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坏小子说笑话

DNA序列的k-mer index 问题
. O4 V2 m6 D$ q& f" T* f" Y2 L给定一个DNA序列，这个系列只含有4个字母ATCG，如 S =“CTGTACTGTAT”。给定一个整数值k，从S的第一个位置开始，取一连续k个字母的短串，称之为k-mer（如k= 5，则此短串为CTGTA）， 然后从S的第二个位置， 取另一k-mer（如k= 5，则此短串为TGTAC），这样直至S的末端，就得一个集合，包含全部k-mer 。 如对序列S来说，所有5-mer为

+ o1 ^  M1 [" Z. m7 d｛CTGTA，TGTAC，GTACT，TACTG，ACTGT，TGTAT｝

通常这些k-mer需一种数据索引方法，可被后面的操作快速访问。例如，对5-mer来说，当查询CTGTA，通过这种数据索引方法，可返回其在DNA序列S中的位置为｛1，6｝。
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1 h6 S( |% W4 i% S问题
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4 z7 D8 {9 G+ N) D6 S( P现在以文件形式给定 100万个 DNA序列，序列编号为1-1000000，每个基因序列长度为100 。
7 M# V$ j+ J( I) N1 T
8 W" _, ~, Q/ I; G, [6 I（1）要求对给定k， 给出并实现一种数据索引方法，可返回任意一个k-mer所在的DNA序列编号和相应序列中出现的位置。每次建立索引，只需支持一个k值即可，不需要支持全部k值。
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（2）要求索引一旦建立，查询速度尽量快，所用内存尽量小。
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（3）给出建立索引所用的计算复杂度，和空间复杂度分析。
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（4）给出使用索引查询的计算复杂度，和空间复杂度分析。

（5）假设内存限制为8G，分析所设计索引方法所能支持的最大k值和相应数据查询效率。
7 [! {( z9 o* Z! z$ t（6）按重要性由高到低排列，将依据以下几点，来评价索引方法性能
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/ l$ J/ ~# p$ ?希望好心人帮忙
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