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TA的每日心情 | 开心 2023-7-31 10:17 |
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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录6 J: ^. k6 f" I0 B
书籍:《R语言与数据挖掘》
& x0 _9 L e# N5 @; @3 f#(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat+ Q5 n; v4 t: ` E. D1 i8 T
library(reshape)+ h, `3 I* _6 R
CO2$ m( D3 V* A2 X/ S, |( H; C
CO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat"))
: p8 `8 h0 F) f
' B# j- u7 ~( E2 r, [#(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行
/ k) N" r! d" P> anyNA(CO2)# p. Z# A- }+ i! W6 R" C8 y
[1] FALSE
: m# d! z! N W3 a9 [6 i+ ^#检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]
5 P% o0 y F. x; x6 D3 f( a5 e) _2 H! ]
#(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)+ B1 |/ T9 U2 S7 s- J
#篇幅问题删除部分输出数据
p3 z. a% g, M, ~: k* D2 s> sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小
2 f/ U u$ r* q! ]- w0 A [1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.7- Q$ `+ P2 [& Q; H4 R
[13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.4
4 Y* T/ U4 T- W# t$ t[25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.17 ^: C9 k. r' Q- f3 e; d8 r
[37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2- U Y% Z# L9 @0 a
[49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.9
- s& I* I1 h* v0 ~/ H9 Z3 O; l> sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)$ y; H& V9 l* T7 Y* L+ _
[1] 7.7 9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.6& e6 R, W* g4 j6 M
[13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.1
* G- N' K$ ` n9 A8 J[25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.8* ~" Q+ G2 Z! S8 A
[37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.9
2 L7 V5 q# @4 g% Z. e+ S& c0 Y[49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.3
9 B4 r, V- v# @- q3 y$ S* {( h+ [+ H$ |9 R
> CO2[order(CO2$uptake),]
: k4 m2 u, L _. L& p Plant Type Treat conc uptake
8 ~: s+ @5 I) @/ W9 q71 Mc2 Mississippi chilled 95 7.7) F8 z& O. g9 c# G( e" Z+ q: W
29 Qc2 Quebec chilled 95 9.3% d3 ~* C; r1 m! _2 `8 A
64 Mc1 Mississippi chilled 95 10.5
6 J: J8 B( i" j43 Mn1 Mississippi nonchilled 95 10.6% x i: w, K7 Q1 G _
78 Mc3 Mississippi chilled 95 10.6+ W' ], n' e! `+ y/ T6 K
57 Mn3 Mississippi nonchilled 95 11.3 P& ~( }7 t* E s
: s- E8 B; p9 F1 u6 C3 Z9 Q% Z> CO2[order(-CO2$uptake),]+ S2 w, {) G1 r; }" r' N; i, C' ^ T
Plant Type Treat conc uptake
/ _4 V. e5 p3 q4 d: U; o21 Qn3 Quebec nonchilled 1000 45.5
, K9 K6 s3 G9 w9 z" r14 Qn2 Quebec nonchilled 1000 44.3
% m6 j2 t3 S" i4 w% P7 z; `7 ^1 \20 Qn3 Quebec nonchilled 675 43.9
: T3 D% x7 @5 m |3 Y" t19 Qn3 Quebec nonchilled 500 42.9
. \ {( _! s5 e" G7 {# I! s35 Qc2 Quebec chilled 1000 42.4* f5 d+ W2 c2 J) [
/ d! D! d0 W0 [- m* X1 ]8 F* W#(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:49 R8 z$ u2 D- U
n <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4))
9 N$ D; @1 {+ m/ r; q3 }2 g(sample1 <- CO2[n == 1,])4 z. X& H" x9 x, H$ y& S
(sample2 <- CO2[n == 2,])
* n( e' B- w$ N3 A& y; u
; a1 T: }; K. [# R! j#(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值; l7 F# X" _: D9 K. g
tapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)
+ L8 r- x/ I7 K8 Q4 P I
- `7 P$ V8 O/ P5 B/ |#(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值
2 v% ~, E" x2 C& haggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)
2 e4 F8 g+ w% n( a- R/ L1 n
$ z1 T' Q0 E2 h O8 y" \% h#(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值
/ \3 p1 ]; e2 b9 |# i \' G( r' Llapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean). [; |+ v+ U9 L
0 z, L. n- n: j# w# k+ m#(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中7 X' E. Q( F' b6 v1 s; ?( ?' f% E4 k
Plant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)0 N) B) X9 r. G2 O5 S) Y$ o% P4 X
Plant_Qn
# [* ?+ } J; Y% j' ~3 I9 O$ a. I$ H" W+ w; H0 K+ r4 C5 |
#(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“
! P% C" w+ A0 Z- B2 z! [% p3 b8 e$ M$ Z+ R9 i
5 N3 D; r8 K, Y#编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度5 C, H+ r. |" ^3 G H8 Y5 I) i# `
#生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……
1 U9 {/ X5 C! F# N, q Y. wgsub("[t]","t",CO2$Plant)4 K$ l5 V/ h4 Z; ?' ]. `
: {, @1 P3 o/ h0 t- l. r, q/ r
library(fBasics)" p( P: z( C. z/ {7 G7 c# B8 ]2 I& Z
stat <- function(x)' ~8 {6 \' V9 Q" J" X9 J( l9 q% I
{
( [* R# d4 @5 T" Y* w* p7 V7 K0 o if(!is.numeric(x))7 D: f5 U9 B" n
{
9 ?: \% |+ p7 | stop("the input data must be numeric!\n")) Z8 c# L7 \! O3 ~# I
}, L4 A" O8 b$ ?. |
if(length(x) == 1): z+ h6 Z4 ~3 S7 J, ]
{4 T' F5 j) a) m7 X; ?
stop("can not compute sd for one number!\n")
7 k2 d' q6 W# j: }$ z }
p" P" ]; W: o2 y' v% W; J max1 <- max(x)
9 ^1 ]$ e0 F# r# I% r min1 <- min(x)1 f5 T" u; k8 A+ |; W
mean1 <- mean(x)
9 S7 [9 \7 j' C8 d: } skewness1 <- skewness(x)
+ g. c2 X) @# M kurtosis1 <- kurtosis(x)0 H( K( t; C" a" g3 c7 y
answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)
: r' [/ x( l2 e: R+ y4 Q% t return(answer)
" W* x2 I$ o/ z, l/ v& q}
! B1 ^& V7 P. k" f' V3 [
/ C% F/ {3 b9 Y |( ct <- rt(100,2)" U5 u9 @/ A! Y0 S6 h( |% H
stat(t)
# z1 N7 [- V5 T2 g2 z
: z p+ B8 X. U$ w% M6 A0 c
; S6 m+ r g& a7 X
* r& e/ H) s2 f0 N& ]7 A; \# _# H* i; P0 D( `& S
|
zan
|