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关于matlab代码矢量化的理解

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    [LV.1]初来乍到

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    1#
    发表于 2010-10-5 09:32 |只看该作者 |倒序浏览
    |招呼Ta 关注Ta
    代码矢量化是matlab的精髓,其基本特点是运行速度快和代码简洁,它是如何实现的?
    : B2 D( T* Q5 B
    6 q  j9 \8 G$ p% R# l按我的理解,代码矢量化的本质就是设计专门的函数对数组元素集中运算,这样可提高运行速度,同时兼有代码简洁的特点。) X7 Y, E, o4 J7 R: g$ p1 ?- T
    : i! q" J! w' n' ~7 R
    对matlab的理解比较肤浅,但也确实看不出有更深意义的东西,望解惑。2 i" K/ o2 m! o* p6 p3 t+ |
    2 d& |* M. R7 Z7 i6 O* V3 }
    大家有什么看法,愿畅所欲言。% q2 i' I- y+ q6 M2 a
    zan
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    [LV.1]初来乍到

    本帖最后由 forcal 于 2010-10-12 21:46 编辑
    7 }! O. U  S; J5 l- o$ I
    6 ]' f# y2 J; Q4 {我正在练手设计的FcMath库也打算以矩阵运算为基础,设计一些专门的函数对数组元素集中运算,运行效率确实有所提高(甚至有些涉及矩阵的算法比matlab还快),代码也简洁了,但不知这是不是矢量化?& n; v/ I8 ^: x0 A

    " d$ [4 w8 K. ^, E( _脚本运行效率应该取决于函数调度效率、对象管理效率和函数内部算法的实现。
    + ~. q' ?2 ?: P; R  T* h1 d! B& H. h1 n2 s0 u8 L" U7 l
    我感觉,matlab的函数调度效率较低,对象管理效率这个不好说,但一些函数内部的设计比较优秀。故有些Forcal代码比matlab快,而有些慢。4 H; G& K- z) F& [$ ?1 r

    : G. q# c2 n* f. M6 K( p4 h5 n8 T以下例子体现了Forcal和matlab的效率差别所在。
    % Q* {& T, l, {5 [$ V" k
    ' z) r; |6 R- f# Z这个matlab程序段是网友lin2009 给出的,理论结果是每个元素均为275000。
    1. clear all
      0 {8 |, @) m8 f0 m* r\" Q: F
    2. clc# l5 U- V6 a* w  w0 R: a
    3. tic
      0 A  d! I, m( J9 }8 _2 `
    4. k = zeros(5,5); % //生成5×5全0矩阵
      7 o$ {! V% Q/ n. c
    5. % 循环计算以下程序段1000 00次:
      + m& d- X  G0 A4 a1 l\" _5 k
    6. for m = 1:1000 00
      ; B1 I0 D# \$ G$ N7 I
    7.     a = rand(5,7);% f' ^$ o, O/ X+ u
    8.     b = rand(7,5);%//生成5×7矩阵a,7×5矩阵b,用0~1之间的随机数初始化
      % O' X7 n4 [& [4 C
    9.     k = k + a * b + a(1:5, 2:6) * b(2:6, 1:5) - a(:, 7) * b(3, :);
      & q% B5 P1 ]! r$ ?8 t0 V
    10. end+ ]* t0 o$ B3 V2 K# c
    11. k* j4 F0 r8 U2 X+ R
    12. toc
    复制代码

    6 r6 E2 B* p1 p* u  |Forcal代码1:运行稍快的代码,比matlab约快10%吧?  q! T7 [7 G) }- U8 D0 M2 h+ v
    1. !using["math","sys"];8 ?) y  z! L$ B# W
    2. mvar:
    3. * Y& C; _; D& L
    4. t0=clock(),
    5. 5 i6 A, d9 U7 X; \. v/ J
    6. oo{k=zeros[5,5]},
    7. 1 r: O, ^) A5 i9 C1 S( C\\" s
    8. i=0,((i++)<100000).while{
    9. 4 ]* W, G( B' p. k7 e2 |7 K
    10.   oo{: w4 e3 l% _( H6 C8 D7 G
    11.     a=rand[5,7], b=rand[7,5],
    12. \\" M- V* _9 W# A
    13.     k.oset[k+a*b+a.subg(0,4:1,5)*b.subg(1,5:0,4)-a.subg(neg:6)*b.subg(3:neg)]- }\\" g' M' G\\" X; x+ d0 t9 ~' J
    14.   }
    15. 3 d; T/ m( w2 K4 L+ Q- l3 L8 L
    16. },\\" B, Q9 g- Y4 ?, `\\" m' T\\" l: j
    17. k.outm(),
    18. ) r5 ?2 l' @8 G
    19. [clock()-t0]/1000;
    在我的电脑上运行时间为3.344秒。
    ( S, f% C9 o2 O3 b! m1 `* ^; c5 e% F
    2 t$ `: g  ^6 ?: I( c( P4 DForcal代码2:比较好看些的代码,似乎也比matlab稍快吧?
    5 e" N0 V: y4 ^5 Z
    1. !using["math","sys"];* \% S, L: ~, F1 |8 y9 N! P
    2. (:t0,k,i,a,b)=5 w0 R9 h% P* J8 T5 Z- q
    3. {
    4. 4 D* I! N; C2 N+ m; m
    5.   t0=clock(),: B5 B% D# K! y# `+ F
    6.   oo{k=zeros[5,5]},
    7. & [, G$ c3 J2 Y; g2 s\\" b$ [
    8.   i=0,((i++)<100000).while{1 g2 Q7 z/ M! [, H( C2 i3 X
    9.     oo{
    10.   @/ E( z$ A. L  H- I. M; g4 ^
    11.       a=rand[5,7], b=rand[7,5],3 @0 ]4 S- w& s\\" G; |7 |8 e
    12.       k.=k+a*b+a(0,4:1,5)*b(1,5:0,4)-a(neg:6)*b(3:neg)% c5 a& |- m- R
    13.     }
    14. + Z9 y  k8 G8 h3 A/ Y: p& X
    15.   },1 _$ q$ r/ F& }& x0 `! P
    16.   k.outm(),
    17. 1 e\\" h2 g- `2 I6 a0 ^
    18.   [clock()-t0]/10006 K7 b9 F, T, h$ y
    19. };
    在我的电脑上运行时间为3.579秒。
    0 r3 k3 W! p+ v; V% r. e9 {
    1 V: l7 ]6 D7 F4 g- n2 ]- y$ m7 X例子2:) |' L/ p' J; j8 I; ]1 o4 R
    一段程序的Forcal实现:7 R1 n& ^; S) |( b& X5 f
    1. //用C++代码描述为:
      \" |; N. _& ^& i1 v6 ]9 ]& x\" B
    2. s=0.0;  & {& c* F& P' b
    3. for(x=0.0;x<=1.0;x=x+0.0011)  * j! z! S/ {* E' Y: c$ W
    4. {
      9 ?6 H0 K# b; p, l
    5.   for(y=1.0;y<=2.0;y=y+0.0009)
      2 N9 v5 W2 t2 a: V. Y1 J
    6.   {
      ' g2 b! }7 L3 s7 \8 s2 S
    7.   s=s+cos(1-sin(1.2*x^(y/2)+cos(1-sin(1.2*y^(x/2)))));5 W7 l) t, U\" V) h, I
    8.   }, @+ ]: ~  U2 j3 O0 [, a0 w
    9. }  
    复制代码
    结果:
    * M2 V, o# K& V. B1008606.649474414 D. Y8 a2 a- X/ D6 s0 T" E
    0.609 //时间
    % ~6 Q1 X4 H+ `, I" X4 T3 Y7 x' A7 V' `% c
    这个matlab程序段是网友yycs001给出的。. I0 c/ \# C+ d+ V* M4 X
    1. %file speedtest.m
      8 f4 ]* H7 w6 c) d& r7 Y
    2. function speedtest9 n4 f2 r; X- _$ h4 ?0 h) f, u& [5 M' u
    3. format long
      ; k( D! B) ]# c) {9 ~' `+ o7 q2 S
    4. tic
      * z% T/ c+ |  s- i$ C7 I( V% a
    5. [x,y]=meshgrid(0:0.0011:1,1:0.0009:2);3 ^5 y5 k, d3 }' T
    6. s=sum(sum(cos(1-sin(1.2*x.^(y/2)+cos(1-sin(1.2*y.^(x/2)))))))* F0 R- H5 L9 e  [2 j
    7. toc
    复制代码
    % S$ I2 X, K( ^& U+ z. ]
    Forcal代码1:**数组求和函数Sum,完全矢量化的代码) i, h# S$ A' w  t. R. W
    1. !using["math","sys"];& O9 j, Z! x6 h( Z' @8 s# V3 H% `6 P
    2. mvar:
    3. 2 x: ^! F% B- H+ b% l
    4. t=clock(),\\" q5 @3 D  e7 D  k! r& f
    5. oo{
    6. 6 z8 R. O6 h0 i$ x\\" e
    7.   ndgrid[linspacex(0,1,0.0011),linspacex(1,2,0.0009),&x,&y],
    8. 2 ?  {2 L: A+ e$ r9 o. U2 E% b8 Z
    9.   Sum[Cos(rn(1)-Sin(rn(1.2)*x^(y/rn(2))+Cos(rn(1)-Sin(rn(1.2)*y^(x/rn(2)))))),0]
    10. : O0 z/ h1 ~+ E& T$ K
    11. };% t8 l% D: j' {( {5 r9 u\\" E7 ]/ b
    12. [clock()-t]/1000;
    结果:
    : t5 D4 U7 a4 x- m* A+ G  z1008606.64947441
    ' c, C1 R/ r0 X2 d0.625 //时间
    6 p4 M1 y3 e9 u. {$ x; s% G1 T4 y' @* E! W
    + o( G/ i# ?5 \" B6 z或者这个,与上面效率差别不大:7 O- |2 v* O! e4 D
    1. !using["math","sys"];& C/ m- j! h. ]) h
    2. mvar:
    3. , i) J' ?/ P1 L
    4. t=clock(),
    5. # A6 x  M% |2 U* c  W
    6. oo{
    7. 4 ?4 ?0 f' @3 N! w+ ^7 D
    8.   ndgrid[linspacex(0,1,0.0011),linspacex(1,2,0.0009),&x,&y],! m+ L, W4 o, H, s+ v
    9.   Sum[Sum[Cos(rn(1)-Sin(rn(1.2)*x^(y/rn(2))+Cos(rn(1)-Sin(rn(1.2)*y^(x/rn(2))))))]]
    10. 4 O5 Q; S- }- }( [7 Y
    11. };) @% V4 o3 H) _& o
    12. [clock()-t]/1000;
    * k* A$ B* b% y7 a7 [
    Forcal代码2:求和函数sum,非矢量化代码
    3 w  P0 U6 ]5 s( Q$ f
    1. f(x,y)=cos(1-sin(1.2*x^(y/2)+cos(1-sin(1.2*y^(x/2)))));
      4 h9 T% p\" b) E5 ^% e+ Y
    2. sum["f",0,1,0.0011,1,2,0.0009];
    复制代码
    结果:9 r5 u% J4 b8 V6 i* W$ ~% \
    1008606.649474416 Z- U+ l8 v2 b; F  V- M3 I/ r
    0.719 //时间
    # e4 M1 F- \+ c5 t/ Z
    . @& \1 ~/ ]4 qForcal代码3:while循环
    % q% h# p5 _' P( A
    1. mvar:5 y/ t% u! Z\" n\" f- G7 H
    2. t=sys::clock();
      ! t. U7 T& c6 x- Y1 f: b\" X
    3. s=0,x=0,
      7 C7 g; z9 a' j6 ^; n5 I
    4. while{x<=1,  //while循环算法; % r- ?! z* n1 z
    5.    y=1, : ?6 M$ m) _* E  T7 V
    6.    while{y<=2,
        \1 i' Y: N  w- \
    7.        s=s+cos(1-sin(1.2*x^(y/2)+cos(1-sin(1.2*y^(x/2))))),
      + ]: P& I  N+ u+ y\" X
    8.        y=y+0.0009
      ; w7 l: L; Q5 E0 N* O3 T- Z( C
    9.       },
      ( R) x2 y. {8 i+ t7 B% s2 z
    10.    x=x+0.0011
      4 Y1 F! ^. [\" X9 X( s
    11. },
      * t\" Z3 [0 S& x; P\" u* A3 W5 y9 {
    12. s;7 S/ S% u7 }, Z
    13. [sys::clock()-t]/1000;
    复制代码
    结果:1 ]+ C- o. ]2 u) Q5 h8 x! C
    1008606.649474416 \  @& d9 y; B$ s5 y
    0.734 //时间" ]2 V: O7 s1 g" X  L$ s

    0 p9 J( @0 Q' Z" i大家可下载OpenFC进行测试:http://www.forcal.net/xiazai/forcal9/openfc32w.rar9 l- |* f$ p% S9 M' ]

    - _+ |0 }9 f6 E# v注意Forcal的矢量化代码第一次运行有时效率较低。/ s- f* o8 }/ p
    & a4 H% V* C6 |4 a3 j2 k1 D+ X
    例子1中Forcal和matlab都是矢量化代码,但matlab跑不过Forcal。该例子的特点是函数调用频繁,临时变量生成多,但矩阵很小,矩阵的各种函数运行时耗时较少。故说明Forcal函数调用+变量管理效率优于matlab。
    . i0 I, j2 q1 R4 b
    8 n8 K5 J% [* U8 N; |6 ~" e例子2中Forcal的矢量化代码是最快的,但与matlab的矢量化代码相比仍有差距。该例子的特点是函数调用少,临时变量也少,但矩阵大。故说明Forcal的各种矩阵函数Sin、Cos及矩阵的加减运算等函数的内部设计不及matlab。
    ) z$ N& k6 x. W3 X
    % X% w! `* }" B  A6 @如能在函数内部设计上下点功夫,例子2超越matlab也是可能的。在这方面,期待高手们的指点。
    . |5 ~  S' |! E/ ]( f3 F- T+ }5 S0 T, c6 S$ f% n6 a& ?) `: o, q% ?: t
    如果例子2速度也超越了matlab ,matlab矢量化的神秘面纱就揭开了。- _0 j% b) L# n4 _
    # N" n/ ]) T4 M* K9 p+ S
    顺便说一下,例子1如果用C++的运算符重载来实现,速度将比Forcal慢一些,也就是说,在涉及运算符重载时,脚本的效率有时比C++还要高些。

    % T; U. T, g3 [7 [. l1 f6 j1 i
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    参考:http://bbs.emath.ac.cn/thread-2709-1-1.html
    3 ?# P4 m! G% o( q- n, ?
    4 g2 I+ A# p8 a& R- b我在多个帖子中有不同说明,但将这些说明再集中到一个帖子中比较麻烦,大家相互参考一下,看能否把这个问题解决了。
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