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TA的每日心情 | 开心 2020-11-14 17:15 |
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签到天数: 74 天 [LV.6]常住居民II
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问题的提出( q+ R. b0 ]4 Q# b/ ]
医生们发现,在一个民族或地区,当某种传染病流传时,波及到的总人数大体上保持为一个常数。即既非所有人都会得病也非毫无规律,两次流行(同种疾病)的波及人数不会相差太大。如何解释这一现象呢?试用建模方法来加以证明。
- N$ m8 g* Z6 J5 P/ M+ i3 H0 a, t
6 ?: Z1 @1 e" v, m! D: Y. S/ o指数模型
) G- @) X- U7 A- H' h7 W定义已感染人数为i(t) i(t)i(t),假设每个病人单位时间有效接触(足以使人致病)的人数为λ \lambdaλ,那么,在时间段Δt \Delta tΔt内,病人的增量可以用如下的公式进行计算/ i6 e1 A& V; r1 ~5 C3 O, }
i(t+Δt)−i(t)=λi(t)Δt i(t+\Delta t) - i(t) = \lambda i(t)\Delta t
; W& x9 a; C' h6 K* d% }2 R' Ti(t+Δt)−i(t)=λi(t)Δt
% v( S4 Y6 P& Z7 q/ w
( d/ {5 N2 C. R l( {- N; z( q将i(t) i(t)i(t)移到等式的右边,我们得到如下的递推公式
- O+ t8 J$ c& i O- fi(t+Δt)=i(t)+λi(t)Δt i(t+\Delta t) = i(t) + \lambda i(t)\Delta t S( s7 U- ?3 ^, A/ R" Y8 o, i
i(t+Δt)=i(t)+λi(t)Δt
) j( J- N! m. e
+ `: i1 Z7 b4 @( t# I. f以上递推公式意味着,我们可以通过当前时刻的病人人数和致病参数λ \lambdaλ,计算得到Δt \Delta tΔt时间后的病人人数,将以上思想在Python中进行实现,代码如下。; z% v) j7 n0 ?: H' n$ U, S- j7 j
5 p. ^% ^3 o4 t. F6 Q L' }
import matplotlib.pyplot as plt3 }2 t& o7 N4 A) t
%matplotlib inline
: _/ ?8 g7 N; u6 ^( W' J$ h9 gdeltaT = 0.01
% M; a. \8 l, z3 Ulamb = 2 U# B$ J1 _0 z9 L
i_list = []
3 l9 L3 A# P: N6 M4 |" Ji0 = 0.08; # 初始有8%的人患病
. w) r- ^1 R I, L. V3 [i_list.append(i0)1 n$ s3 V3 ?* k# a, u
Tot_Time = 10
0 h$ n- h! }; [# F* A5 ITotStep = int(Tot_Time/deltaT)
" e4 h9 V- k5 A6 i1 n##
3 B0 q' [7 \3 q% u0 [5 X+ @for i in range(TotStep): Y3 c$ F# M& l
i_new = i_list[-1] + lamb * i_list[-1] * deltaT0 H7 }5 J+ n9 `2 k9 h
i_list.append(i_new)
! i2 [7 p [% ^' y9 L# N% W3 nplt.plot(i_list)
4 y4 h$ f7 l! }8 G8 f
8 \/ R; c+ H6 f% d将以上代码在Jupyter Notebook中运行,得到病人人数的变化趋势见下图,从中我们可以看到病人的增长是指数级的,在短短十天后,已经有3000万人患病!这显然不符合实际情况的,那么问题出在哪里了呢?
6 \( m e. ^% \/ M( h7 a/ \% N2 i( q5 j; ^6 B
1 F% V2 o* w6 C) H# O' o' R实际上,若病人解除的是病人,并不能够使病人再次患病,实际上以上的算法导致了重复计数现象的发生。解决办法:必须区分已感染者和未感染者。
$ S8 v( e0 }1 p$ d3 z5 y, J7 l( b; b
SI模型! N+ h, H6 R2 t D7 M8 s) o
现在我们将人群分成两个群体:已感染者(病人,Infected)和未感染者(健康者,Suspect),该模型称为SI模型,模型假设:/ h3 ~' ~# u' P9 h( U* I4 u
8 R- F' r }* x; y
在研究时间内,不考虑死亡率和出生率,即总人数N NN不变,病人和健康人的比例分别为i(t) i(t)i(t)和s(t) s(t)s(t)7 W1 {7 z+ B3 J7 v) w9 w2 S1 L* E
每个病人在单位时间内有效接触并致病的人数为λ \lambdaλ,且只有接触健康人才会致病,称λ \lambdaλ为日接触率: K: g; _, p; \2 M
仿照指数模型里面的建模方法,在时间段Δt \Delta tΔt内,病人的增量可以用如下的公式进行计算% X; [% h: F' ~) j6 ]/ ]' z/ S
; j) ]8 \+ E- k7 g3 Y2 WN[i(t+Δt)−i(t)]=[λs(t)]Ni(t)Δt N[i(t+\Delta t)-i(t)]=[\lambda s(t)] N i(t) \Delta t) z4 ^& g+ H8 j9 @& N
N[i(t+Δt)−i(t)]=[λs(t)]Ni(t)Δt4 n8 U0 m Y7 m& q! w5 T1 k
) D7 u2 \- I8 s% G& o
消去N NN,再将i(t) i(t)i(t)移到等式的右边,我们得到如下的递推公式5 N" t0 ?% e2 s0 {. c& H4 L" M& \
i(t+Δt)=i(t)+λi(t)s(t)Δt i(t+\Delta t) = i(t) + \lambda i(t)s(t)\Delta t3 ~3 N1 F! }! W5 E* h
i(t+Δt)=i(t)+λi(t)s(t)Δt+ {5 t, N% g6 V0 {6 |- n* m
# M5 m1 O0 ^& c; F3 Q( t, O- D ]同样地,我们可以通过当前时刻的病人人数和致病参数λ \lambdaλ,计算得到Δt \Delta tΔt时间后的病人人数,将以上思想在Python中进行实现,代码如下:
- `$ h1 ]/ W0 H" |3 f
$ }: K* c" S5 {& r- N+ X9 pimport matplotlib.pyplot as plt5 j( U0 u( A8 G. e8 Y5 g' G# ~
%matplotlib inline
1 X& }5 x, i* J5 [deltaT = 0.01+ J z1 j" z/ S$ G% q7 K. ^ O
lamb = 2 B8 w- g+ K6 O/ n9 n7 Y
i_list = []
3 r& U+ B4 X, r' _+ ts_list = []
' W, V) j4 d0 `9 t- C5 _1 Mi0 = 0.08; # 初始有8%的人患病3 |: J0 E1 p, n) i8 k
i_list.append(i0)
& H+ e+ C# c; ws_list.append(1 - i0), E+ q G) U$ k7 h# v! o
Tot_Time =5) j- p$ \$ M0 x. F2 Z5 S
TotStep = int(Tot_Time/deltaT)# }% v3 s/ ?+ U+ a" d1 B
##
8 b* N6 e4 Q6 P( p R5 [1 e' ^for i in range(TotStep):
$ f3 r4 D; i. B4 m$ ]) ] i_new = i_list[-1] + lamb * i_list[-1] * deltaT * s_list[-1]
. z) D' a' H6 Y8 T7 z+ c i_list.append(i_new)
* r6 }( Q' n0 N# f- E! _0 | s_list.append(1- i_new): Z/ F5 R$ @ ?/ M) n
Time = [i * deltaT for i in range(TotStep + 1)]5 b2 w; ]' S1 q5 @. Z1 I
plt.plot(Time,i_list), e. ]: s- j9 Y+ @' j1 @9 \
plt.plot(Time,s_list)1 l- v7 _" l; n: Y- z
plt.title("SI",fontsize = 20)
- N* P' T! [( B, Kplt.xlabel("Time")
+ B/ h; e. d$ ]" @1 Tplt.ylabel('i(t)')
9 ~# g% b( m( R# e9 P* b& X- w. H1 v$ L4 z+ D) t
从SI模型我们可以看到,病人比例不再会出现"指数爆炸"的情况,在t→∞ t \rightarrow \inftyt→∞时最大患病比例为1。在SI模型中,病人数量的增长曲线是一个典型的S型曲线,又称为Logistic曲线,该曲线在生物学上经常被用来描述物种的增长模。
* M/ Z% E; o4 v* }; @( }( |' f
1 I# F2 `2 W* e( @7 D然后,SI模型的结论告诉我们,无论λ \lambdaλ多么小,最终人群都会患病,这显然也是不符合实际情况的。- H. P8 k4 f8 K' B
————————————————9 S0 H7 V3 P7 I2 B$ g) c1 U
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; C) w9 D% s! k$ w3 v) i7 @原文链接:https://blog.csdn.net/baidu_26746963/article/details/939183832 ?) k4 h/ F, ^2 R- y
, {9 A4 Z7 }! v, y6 l' @# l8 ?6 x$ C3 N9 J
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