 B& H. b5 V}* H% j7 \- T% D' ]1 i. n: J7 C

    ' L; c, h3 m0 L& g( T* n, ct <- rt(100,2)' u( }1 P3 a2 R% F
    stat(t)
      w* U: G9 N7 h8 p+ `% a, ~7 F, g: a  S9 ?; Y$ T5 ?

    % o2 F8 Y- ~% f1 S# S( I$ u. W
    # ?0 t5 Q5 e" z4 ?4 P+ |- @! J, B4 ^
    zan
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