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主成分分析(PCA)进行特征提取

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发表于 2023-8-20 17:19 |只看该作者 |倒序浏览
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这段代码实现了主成分分析(PCA)的数据得分计算和特征向量提取。下面是代码的解释:5 G' G! v0 ]8 P

7 O( H  R  c$ R$ K/ I6 \1.函数定义:
4 u7 D  h) }9 k; {6 ]# ?
1 D" s% v  v  }( K  `/ }" y
' w) |, `" ]8 D5 w1 Z; w; I( F$ L2.函数名为PCA,接受两个输入参数:raw_data(原始数据)和T(保留率),并返回新数据。
+ x% L0 G/ z; y. C. V( k
& X0 b  i. n! y) l: G/ v
6 T/ R) j& D) S$ V9 m3.数据读取与标准化:
0 h! u6 Y3 A1 {# R( g; {1 t! W/ r' L- j

  c' |5 I7 A+ U4 j) E" L4.将原始数据raw_data赋值给变量A。
$ d' n; g6 w( q3 O" v7 C2 V3 b  v' y5.获取数据矩阵的尺寸,其中a表示行数,b表示列数。3 \$ {' c. H7 R4 O4 U; D
6.创建一个与原始数据大小相同的零矩阵SA。
" h  r7 f- K2 T0 S) l7.使用循环将数据按列进行放置,并进行标准化(归一化),即将每列数据减去该列的均值,再除以该列的标准差。
9 ]/ C0 ]; X' V- [) C" o3 \0 k$ [/ [  |; N. j- H& F6 d- h
; T. U9 Y" s# R4 R
8.求解相关系数:
/ b- T3 |3 d# F' e/ S0 O
+ b' X8 h+ m) E+ `
5 Y  b% M4 Z- T! }9.使用corrcoef函数计算归一化后的数据矩阵SA的相关系数矩阵CM。
; P+ X% k0 T! {4 S9 L8 H0 p* X" ~* ?2 V, ?1 b

; N  R# T; N, S% F0 ]/ L10.计算特征值和特征向量:; Q. D. T9 O8 ^$ F9 ?

9 C3 N' N8 p* s5 Y8 x
* [# ^5 R! G/ H$ X8 Q+ F11.使用eig函数对相关系数矩阵CM进行特征值分解,得到特征向量矩阵V和特征值矩阵D。
" `( z, s6 M9 O$ {6 `! v( Y1 X8 Q5 B! z7 N

( [9 |- F' t* t; e7 R8 \6 ?, d, P12.提取特征值和计算贡献率:, z4 y: m  \5 D- V( W+ [+ M
: |( c  r8 F+ Y; a( f* f: K

# C5 P' I$ Q- v3 e13.创建一个零矩阵DS,其大小为b x 3,其中b为特征值矩阵D的列数。
/ P; ^+ U4 S6 h& `4 b6 ~14.将特征值矩阵D的对角线元素(特征值)赋值给DS的第一列。
+ O. Y& Q9 C3 t( t15.对DS按照第一列的值进行从大到小排序。' g. E, j- ?6 _& O; J, @
16.计算特征值的贡献率,将特征值除以所有特征值的和,并将结果赋值给DS的第二列。
( Y  q0 A0 z1 G# a17.计算特征值的累计贡献率,对贡献率列进行累加,并将结果赋值给DS的第三列。" D* f0 j4 M9 O7 j
( W9 I( g4 i. q% M+ }7 @/ E) _. @

% z7 _/ a0 [7 ^6 D* }18.确定保留主成分的数量:# n6 o* i. F6 W
. [: P+ n5 \& s: w8 l

! z( H' O, m# z6 @6 V; t% a19.找到累计贡献率大于等于设定的保留率T的索引位置。
* n1 x! `6 x5 K  }20.提取第一个满足条件的索引(最小的保留主成分数量)并赋值给变量Com_num。$ w3 y" g1 v/ G# k3 K) k7 [7 }/ j7 i
% O) e6 l7 A1 E: m2 M- c

! \% l; {8 b9 L" [, |, ~# ~% _& i21.提取主成分对应的特征向量:
# j! N" s/ G/ N9 ]) v4 Z4 l1 q: E' c
# E5 w  d* A/ B! @, Y3 P
, @* L0 `! e0 i22.将特征向量矩阵V的最后Com_num列反转(从最后一列开始取),得到主成分对应的特征向量矩阵PV。% l2 |- x4 Y) v5 b1 e
& z0 R3 N" y5 t1 x, M! C

, ]5 c2 \# J+ L+ w1 s23.计算在主成分上的数据得分:2 c- l. l8 ]5 q& _/ {

; R9 F( D4 z+ v* M3 o
! E' r$ U) M# \# z, s, h1 ^4 F24.将归一化后的数据矩阵SA与主成分特征向量矩阵PV相乘,得到在主成分上的数据得分矩阵data。, ~0 c) M& t9 r) R% Z: w' b

& e# _9 F. z/ O7 b, U. S3 C该函数的作用是对原始数据进行主成分分析,并返回在主成分上的数据得分矩阵。主成分分析用于降维和数据探索,它将原始数据转换为一组新的线性维度,其中每个维度都是原始数据维度的线性组合。这些新的维度(主成分)根据特征值的贡献率进行排序,保留贡献率较高的主成分。5 j7 M. [+ u4 j

+ X4 W( ^, H5 z& o0 I" o
$ @+ J+ ~6 l3 ]1 \$ [# Q! v0 _! g+ X: y! F6 `- M

1 B# n# f  j* ^3 o8 `* W" h& b. U$ ?

PCA.m

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