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TA的每日心情 | 开心 2020-11-14 17:15 |
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问题的提出
- z2 }4 r) }9 ?/ v: ]医生们发现,在一个民族或地区,当某种传染病流传时,波及到的总人数大体上保持为一个常数。即既非所有人都会得病也非毫无规律,两次流行(同种疾病)的波及人数不会相差太大。如何解释这一现象呢?试用建模方法来加以证明。0 s+ a: W4 O4 h' x/ a, \2 r! R' `
' E6 N) Q8 t! \ p! c
指数模型
6 u# X% {6 W9 j, l8 \( X定义已感染人数为i(t) i(t)i(t),假设每个病人单位时间有效接触(足以使人致病)的人数为λ \lambdaλ,那么,在时间段Δt \Delta tΔt内,病人的增量可以用如下的公式进行计算( j# Q- }) o1 d# Y+ Y# i
i(t+Δt)−i(t)=λi(t)Δt i(t+\Delta t) - i(t) = \lambda i(t)\Delta t7 T" c4 {8 h, S% m+ O+ _, Q* e
i(t+Δt)−i(t)=λi(t)Δt+ r' r- b* _0 w1 m7 r: ]
. k5 e# I% a. R! Z( c将i(t) i(t)i(t)移到等式的右边,我们得到如下的递推公式0 a1 e ]! U$ v+ `
i(t+Δt)=i(t)+λi(t)Δt i(t+\Delta t) = i(t) + \lambda i(t)\Delta t
3 E4 M, Y/ Y( k; V9 E- E6 ]i(t+Δt)=i(t)+λi(t)Δt% Q% S. R# ^& j. v5 u
' F X% A$ D3 h: f8 F
以上递推公式意味着,我们可以通过当前时刻的病人人数和致病参数λ \lambdaλ,计算得到Δt \Delta tΔt时间后的病人人数,将以上思想在Python中进行实现,代码如下。6 V$ }4 I& i& v' f
( `; j: M S$ y9 ?# i2 m0 b* t ~2 d% g
import matplotlib.pyplot as plt
+ M/ A5 v2 ^4 c# {3 E `: n6 h; P6 G3 `%matplotlib inline4 K& q2 X5 V l6 S4 u# { F
deltaT = 0.01
# G+ E% K* |" E* i; F, c% Olamb = 2
" B2 ~" W5 I4 Di_list = []
% w1 t, q! ?$ s+ N3 Di0 = 0.08; # 初始有8%的人患病
$ u" H6 N9 ^! O' A# N* ni_list.append(i0)
5 l. W6 u9 W0 w, m+ mTot_Time = 10
( h6 G) y2 I- uTotStep = int(Tot_Time/deltaT): N: K" G1 T, n; }; m1 M+ ^
## / b1 \2 ~$ V! H& [- N# i- L J
for i in range(TotStep):; K, G4 t2 {# e( O0 q
i_new = i_list[-1] + lamb * i_list[-1] * deltaT
4 I v: g! i" u. R: Q. G i_list.append(i_new)/ n( O9 B o2 w; o1 {5 L% ?6 u
plt.plot(i_list)+ }9 O+ {, L, Q7 g- g
) p& d* E0 e! \8 Z1 Z) J3 O* ^$ P将以上代码在Jupyter Notebook中运行,得到病人人数的变化趋势见下图,从中我们可以看到病人的增长是指数级的,在短短十天后,已经有3000万人患病!这显然不符合实际情况的,那么问题出在哪里了呢?
( N E2 M1 a7 v1 t. ]' p# |- E
9 ?: M( N( R0 C; R3 ~' A$ h! L) x, Y2 {9 I3 g
实际上,若病人解除的是病人,并不能够使病人再次患病,实际上以上的算法导致了重复计数现象的发生。解决办法:必须区分已感染者和未感染者。2 ]6 W3 `/ U! l4 j; o' n
5 f6 T/ n! ]& K3 J0 r
SI模型/ a! `: y/ h+ s8 k5 k+ _7 Z
现在我们将人群分成两个群体:已感染者(病人,Infected)和未感染者(健康者,Suspect),该模型称为SI模型,模型假设:7 L0 l9 q1 @- g, L3 Y% h/ F
- v2 S) G' F4 Y' ~ e3 n q
在研究时间内,不考虑死亡率和出生率,即总人数N NN不变,病人和健康人的比例分别为i(t) i(t)i(t)和s(t) s(t)s(t)- A9 p3 D, n& f( @7 D) ~
每个病人在单位时间内有效接触并致病的人数为λ \lambdaλ,且只有接触健康人才会致病,称λ \lambdaλ为日接触率) g( S5 i! |: W0 V# \2 ~6 N
仿照指数模型里面的建模方法,在时间段Δt \Delta tΔt内,病人的增量可以用如下的公式进行计算
$ g/ O: d* N" I* u. y) h% C7 b+ j- ], v6 ~
N[i(t+Δt)−i(t)]=[λs(t)]Ni(t)Δt N[i(t+\Delta t)-i(t)]=[\lambda s(t)] N i(t) \Delta t, N8 K6 u) s# o
N[i(t+Δt)−i(t)]=[λs(t)]Ni(t)Δt
( K* V1 r+ R. m- }+ |
9 R7 K1 F/ S1 m2 c2 t- L& H消去N NN,再将i(t) i(t)i(t)移到等式的右边,我们得到如下的递推公式
0 y: E1 ]. n; N0 X$ Fi(t+Δt)=i(t)+λi(t)s(t)Δt i(t+\Delta t) = i(t) + \lambda i(t)s(t)\Delta t
1 N& C4 l! r* o! r0 j/ b- Ui(t+Δt)=i(t)+λi(t)s(t)Δt
[8 B( {7 u/ ?
$ C- t4 H9 ~- B3 |$ ^# d+ o& j8 D同样地,我们可以通过当前时刻的病人人数和致病参数λ \lambdaλ,计算得到Δt \Delta tΔt时间后的病人人数,将以上思想在Python中进行实现,代码如下:- L% U$ W7 Q, ], D" D7 T
. \; _- Z; m; A4 ]# n: k
import matplotlib.pyplot as plt; `4 r+ ~1 b' R4 s: K: l! P
%matplotlib inline' m1 }8 M* y( S8 c
deltaT = 0.01! r" U: [% X' k% C% J9 b, X2 z& A
lamb = 2$ C8 f9 v8 o! ]2 s I
i_list = []
- e) K- u1 h& {. M As_list = []
" e. |* k+ ~1 D1 ^+ g4 @i0 = 0.08; # 初始有8%的人患病
! Q$ H# W1 ?/ v6 ki_list.append(i0); `% s$ e9 y6 D1 n* W; z
s_list.append(1 - i0)! ?& ^7 h1 C; A; S3 w
Tot_Time =5 ~1 g, `. K7 C3 z; O" `. l
TotStep = int(Tot_Time/deltaT)
$ n& b: p- y/ _$ \# d/ m B- p5 @## : X$ B, {( A E% r; e% P
for i in range(TotStep):
8 t# n) V8 T( Z0 A/ ?- ]! d i_new = i_list[-1] + lamb * i_list[-1] * deltaT * s_list[-1]
( k- J: T7 X% I( j i_list.append(i_new)
4 o7 e; S U$ p) R" j s_list.append(1- i_new)) q+ d; V3 h: ]& j
Time = [i * deltaT for i in range(TotStep + 1)]+ R/ l$ D6 K( h' |5 V( R [" k& w7 T
plt.plot(Time,i_list)
0 m6 e& P8 W- vplt.plot(Time,s_list)9 @2 R5 V0 ^$ u' f5 w4 o4 p
plt.title("SI",fontsize = 20)
3 s9 x* f0 y' Q6 fplt.xlabel("Time")& y' g% G. Q, m! t$ |& Y
plt.ylabel('i(t)')' G! ~5 I/ G& @' G
5 l! ]1 U* d8 h, T. _( M
从SI模型我们可以看到,病人比例不再会出现"指数爆炸"的情况,在t→∞ t \rightarrow \inftyt→∞时最大患病比例为1。在SI模型中,病人数量的增长曲线是一个典型的S型曲线,又称为Logistic曲线,该曲线在生物学上经常被用来描述物种的增长模。3 \& U" p9 v, o4 y( b
0 M( p* w. C; S5 ~" U然后,SI模型的结论告诉我们,无论λ \lambdaλ多么小,最终人群都会患病,这显然也是不符合实际情况的。
}3 Z" \- M! n L: q————————————————
/ V4 J4 u5 X# U' O) J版权声明:本文为CSDN博主「任公子ha」的原创文章,遵循CC 4.0 BY-SA版权协议,转载请附上原文出处链接及本声明。
, B7 h% T, ]5 B z) d8 ]1 b原文链接:https://blog.csdn.net/baidu_26746963/article/details/93918383
) V, P0 h- H2 A6 [4 T- j) x4 g3 n3 m1 I9 W* I; j
2 J" p/ U' o8 k9 \/ X/ v& W
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