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python 解决主成分分析 pca

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发表于 2024-3-21 11:03 |只看该作者 |倒序浏览
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主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)是一种常用的降维技术和数据预处理方法,它通过线性变换将高维数据映射到低维空间中,以找到数据中的主要特征。
4 I4 ~4 D8 M- ]. e3 D% h主成分分析的基本思想是将原始数据投影到一个新的坐标系中,使得投影后的数据具有最大的方差。这些新的坐标轴被称为主成分,而每个主成分都是原始特征的线性组合。主成分按照其所解释的方差贡献程度进行排序,最重要的主成分排在前面。
. G2 _  _3 i/ D  }: E主成分分析的步骤如下:
, G; n% L+ X) X- t3 g$ d! l
9 V3 c! H. {6 x( B$ S1.标准化数据:将原始数据进行标准化处理,使得每个特征的均值为0,方差为1。这样可以避免某些特征由于量级差异造成的影响。% x, h' O9 D& `$ w* n( _
2.计算协方差矩阵:根据标准化后的数据计算协方差矩阵。协方差矩阵描述了不同特征之间的相关性。
2 M4 X. A( y+ q8 F2 l7 ^5 T9 T, H$ Q3.计算特征值和特征向量:对协方差矩阵进行特征值分解,得到特征值和对应的特征向量。特征值表示每个主成分所解释的方差,特征向量表示各个主成分的方向。% m7 h! A; e  V
4.选择主成分:根据特征值的大小选择要保留的主成分的数量。通常选择保留累计贡献率较高的主成分。. Z- S5 x+ [" T3 j: K: o  m
5.数据转换:将原始数据投影到选定的主成分上,得到降维后的数据。. }$ Q- b" O7 {0 L
# ?3 K4 S5 F5 }3 W
主成分分析的主要应用包括降维、可视化、特征提取和去除数据中的噪音。通过降低数据的维度,主成分分析可以简化数据集并去除冗余信息,从而提高后续分析的效率和准确性。! s1 r, ^& t" T

8 B% v# ]  K- D! i8 l9 x逐行解释代码的含义:
3 w$ p  D( K6 F2 \: ?import numpy as np9 R$ Y8 J5 ~6 n* U+ q4 Z
import pandas as pd
7 t/ R( h6 N5 k8 G4 f# qfrom sklearn.decomposition import PCA: x( ~1 J( ?) t

7 z5 P" {8 L* W9 [这些是导入所需的库。numpy用于数值计算,pandas用于数据处理,sklearn.decomposition中的PCA用于主成分分析。* Z! y7 y/ C- e9 b
df = pd.DataFrame({" z8 x) }1 l' h% E6 Z
    'x1': [149.5, 162.5, 162.7, 162.2, 156.5],
- B3 x3 q! f3 M6 q. v( |# v) C- g    'x2': [69.5, 77, 78.5, 87.5, 74.5],& o0 J! S, f" ~6 D3 z+ H. e
    'x3': [38.5, 55.5, 50.8, 65.5, 49]6 \8 ^& o, c; l2 a
})' T# U! [: H9 H* C5 f* j

4 d1 Z  b+ T- h$ a$ q  k* |这里创建了一个数据帧df,包含了3个变量 x1、x2、x3 的观测值。数据集中每一列代表一个变量,每一行代表一个观测值。! M8 M/ D0 C4 o  N1 n
model = PCA().fit(np.array(df))% y! O6 l( [8 n0 o7 B) g
2 @; n8 o5 l! v$ D. c7 b
这行代码创建了一个PCA对象,并使用fit方法拟合数据。fit方法将数据df作为输入,并根据数据计算主成分分析模型。* I- K2 m, `& y
print('特征值:', model.explained_variance_)  g" n) ~/ J8 k1 l
print('贡献率:', model.explained_variance_ratio_)
1 o$ j- N, O/ k1 x+ T0 eprint('各主成分的系数:', model.components_)& Y( _- `, P* L9 A/ C

' \; i# h) M, R这几行代码分别打印了主成分分析模型的三个重要属性:
% m7 i- E+ C! @" H/ ~$ t1 Z* U# p1 h0 a  t; o' P' B3 S% e
1.explained_variance_:特征值,表示每个主成分的方差。
. T. m4 E' v! G, C+ ?2.explained_variance_ratio_:贡献率,表示每个主成分的方差占总方差的比例。
; a- m  ?5 V$ _7 P3 Z' z& x3.components_:各主成分的系数,表示每个主成分在原始变量空间中的权重。
. d  @+ F, n( C' O( X# F, T* \$ ?
' J# T8 [. T* d7 f' `, npca_df = pd.DataFrame(model.transform(np.array(df)))
: L- k& Z* ?0 a" z  O1 ]% Z. C* apca_df.columns = ['F1', 'F2', 'F3']
. `" K- }% F) `) spca_df) w- r& f* l, U* O2 Q& N# S
( T8 E. N% I  @0 g/ i9 u- i% A7 N
这几行代码使用model.transform方法将原始数据进行主成分转换,并将结果存储到一个新的数据帧pca_df中。pca_df包含三个列,分别命名为'F1'、'F2'、'F3',分别表示三个主成分的值。9 a/ \. A$ A" k9 e! |  ?( `. J' X
希望这个逐行解释对你有帮助!如果你还有其他问题,请随时提问。% J" |5 c$ W' g7 g: q' F

9 W8 ]3 {0 j9 ~& j6 D& P& D  J" y, u

29.pca.py

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