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python 解决主成分分析 pca

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发表于 2024-3-21 11:03 |只看该作者 |倒序浏览
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主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)是一种常用的降维技术和数据预处理方法,它通过线性变换将高维数据映射到低维空间中,以找到数据中的主要特征。; w8 T- [( q; w" n) i, y5 o
主成分分析的基本思想是将原始数据投影到一个新的坐标系中,使得投影后的数据具有最大的方差。这些新的坐标轴被称为主成分,而每个主成分都是原始特征的线性组合。主成分按照其所解释的方差贡献程度进行排序,最重要的主成分排在前面。
: w  X# x5 z( O. [. h( e0 Q8 H% ]主成分分析的步骤如下:
# @4 s' U6 C& ?! W5 J
: `9 f4 `% M9 h) D/ S1.标准化数据:将原始数据进行标准化处理,使得每个特征的均值为0,方差为1。这样可以避免某些特征由于量级差异造成的影响。
, y: k9 X$ G# L- i2.计算协方差矩阵:根据标准化后的数据计算协方差矩阵。协方差矩阵描述了不同特征之间的相关性。. C! V) s4 {: m3 [& R# L
3.计算特征值和特征向量:对协方差矩阵进行特征值分解,得到特征值和对应的特征向量。特征值表示每个主成分所解释的方差,特征向量表示各个主成分的方向。
' R' t% Q8 [  r! b/ O% y; q4.选择主成分:根据特征值的大小选择要保留的主成分的数量。通常选择保留累计贡献率较高的主成分。
0 o$ J3 a, C: h& ]( i: o5.数据转换:将原始数据投影到选定的主成分上,得到降维后的数据。
5 l/ v: s( _. y5 u; X/ a; n% ^$ l  ]+ E& `0 Z2 D
主成分分析的主要应用包括降维、可视化、特征提取和去除数据中的噪音。通过降低数据的维度,主成分分析可以简化数据集并去除冗余信息,从而提高后续分析的效率和准确性。
& k0 H* X/ I' D' Z$ {% r  [" z
' \0 p% F1 g7 B逐行解释代码的含义:; W' y/ s. m# ?- d) ?
import numpy as np% y' A8 Q9 T6 A+ `& V# ]0 Y+ M
import pandas as pd
# b/ R9 b/ P' F7 y. c- ]from sklearn.decomposition import PCA- q% |0 r) M( b

0 H  j- U1 B) P3 V3 Q7 d' y这些是导入所需的库。numpy用于数值计算,pandas用于数据处理,sklearn.decomposition中的PCA用于主成分分析。2 l5 e" {% i' B3 y' u- v
df = pd.DataFrame({
5 G: z4 t% ~  V5 d( b+ r. k    'x1': [149.5, 162.5, 162.7, 162.2, 156.5],9 }8 k) O- z7 f9 Z2 {# R$ M/ M+ l: Y
    'x2': [69.5, 77, 78.5, 87.5, 74.5],
" U2 j5 D2 ?0 A8 u$ H% a  L4 d    'x3': [38.5, 55.5, 50.8, 65.5, 49]: z2 {1 _0 H8 S! G) g
})
$ i9 n: [7 H5 o9 P4 T! Z( o& n$ B9 G7 Y, I1 N8 K/ W9 l" L
这里创建了一个数据帧df,包含了3个变量 x1、x2、x3 的观测值。数据集中每一列代表一个变量,每一行代表一个观测值。1 Q2 q3 x$ I. S6 \
model = PCA().fit(np.array(df))! b8 d/ H' H( m/ l% p: F; W/ Z# J

" u8 O9 b' D; u' N# ~" o0 V这行代码创建了一个PCA对象,并使用fit方法拟合数据。fit方法将数据df作为输入,并根据数据计算主成分分析模型。! {( X5 j4 R4 E% v. u
print('特征值:', model.explained_variance_)8 d# G) m: F: {9 B7 x0 m
print('贡献率:', model.explained_variance_ratio_)6 x8 |! L( }9 Z3 g. ~4 w. \# ^
print('各主成分的系数:', model.components_)  }5 @6 j6 `2 H

3 P8 x5 k; h$ O  k$ f% `3 z; F这几行代码分别打印了主成分分析模型的三个重要属性:5 X8 d3 t+ S* M6 \: V5 q# u- t
. K) y  h/ C- I/ j  f
1.explained_variance_:特征值,表示每个主成分的方差。
+ R4 v. q5 v" p' h9 o2 S2.explained_variance_ratio_:贡献率,表示每个主成分的方差占总方差的比例。
0 E# B% s7 f$ M( @/ f# t3.components_:各主成分的系数,表示每个主成分在原始变量空间中的权重。
4 q! T0 `; ?6 r9 W; m( y* m! [
: }/ o7 T! Y: i# ?pca_df = pd.DataFrame(model.transform(np.array(df)))6 d" S  Q6 k5 W2 Z& b4 f! Z, r/ f+ {
pca_df.columns = ['F1', 'F2', 'F3']- o) g  Z' p- O9 w; Y( `- ]
pca_df
2 ~/ @7 v& g9 u, ~8 q; V( g/ g! Y) t/ j
/ J5 V. M' m) P1 p) C5 N/ \4 w这几行代码使用model.transform方法将原始数据进行主成分转换,并将结果存储到一个新的数据帧pca_df中。pca_df包含三个列,分别命名为'F1'、'F2'、'F3',分别表示三个主成分的值。
. f) s* o4 o. P( E1 B希望这个逐行解释对你有帮助!如果你还有其他问题,请随时提问。; s9 \% W, _" Z

. t- n; [& j+ ?) c2 D; \+ i; y; P& |
9 E4 e3 R, I) o$ t1 W% p

29.pca.py

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