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主成分分析(PCA)进行特征提取

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发表于 2023-8-20 17:19 |只看该作者 |倒序浏览
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这段代码实现了主成分分析(PCA)的数据得分计算和特征向量提取。下面是代码的解释:
- @' [$ h9 M! [" ?# z
  k* B8 ^2 C* F" D; u3 o1.函数定义:
/ R$ Y6 s9 W. v- s  Y2 \
6 f* L: m: k. d: h! n! i+ v$ ^5 m( ~8 D, v( T0 I
2.函数名为PCA,接受两个输入参数:raw_data(原始数据)和T(保留率),并返回新数据。& R) t9 O* {" `( B* w! q5 Z
* X1 A$ K0 n8 k8 w

  j" T0 f4 m' P$ u3.数据读取与标准化:& Q, Z' @; M+ O7 m. R

& z6 r1 X$ T: r# H9 ?( s$ b6 l  `" B8 i3 `
4.将原始数据raw_data赋值给变量A。
: l' H& N4 s* w- [8 W5.获取数据矩阵的尺寸,其中a表示行数,b表示列数。2 D# N7 F$ O  a4 `$ G& N
6.创建一个与原始数据大小相同的零矩阵SA。& b# B, S2 F1 V" F) j
7.使用循环将数据按列进行放置,并进行标准化(归一化),即将每列数据减去该列的均值,再除以该列的标准差。9 |* v& e3 |1 ]& f* X! i

4 W# d7 q; @, z  [3 o4 u% w6 s  @* k8 [5 h  i
8.求解相关系数:) Y  ~! Z# I; }% k7 ?9 F0 T
( g% W6 W. ]$ ?8 Y: X

- [, d3 h4 j  `: r1 t8 w9.使用corrcoef函数计算归一化后的数据矩阵SA的相关系数矩阵CM。
% j0 P4 r2 N+ x7 h. n* e; d+ `! I/ h4 }% t2 b
% p; p: W9 g; [
10.计算特征值和特征向量:
" ^: H2 _, }  F6 k- d6 e: N4 r
, g! g* [( P- P' V* e& C3 H
' g  t1 B( G2 S2 C: B8 t& K; \* r11.使用eig函数对相关系数矩阵CM进行特征值分解,得到特征向量矩阵V和特征值矩阵D。9 K; k8 M( Y/ `( o- g; {

& S* e+ S1 O+ h3 B, @* ^+ G# X* X
12.提取特征值和计算贡献率:) U# ~, f2 D: ]% [! {0 {4 j
0 ]) `" \. }# a7 @1 O2 m
4 c& X3 n# c' ^5 p
13.创建一个零矩阵DS,其大小为b x 3,其中b为特征值矩阵D的列数。! I- L' ]$ Q& i1 R# R5 M3 V
14.将特征值矩阵D的对角线元素(特征值)赋值给DS的第一列。# A7 N' X+ p5 L
15.对DS按照第一列的值进行从大到小排序。
# P+ ?6 I# c( o+ H& B& Y16.计算特征值的贡献率,将特征值除以所有特征值的和,并将结果赋值给DS的第二列。' {* {; H, |- F3 a
17.计算特征值的累计贡献率,对贡献率列进行累加,并将结果赋值给DS的第三列。( [4 J7 j5 i; A2 F  R
- Z% z) n! ~7 c5 R) E- u
0 D3 ]5 @6 x$ B8 A* a3 |. ]  ]7 a
18.确定保留主成分的数量:
0 k- h. S" @  a, C) v( N8 K' n* d
8 J8 u8 ]: {; {7 C9 ~( H7 v$ ^+ o; Y* R# m) |% N
19.找到累计贡献率大于等于设定的保留率T的索引位置。
4 j2 Y* O. I  n# D3 T0 ?3 X! E20.提取第一个满足条件的索引(最小的保留主成分数量)并赋值给变量Com_num。* k7 e, g& J" Z( ]8 W% c
6 s1 p* g7 t7 W( A* i

7 k9 U! C% x: D& @2 }( p- }7 m21.提取主成分对应的特征向量:
" S, Z. a/ @. g. O/ T+ q+ T. _* q. T  E9 Q& w; U3 u& A  v

! d1 K! b8 U9 u" o7 q8 f$ ^% e# E22.将特征向量矩阵V的最后Com_num列反转(从最后一列开始取),得到主成分对应的特征向量矩阵PV。" G, V* H# _. Y7 f3 k

+ n4 O' I5 p' D/ }. y
( M0 a$ U  {- M7 I) L8 B23.计算在主成分上的数据得分:
! _/ y2 x$ ~: J9 c8 g
" d+ {, g5 |( N' O' l4 ]' r, K% n# i& e$ b
24.将归一化后的数据矩阵SA与主成分特征向量矩阵PV相乘,得到在主成分上的数据得分矩阵data。
; U, Z1 l& ^9 X: k% Q( V0 u0 O8 w$ o; t1 y/ [/ b, j1 P
该函数的作用是对原始数据进行主成分分析,并返回在主成分上的数据得分矩阵。主成分分析用于降维和数据探索,它将原始数据转换为一组新的线性维度,其中每个维度都是原始数据维度的线性组合。这些新的维度(主成分)根据特征值的贡献率进行排序,保留贡献率较高的主成分。1 x2 L8 M/ Z3 U- w) [

# W4 A5 w" l) Q. e) W& a% T' j  l8 U2 P+ u# T' Y  M1 z
. b- A* g) }$ }" K0 W: d

7 \4 h8 _/ B& R1 T( H1 [
/ n9 R0 M' j% U- i+ v

PCA.m

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