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[建模教程] 差分方程模型(四):遗传模型

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    发表于 2020-6-7 16:37 |只看该作者 |倒序浏览
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    1 常染色体遗传模型
    ! K/ ~8 d$ G: h& C1 R* H常染色体遗传中,后代从每个亲体的基因对中各继承一个基因,形成自己的基因对, 基因对也称为基因型。如果我们所考虑的遗传特征是由两个基因 A 和 a 控制的,那么 就有三种基因对,记为 AA, Aa,aa 。例如,金鱼草由两个遗传基因决定花的颜色,基 因型是 AA的金鱼草开红花, Aa 型的开粉红色花,而 aa 型的开白花。又如人类眼睛 的颜色也是通过常染色体遗传控制的。基因型是 AA或 Aa 的人,眼睛为棕色,基因型 是aa 的人,眼睛为蓝色。这里因为 AA和 Aa 都表示了同一外部特征,我们认为基因 A 支配基因a ,也可以认为基因a 对于 A 来说是隐性的。当一个亲体的基因型为 Aa ,而 另一个亲体的基因型是aa 时,那么后代可以从aa 型中得到基因a ,从 Aa 型中或得到 基因 A ,或得到基因a 。这样,后代基因型为 Aa 或 aa 的可能性相等。下面给出双亲 体基因型的所有可能的结合,以及其后代形成每种基因型的概率,如下表所示。* V; J( S4 K& z+ ?3 U# P
    ) _- N: P- [' T, T1 L

    ) e! U  ?" B) Z7 N6 @6 k, d6 G4 \% Y  Q% B* f
    例 5 农场的植物园中某种植物的基因型为 AA, Aa 和 aa 。农场计划采用 AA型的 植物与每种基因型植物相结合的方案培育植物后代。那么经过若干年后,这种植物的任 一代的三种基因型分布如何?
    ( A) \& q" E2 j1 n
    # }+ X6 u) D3 Y5 c; i) Z6 p(a)假设! t8 r: H( m9 Q
    令n = 0,1,2,...。 1 F& S& V! f, L" O* L
    ) m" Z0 x  j# [" M

    . r7 T" F/ V  N" ]6 n: J" Z
    0 M6 y, m& r3 c0 Z" j' ~% D: p8 p7 t) B) q5 r3 C+ V
    ! X- g- ]: z) d& ~  f8 Z: d
    (b)建模' V+ k9 A6 ~$ F, f

    $ p1 k3 n- }" L
    / g6 A# x5 G# V2 _
    ' c1 J+ H( g% V% ~# n% X% b+ w+ {0 V$ }6 |" F7 M
    . I' r" R, J+ I/ C- m( m& V
    1 g1 s9 X5 w) x
    编写如下 Matlab 程序:3 p6 i8 I. K- J! U

    - m- l, m$ X# l5 lsyms n a0 b0 c06 v4 B6 T$ }% Y$ Y& H+ m
    M=sym('[1,1/2,0;0,1/2,1;0,0,0]');
    3 X6 H1 d2 y7 f% x! E4 n0 l[p,lamda]=eig(M);
    ( P1 f( }+ p& t8 }7 r+ q0 [x=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0];6 ^6 w7 J7 J+ C: P! t% [6 x8 N
    x=simple(x)
    8 \8 |, U: p/ j% D: ?1 A8 q3 I& X1 k( g) \# b

    + I$ e- U$ w7 q2 ?
    7 m( Z' f5 x# |: Y/ ]

    即在极限的情况下,培育的植物都是 AA型。

    (c)模型的讨论

    若在上述问题中,不选用基因 AA型的植物与每一植物结合,而是将具有相同基因 型植物相结合,那么后代具有三种基因型的概率如下表所示。

    编写如下 Matlab 程序:


    ! G2 V! f, A* f: t8 B4 t1 J6 }2 csyms n a0 b0 c0; G  i$ y: h- I' U# u# ~
    M=sym('[1,1/4,0;0,1/2,0;0,1/4,1]');2 h* X3 s& T2 t& {
    [p,lamda]=eig(M);
      ?# r/ h) j, Q' M# d9 U* d5 D+ wx=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0];/ w: C4 W7 y) r1 @2 @/ R, r! Y
    x=simple(x) 1 R5 z* x4 K+ ]
    " S/ q7 R0 K$ G& j

    0 u. f3 f0 E! r9 s+ x3 X# M2 H0 Z8 N, o. n+ ]! o( p: a7 y
    2 常染色体隐性病模型
    5 T9 o8 {* d: f现在世界上已经发现的遗传病有将近 4000 种。在一般情况下,遗传病与特殊的种 族、部落及群体有关。例如,遗传病库利氏贫血症的患者以居住在地中海沿岸为多,镰 状网性贫血症一般流行在黑人中,家族黑蒙性白痴症则流行在东欧犹太人中间。患者经 常未到成年就痛苦地死去,而他们的父母则是疾病的病源。假若我们能识别这些疾病的 隐性患者,并且规定两个隐性患者不能结合(因为两个隐性患者结合,他们的后代就可 能成为显性患者),那么未来的儿童,虽然有可能是隐性患者,但决不会出现显性特征, 不会受到疾病的折磨。现在,我们考虑在控制结合的情况下,如何确定后代中隐性患者 的概率。+ p2 s) @+ c+ u' d) l" f
    ) w* y/ s. V6 v+ F6 |( @) i
    (a)假设
    - c0 q; @0 o, H; w3 ~# _( c' K(i)常染色体遗传的正常基因记为 A ,不正常基因记为a ,并以 AA, Aa,aa 分别 表示正常人,隐性患者,显性患者的基因型。
    7 |9 F6 Z! Z3 S/ U9 c( A+ p! L: ?  u$ J& V# a
    % K, q- s1 S) C% B4 u

    % `8 _, D- t! n6 V4 @; { (b)建模/ X# E  \8 t& W' h0 ^# `
    7 O& Q4 F- p: |/ W

    1 X1 |5 C$ C: L2 f$ A! E/ o6 y9 I+ v7 z. I. H' l  O6 A3 S
    , [# L7 o& |* [' p$ M5 O
    ; E$ x/ o3 f, D, y, y

    4 _) o% `4 v# F5 ]; p' |: `4 z(c)模型讨论
    # d: g/ G) ]  R1 o- B研究在随机结合的情况下,隐性患者的变化是很有意思的,但随机结合导致了非线 性化问题,超出了本章范围,然而用其它技巧,在随机结合的情况下可以把(24)式改写为
    * |" m9 [2 j# v' r: o, P: j  P! \8 o  |3 f# u

    # c2 F- d5 F1 w( C
    ) m) k7 B$ H/ ^6 D& ~2 i. u下面给出数值的例子: 某地区有 10%的黑人是镰状网性贫血症隐性患者,如果控制结合,根据(24)式 可知下一代(大约 27 年)的隐性患者将减少到 5%;如果随机结合,根据(25)式, 可以预言下一代人中有 9.5%是隐性患者,并且可计算出大约每出生 400 个黑人孩子, 其中有一个是显性患者。# T; }' S3 q, P
    4 L" l3 L% `+ p) D3 a, i
    3   X − 链遗传模型
    : K" a! ~& X5 [! S3 hX − 链遗传是指雄性具有一个基因 A 或a ,雌性具有两个基因 AA,或 Aa ,或 aa 。 其遗传规律是雄性后代以相等概率得到母体两个基因中的一个,雌性后代从父体中得到 一个基因,并从母体的两个基因中等可能地得到一个。下面,研究与 X − 链遗传有关 的近亲繁殖过程。
    & [, }8 a* M) r% z, S2 ?
    " y4 Y* X# r6 c+ j( N, |(a)假设* W$ o: Z; f9 D  S7 n
    (i)从一对雌雄结合开始,在它们的后代中,任选雌雄各一个成配偶,然后在它 们产生的后代中任选两个结成配偶。如此继续下去。1 `8 C* \! S" ]" z: O: a- W! K

      z7 q4 N4 k" P(ii)父体与母体的基因型组成同胞对,同胞对的形式有 (A, AA) , (A, Aa) , (A,aa) , (a, AA) ,(a, Aa) ,(a,aa) 六种。初始一对雌雄的同胞对,是这六种类型 中的任一种,其后代的基因型如下表所示。
    ) t% u" o- Q+ W8 [" U, x' b$ s) w7 j8 _9 q

    * y/ Z5 Z! G; X$ i0 A- Y$ v8 |. G; g7 B4 B% l2 ~

    # `/ H! }% N4 _& ]0 N6 ~0 v3 ]1 k5 R+ K+ k: e& h( Z2 U( J

    ; g. ~' Z- }4 z
      L7 e& ~. Z* W7 Z+ p- [4 h7 U: G: X: D$ u+ `5 ?/ D$ A
    编写如下 Matlab 程序:
    + F" [0 l5 n+ n) i/ v6 I
    ) b( z: h3 Z: N, z' Isyms n a0 b0 c0 d0 e0 f08 A# ~2 `( C: U
    M=[1 1/4 0 0 0 0;0 1/4 0 1 1/4 0;0 0 0 0 1/4 0;- O0 I" K7 X* F! |) H9 s$ Q+ M
    0 1/4 0 0 0 0;0 1/4 1 0 1/4 0;0 0 0 0 1/4 1];
    ! D: b2 |. _' wM=sym(M);
    ) I+ J, Z2 m8 v" {* Z, V[p,lamda]=eig(M);
    ! h" h% j4 }; `) @+ j0 Ix=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0;d0;e0;f0];4 H, T  a  J6 p- S: `% X7 s: u
    x=simple(x) 4 B/ W, |3 H, E* O2 Y! [

    3 u% Y% [3 f! p; C* r' s  k由上述程序计算结果可以看出- `% ~) I+ r0 V9 y, E& }7 h
    # ^* H$ ]3 @. _

    + c2 u2 u6 j5 Z) p: d9 v8 E
    ' s2 Z( Q, O) [. m* L, b* V& h习 题6 A3 J# X. d& ^- m' M% u: k
    1. (汉诺塔问题)n 个大小不同的圆盘依其半径大小依次套在桩 A 上,大的在下, 小的在上。现要将此 n 个盘移到空桩 B 或C 上,但要求一次只能移动一个盘且移动过 程中,始终保持大盘在下,小盘在上。移动过程中桩 A 也可利用。设移动 n 个盘的次 数为  ,试建立关于  的差分方程,并求  的通项公式。: u( p- w" Q& }3 {; M

    - t: t4 t" _! p2 w. g4 L9 D5 `2. 设第一月初有雌雄各一的一对小兔。假定两月后长成成兔,同时(即第三月) 开始每月初产雌雄各一的一对小兔,新增小兔也按此规律繁殖。设第n 月末共有  对 兔子,试建立关于  的差分方程,并求  的通项公式。( N5 a1 Y1 N! N6 @5 r' q
    6 @: [' {6 P4 G; y3 P
    3. 在常染色体遗传的问题中,假设植物总是和基因型是 Aa 的植物结合。求在第n 代中,基因型为 AA, Aa 和 aa 的植物的百分率,并求当 n 趋于无穷大时,基因型分布 的极限。 ! {" c- Z! R# ?6 u$ Y- B' U! @
    3 u+ a6 C; I+ z# P  u

    % [- A% Q& I: h$ Q' l# a* L1 N( p! g. m% m" X' t

    1 w8 D) X( |; Q$ P; W% @* ^————————————————
    + d3 y8 _7 ]" J% V, k% U" m' _版权声明:本文为CSDN博主「wamg潇潇」的原创文章,遵循CC 4.0 BY-SA版权协议,转载请附上原文出处链接及本声明。
    3 j8 v1 c& s2 t/ @2 i3 Q原文链接:https://blog.csdn.net/qq_29831163/article/details/89646596
    3 r' D6 ~* L( X6 j
    6 }  X$ S9 T6 x* ~
    * r( e; m) ?9 H( M
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