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[建模教程] 差分方程模型(四):遗传模型

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    发表于 2020-6-7 16:37 |只看该作者 |倒序浏览
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    1 常染色体遗传模型
    ! O% @. p' T9 t/ a常染色体遗传中,后代从每个亲体的基因对中各继承一个基因,形成自己的基因对, 基因对也称为基因型。如果我们所考虑的遗传特征是由两个基因 A 和 a 控制的,那么 就有三种基因对,记为 AA, Aa,aa 。例如,金鱼草由两个遗传基因决定花的颜色,基 因型是 AA的金鱼草开红花, Aa 型的开粉红色花,而 aa 型的开白花。又如人类眼睛 的颜色也是通过常染色体遗传控制的。基因型是 AA或 Aa 的人,眼睛为棕色,基因型 是aa 的人,眼睛为蓝色。这里因为 AA和 Aa 都表示了同一外部特征,我们认为基因 A 支配基因a ,也可以认为基因a 对于 A 来说是隐性的。当一个亲体的基因型为 Aa ,而 另一个亲体的基因型是aa 时,那么后代可以从aa 型中得到基因a ,从 Aa 型中或得到 基因 A ,或得到基因a 。这样,后代基因型为 Aa 或 aa 的可能性相等。下面给出双亲 体基因型的所有可能的结合,以及其后代形成每种基因型的概率,如下表所示。$ a7 h8 z5 i! ]8 ?+ P

    7 T" P: d. ]6 R8 w
    8 C) N! k! U8 b$ {) S; }0 i' n  o
    例 5 农场的植物园中某种植物的基因型为 AA, Aa 和 aa 。农场计划采用 AA型的 植物与每种基因型植物相结合的方案培育植物后代。那么经过若干年后,这种植物的任 一代的三种基因型分布如何?9 p( a, ^6 ?! b/ Z* Q1 L
    1 p. e% }; t& E) V
    (a)假设
    ; \7 b% D7 a  W8 @0 f' r* T令n = 0,1,2,...。
    2 t$ ]! I0 d3 `# O4 K% X) g/ Z0 p% s* j7 j
    3 G$ ]# }; b5 B! I% s
    : F; b2 y4 Q, c% M3 j) @

    . R- o( C2 e5 y& T0 T4 I1 q- v0 i3 v5 W
    (b)建模
    9 g4 K$ d8 g0 m  X/ H* x  \+ x, ~7 U! M2 C
    2 M5 z! g1 W( M, G  y( R

    : I( b' z  t& G1 C* @1 I9 {1 S1 E) Z/ O, @' Y# I$ a* I! h' V
    . h- ]  M/ `9 G4 i- J. }

    % J$ O( Y% S2 z9 u编写如下 Matlab 程序:
    1 o$ l7 K) H  @  G4 j  o% H* T4 d  t- s, x' W. \. Y( C3 V
    syms n a0 b0 c0
    8 f: j% I3 E8 `: h( p: d1 NM=sym('[1,1/2,0;0,1/2,1;0,0,0]');% B& h5 {7 x9 _; C5 e
    [p,lamda]=eig(M);, j6 q/ u4 \; o. P* Z7 o
    x=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0];
    % V9 i" u3 p( P; M: V- t9 s" G0 Xx=simple(x)
    # G" H! P/ e( m+ k
    0 D0 T& F2 Q) j. t, o- v' J8 B$ H2 j1 _

    ( ?, n. I- j% P$ h

    即在极限的情况下,培育的植物都是 AA型。

    (c)模型的讨论

    若在上述问题中,不选用基因 AA型的植物与每一植物结合,而是将具有相同基因 型植物相结合,那么后代具有三种基因型的概率如下表所示。

    编写如下 Matlab 程序:

    2 p1 c7 R, |2 X) L9 {
    syms n a0 b0 c0. k- ?+ V7 G4 N" {
    M=sym('[1,1/4,0;0,1/2,0;0,1/4,1]');
    5 o, S! Z0 x4 ]. j[p,lamda]=eig(M);6 x/ L. l  w5 s- y% Q# ]) e' D
    x=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0];: o+ C) {  x7 N: g4 ^! f
    x=simple(x)
    5 S; V; a) d" S" Q8 @& _4 L- X1 r4 J

    % D7 W' c/ K& ]$ I3 F: ?$ V8 a, G4 C9 _+ K
    2 常染色体隐性病模型
    ) z/ U- A1 f/ n6 P& ^* d) D现在世界上已经发现的遗传病有将近 4000 种。在一般情况下,遗传病与特殊的种 族、部落及群体有关。例如,遗传病库利氏贫血症的患者以居住在地中海沿岸为多,镰 状网性贫血症一般流行在黑人中,家族黑蒙性白痴症则流行在东欧犹太人中间。患者经 常未到成年就痛苦地死去,而他们的父母则是疾病的病源。假若我们能识别这些疾病的 隐性患者,并且规定两个隐性患者不能结合(因为两个隐性患者结合,他们的后代就可 能成为显性患者),那么未来的儿童,虽然有可能是隐性患者,但决不会出现显性特征, 不会受到疾病的折磨。现在,我们考虑在控制结合的情况下,如何确定后代中隐性患者 的概率。9 ^! Z' b) l9 O5 N+ E# x; O6 N9 `
    * [$ ^5 v" Z: E# a; o1 w0 d
    (a)假设' s+ b' R; n2 F+ i4 H
    (i)常染色体遗传的正常基因记为 A ,不正常基因记为a ,并以 AA, Aa,aa 分别 表示正常人,隐性患者,显性患者的基因型。
    2 z4 U; ?5 h: j* }" B- V8 P. g+ M! y% L; b7 E

    7 i5 Q* E8 c& s( H: }$ h8 Z8 s4 p: B$ A0 I# K
    (b)建模9 ~! q, }5 F" F8 Z8 {

    2 p: ]1 x9 s9 |, @& M' m8 r/ |% @; y& r) j6 [8 K" o
    7 z5 e  `3 A  P( f) ^9 G/ G8 r
    ; n5 e, T3 m5 [. C) I

    ( D/ E1 r5 H7 n/ L: {# s& h; y6 s8 j" H5 G
    (c)模型讨论
    ' V; s# y3 R7 s3 [; Y7 x研究在随机结合的情况下,隐性患者的变化是很有意思的,但随机结合导致了非线 性化问题,超出了本章范围,然而用其它技巧,在随机结合的情况下可以把(24)式改写为2 i6 a0 o: f& l* U) ]+ F
    5 d1 Q6 S; `4 \
    / s: ]1 S: o, I, I+ {
    * |5 @. N& I/ Y8 _" W  |
    下面给出数值的例子: 某地区有 10%的黑人是镰状网性贫血症隐性患者,如果控制结合,根据(24)式 可知下一代(大约 27 年)的隐性患者将减少到 5%;如果随机结合,根据(25)式, 可以预言下一代人中有 9.5%是隐性患者,并且可计算出大约每出生 400 个黑人孩子, 其中有一个是显性患者。) p8 c) K  @9 M# w1 @$ ^  e; Q
    ; C& \, q$ L  Y1 O+ U, W  ]
    3   X − 链遗传模型
    4 U2 }; q) o; I) }X − 链遗传是指雄性具有一个基因 A 或a ,雌性具有两个基因 AA,或 Aa ,或 aa 。 其遗传规律是雄性后代以相等概率得到母体两个基因中的一个,雌性后代从父体中得到 一个基因,并从母体的两个基因中等可能地得到一个。下面,研究与 X − 链遗传有关 的近亲繁殖过程。
    ; @5 K2 O6 ~& p! b$ v
    ; o# N0 U9 k! L7 k5 c' g(a)假设8 J8 J' G  k6 s! v
    (i)从一对雌雄结合开始,在它们的后代中,任选雌雄各一个成配偶,然后在它 们产生的后代中任选两个结成配偶。如此继续下去。
      k+ [( p" f( r7 k) ~4 s; ]
    0 X2 H4 {2 W9 y0 ](ii)父体与母体的基因型组成同胞对,同胞对的形式有 (A, AA) , (A, Aa) , (A,aa) , (a, AA) ,(a, Aa) ,(a,aa) 六种。初始一对雌雄的同胞对,是这六种类型 中的任一种,其后代的基因型如下表所示。7 t' Z- A  U. h' c1 {6 p* u

    3 q" I! G, {3 G4 L0 j& G2 j9 B, m0 p4 b3 ?5 Y; i) I/ O
    ! f0 Y4 r4 f' o2 O7 ]

    ) U# E7 {9 P1 P2 D; U. \- I- o- |

    ( F* J+ S0 T2 P4 S& n3 l. h! w$ V0 V2 ~5 R- M5 s7 @3 V4 T; Q; `
    + f- s8 W7 U0 q( D+ L0 E/ a# |7 Z
    编写如下 Matlab 程序:
    / x: N, y) w9 e$ j
    # k, A) u' z* `. Z8 ssyms n a0 b0 c0 d0 e0 f0
    % K8 D; h9 p$ s9 xM=[1 1/4 0 0 0 0;0 1/4 0 1 1/4 0;0 0 0 0 1/4 0;5 d" ~( b, X& t& y. s! p* a) L
    0 1/4 0 0 0 0;0 1/4 1 0 1/4 0;0 0 0 0 1/4 1];
    " n. M' ~* w, @. A) k0 I2 OM=sym(M);/ W( m% ]) ^2 T: j3 O7 i/ w6 G2 i) l, L4 e
    [p,lamda]=eig(M);4 Y+ o- }5 J  ]' \  Y% C9 Z1 B
    x=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0;d0;e0;f0];
    . C; P* G2 E" T) j/ qx=simple(x)
    : m" [6 l0 G1 W' a3 \# @
    7 r" t* Q) d' ]* j由上述程序计算结果可以看出" V" E3 @  f  f6 v
    * t. y; c% F) \- L
    0 g1 \. |$ u& D" _4 B0 ?

    ' k2 c) v: o3 G2 t0 Y习 题
    / Z, W% |3 \+ C6 [% Y* y9 t1. (汉诺塔问题)n 个大小不同的圆盘依其半径大小依次套在桩 A 上,大的在下, 小的在上。现要将此 n 个盘移到空桩 B 或C 上,但要求一次只能移动一个盘且移动过 程中,始终保持大盘在下,小盘在上。移动过程中桩 A 也可利用。设移动 n 个盘的次 数为  ,试建立关于  的差分方程,并求  的通项公式。
    3 n2 d9 q/ y0 Q) x$ x: C
      \5 N' ~- D4 U1 B3 B* G' j' z2. 设第一月初有雌雄各一的一对小兔。假定两月后长成成兔,同时(即第三月) 开始每月初产雌雄各一的一对小兔,新增小兔也按此规律繁殖。设第n 月末共有  对 兔子,试建立关于  的差分方程,并求  的通项公式。) |; h  Y6 K* ^% x5 s

    ; q2 Q5 w( B+ F3. 在常染色体遗传的问题中,假设植物总是和基因型是 Aa 的植物结合。求在第n 代中,基因型为 AA, Aa 和 aa 的植物的百分率,并求当 n 趋于无穷大时,基因型分布 的极限。
    ! {$ ?4 A' d0 I; K  w0 j1 A' m6 s
    7 Y4 w* G5 |% J! D
    + a' y6 d2 Q2 `" ~1 t* t$ I
    . X/ D7 T8 l4 \3 H0 J9 z" a7 j' E" [
    ————————————————4 E* ]/ W( u0 @2 h+ h
    版权声明:本文为CSDN博主「wamg潇潇」的原创文章,遵循CC 4.0 BY-SA版权协议,转载请附上原文出处链接及本声明。
    3 ?2 m' n1 b* |$ O原文链接:https://blog.csdn.net/qq_29831163/article/details/89646596
    . ~& i% _3 u3 M; I. m
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    : S' A+ D4 N( z! n, ^% R% O7 ~
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