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主成分分析(PCA)进行特征提取

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发表于 2023-8-20 17:19 |只看该作者 |倒序浏览
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这段代码实现了主成分分析(PCA)的数据得分计算和特征向量提取。下面是代码的解释:" w" Z" I6 l6 s; f9 l( F. z

6 U2 l8 ?( k* {7 T& b1.函数定义:
! f4 b  L: V5 ]% j; t' u! D8 q
. j' ^; j0 g9 f$ _1 ?) s
- E( l% P; v' ^! a, H2.函数名为PCA,接受两个输入参数:raw_data(原始数据)和T(保留率),并返回新数据。5 i! O, T3 M4 V! r3 }
7 f# E* g, G" H7 T

+ [" `4 J/ g- S6 ^+ [- i9 l$ t4 \' C3.数据读取与标准化:$ n$ ]- t* p1 V$ k! }( U1 ]
4 x- Z! b# I. C6 p2 }

: J& s- b, U) L: n4 h1 M! l4.将原始数据raw_data赋值给变量A。$ k" B+ ?8 c8 b3 Y+ J/ a1 k
5.获取数据矩阵的尺寸,其中a表示行数,b表示列数。
6 v, c0 z/ c: N& q$ U, f6.创建一个与原始数据大小相同的零矩阵SA。
) O# w/ W' T0 O2 j7.使用循环将数据按列进行放置,并进行标准化(归一化),即将每列数据减去该列的均值,再除以该列的标准差。
% ^6 E" G! ]) |' W- V+ a4 N
0 g  Q+ s5 N! p. V2 T
$ K1 Y& ~' o. y( a6 Z. T8.求解相关系数:1 S% F8 t0 l9 f& }5 c- o

. Y3 j& w+ N+ I# e+ h3 B+ ]- ^/ n+ M
9.使用corrcoef函数计算归一化后的数据矩阵SA的相关系数矩阵CM。
/ v" b+ T$ u# z# F
8 R& [+ `. W% P  x# ?9 x# z$ n+ B0 d7 w) x- f& h
10.计算特征值和特征向量:
% z5 m; x2 k9 `1 E) {% ?; ~4 S9 u* y+ r) R& x

+ P/ C. B! G! J, Y, ^11.使用eig函数对相关系数矩阵CM进行特征值分解,得到特征向量矩阵V和特征值矩阵D。
8 B3 f3 s+ o* @) W: X1 L: q8 H' y8 B  z; }
" m' ~' X& V7 i# X0 d3 J
12.提取特征值和计算贡献率:
" I- c+ \! Q+ x, |5 \% \) G! W, y0 J$ }( d$ j

8 D$ v6 C! c! ?/ x1 X13.创建一个零矩阵DS,其大小为b x 3,其中b为特征值矩阵D的列数。
& {2 U; N5 D6 z6 Y! @$ g; O14.将特征值矩阵D的对角线元素(特征值)赋值给DS的第一列。
! ]9 e% [8 j7 N15.对DS按照第一列的值进行从大到小排序。
% u5 X# e; D! y! D16.计算特征值的贡献率,将特征值除以所有特征值的和,并将结果赋值给DS的第二列。
3 j( }3 ^' [6 y5 U+ y5 ?8 O, r17.计算特征值的累计贡献率,对贡献率列进行累加,并将结果赋值给DS的第三列。
2 o  J$ Q2 R9 `) d' p) U3 J4 ~; ^6 L: \* l+ E" V& a: V$ F

8 \5 H3 q; G' h- R& y) u18.确定保留主成分的数量:4 I5 o: B" y6 G4 A
# w* M, D3 m0 c6 q2 d& D8 N
, [6 l) m0 _# ?
19.找到累计贡献率大于等于设定的保留率T的索引位置。# R$ X" M; R4 a; B+ m
20.提取第一个满足条件的索引(最小的保留主成分数量)并赋值给变量Com_num。* f1 l$ u7 o8 V. [  m

9 V+ a  L* T" y! M  E$ }6 B: u% W. ^# D. n3 y; z* i2 [5 C
21.提取主成分对应的特征向量:
' v0 v1 @1 |, g9 `+ |5 ^# ?$ V
( N8 A% ]) S! c$ \) ]  R
2 c6 D+ m& R: ^" b/ r- E4 [' X22.将特征向量矩阵V的最后Com_num列反转(从最后一列开始取),得到主成分对应的特征向量矩阵PV。7 B6 d6 Q1 V- K8 ?
& M  ~- W/ x# \
2 m) Z8 J1 ^( x+ D
23.计算在主成分上的数据得分:
7 U9 H$ Y3 [* N" O7 W- ~  v1 W: `) c( k# T! u2 N6 ^

9 H2 k! a+ Y9 W' |: ]5 k( C; _24.将归一化后的数据矩阵SA与主成分特征向量矩阵PV相乘,得到在主成分上的数据得分矩阵data。, E: [# q  `' |! Z3 d* ?. |
7 D* f% A- _/ L
该函数的作用是对原始数据进行主成分分析,并返回在主成分上的数据得分矩阵。主成分分析用于降维和数据探索,它将原始数据转换为一组新的线性维度,其中每个维度都是原始数据维度的线性组合。这些新的维度(主成分)根据特征值的贡献率进行排序,保留贡献率较高的主成分。4 g9 L7 u$ R% Y. U  ]1 C

. m6 w5 r& [- F' J5 N7 Z4 s4 g) n  I; ~, Y7 M! P, H
$ }! G8 F# N: L; @  M. @! \7 c
! R, X3 y9 `; k# O" C

  f6 y6 u9 Z" `' M! v( \

PCA.m

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