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python 解决主成分分析 pca

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发表于 2024-3-21 11:03 |只看该作者 |倒序浏览
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主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)是一种常用的降维技术和数据预处理方法,它通过线性变换将高维数据映射到低维空间中,以找到数据中的主要特征。
; U+ W3 b" m; X: ?' L  `; [. ~主成分分析的基本思想是将原始数据投影到一个新的坐标系中,使得投影后的数据具有最大的方差。这些新的坐标轴被称为主成分,而每个主成分都是原始特征的线性组合。主成分按照其所解释的方差贡献程度进行排序,最重要的主成分排在前面。
+ G5 U# y# y$ f5 k, `1 L5 C) n& A+ A主成分分析的步骤如下:
" q9 `5 S& s1 _) ^% \
- p6 o( d  b2 N7 T1.标准化数据:将原始数据进行标准化处理,使得每个特征的均值为0,方差为1。这样可以避免某些特征由于量级差异造成的影响。
. S, ]* `& C$ A& i2 T2.计算协方差矩阵:根据标准化后的数据计算协方差矩阵。协方差矩阵描述了不同特征之间的相关性。5 R; l6 }1 k! `. g, O
3.计算特征值和特征向量:对协方差矩阵进行特征值分解,得到特征值和对应的特征向量。特征值表示每个主成分所解释的方差,特征向量表示各个主成分的方向。: l; v* u. G0 ]1 E" }, _! t9 s
4.选择主成分:根据特征值的大小选择要保留的主成分的数量。通常选择保留累计贡献率较高的主成分。
; ]! e  Z2 {# l' v! S7 V5.数据转换:将原始数据投影到选定的主成分上,得到降维后的数据。
2 r% c- v1 c3 @4 D# L
- Q" e3 ~# q& t, P8 `主成分分析的主要应用包括降维、可视化、特征提取和去除数据中的噪音。通过降低数据的维度,主成分分析可以简化数据集并去除冗余信息,从而提高后续分析的效率和准确性。
  ?6 d, s! ]9 @! X$ [3 y" ^! |. Z5 M3 w3 l  L
逐行解释代码的含义:' ?% }8 b0 i: ^4 i2 }4 T8 b( |8 V
import numpy as np
0 s) s! Z, R& x+ M4 G' e9 iimport pandas as pd" b0 J' `' U5 _! q. d7 p
from sklearn.decomposition import PCA
2 U+ _4 \! Z6 ?& u8 |2 t
! P5 U: H- Z$ i/ o这些是导入所需的库。numpy用于数值计算,pandas用于数据处理,sklearn.decomposition中的PCA用于主成分分析。
) E/ q% J. R0 Z6 Bdf = pd.DataFrame({
+ l5 Z" N+ f& R* B    'x1': [149.5, 162.5, 162.7, 162.2, 156.5],
) g5 l. b0 V& ~! ]9 I; Q* F* w5 G    'x2': [69.5, 77, 78.5, 87.5, 74.5],% D8 e* l8 ?8 z4 {! d* {
    'x3': [38.5, 55.5, 50.8, 65.5, 49]; A0 d, s* P$ e0 Y# p# Q% W  `
})
0 I* V% J- W  n5 R9 m
: V$ Z& {' ~% z% S: N这里创建了一个数据帧df,包含了3个变量 x1、x2、x3 的观测值。数据集中每一列代表一个变量,每一行代表一个观测值。
1 D+ M8 v# Q$ _3 l3 z2 n8 R3 v  Xmodel = PCA().fit(np.array(df))% g' t6 ?7 m& B
) R$ o( b; @3 h# b, E3 M) q5 u
这行代码创建了一个PCA对象,并使用fit方法拟合数据。fit方法将数据df作为输入,并根据数据计算主成分分析模型。8 n2 U' x$ d1 ~
print('特征值:', model.explained_variance_)2 ]" V/ p& ?$ r$ K- Q4 d& w, P7 n
print('贡献率:', model.explained_variance_ratio_)
1 ^  K6 T9 V( M, p. ~print('各主成分的系数:', model.components_)
. M. m7 i# P! z+ z+ ]% d
8 K+ k/ ]( @) p+ U这几行代码分别打印了主成分分析模型的三个重要属性:
) s& h7 T2 w8 O2 V
" Q: F/ E. p  f, ]+ N% j1.explained_variance_:特征值,表示每个主成分的方差。: T# r; p- |1 ]; i& f( W
2.explained_variance_ratio_:贡献率,表示每个主成分的方差占总方差的比例。
; r3 m0 r, s, K8 Y3.components_:各主成分的系数,表示每个主成分在原始变量空间中的权重。
: ^! `& X1 t) Y" S* A  X: o* Q; F; A1 q" J" }
pca_df = pd.DataFrame(model.transform(np.array(df)))# w- @1 j& L; X$ o
pca_df.columns = ['F1', 'F2', 'F3']6 |3 M4 D  k+ w$ U0 D8 D
pca_df" `) |$ W. m$ J1 y

" B" v8 ]! W% f! F/ B8 b这几行代码使用model.transform方法将原始数据进行主成分转换,并将结果存储到一个新的数据帧pca_df中。pca_df包含三个列,分别命名为'F1'、'F2'、'F3',分别表示三个主成分的值。) s5 m- E7 c1 B4 r
希望这个逐行解释对你有帮助!如果你还有其他问题,请随时提问。& m2 O" a: h5 d; K; m
: u3 X* X) h1 B% p( G! [

& J0 _2 q. ~5 a5 c

29.pca.py

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