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TA的每日心情 | 开心 2020-11-14 17:15 |
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1 常染色体遗传模型
& t) s+ b' X7 y4 k常染色体遗传中,后代从每个亲体的基因对中各继承一个基因,形成自己的基因对, 基因对也称为基因型。如果我们所考虑的遗传特征是由两个基因 A 和 a 控制的,那么 就有三种基因对,记为 AA, Aa,aa 。例如,金鱼草由两个遗传基因决定花的颜色,基 因型是 AA的金鱼草开红花, Aa 型的开粉红色花,而 aa 型的开白花。又如人类眼睛 的颜色也是通过常染色体遗传控制的。基因型是 AA或 Aa 的人,眼睛为棕色,基因型 是aa 的人,眼睛为蓝色。这里因为 AA和 Aa 都表示了同一外部特征,我们认为基因 A 支配基因a ,也可以认为基因a 对于 A 来说是隐性的。当一个亲体的基因型为 Aa ,而 另一个亲体的基因型是aa 时,那么后代可以从aa 型中得到基因a ,从 Aa 型中或得到 基因 A ,或得到基因a 。这样,后代基因型为 Aa 或 aa 的可能性相等。下面给出双亲 体基因型的所有可能的结合,以及其后代形成每种基因型的概率,如下表所示。
) q9 Z' j% J2 f# E; q! k0 A7 D7 G3 Y/ @( ?! q2 B- e/ x% T" ^7 G
![]()
9 c9 K9 }: L2 s0 r
5 r" ]. Z( i0 b& C* P+ G) o3 _例 5 农场的植物园中某种植物的基因型为 AA, Aa 和 aa 。农场计划采用 AA型的 植物与每种基因型植物相结合的方案培育植物后代。那么经过若干年后,这种植物的任 一代的三种基因型分布如何?
- H6 I, e6 ] f3 T) _2 q, N2 ]5 |
(a)假设4 I. \# ^* c2 f( D* E# K0 U: A
令n = 0,1,2,...。
: @5 ~; M5 Y: l4 ~
2 O8 F. h% J6 ^![]()
) g& A+ l* U8 I. ]* l( x' V1 U! \
5 f0 c+ y1 }9 [. s0 g4 W, e6 G$ ~5 p% g; z5 R
(b)建模. I0 h$ N2 s- H
, t- I/ N/ g4 ?) @* u: R/ n( D* i( W
' [; Y6 z, A/ S8 ?3 T* W
4 V) `5 S- y9 P0 u0 e
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. B# O& c; ?/ I" ^' a4 K/ y& `9 t; U; F
4 }0 A" `0 V) U2 k9 s' `& ~2 i8 V% F3 o4 y7 |
编写如下 Matlab 程序:
7 e! j! ?$ o1 \& y0 I9 a) N" Q3 R9 B+ k
syms n a0 b0 c0
' c; j; c% f$ C5 l' C" ] pM=sym('[1,1/2,0;0,1/2,1;0,0,0]');; ]; N4 L8 A; s. i/ b/ z
[p,lamda]=eig(M);
% p" P3 {% w6 u0 M) R$ _x=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0];
/ @. P3 x* \, V! h5 w$ vx=simple(x) 1 F4 L. A& H! i z' a4 U- E
6 H0 \! t3 w7 S- e; w$ X& k' s7 c; r0 a![]()
' K2 [; q7 ?* K$ z% L) u, i0 }9 j
4 y2 ?0 B' p/ v7 P- T 即在极限的情况下,培育的植物都是 AA型。 (c)模型的讨论若在上述问题中,不选用基因 AA型的植物与每一植物结合,而是将具有相同基因 型植物相结合,那么后代具有三种基因型的概率如下表所示。 ![]()
编写如下 Matlab 程序:
$ E6 o: O E7 j! H4 Isyms n a0 b0 c0
7 _% k6 f! S# a9 S5 m$ hM=sym('[1,1/4,0;0,1/2,0;0,1/4,1]');9 X& i* f, X6 l1 B7 S! g
[p,lamda]=eig(M);
' p/ L; v& [) I& ^x=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0];* j- r7 h5 C5 n: K( e
x=simple(x) ; H* W5 g8 \# T0 t/ e; }" h; B5 j
5 \7 B& C7 H5 c5 y w p# P" y( ]) [+ b2 _ W$ d6 i# Q
# j: z5 _8 R1 e( Q, P+ B/ W2 常染色体隐性病模型
" Z# J% ]% S& z$ [' f) M现在世界上已经发现的遗传病有将近 4000 种。在一般情况下,遗传病与特殊的种 族、部落及群体有关。例如,遗传病库利氏贫血症的患者以居住在地中海沿岸为多,镰 状网性贫血症一般流行在黑人中,家族黑蒙性白痴症则流行在东欧犹太人中间。患者经 常未到成年就痛苦地死去,而他们的父母则是疾病的病源。假若我们能识别这些疾病的 隐性患者,并且规定两个隐性患者不能结合(因为两个隐性患者结合,他们的后代就可 能成为显性患者),那么未来的儿童,虽然有可能是隐性患者,但决不会出现显性特征, 不会受到疾病的折磨。现在,我们考虑在控制结合的情况下,如何确定后代中隐性患者 的概率。- O5 d* e8 d. B* {
$ Y& c' @) W9 ^- i0 i" N
(a)假设
3 a$ G6 C+ D6 [4 P(i)常染色体遗传的正常基因记为 A ,不正常基因记为a ,并以 AA, Aa,aa 分别 表示正常人,隐性患者,显性患者的基因型。
1 r6 a- k- G6 p9 d" E# r2 R6 e0 p9 G- e2 _9 }1 A5 f8 ?9 N
' X0 m, T3 v3 m' Y7 ^3 R
0 Y4 t% o! F+ _$ o4 S' H1 y: J
(b)建模$ @- a$ M: v$ ^$ W' P7 U
" @$ q& q+ ?2 g$ |* c![]()
, z p/ V; ]( q6 A/ U2 C( d. i2 }/ ^9 D6 C8 i* ?0 U
7 E2 G. v+ j2 `0 N2 y! S3 l+ c: i
/ _0 W5 c0 j' w* Y$ A! g( n- p# A
/ c. _5 E; }! j4 [. z+ i0 R) L; m
(c)模型讨论; W2 a5 g7 o- z% T9 B
研究在随机结合的情况下,隐性患者的变化是很有意思的,但随机结合导致了非线 性化问题,超出了本章范围,然而用其它技巧,在随机结合的情况下可以把(24)式改写为
8 J8 Q5 t# v! Y5 f' o' L& R% O! t- f6 V& n9 G, I; y
![]()
- Z* o7 g* \2 F+ Q; Y; T" J1 t1 ^: M7 {9 Q% G, Q' M
下面给出数值的例子: 某地区有 10%的黑人是镰状网性贫血症隐性患者,如果控制结合,根据(24)式 可知下一代(大约 27 年)的隐性患者将减少到 5%;如果随机结合,根据(25)式, 可以预言下一代人中有 9.5%是隐性患者,并且可计算出大约每出生 400 个黑人孩子, 其中有一个是显性患者。
& j3 a/ y2 e7 Z* |7 z
( g: s# g6 [* L N4 C+ M3 X − 链遗传模型
/ ]# C9 `; Y* u$ NX − 链遗传是指雄性具有一个基因 A 或a ,雌性具有两个基因 AA,或 Aa ,或 aa 。 其遗传规律是雄性后代以相等概率得到母体两个基因中的一个,雌性后代从父体中得到 一个基因,并从母体的两个基因中等可能地得到一个。下面,研究与 X − 链遗传有关 的近亲繁殖过程。
3 U/ B* o6 \/ B2 u( P
$ t7 p a E# w7 w* ]( K' I(a)假设9 o# b/ s; K9 n. [ n( R; @% Q
(i)从一对雌雄结合开始,在它们的后代中,任选雌雄各一个成配偶,然后在它 们产生的后代中任选两个结成配偶。如此继续下去。7 H/ |( |( k: }5 o
G5 w$ Q9 u: k) b- N
(ii)父体与母体的基因型组成同胞对,同胞对的形式有 (A, AA) , (A, Aa) , (A,aa) , (a, AA) ,(a, Aa) ,(a,aa) 六种。初始一对雌雄的同胞对,是这六种类型 中的任一种,其后代的基因型如下表所示。+ ~ u, t) c( N% E4 E8 D9 `& p
% g- k0 w; F; w2 {: ?8 ^
' C0 w* Z6 z0 q$ q! f- Q' g9 _![]()
7 L4 T) o7 h$ W3 |# J
; G2 ^3 A* v' Z+ f6 w% @ 5 U9 W- Q, b% X2 H& ]8 j7 D9 w1 R
/ K( g/ T/ d1 R7 v& D! z k; Z5 O 0 h" ~- a" }' x
( G7 G2 k+ A: D! ^$ M& r8 i
编写如下 Matlab 程序:6 V# {( k% Z3 N- b: P7 m: x
/ a3 j+ u) ?. Q& hsyms n a0 b0 c0 d0 e0 f01 \" |8 @! e: a2 }/ N$ i& B
M=[1 1/4 0 0 0 0;0 1/4 0 1 1/4 0;0 0 0 0 1/4 0;) T; r* [) g7 u: W ~# Z0 U
0 1/4 0 0 0 0;0 1/4 1 0 1/4 0;0 0 0 0 1/4 1];* J& |- ]/ |/ E+ G' d7 p7 _
M=sym(M);7 d5 X+ g( b: z$ F
[p,lamda]=eig(M);4 i5 a) b$ W0 l# B1 ?# N
x=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0;d0;e0;f0];8 ^$ I* H u: A+ b7 y
x=simple(x) 2 W$ @5 P+ C/ E7 r( _) \. Q' O
7 E, m2 O- X8 Y4 P+ }! a6 w( L+ ]
由上述程序计算结果可以看出 a2 J( R. e& T' i
0 |( Z$ p5 @: p0 y* v
6 j+ P. ?7 ]/ G {, @8 {3 n
* k) m# R4 O, b- C; o习 题2 T5 W' {8 E" J
1. (汉诺塔问题)n 个大小不同的圆盘依其半径大小依次套在桩 A 上,大的在下, 小的在上。现要将此 n 个盘移到空桩 B 或C 上,但要求一次只能移动一个盘且移动过 程中,始终保持大盘在下,小盘在上。移动过程中桩 A 也可利用。设移动 n 个盘的次 数为 ,试建立关于 的差分方程,并求 的通项公式。2 [ Z8 J) U- f; v7 z
# n5 Y) R; g. @& x: H2. 设第一月初有雌雄各一的一对小兔。假定两月后长成成兔,同时(即第三月) 开始每月初产雌雄各一的一对小兔,新增小兔也按此规律繁殖。设第n 月末共有 对 兔子,试建立关于 的差分方程,并求 的通项公式。' _' _+ L: M# `1 }8 }
( z* k' n# ?: z$ Y5 d7 Q9 Y8 ?) X3. 在常染色体遗传的问题中,假设植物总是和基因型是 Aa 的植物结合。求在第n 代中,基因型为 AA, Aa 和 aa 的植物的百分率,并求当 n 趋于无穷大时,基因型分布 的极限。
) _; X6 Q7 K4 I: e, B. [: y$ F7 h# p/ t6 Z. K& t' g
7 U+ C9 p/ Y* J: {, q
$ s: B- C) G) B" o3 X1 Q/ `6 ?+ R7 ?
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