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这段代码实现了主成分分析(PCA)的数据得分计算和特征向量提取。下面是代码的解释:
0 l4 b0 U8 b6 |% v% n! g5 ~! ~ i f8 I
1.函数定义:2 m, _" m* z/ g8 K) q/ L* b6 K
, M2 r3 g/ v& J
- _% O. ^5 t/ j2 n& s/ h
2.函数名为PCA,接受两个输入参数:raw_data(原始数据)和T(保留率),并返回新数据。3 F/ ^: k6 v/ j% t
# t. V5 U+ j1 g9 r5 h5 k' k
* A3 f# h2 P0 k' ~' z3.数据读取与标准化:
5 x8 X, Y3 [8 D$ G( D) t4 z2 F5 h) d. O% [1 E3 {
3 t3 f0 a" D: B$ X9 [7 P; |- e
4.将原始数据raw_data赋值给变量A。
. @2 Y- F u1 k3 y3 {5.获取数据矩阵的尺寸,其中a表示行数,b表示列数。- y' \2 Q* T* t F7 u% a7 D& J- A& O
6.创建一个与原始数据大小相同的零矩阵SA。
" n4 J8 s7 Z& j& O$ n( u7.使用循环将数据按列进行放置,并进行标准化(归一化),即将每列数据减去该列的均值,再除以该列的标准差。9 U& ]/ c' L1 Q! T/ g
$ r: L/ d3 v: z9 z( U" P0 r* ]- e. o
8.求解相关系数:
8 p/ |9 q4 A" u! T) L( }
* I* ]5 O y9 I" M/ |7 U1 O% w# K3 [ B! W
9.使用corrcoef函数计算归一化后的数据矩阵SA的相关系数矩阵CM。
$ a4 h+ a5 j1 S' ~2 M
8 E _: _3 @6 F* Y% ?2 H2 Z* S3 i% t" s1 _; d
10.计算特征值和特征向量:5 B( G5 O* D9 x2 n! Q
" v) ~2 s. g- d2 J/ N2 ?
% m: `, v' e* v' ^4 i j; [11.使用eig函数对相关系数矩阵CM进行特征值分解,得到特征向量矩阵V和特征值矩阵D。" B% X- V$ P7 C1 k
. i" ^! F8 o" B; K$ ?4 f8 z
+ s' m' H9 D' ?) k12.提取特征值和计算贡献率:
3 l: D; x& ]! \# \/ o; W% V8 Y1 p9 V7 d4 t; W6 i3 w, F1 |# [0 k
% N- V" o; I' z6 D( @
13.创建一个零矩阵DS,其大小为b x 3,其中b为特征值矩阵D的列数。2 u6 y: z& [0 B
14.将特征值矩阵D的对角线元素(特征值)赋值给DS的第一列。; Z! b* Q1 ?- u+ n
15.对DS按照第一列的值进行从大到小排序。
p9 E4 ~9 O/ X# F4 B16.计算特征值的贡献率,将特征值除以所有特征值的和,并将结果赋值给DS的第二列。- _; O0 E* s, b. c5 V o
17.计算特征值的累计贡献率,对贡献率列进行累加,并将结果赋值给DS的第三列。
; ]. P; K7 s) p. m
8 M1 v% J- v+ L4 k% r7 v
; |9 w5 `. o: K) D U: l: z1 v18.确定保留主成分的数量:
! M e- c1 q/ F2 h5 E, d- K7 a% M' G" G+ F
) m/ D: M" V- q$ t4 f, u
19.找到累计贡献率大于等于设定的保留率T的索引位置。! v+ V% {0 W. O0 `8 P
20.提取第一个满足条件的索引(最小的保留主成分数量)并赋值给变量Com_num。& j. e$ S( k- n5 n1 M' Y' G# J
1 C9 n8 ?7 p( P! s3 T" o$ F- _7 k( H
21.提取主成分对应的特征向量:
: Y3 `/ R1 }( k$ N$ w& B# ^
: c5 R9 U1 n4 C8 a; g1 |% P( H6 T) m9 c8 @9 n1 L* f
22.将特征向量矩阵V的最后Com_num列反转(从最后一列开始取),得到主成分对应的特征向量矩阵PV。3 O0 U6 O4 V% g$ c
& ~% d/ A( i! G8 ~) Q) Z5 c3 C; f, M+ |& K) n
23.计算在主成分上的数据得分:/ @9 ?# f% j1 m8 g" ?; H
2 C" P, _( U4 p0 p( D/ l5 E- y/ l1 {, _$ t9 q! Q
24.将归一化后的数据矩阵SA与主成分特征向量矩阵PV相乘,得到在主成分上的数据得分矩阵data。
8 _0 J. l6 z2 z5 {9 z
n6 f7 X2 K6 u2 R p3 r* \( }, A该函数的作用是对原始数据进行主成分分析,并返回在主成分上的数据得分矩阵。主成分分析用于降维和数据探索,它将原始数据转换为一组新的线性维度,其中每个维度都是原始数据维度的线性组合。这些新的维度(主成分)根据特征值的贡献率进行排序,保留贡献率较高的主成分。
+ X! X/ E8 W8 Q* _" C; b/ a* }0 ?6 `5 Q5 t4 b) n: G4 M! m P! g' D
* F. m" b, z" @- }" ~% K2 U3 e
* n2 ^6 Y& q8 M$ a( I4 C3 U4 Q' j* L& k) z. }& t4 `( o& P3 j$ K
7 f. I+ e& o* s- | |
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PCA.m
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zan
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