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主成分分析(PCA)进行特征提取

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发表于 2023-8-20 17:19 |只看该作者 |倒序浏览
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这段代码实现了主成分分析(PCA)的数据得分计算和特征向量提取。下面是代码的解释:
( g& V( Q; H0 }$ X# z+ m6 P* O8 o, d8 E% N4 e/ g
1.函数定义:2 p0 F2 i/ c- `; A8 j( h; N
/ t) o$ V; g; a# Y4 Q

- z; N; Y6 W, N3 {8 k2 A! j2.函数名为PCA,接受两个输入参数:raw_data(原始数据)和T(保留率),并返回新数据。) O( n3 L$ H7 f/ M1 V4 t9 n

  [3 I; R3 h& ?8 e1 [  b) `# x6 S
3.数据读取与标准化:& S% q4 z, r" u: k

* e( c; r+ s: Y, c" x5 D! L# f& W  c( ?
4.将原始数据raw_data赋值给变量A。
  V% e4 d3 k! s, O; R5.获取数据矩阵的尺寸,其中a表示行数,b表示列数。9 O$ A# ?( O- ?, X" N: C2 K
6.创建一个与原始数据大小相同的零矩阵SA。
1 l  g5 R! D' v9 S- k; H, U6 X( x7 j7.使用循环将数据按列进行放置,并进行标准化(归一化),即将每列数据减去该列的均值,再除以该列的标准差。1 w; s, o! a; N  r1 o
9 L; e  D) G0 h! G
6 F1 E7 t  F! {/ i+ v! V6 t
8.求解相关系数:
( s# o* n' s& R% r* F; p6 l! M+ k5 T
4 s% w' W# a1 a2 {: @* S5 @" W
9.使用corrcoef函数计算归一化后的数据矩阵SA的相关系数矩阵CM。# m4 R6 R) ~" T

. d' d7 N- }4 s& B! ?
# ]$ \& u1 B% x2 j10.计算特征值和特征向量:
' c' x5 p, B( v- Z  \3 f5 @+ R
, i% u/ p" k1 G" M
( [! j+ f9 b5 H11.使用eig函数对相关系数矩阵CM进行特征值分解,得到特征向量矩阵V和特征值矩阵D。
/ _; J, i; m* E: _
; g4 w7 Z: v  v& T% w" V4 q* X# Z
) y  O3 O( G5 Q" f, N  d12.提取特征值和计算贡献率:3 w( i; f4 A  P( j; F* d# Q
9 Z' x4 X8 g' u( M, s& l& i5 Z( Z0 O: w

7 E9 q- a, J( g! P4 N- B13.创建一个零矩阵DS,其大小为b x 3,其中b为特征值矩阵D的列数。
0 Z) g- Q2 U" p% N# y. ?14.将特征值矩阵D的对角线元素(特征值)赋值给DS的第一列。3 k* p$ [' ~4 I' L  M
15.对DS按照第一列的值进行从大到小排序。$ r" G! t4 V  i% |( M) P+ {
16.计算特征值的贡献率,将特征值除以所有特征值的和,并将结果赋值给DS的第二列。% V; \! Z' Z- W; k
17.计算特征值的累计贡献率,对贡献率列进行累加,并将结果赋值给DS的第三列。& S" J6 g5 Z. b' u7 `1 h+ _6 m
! A& g8 C3 s8 z5 b6 Y

9 M. C4 s; g2 e% I" I18.确定保留主成分的数量:& E3 o; l. O$ O8 M/ p

& C+ x/ s  T% w8 X! X1 Y. H: L8 C) `- x- _  \3 X
19.找到累计贡献率大于等于设定的保留率T的索引位置。
$ w' A, n7 v: E% r" m9 V20.提取第一个满足条件的索引(最小的保留主成分数量)并赋值给变量Com_num。
7 Q2 @. S! @+ v- `
5 D) \* @3 c% P3 `- g# t" i4 u7 U
8 n" O$ E" o5 ~: ]# T3 U21.提取主成分对应的特征向量:$ x$ }4 B. s) Z2 E
9 @& h$ l4 R. V8 g' ?" ?

9 A7 \  H7 o: F  @22.将特征向量矩阵V的最后Com_num列反转(从最后一列开始取),得到主成分对应的特征向量矩阵PV。
( Z$ ~: a& c$ A6 h" B# s; G1 [. Y, e2 V, r
" p/ W! w, h. S) T8 F7 T
23.计算在主成分上的数据得分:" G5 |3 b% v& ?4 l

* o& E: I8 S4 X# I) C; n: h! E1 f/ u+ C6 F" l! ]$ L1 k
24.将归一化后的数据矩阵SA与主成分特征向量矩阵PV相乘,得到在主成分上的数据得分矩阵data。4 ^4 f+ Q1 |5 N, }

. v" _& n! x* w. t该函数的作用是对原始数据进行主成分分析,并返回在主成分上的数据得分矩阵。主成分分析用于降维和数据探索,它将原始数据转换为一组新的线性维度,其中每个维度都是原始数据维度的线性组合。这些新的维度(主成分)根据特征值的贡献率进行排序,保留贡献率较高的主成分。
* N1 I4 e) o3 U, J0 N' F
% e5 t' ]- \; U/ j! T' J8 w% a5 B5 [8 n/ Q# d
: x& M: z" C' Q: \8 }3 E

* }' H, ~( G' n& D2 p
. Q( B; E6 v; T/ i4 T- E

PCA.m

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