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TA的每日心情 | 开心 2020-11-14 17:15 |
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问题的提出
" e0 ~* r! h: D0 r) h. b医生们发现,在一个民族或地区,当某种传染病流传时,波及到的总人数大体上保持为一个常数。即既非所有人都会得病也非毫无规律,两次流行(同种疾病)的波及人数不会相差太大。如何解释这一现象呢?试用建模方法来加以证明。
. B% b3 w* w+ S2 A+ D" `: W! g7 @$ Z1 }
指数模型
8 h- o6 X1 ?- W- k7 B定义已感染人数为i(t) i(t)i(t),假设每个病人单位时间有效接触(足以使人致病)的人数为λ \lambdaλ,那么,在时间段Δt \Delta tΔt内,病人的增量可以用如下的公式进行计算
" E# F3 B, [4 J: z& _7 z( ii(t+Δt)−i(t)=λi(t)Δt i(t+\Delta t) - i(t) = \lambda i(t)\Delta t" B; Z& [# X! s; e5 }! F9 [# ^* x
i(t+Δt)−i(t)=λi(t)Δt* S0 b0 G1 C4 |& A! H7 w/ X
# h8 S) N' d" f, Q* n将i(t) i(t)i(t)移到等式的右边,我们得到如下的递推公式' J k( t# e4 x/ l0 f* B
i(t+Δt)=i(t)+λi(t)Δt i(t+\Delta t) = i(t) + \lambda i(t)\Delta t
6 e! v) T2 `- B2 q& zi(t+Δt)=i(t)+λi(t)Δt
K( }8 l8 n1 R
- @0 X9 x. M# }9 [以上递推公式意味着,我们可以通过当前时刻的病人人数和致病参数λ \lambdaλ,计算得到Δt \Delta tΔt时间后的病人人数,将以上思想在Python中进行实现,代码如下。& J( S) O+ e! t" ~" J% h
; b3 M% B( }/ C, o4 f7 E, q3 Timport matplotlib.pyplot as plt
( w1 ]8 b# R4 R, ], H& X: e `# D%matplotlib inline
( w2 O- p# V+ YdeltaT = 0.01
" z+ p, K& s7 a) ~% z' Vlamb = 2& s( ^ b4 M, U( ~6 c
i_list = []5 K: i `- j) o3 l/ n! o
i0 = 0.08; # 初始有8%的人患病' H8 ~0 u- j% S- t9 Y0 V
i_list.append(i0) K5 l1 \& `9 e7 h1 G' b" H6 }
Tot_Time = 10
$ @2 L ~$ n! P5 g% [5 ETotStep = int(Tot_Time/deltaT)
$ T& R: q" T+ s" h- A3 _##
/ f: n/ ^* D' m7 Tfor i in range(TotStep):
6 x& v$ O; V# C# E# E i_new = i_list[-1] + lamb * i_list[-1] * deltaT* N) ] P/ U1 v: O- z1 X8 y
i_list.append(i_new)/ X5 `$ _0 |" [" _$ Q
plt.plot(i_list)
$ c% l/ }3 H+ I I. y
7 ^; @* t: h& E: ~6 W; V将以上代码在Jupyter Notebook中运行,得到病人人数的变化趋势见下图,从中我们可以看到病人的增长是指数级的,在短短十天后,已经有3000万人患病!这显然不符合实际情况的,那么问题出在哪里了呢?
2 G, d8 p, D- O* p4 u/ O9 i, X- x$ v3 i: R/ ]
. |1 [# w" }4 V实际上,若病人解除的是病人,并不能够使病人再次患病,实际上以上的算法导致了重复计数现象的发生。解决办法:必须区分已感染者和未感染者。1 H8 D' {* n: D. f: y6 A; |
8 j: I' r4 G$ n+ a5 k* b5 S0 s6 E! eSI模型
9 L, }: o u6 N7 G+ }' Z现在我们将人群分成两个群体:已感染者(病人,Infected)和未感染者(健康者,Suspect),该模型称为SI模型,模型假设:
$ H$ N' I' P7 N$ |7 E3 K) K+ `
) j" {. }( O0 i( C在研究时间内,不考虑死亡率和出生率,即总人数N NN不变,病人和健康人的比例分别为i(t) i(t)i(t)和s(t) s(t)s(t)9 ^4 a+ Q7 C3 b: X2 E0 C9 [
每个病人在单位时间内有效接触并致病的人数为λ \lambdaλ,且只有接触健康人才会致病,称λ \lambdaλ为日接触率
! F; |' V; ?0 `3 X/ S仿照指数模型里面的建模方法,在时间段Δt \Delta tΔt内,病人的增量可以用如下的公式进行计算
; Q* e& K" R8 Z' G# s
7 |7 d* n; G5 ^; g1 ~7 O! aN[i(t+Δt)−i(t)]=[λs(t)]Ni(t)Δt N[i(t+\Delta t)-i(t)]=[\lambda s(t)] N i(t) \Delta t
( X# e4 T% s8 f% i6 z4 QN[i(t+Δt)−i(t)]=[λs(t)]Ni(t)Δt7 |. }3 A" J. q# T+ ]
4 S6 M0 V+ A' @1 a# o! ?& W) M9 S
消去N NN,再将i(t) i(t)i(t)移到等式的右边,我们得到如下的递推公式# e: [* U9 R& I
i(t+Δt)=i(t)+λi(t)s(t)Δt i(t+\Delta t) = i(t) + \lambda i(t)s(t)\Delta t
5 H# m) _+ }, Q' Ji(t+Δt)=i(t)+λi(t)s(t)Δt3 h# W! s( l0 D
, _6 X: t* n) F- {' e; q
同样地,我们可以通过当前时刻的病人人数和致病参数λ \lambdaλ,计算得到Δt \Delta tΔt时间后的病人人数,将以上思想在Python中进行实现,代码如下:& A. \2 W+ J; a+ q( }1 x
! E$ u/ R+ p0 _, ]0 \$ V& N" }
import matplotlib.pyplot as plt
) w2 w& L4 X8 ^( C( ]: ?%matplotlib inline
" B& c" c1 o( EdeltaT = 0.013 u9 W S/ `: K2 f
lamb = 2
6 c, T. w- {! B M/ {i_list = []. V& l4 `* O- x# \( S* C
s_list = []( }6 {/ h! Q1 x! v9 p8 b/ \
i0 = 0.08; # 初始有8%的人患病
4 r w" I0 |2 R1 f: Qi_list.append(i0)
" P; X [7 R5 a* e) Ks_list.append(1 - i0)
/ a6 F/ a7 K* V$ fTot_Time =5% O1 A" K C8 l$ ~6 P
TotStep = int(Tot_Time/deltaT); t' s3 _, ^* v/ T' A9 I
##
3 d7 P7 ?! c t0 D0 _. `6 Hfor i in range(TotStep):
0 }; G" Z/ ]8 ^ i_new = i_list[-1] + lamb * i_list[-1] * deltaT * s_list[-1]1 K C0 }/ Y/ u: M$ C/ P
i_list.append(i_new)
u! p, d, ^4 t! y s_list.append(1- i_new)
( ]- `, ]2 o: K' _Time = [i * deltaT for i in range(TotStep + 1)]/ s3 L* C4 }% h
plt.plot(Time,i_list) T0 d, n2 G1 F5 K' M. }5 g) T5 b
plt.plot(Time,s_list) _- @, O1 K$ V* E
plt.title("SI",fontsize = 20)& m) V. D" W1 I
plt.xlabel("Time")
K+ L9 y3 f2 M5 \1 @( I) W. `plt.ylabel('i(t)')
0 O- K, o0 w& ~1 F8 H9 x% E4 ]4 P# Q0 x4 [! s7 c+ O) o; t
从SI模型我们可以看到,病人比例不再会出现"指数爆炸"的情况,在t→∞ t \rightarrow \inftyt→∞时最大患病比例为1。在SI模型中,病人数量的增长曲线是一个典型的S型曲线,又称为Logistic曲线,该曲线在生物学上经常被用来描述物种的增长模。, t. b) b- u5 m: W% Y' m. u
C' E7 t; }1 u/ ~9 `( s然后,SI模型的结论告诉我们,无论λ \lambdaλ多么小,最终人群都会患病,这显然也是不符合实际情况的。
, j) p9 @9 X& `$ z+ z! s————————————————7 H9 c0 M {. o. G* p _* @5 i% s
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+ M) \4 C( y: ^; r4 U/ a) H原文链接:https://blog.csdn.net/baidu_26746963/article/details/93918383
. p# z. O# z) p6 F1 M" `$ D6 ]* E9 q3 Z* k4 f- h3 K
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