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主成分分析(PCA)进行特征提取

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发表于 2023-8-20 17:19 |只看该作者 |倒序浏览
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这段代码实现了主成分分析(PCA)的数据得分计算和特征向量提取。下面是代码的解释:8 ]7 t) _2 |4 q  ^  ~% D" ?" t

" K* E& C) [/ P9 S9 l* C1.函数定义:
) ]$ v) r6 d# @5 Q7 O$ C8 n" [4 _, O, Y: p; Y
, j! B2 |: k2 p1 ?7 C
2.函数名为PCA,接受两个输入参数:raw_data(原始数据)和T(保留率),并返回新数据。
( S  {9 {) |. Z) |5 u" |" K. k/ T" S, M% d- }
7 |5 t4 m* r$ R& I# p4 U5 Y/ U
3.数据读取与标准化:
1 V% z; z+ W1 r. Y) w
& {# O( ]8 L2 r  \! d; y+ W
# G% P+ A. [9 ^; y8 x4.将原始数据raw_data赋值给变量A。3 j1 s! K# U5 Q2 S. j
5.获取数据矩阵的尺寸,其中a表示行数,b表示列数。
4 n4 @+ d( Z' i- k4 N3 |6.创建一个与原始数据大小相同的零矩阵SA。, y* n! M! }0 o. z$ G8 `# B. X
7.使用循环将数据按列进行放置,并进行标准化(归一化),即将每列数据减去该列的均值,再除以该列的标准差。+ Y5 S) T- l; U9 ~3 Y2 ]
/ Y' K2 t% [* u
- L" c( p/ H; X. r0 h' {2 U
8.求解相关系数:
  e9 y7 k: N, }- D! S
+ z7 d* M: n) ~* _0 k6 Z2 y8 K2 D0 p% ]! B2 i
9.使用corrcoef函数计算归一化后的数据矩阵SA的相关系数矩阵CM。
0 \; U: \5 e$ m; q* o# Y1 |9 b# w
; s) g8 @8 M2 _& x& y; @. p' Z
10.计算特征值和特征向量:
( a+ m0 ?/ J6 t; o9 u! E7 u* a/ Y3 d1 O- ^. Y

% T& N8 F# k  A8 X11.使用eig函数对相关系数矩阵CM进行特征值分解,得到特征向量矩阵V和特征值矩阵D。
% S3 J' R9 }$ W% Y$ R& Y& ~/ n, q* @& l- \: n* L

4 b* f+ B9 u5 E- Y12.提取特征值和计算贡献率:8 E# h0 J, k1 [: g9 b
2 ]9 W+ x: y5 e7 s+ t

- J, p2 |4 x* m4 _- n; U% N13.创建一个零矩阵DS,其大小为b x 3,其中b为特征值矩阵D的列数。! a* e+ Z/ h0 n9 H
14.将特征值矩阵D的对角线元素(特征值)赋值给DS的第一列。# o% w; G' f6 A) M
15.对DS按照第一列的值进行从大到小排序。$ Q0 o+ Y5 ~! B# j8 i
16.计算特征值的贡献率,将特征值除以所有特征值的和,并将结果赋值给DS的第二列。
" V6 B- q1 y9 l17.计算特征值的累计贡献率,对贡献率列进行累加,并将结果赋值给DS的第三列。3 O$ i$ w8 X+ T0 c& `$ e/ ^
8 i2 N  X& ]1 r4 A& y

" ?6 L0 O3 t% ^  b" n& G# [18.确定保留主成分的数量:
9 L2 r* ~$ ]3 n' s& A+ d- y* p
/ S9 e  \2 ^$ `3 n2 I% Z$ R7 R5 j: h4 B# d! ?
19.找到累计贡献率大于等于设定的保留率T的索引位置。
* c7 }# d, e% u9 H2 Q9 {* d( Z0 F20.提取第一个满足条件的索引(最小的保留主成分数量)并赋值给变量Com_num。$ w3 @6 [' g: `
; U% C' p. {0 H; S) }" o6 J6 O9 O% K5 F
9 W# y5 S9 ]( }& q. y& }; L
21.提取主成分对应的特征向量:8 D$ H1 e0 @! U, h6 Q- r% c2 o
& K+ g, C9 O6 |8 ^/ a
. T1 r5 D$ W9 ]6 ]6 \
22.将特征向量矩阵V的最后Com_num列反转(从最后一列开始取),得到主成分对应的特征向量矩阵PV。
+ R/ i+ j- E/ Y: m9 f. m3 K  k2 W( c3 c- w! U% d

: `' L8 ]! j4 E  A23.计算在主成分上的数据得分:
- Z' w' w7 G! `% e/ M0 C$ a
! t7 G7 O# I! \7 h- [6 ^$ Y1 _  i4 _8 f4 b0 V
24.将归一化后的数据矩阵SA与主成分特征向量矩阵PV相乘,得到在主成分上的数据得分矩阵data。
, ?& x  a' }2 `+ t  |
9 l# J( ]8 H( l0 ]/ v该函数的作用是对原始数据进行主成分分析,并返回在主成分上的数据得分矩阵。主成分分析用于降维和数据探索,它将原始数据转换为一组新的线性维度,其中每个维度都是原始数据维度的线性组合。这些新的维度(主成分)根据特征值的贡献率进行排序,保留贡献率较高的主成分。. O! Y; I( S8 _% E4 }
6 M, W) F% o0 d6 ]

) k8 k5 S. M# y' x9 x& q2 T3 ?/ a- x/ I2 T4 Q  F( @

; I3 F: X4 s! n( b' G3 z" h' I! z
5 G2 `" i' P7 {; @* h

PCA.m

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