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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录

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    [LV.7]常住居民III

    自我介绍
    数学中国浅夏
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    1#
    发表于 2021-11-24 16:50 |只看该作者 |倒序浏览
    |招呼Ta 关注Ta
                                                                【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录6 J: ^. k6 f" I0 B
    书籍:《R语言与数据挖掘》
    & x0 _9 L  e# N5 @; @3 f#(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat+ Q5 n; v4 t: `  E. D1 i8 T
    library(reshape)+ h, `3 I* _6 R
    CO2$ m( D3 V* A2 X/ S, |( H; C
    CO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat"))
    : p8 `8 h0 F) f
    ' B# j- u7 ~( E2 r, [#(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行
    / k) N" r! d" P> anyNA(CO2)# p. Z# A- }+ i! W6 R" C8 y
    [1] FALSE
    : m# d! z! N  W3 a9 [6 i+ ^#检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]
    5 P% o0 y  F. x; x6 D3 f( a5 e) _2 H! ]
    #(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)+ B1 |/ T9 U2 S7 s- J
    #篇幅问题删除部分输出数据
      p3 z. a% g, M, ~: k* D2 s> sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小
    2 f/ U  u$ r* q! ]- w0 A [1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.7- Q$ `+ P2 [& Q; H4 R
    [13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.4
    4 Y* T/ U4 T- W# t$ t[25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.17 ^: C9 k. r' Q- f3 e; d8 r
    [37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2- U  Y% Z# L9 @0 a
    [49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.9
    - s& I* I1 h* v0 ~/ H9 Z3 O; l> sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)$ y; H& V9 l* T7 Y* L+ _
    [1]  7.7  9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.6& e6 R, W* g4 j6 M
    [13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.1
    * G- N' K$ `  n9 A8 J[25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.8* ~" Q+ G2 Z! S8 A
    [37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.9
    2 L7 V5 q# @4 g% Z. e+ S& c0 Y[49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.3
    9 B4 r, V- v# @- q3 y$ S* {( h+ [+ H$ |9 R
    > CO2[order(CO2$uptake),]
    : k4 m2 u, L  _. L& p   Plant        Type      Treat conc uptake
    8 ~: s+ @5 I) @/ W9 q71   Mc2 Mississippi    chilled   95    7.7) F8 z& O. g9 c# G( e" Z+ q: W
    29   Qc2      Quebec    chilled   95    9.3% d3 ~* C; r1 m! _2 `8 A
    64   Mc1 Mississippi    chilled   95   10.5
    6 J: J8 B( i" j43   Mn1 Mississippi nonchilled   95   10.6% x  i: w, K7 Q1 G  _
    78   Mc3 Mississippi    chilled   95   10.6+ W' ], n' e! `+ y/ T6 K
    57   Mn3 Mississippi nonchilled   95   11.3  P& ~( }7 t* E  s

    : s- E8 B; p9 F1 u6 C3 Z9 Q% Z> CO2[order(-CO2$uptake),]+ S2 w, {) G1 r; }" r' N; i, C' ^  T
       Plant        Type      Treat conc uptake
    / _4 V. e5 p3 q4 d: U; o21   Qn3      Quebec nonchilled 1000   45.5
    , K9 K6 s3 G9 w9 z" r14   Qn2      Quebec nonchilled 1000   44.3
    % m6 j2 t3 S" i4 w% P7 z; `7 ^1 \20   Qn3      Quebec nonchilled  675   43.9
    : T3 D% x7 @5 m  |3 Y" t19   Qn3      Quebec nonchilled  500   42.9
    . \  {( _! s5 e" G7 {# I! s35   Qc2      Quebec    chilled 1000   42.4* f5 d+ W2 c2 J) [

    / d! D! d0 W0 [- m* X1 ]8 F* W#(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:49 R8 z$ u2 D- U
    n <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4))
    9 N$ D; @1 {+ m/ r; q3 }2 g(sample1 <- CO2[n == 1,])4 z. X& H" x9 x, H$ y& S
    (sample2 <- CO2[n == 2,])
    * n( e' B- w$ N3 A& y; u
    ; a1 T: }; K. [# R! j#(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值; l7 F# X" _: D9 K. g
    tapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)
    + L8 r- x/ I7 K8 Q4 P  I
    - `7 P$ V8 O/ P5 B/ |#(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值
    2 v% ~, E" x2 C& haggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)
    2 e4 F8 g+ w% n( a- R/ L1 n
    $ z1 T' Q0 E2 h  O8 y" \% h#(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值
    / \3 p1 ]; e2 b9 |# i  \' G( r' Llapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean). [; |+ v+ U9 L

    0 z, L. n- n: j# w# k+ m#(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中7 X' E. Q( F' b6 v1 s; ?( ?' f% E4 k
    Plant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)0 N) B) X9 r. G2 O5 S) Y$ o% P4 X
    Plant_Qn
    # [* ?+ }  J; Y% j' ~3 I9 O$ a. I$ H" W+ w; H0 K+ r4 C5 |
    #(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“
    ! P% C" w+ A0 Z- B2 z! [% p3 b8 e$ M$ Z+ R9 i

    5 N3 D; r8 K, Y#编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度5 C, H+ r. |" ^3 G  H8 Y5 I) i# `
    #生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……
    1 U9 {/ X5 C! F# N, q  Y. wgsub("[t]","t",CO2$Plant)4 K$ l5 V/ h4 Z; ?' ]. `
    : {, @1 P3 o/ h0 t- l. r, q/ r
    library(fBasics)" p( P: z( C. z/ {7 G7 c# B8 ]2 I& Z
    stat <- function(x)' ~8 {6 \' V9 Q" J" X9 J( l9 q% I
    {
    ( [* R# d4 @5 T" Y* w* p7 V7 K0 o  if(!is.numeric(x))7 D: f5 U9 B" n
      {
    9 ?: \% |+ p7 |    stop("the input data must be numeric!\n")) Z8 c# L7 \! O3 ~# I
      }, L4 A" O8 b$ ?. |
      if(length(x) == 1): z+ h6 Z4 ~3 S7 J, ]
      {4 T' F5 j) a) m7 X; ?
        stop("can not compute sd for one number!\n")
    7 k2 d' q6 W# j: }$ z  }
      p" P" ]; W: o2 y' v% W; J  max1 <- max(x)
    9 ^1 ]$ e0 F# r# I% r  min1 <- min(x)1 f5 T" u; k8 A+ |; W
      mean1 <- mean(x)
    9 S7 [9 \7 j' C8 d: }  skewness1 <- skewness(x)
    + g. c2 X) @# M  kurtosis1 <- kurtosis(x)0 H( K( t; C" a" g3 c7 y
      answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)
    : r' [/ x( l2 e: R+ y4 Q% t  return(answer)
    " W* x2 I$ o/ z, l/ v& q}
    ! B1 ^& V7 P. k" f' V3 [
    / C% F/ {3 b9 Y  |( ct <- rt(100,2)" U5 u9 @/ A! Y0 S6 h( |% H
    stat(t)
    # z1 N7 [- V5 T2 g2 z
    : z  p+ B8 X. U$ w% M6 A0 c
    ; S6 m+ r  g& a7 X
    * r& e/ H) s2 f0 N& ]7 A; \# _# H* i; P0 D( `& S
    zan
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