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关于matlab代码矢量化的理解

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    [LV.1]初来乍到

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    1#
    发表于 2010-10-5 09:32 |只看该作者 |倒序浏览
    |招呼Ta 关注Ta
    代码矢量化是matlab的精髓,其基本特点是运行速度快和代码简洁,它是如何实现的?; w3 g5 |  `( }( F6 x/ g1 C; U: L! e
    8 t) B0 o3 R6 Z8 X
    按我的理解,代码矢量化的本质就是设计专门的函数对数组元素集中运算,这样可提高运行速度,同时兼有代码简洁的特点。
    , `2 N1 @. s7 Q" b) h) u! r" }+ `2 n4 D: ~. h1 H& I2 a& y
    对matlab的理解比较肤浅,但也确实看不出有更深意义的东西,望解惑。
    - M- x( i- B  Z( D) n0 K1 z0 h6 v/ o; l$ j, e' R
    大家有什么看法,愿畅所欲言。5 U7 O) m1 C9 }
    zan
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    [LV.1]初来乍到

    本帖最后由 forcal 于 2010-10-12 21:46 编辑
    ; |! w0 r2 N9 X- R  G6 a' A+ W( Q5 f) L. w; d- A( e, X$ t% V
    我正在练手设计的FcMath库也打算以矩阵运算为基础,设计一些专门的函数对数组元素集中运算,运行效率确实有所提高(甚至有些涉及矩阵的算法比matlab还快),代码也简洁了,但不知这是不是矢量化?
    , l: J' A' L# c. S. A1 u  |/ k# M. P; a5 x( O0 H- q7 R
    脚本运行效率应该取决于函数调度效率、对象管理效率和函数内部算法的实现。
    ! |7 j5 s0 N) c3 v( R6 z
    4 {# n5 b' [  @* R- c8 o我感觉,matlab的函数调度效率较低,对象管理效率这个不好说,但一些函数内部的设计比较优秀。故有些Forcal代码比matlab快,而有些慢。2 y4 @1 _* p% B" s
    0 g* G% d# F4 S7 N7 T+ q
    以下例子体现了Forcal和matlab的效率差别所在。+ [8 H$ w$ h0 k( M4 Y
    0 m! ~' k6 U6 N  q* @
    这个matlab程序段是网友lin2009 给出的,理论结果是每个元素均为275000。
    1. clear all
      , s2 A# l' ^, ^$ E
    2. clc
      * [  y, I* r; T0 b
    3. tic\" ?: I+ {3 U9 j( y; Y' k7 R\" t. m
    4. k = zeros(5,5); % //生成5×5全0矩阵
      ) d0 c9 o0 H5 e
    5. % 循环计算以下程序段1000 00次:  z; J% F8 b3 ^8 X& M$ y- g
    6. for m = 1:1000 00
      8 G; l- D+ L. s4 k. E3 T; H' J
    7.     a = rand(5,7);
      2 k+ R9 t3 a6 l+ y$ b' L
    8.     b = rand(7,5);%//生成5×7矩阵a,7×5矩阵b,用0~1之间的随机数初始化+ M& z7 T/ f2 J  N2 M
    9.     k = k + a * b + a(1:5, 2:6) * b(2:6, 1:5) - a(:, 7) * b(3, :);# k& L+ k: L& w. v
    10. end\" a: F\" j1 R2 f) _- h
    11. k
      3 b1 D% E; A' O* l\" d
    12. toc
    复制代码
    & b# c/ Y4 ~7 r% I5 E+ h6 n6 S
    Forcal代码1:运行稍快的代码,比matlab约快10%吧?
    : p0 [9 v2 r, u' R" d
    1. !using["math","sys"];9 p! i1 T, {* X: H0 U- a+ H
    2. mvar:
    3. 6 W- c* _' D- k
    4. t0=clock(),
    5. $ z( [\\" S4 o8 V1 w* K
    6. oo{k=zeros[5,5]},2 ^1 r9 ?) e2 \$ w- V2 I$ Q
    7. i=0,((i++)<100000).while{' q  K4 u8 u( _
    8.   oo{
    9.   F( [: ]. v! {0 v
    10.     a=rand[5,7], b=rand[7,5],3 \: ?* P, L\\" n0 Y$ v
    11.     k.oset[k+a*b+a.subg(0,4:1,5)*b.subg(1,5:0,4)-a.subg(neg:6)*b.subg(3:neg)]+ E1 f* M5 b% R& r3 h\\" ?
    12.   }1 X% B% E, n. q! f
    13. },) ?8 Y- J' D( p\\" P) c! f
    14. k.outm(),$ D$ ^( s3 U: T2 ?  v6 r
    15. [clock()-t0]/1000;
    在我的电脑上运行时间为3.344秒。
    7 l, X* @) S* E0 p: R, v! ^5 C$ J
    " h7 p% D* M0 r1 l/ X. I2 x0 AForcal代码2:比较好看些的代码,似乎也比matlab稍快吧?1 i4 C, a! p5 c, T- K6 L9 h& K9 l4 O
    1. !using["math","sys"];) l& {6 t4 r9 E7 W
    2. (:t0,k,i,a,b)=
    3. - r* e7 n: C: @; y\\" V
    4. {# Y. ?* H1 p# R8 m8 Y
    5.   t0=clock(),
    6. / y. b, N7 X8 X, c
    7.   oo{k=zeros[5,5]},- J, M% t+ H+ {\\" }% \. @
    8.   i=0,((i++)<100000).while{
    9. / w\\" y/ d8 ~: s, A  q& X
    10.     oo{
    11. ' m' \+ L5 |; c# X, f$ e; f
    12.       a=rand[5,7], b=rand[7,5],* l  t) F: ^6 ]. p9 n, X. F
    13.       k.=k+a*b+a(0,4:1,5)*b(1,5:0,4)-a(neg:6)*b(3:neg)7 @& f8 ~\\" g7 z' x* Z2 {
    14.     }
    15. ! d3 m% K# Z0 W0 r7 c
    16.   },
    17. 6 H4 F8 |$ Q3 ?, Y0 x  |! l
    18.   k.outm(),3 H1 ]9 Q: n8 h* u( _/ h
    19.   [clock()-t0]/10007 @0 |  o\\" U9 p2 \' s* p# x
    20. };
    在我的电脑上运行时间为3.579秒。
    , D, q. S: g+ E8 O8 i1 }1 k% S" T3 ~: {, m
    例子2:
    " l1 q+ x0 q( O. l0 A8 q4 C一段程序的Forcal实现:
    ) g( D  `$ D8 ^9 P5 d3 v0 e% ]0 o
    1. //用C++代码描述为:
      - I0 P* M0 b$ W$ Q9 k& K
    2. s=0.0;  / m. f8 q3 r8 T, T3 u9 |
    3. for(x=0.0;x<=1.0;x=x+0.0011)  + J1 S' y( S* G; w1 }# h
    4. {1 ?0 p/ Q2 B0 r1 J- z- c* W
    5.   for(y=1.0;y<=2.0;y=y+0.0009)
      2 o' {& a4 g9 I7 {/ I: Q
    6.   {; x+ z/ e) L* L2 p+ ^1 ]6 N3 ?
    7.   s=s+cos(1-sin(1.2*x^(y/2)+cos(1-sin(1.2*y^(x/2)))));
      2 N# F# R2 P' n; ~: d7 g
    8.   }
      5 M9 ^. n& Q; C5 W
    9. }  
    复制代码
    结果:
    9 K/ Z0 F' x0 J" L! W, K$ e1008606.64947441- f+ D( S3 i8 g+ D* o" j9 F; h0 k* R+ z+ Y
    0.609 //时间2 T# r5 P2 E" ]0 b4 {  \2 {+ V6 J

    : l, x6 Z  V: R! h这个matlab程序段是网友yycs001给出的。9 \( z& F9 |+ K: q$ `
    1. %file speedtest.m9 W% k% A+ e  S! R
    2. function speedtest# A6 w8 S+ U+ H- `: H2 z
    3. format long
      6 O& J$ w: _- Z3 n( S
    4. tic4 V3 o7 Z* w; N, b4 e
    5. [x,y]=meshgrid(0:0.0011:1,1:0.0009:2);
      ( W' y. L7 Y7 X6 V* r
    6. s=sum(sum(cos(1-sin(1.2*x.^(y/2)+cos(1-sin(1.2*y.^(x/2)))))))9 S\" m* l5 f: M1 U, O1 N8 v: H
    7. toc
    复制代码

    ! L* m- z' H; e# S$ @Forcal代码1:**数组求和函数Sum,完全矢量化的代码
    9 F' O! u  h+ i! y8 B( D
    1. !using["math","sys"];1 Z4 M- m0 r6 W2 ]7 }
    2. mvar:* X% Y; i2 {4 @. y: @9 |1 e
    3. t=clock(),
    4. 9 r, C, a! z1 y5 K* y
    5. oo{
    6. % ], b; k2 N& d. x3 R  d. h
    7.   ndgrid[linspacex(0,1,0.0011),linspacex(1,2,0.0009),&x,&y],! D0 Z* a9 K' H
    8.   Sum[Cos(rn(1)-Sin(rn(1.2)*x^(y/rn(2))+Cos(rn(1)-Sin(rn(1.2)*y^(x/rn(2)))))),0]
    9. ' V, L' R; x- n+ ]) s5 }0 O( |9 m5 K' l
    10. };
    11. 4 c% P* x! S3 @/ s, ^) w3 [
    12. [clock()-t]/1000;
    结果:
    0 @5 r+ K4 h0 x6 \, ~8 ^: o1008606.64947441
    7 o1 q# Z9 G% J% H0.625 //时间
    * \- a) Z9 d; C" }7 x; p- u4 Q. K5 I+ K  ^; I
    或者这个,与上面效率差别不大:
    . e% E+ I. E$ k0 u. g" h
    1. !using["math","sys"];0 m+ q: [2 z$ m
    2. mvar:
    3. 3 q( b5 [- p* b  w, ~
    4. t=clock(),
    5. 3 m$ z7 v2 J+ A0 D
    6. oo{, |  s9 y# m/ C5 L& o
    7.   ndgrid[linspacex(0,1,0.0011),linspacex(1,2,0.0009),&x,&y],
    8. 7 i, J/ n4 {9 Q! Z
    9.   Sum[Sum[Cos(rn(1)-Sin(rn(1.2)*x^(y/rn(2))+Cos(rn(1)-Sin(rn(1.2)*y^(x/rn(2))))))]]% x1 p- E- W0 q2 J( z$ V6 f\\" e
    10. };- `4 w( X5 y; N; i9 J) |; [
    11. [clock()-t]/1000;
    - E1 r: D0 u# {6 G4 C, M2 K( E
    Forcal代码2:求和函数sum,非矢量化代码
    ! L6 u# v; Q  L
    1. f(x,y)=cos(1-sin(1.2*x^(y/2)+cos(1-sin(1.2*y^(x/2)))));
      . m( Y0 m1 O2 c' g6 k% K
    2. sum["f",0,1,0.0011,1,2,0.0009];
    复制代码
    结果:( ~; J6 y6 f) \
    1008606.64947441
    # z* g7 m5 f- k/ x5 [0.719 //时间9 O" Q/ v* [0 t. J( W0 @
    6 o5 J. h: A3 k! s
    Forcal代码3:while循环) v/ u- d. G3 V. I! G
    1. mvar:: Y3 `! V8 s: [& l8 }5 \& ]$ p
    2. t=sys::clock();8 ^* B/ W  Z$ Q4 C
    3. s=0,x=0,
      . M/ k) [8 @1 M1 P3 u: a4 w
    4. while{x<=1,  //while循环算法; ) k/ N+ _  a5 ?* r' M3 Y; J- B
    5.    y=1,
      1 t- K4 c/ L+ k% W0 z
    6.    while{y<=2,
      / \, s2 n2 K, S% B+ X9 z6 w% ]
    7.        s=s+cos(1-sin(1.2*x^(y/2)+cos(1-sin(1.2*y^(x/2))))),
      7 d% y2 C3 c6 q3 L
    8.        y=y+0.0009 2 ~$ i% ^# l; u, j: g# o( S
    9.       }, + H) h# }4 M+ v- b0 B* b
    10.    x=x+0.0011 * K& E8 _. I! d: W  l
    11. },
      : `, Y3 s5 L/ U+ K9 L
    12. s;1 R7 W# a+ x9 D* R
    13. [sys::clock()-t]/1000;
    复制代码
    结果:
    8 u6 l* r6 ~* n. c1008606.64947441
    5 d& p- r* ~* n8 k" |: ^0.734 //时间
    / J& o- O$ C% E. ?# L) N' M4 E$ @* F' i5 q* l  b! q6 \) J
    大家可下载OpenFC进行测试:http://www.forcal.net/xiazai/forcal9/openfc32w.rar0 |; l& v6 H$ l" w

    # M; c  ]# T  B: C1 h& h- U. W注意Forcal的矢量化代码第一次运行有时效率较低。
    , H. P5 \8 G# }$ H
    4 |0 x% y/ b9 a% w7 _. @- |2 ~6 f例子1中Forcal和matlab都是矢量化代码,但matlab跑不过Forcal。该例子的特点是函数调用频繁,临时变量生成多,但矩阵很小,矩阵的各种函数运行时耗时较少。故说明Forcal函数调用+变量管理效率优于matlab。  n( I5 X6 T; l) c; Z
    ) z/ ?8 L" \  ~) q, ]
    例子2中Forcal的矢量化代码是最快的,但与matlab的矢量化代码相比仍有差距。该例子的特点是函数调用少,临时变量也少,但矩阵大。故说明Forcal的各种矩阵函数Sin、Cos及矩阵的加减运算等函数的内部设计不及matlab。
    5 w$ `9 J- Q, b; f
    + W" U3 n2 z. m如能在函数内部设计上下点功夫,例子2超越matlab也是可能的。在这方面,期待高手们的指点。: Y4 ~" Z7 N$ T

    ' o. L. i% r! }0 a如果例子2速度也超越了matlab ,matlab矢量化的神秘面纱就揭开了。$ ?5 z- v( s  k1 Y3 Y+ p, g
    0 K/ ]1 s2 }, D4 s: a7 I: u0 q
    顺便说一下,例子1如果用C++的运算符重载来实现,速度将比Forcal慢一些,也就是说,在涉及运算符重载时,脚本的效率有时比C++还要高些。
    , ]3 Z9 c6 ?& o. |; }6 |7 Z5 l
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    参考:http://bbs.emath.ac.cn/thread-2709-1-1.html2 \. K+ A; A& G. E

    ) j% ~4 U' }4 G3 R3 P1 |1 M$ X8 R# F我在多个帖子中有不同说明,但将这些说明再集中到一个帖子中比较麻烦,大家相互参考一下,看能否把这个问题解决了。
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