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python 解决主成分分析 pca

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发表于 2024-3-21 11:03 |只看该作者 |倒序浏览
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主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)是一种常用的降维技术和数据预处理方法,它通过线性变换将高维数据映射到低维空间中,以找到数据中的主要特征。
( Q6 t/ z4 s  n: i, i. v* f主成分分析的基本思想是将原始数据投影到一个新的坐标系中,使得投影后的数据具有最大的方差。这些新的坐标轴被称为主成分,而每个主成分都是原始特征的线性组合。主成分按照其所解释的方差贡献程度进行排序,最重要的主成分排在前面。( h2 y2 x  w! j  \
主成分分析的步骤如下:' E$ L6 u/ t" D# A. u( I5 f  e3 P* x
% {, }3 y# \* N0 Q, ~- y) x5 s- K
1.标准化数据:将原始数据进行标准化处理,使得每个特征的均值为0,方差为1。这样可以避免某些特征由于量级差异造成的影响。9 |) K) j# G) p3 q- M9 w
2.计算协方差矩阵:根据标准化后的数据计算协方差矩阵。协方差矩阵描述了不同特征之间的相关性。
+ h( M9 ?) Z( @4 q0 p' l3.计算特征值和特征向量:对协方差矩阵进行特征值分解,得到特征值和对应的特征向量。特征值表示每个主成分所解释的方差,特征向量表示各个主成分的方向。
( A5 q% a' j1 ~. F, |7 ], O4.选择主成分:根据特征值的大小选择要保留的主成分的数量。通常选择保留累计贡献率较高的主成分。! p7 e) e+ v0 {( z) N+ r+ o& a7 Z
5.数据转换:将原始数据投影到选定的主成分上,得到降维后的数据。
' Y! q- a9 ^' E3 M, b# Q$ h) ^6 E! _, ]( R
主成分分析的主要应用包括降维、可视化、特征提取和去除数据中的噪音。通过降低数据的维度,主成分分析可以简化数据集并去除冗余信息,从而提高后续分析的效率和准确性。' F$ Z/ u& i9 Y# S8 D

9 R- ^1 u) ~# b% S  K/ [7 G逐行解释代码的含义:
% c  ^+ [2 N6 Fimport numpy as np4 E' t6 b0 S) H4 Z3 Q0 t* T2 S! `$ P
import pandas as pd: d+ X% X0 x' ]3 |. Y7 g. y
from sklearn.decomposition import PCA
/ K  _, E) T1 \1 b, u1 l, z! l
1 S: k% s: t1 }4 V$ x8 _8 L这些是导入所需的库。numpy用于数值计算,pandas用于数据处理,sklearn.decomposition中的PCA用于主成分分析。
$ W1 h4 h8 l% {) V6 j$ |df = pd.DataFrame({
0 t7 w, J- N( B4 }* E    'x1': [149.5, 162.5, 162.7, 162.2, 156.5],
% S! K4 B, U, n1 _9 h* o3 f    'x2': [69.5, 77, 78.5, 87.5, 74.5],! ?1 ]; @8 X8 S
    'x3': [38.5, 55.5, 50.8, 65.5, 49]
" r% B( S  i/ |# a})
5 C% s) v3 D3 R; |+ r; R, r7 B% Q! G. `# Y/ q
这里创建了一个数据帧df,包含了3个变量 x1、x2、x3 的观测值。数据集中每一列代表一个变量,每一行代表一个观测值。  L; |+ i. @3 R: i/ m
model = PCA().fit(np.array(df))7 E0 f+ @3 u8 z% [- z

2 |0 B& h& J% o* o. k/ I2 `这行代码创建了一个PCA对象,并使用fit方法拟合数据。fit方法将数据df作为输入,并根据数据计算主成分分析模型。& I1 J0 U& ~- C. k0 l
print('特征值:', model.explained_variance_)7 j- r: v& Z; h
print('贡献率:', model.explained_variance_ratio_)+ d1 L; B9 ?/ w" p$ m. g- a
print('各主成分的系数:', model.components_)
* W: F: {- t2 C% T# Q  N
" _: K1 y! f4 h, C# D4 _这几行代码分别打印了主成分分析模型的三个重要属性:: Y9 Z' p7 S7 P2 O2 d

6 H1 s+ g' m$ |* X; H% q' U0 j$ q1.explained_variance_:特征值,表示每个主成分的方差。2 u$ \7 ]8 s$ F6 K5 u# ^
2.explained_variance_ratio_:贡献率,表示每个主成分的方差占总方差的比例。2 C. e3 |1 ?; {4 e# [
3.components_:各主成分的系数,表示每个主成分在原始变量空间中的权重。, \$ f5 ]6 d( e
" g$ W/ @2 ]1 o* ~
pca_df = pd.DataFrame(model.transform(np.array(df)))" H* v# A1 \9 z1 b
pca_df.columns = ['F1', 'F2', 'F3']( H* Q# l, B5 V  ]4 ]/ J
pca_df% d% b- Y  A2 F

9 `  a9 P: g4 Z' P$ G这几行代码使用model.transform方法将原始数据进行主成分转换,并将结果存储到一个新的数据帧pca_df中。pca_df包含三个列,分别命名为'F1'、'F2'、'F3',分别表示三个主成分的值。
0 D( c7 Q' Z8 x: ^5 b/ e希望这个逐行解释对你有帮助!如果你还有其他问题,请随时提问。
9 V2 M- l" w) ?; o& V/ a7 E4 O$ y) ~/ w

) o) }. Y/ V3 b' ~$ o, P

29.pca.py

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