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关于matlab代码矢量化的理解

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    [LV.1]初来乍到

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    1#
    发表于 2010-10-5 09:32 |只看该作者 |倒序浏览
    |招呼Ta 关注Ta
    代码矢量化是matlab的精髓,其基本特点是运行速度快和代码简洁,它是如何实现的?
    ' X9 {4 P$ U) v  z4 R
    $ p# \1 E. i7 h5 H& s# n5 l  R按我的理解,代码矢量化的本质就是设计专门的函数对数组元素集中运算,这样可提高运行速度,同时兼有代码简洁的特点。
      _& ^! t$ O: d6 N) H3 Z4 Z4 Z" _
    对matlab的理解比较肤浅,但也确实看不出有更深意义的东西,望解惑。
    , X( l8 x! D) z9 z
    4 ?% j! V0 t+ Y0 _9 g; ]% [* @大家有什么看法,愿畅所欲言。( |, F8 ?  a* ^0 b/ K" k
    zan
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    [LV.1]初来乍到

    本帖最后由 forcal 于 2010-10-12 21:46 编辑
    # v% ?. q, s( a( k/ L
    ( u; A! s/ U# I9 k; n7 x8 t我正在练手设计的FcMath库也打算以矩阵运算为基础,设计一些专门的函数对数组元素集中运算,运行效率确实有所提高(甚至有些涉及矩阵的算法比matlab还快),代码也简洁了,但不知这是不是矢量化?2 f; Z* ^% J& T
    , B4 L! Q$ X8 F: F1 w+ T. {0 n
    脚本运行效率应该取决于函数调度效率、对象管理效率和函数内部算法的实现。
    ' h. F" E0 ~2 t& n, R  ?. N1 Y0 Z. J! Y
    我感觉,matlab的函数调度效率较低,对象管理效率这个不好说,但一些函数内部的设计比较优秀。故有些Forcal代码比matlab快,而有些慢。
    3 T( ?  N  u. [8 N  {  k' `# r1 S5 t) H) s+ B/ n
    以下例子体现了Forcal和matlab的效率差别所在。) X( y0 m% J( F5 [# B+ Z9 s
    4 ~- b6 W1 n4 R( A7 K. `! S4 Y
    这个matlab程序段是网友lin2009 给出的,理论结果是每个元素均为275000。
    1. clear all
      ! k! L: @' O) l: r
    2. clc
      ! ^; m2 T0 ^9 E, Z\" ~7 h1 |
    3. tic
      # n7 J* e  k8 b
    4. k = zeros(5,5); % //生成5×5全0矩阵) ]& f, F; m( L: w/ E, a
    5. % 循环计算以下程序段1000 00次:
      5 C& v  v) t) A( t1 G. I7 }+ A
    6. for m = 1:1000 00! A$ @$ K9 F# G  v6 }9 t& Z: J
    7.     a = rand(5,7);! J% [7 Z$ i. ~1 A  [6 i2 T, c' M
    8.     b = rand(7,5);%//生成5×7矩阵a,7×5矩阵b,用0~1之间的随机数初始化' R4 {: v5 k. X+ u5 \
    9.     k = k + a * b + a(1:5, 2:6) * b(2:6, 1:5) - a(:, 7) * b(3, :);( [9 x/ a3 K: F; y; X, ~
    10. end- D% c2 u* l) U+ p. y( s\" r5 G3 {
    11. k/ k  U  d5 i9 O+ w( g/ F6 D
    12. toc
    复制代码

    " V9 m0 K3 ~9 SForcal代码1:运行稍快的代码,比matlab约快10%吧?
    - O# p; V& e0 o6 {  a2 N
    1. !using["math","sys"];% }& Q) _  ]1 W- x
    2. mvar:
    3. 1 }' `8 ^& R# L( a  ^
    4. t0=clock(),) f+ [6 {* R) |; Y* Q
    5. oo{k=zeros[5,5]},
    6. . W! c0 K' g6 N3 u
    7. i=0,((i++)<100000).while{
    8. : ~5 {$ s3 Q2 Y
    9.   oo{
    10. \\" V3 H2 @5 b7 s( N) t: k- l
    11.     a=rand[5,7], b=rand[7,5],
    12. 7 M8 t- s( y: z
    13.     k.oset[k+a*b+a.subg(0,4:1,5)*b.subg(1,5:0,4)-a.subg(neg:6)*b.subg(3:neg)]
    14. / h5 t- @\\" l- C
    15.   }
    16. ' X& ~0 p, Y6 v) W
    17. },2 P6 M\\" O\\" p, ]2 v( S
    18. k.outm(),
    19. 6 `$ ^  j) ^, {8 N5 k
    20. [clock()-t0]/1000;
    在我的电脑上运行时间为3.344秒。
    1 s( F1 e" I. j- V6 C- Z) s
    8 N& j; [! d0 T: e" r4 U1 N. MForcal代码2:比较好看些的代码,似乎也比matlab稍快吧?
    1 g: u& \( G' A, A
    1. !using["math","sys"];3 {2 ^; r9 T+ ]! b! I
    2. (:t0,k,i,a,b)=
    3. ) q\\" c7 \4 a2 w) Q
    4. {
    5. ) }4 |; }8 f$ V. W4 ~
    6.   t0=clock(),\\" \  Y1 [3 b. v3 S
    7.   oo{k=zeros[5,5]},, b9 z4 s) X9 U4 q2 @
    8.   i=0,((i++)<100000).while{
    9. \\" A3 j: Q. h3 j4 H( A- s
    10.     oo{
    11. ; t' {( U1 q) G% O1 ^
    12.       a=rand[5,7], b=rand[7,5],/ z! |/ }9 T# E
    13.       k.=k+a*b+a(0,4:1,5)*b(1,5:0,4)-a(neg:6)*b(3:neg)/ m  {; b' c# _9 l) J- W4 G\\" y
    14.     }- y5 X% t' X% @) z1 J& V1 M/ T
    15.   },3 L' I( G8 n# R: P; g% Z6 X' s
    16.   k.outm(),
    17. 2 q( d% l4 M$ ]2 t! j
    18.   [clock()-t0]/10000 ]\\" K' c% P( x6 i9 n
    19. };
    在我的电脑上运行时间为3.579秒。
      x, K7 ^7 k, `) o, V5 O; j
    : T* K" P9 V# p* H例子2:
    : e( K+ E% r' e) `" p- c. l: s# F7 H一段程序的Forcal实现:4 J2 Q  x; e! d- p
    1. //用C++代码描述为:* B1 L' X) k$ G/ V5 s; E
    2. s=0.0;  
      ! r+ l. P; W. `! ^; D
    3. for(x=0.0;x<=1.0;x=x+0.0011)  4 Q+ i9 d( v1 P' V
    4. {
      $ \* m( C$ a2 m$ M# ~\" ?3 e& k
    5.   for(y=1.0;y<=2.0;y=y+0.0009). v6 h8 n4 {% a. Y) L5 r
    6.   {! a2 y\" M6 ?/ m* L& W9 c
    7.   s=s+cos(1-sin(1.2*x^(y/2)+cos(1-sin(1.2*y^(x/2)))));
      9 h' @+ J0 \: H, F1 m: i
    8.   }
      , o1 \+ F\" S7 G( w; |
    9. }  
    复制代码
    结果:
    4 J$ u8 N  N% p$ U1008606.649474410 j- ]8 W* O2 l& ]: f' f
    0.609 //时间
    ; g4 L/ j; Y. F" c0 c1 j! F0 I
    0 T  D9 K) {0 C) b: k! ^这个matlab程序段是网友yycs001给出的。
    2 H9 I+ x: A: v: }7 V/ ~3 J
    1. %file speedtest.m
      , [) _. R6 e- z  c9 s
    2. function speedtest* i9 ~  B/ x  u: i+ D1 J
    3. format long' Q' [* t+ R+ b; s7 }9 A
    4. tic# |+ p% E5 S7 d\" Q$ a
    5. [x,y]=meshgrid(0:0.0011:1,1:0.0009:2);2 q. _. y& R# C, p+ C, Z( D) a$ L
    6. s=sum(sum(cos(1-sin(1.2*x.^(y/2)+cos(1-sin(1.2*y.^(x/2)))))))
      2 D4 c, S/ q% C0 w9 P8 {2 l+ O; S
    7. toc
    复制代码
    2 t# Z1 _; [/ K, F5 y
    Forcal代码1:**数组求和函数Sum,完全矢量化的代码
    6 V; |( K* `* l
    1. !using["math","sys"];) y5 ?/ {5 m1 ?1 _: s0 P
    2. mvar:' k# `8 n- x- V  A0 l  K\\" T
    3. t=clock(),
    4. 5 D2 P& h% O$ H, c
    5. oo{& Q  _: J& J: w7 i4 ]
    6.   ndgrid[linspacex(0,1,0.0011),linspacex(1,2,0.0009),&x,&y],5 m\\" O8 R) u1 x7 [3 J
    7.   Sum[Cos(rn(1)-Sin(rn(1.2)*x^(y/rn(2))+Cos(rn(1)-Sin(rn(1.2)*y^(x/rn(2)))))),0]: X% N/ ~& G, I. j) x
    8. };0 j5 F! Y7 d8 @6 O2 j1 n
    9. [clock()-t]/1000;
    结果:. o' D  J3 l0 F# {8 N
    1008606.64947441
    ; `; G! @3 k: }2 ^0.625 //时间! ]( A, L& ]$ \% [

    6 F" G7 M; e& L或者这个,与上面效率差别不大:
    * P( |) l+ B- t2 V1 m2 b% p$ m
    1. !using["math","sys"];
    2. % w* w, O$ J3 ^\\" s- C9 B
    3. mvar:
    4. % N' E2 l: d+ b  r* N9 B
    5. t=clock(),
    6. 9 F' y. U  J0 m/ D! F
    7. oo{
    8. / `+ o& y6 `! o- H! x/ S- b1 l9 ]
    9.   ndgrid[linspacex(0,1,0.0011),linspacex(1,2,0.0009),&x,&y],
    10. : a1 q1 t1 j+ i  ?/ O* y; ?* N+ W
    11.   Sum[Sum[Cos(rn(1)-Sin(rn(1.2)*x^(y/rn(2))+Cos(rn(1)-Sin(rn(1.2)*y^(x/rn(2))))))]]
    12.   c: U0 c) P4 l
    13. };# U6 A0 v; y- L$ |! ?5 r$ f+ ?
    14. [clock()-t]/1000;
    % |! G/ W8 g( C! z& {" u  ~
    Forcal代码2:求和函数sum,非矢量化代码5 s6 c) r, Q* i/ U& x8 N
    1. f(x,y)=cos(1-sin(1.2*x^(y/2)+cos(1-sin(1.2*y^(x/2))))); $ K$ H9 c5 N# V
    2. sum["f",0,1,0.0011,1,2,0.0009];
    复制代码
    结果:  R% S. s; d( D- H" ]8 z
    1008606.649474412 t+ ]0 o6 C9 q; |' m$ b2 ], i
    0.719 //时间/ H: ]+ s7 V% |) S6 v
    ( D/ |& w% b+ \
    Forcal代码3:while循环
    1 d0 g& m" n6 k/ |
    1. mvar:1 h) @& o\" Q5 r; H
    2. t=sys::clock();
      $ `* r* b. B- k\" K5 s' E3 J7 r) I
    3. s=0,x=0, $ ]5 S# P8 H2 \4 `1 A' \7 D
    4. while{x<=1,  //while循环算法; . ]1 X* P9 Q* q9 x) H2 |
    5.    y=1,
      8 j6 B  o6 n; c/ J
    6.    while{y<=2, ' S3 G* e( [\" s) B- R
    7.        s=s+cos(1-sin(1.2*x^(y/2)+cos(1-sin(1.2*y^(x/2))))), / _9 ?* l6 X2 ^+ `
    8.        y=y+0.0009 # }7 C. f\" |5 c# @& q
    9.       }, \" g% C0 Z- o$ i; b  ~6 R( t& q\" z
    10.    x=x+0.0011   q+ f. s1 }7 N/ f
    11. },
      * |+ }1 P! K9 l0 x& Q6 y# N$ E
    12. s;+ w5 T6 H  L% p
    13. [sys::clock()-t]/1000;
    复制代码
    结果:% C4 p9 u; i' |+ @6 i
    1008606.64947441
    , o0 o3 f. P3 L3 K0.734 //时间
    - ^  j, s8 o; P# p. j+ y0 z) V% C1 v3 s9 A" V5 C* s# C. `: d
    大家可下载OpenFC进行测试:http://www.forcal.net/xiazai/forcal9/openfc32w.rar
    . P/ b8 v8 q% W9 y
    * ?+ {2 `0 G" t/ w4 V0 m0 U* H注意Forcal的矢量化代码第一次运行有时效率较低。
      l; A, R+ ^0 s/ E# M1 N; J0 v5 B% K2 `4 e& X; _  M$ t
    例子1中Forcal和matlab都是矢量化代码,但matlab跑不过Forcal。该例子的特点是函数调用频繁,临时变量生成多,但矩阵很小,矩阵的各种函数运行时耗时较少。故说明Forcal函数调用+变量管理效率优于matlab。- C/ \1 O( B/ }& d0 J
    7 V8 B% _: M3 j  [2 v, [' E: Y% h
    例子2中Forcal的矢量化代码是最快的,但与matlab的矢量化代码相比仍有差距。该例子的特点是函数调用少,临时变量也少,但矩阵大。故说明Forcal的各种矩阵函数Sin、Cos及矩阵的加减运算等函数的内部设计不及matlab。' A7 G, L' h1 u# e6 ^4 J( Z( c

    ' o" h5 k' i3 G  f; {! X; R如能在函数内部设计上下点功夫,例子2超越matlab也是可能的。在这方面,期待高手们的指点。
    * q3 _# N, W6 h) j0 B7 X5 d' x
      h& L) y4 w: P* C2 Z如果例子2速度也超越了matlab ,matlab矢量化的神秘面纱就揭开了。0 ~6 B, l  h# J' C% {
    ! m6 @& {" C' ]3 y. A1 H( y! Q* |! `
    顺便说一下,例子1如果用C++的运算符重载来实现,速度将比Forcal慢一些,也就是说,在涉及运算符重载时,脚本的效率有时比C++还要高些。
    7 D* z: @9 h6 g, K- U; X* Z
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    参考:http://bbs.emath.ac.cn/thread-2709-1-1.html* f. q* F; Y- @% ?. }" H* Z& r

    4 S6 e( n* }  H% B8 d" f我在多个帖子中有不同说明,但将这些说明再集中到一个帖子中比较麻烦,大家相互参考一下,看能否把这个问题解决了。
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    参考:http://bbs.emath.ac.cn/thread-2727-1-1.html8 _# e; g% T3 ~# C
    , T6 J- j& E* S& }1 O9 @+ P2 S
    关于最快速的矩阵乘实现的讨论。
    8 I  i# H( N9 q: _9 l2 N, }5 t
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