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这段代码实现了主成分分析(PCA)的数据得分计算和特征向量提取。下面是代码的解释:! s% p4 N; l Y( ~1 x
4 Q) S: w7 z: I* `
1.函数定义:
; {( c: k# o1 U) V% b* |3 M) `: O
7 E% M* ~: ?/ p- }# G9 j; O$ m2 A+ h2.函数名为PCA,接受两个输入参数:raw_data(原始数据)和T(保留率),并返回新数据。5 k2 u* o9 i f
+ q% Z3 t' B5 M* p
5 U. N& k9 t& e% W3.数据读取与标准化:
0 D# p- Z) d6 ]3 |/ ?1 ?/ v) _4 P( u3 G7 t4 t1 m
& y: V5 |& L/ ~; ^- x$ {9 m! N4.将原始数据raw_data赋值给变量A。
3 V' D T x. @+ L5.获取数据矩阵的尺寸,其中a表示行数,b表示列数。' H2 a6 Q+ \1 e6 P4 P
6.创建一个与原始数据大小相同的零矩阵SA。8 }7 F8 z& b9 z4 a
7.使用循环将数据按列进行放置,并进行标准化(归一化),即将每列数据减去该列的均值,再除以该列的标准差。, I0 }5 C' Q/ Z$ z2 C. U
; R# z8 B8 R+ e; }3 @# w' Z! c f" _2 F2 G
8.求解相关系数:
0 V7 V# v+ v! I; E8 C6 H: K/ V( j- Z: C: D
4 e' d) b/ O0 b: B$ e% I9.使用corrcoef函数计算归一化后的数据矩阵SA的相关系数矩阵CM。1 h7 y; H! B5 J$ Q
1 `! O# J/ N9 c+ {7 j* B1 }
% @& Y! _. x% H/ V3 A' @
10.计算特征值和特征向量:
Y! t) z2 N9 j6 ^# m8 F
7 Y' x; e- u" x/ J7 k8 K0 t, s! O( S Q, y0 d. w
11.使用eig函数对相关系数矩阵CM进行特征值分解,得到特征向量矩阵V和特征值矩阵D。# [: w7 j. U) J3 b$ ?
, h& \! W/ {$ s7 V0 r7 ?# b, }. {/ u" {1 t1 |0 T3 x; g
12.提取特征值和计算贡献率:% x# g/ s- j4 r! E0 E
3 b# ?& Z h% I S
2 d/ B5 ~; H f8 Y) h13.创建一个零矩阵DS,其大小为b x 3,其中b为特征值矩阵D的列数。/ J* A3 u1 k9 a7 h/ f
14.将特征值矩阵D的对角线元素(特征值)赋值给DS的第一列。+ u. U$ t) W0 g: {8 @" M
15.对DS按照第一列的值进行从大到小排序。
+ G) u% U% E: x% W' Q: I16.计算特征值的贡献率,将特征值除以所有特征值的和,并将结果赋值给DS的第二列。' _- H' d3 r& U& ~9 `9 J
17.计算特征值的累计贡献率,对贡献率列进行累加,并将结果赋值给DS的第三列。; }, ~( ~0 ]' M6 m& Y3 ?
* t+ A3 n4 v2 M, B5 \. u; `. E7 h
7 S: R. r. P2 }9 K. R18.确定保留主成分的数量:
+ _% { Z0 m4 U) w$ \% ?9 [, P/ q
) ?6 K1 S) e: Q* ?' U; c0 D. J1 ^7 l- O8 G7 u9 C2 w
19.找到累计贡献率大于等于设定的保留率T的索引位置。
$ \3 {2 U" c1 e20.提取第一个满足条件的索引(最小的保留主成分数量)并赋值给变量Com_num。/ m; h% X$ @' q! }1 ]$ Q# w* g7 a( c
+ k) y/ H n: d" T& [2 U
7 c3 y5 ]6 `( ]4 {
21.提取主成分对应的特征向量:! [1 R. O: n5 G0 E2 D. F; G
! _1 |; p% ~$ X9 R
8 Q/ W( S; P* m! w
22.将特征向量矩阵V的最后Com_num列反转(从最后一列开始取),得到主成分对应的特征向量矩阵PV。0 H8 a; v d% |3 d0 m! d- m: S5 b `
# g9 V- E: F3 l' d
+ K# R' g: i! z) ]% n23.计算在主成分上的数据得分:
. Q" m0 ~" P0 ^+ x( M! K6 J$ T( V/ |& h
' r& J5 {, M' i4 t, M \2 ~24.将归一化后的数据矩阵SA与主成分特征向量矩阵PV相乘,得到在主成分上的数据得分矩阵data。
& w2 O7 k: {7 @$ h% L1 A2 u+ o; S; }
该函数的作用是对原始数据进行主成分分析,并返回在主成分上的数据得分矩阵。主成分分析用于降维和数据探索,它将原始数据转换为一组新的线性维度,其中每个维度都是原始数据维度的线性组合。这些新的维度(主成分)根据特征值的贡献率进行排序,保留贡献率较高的主成分。9 C j7 Z7 L6 q% ]) e; `
. l5 b$ S( W$ S8 M- f1 k# @$ b. j' f; a2 L1 i9 r
( g! d' U+ v7 p& e& {4 }- M
0 | R6 e( j5 i/ C" A$ F- Z! h
f' _4 n7 Z ~2 P# {$ @4 n- Z |
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PCA.m
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zan
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