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python 解决主成分分析 pca

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发表于 2024-3-21 11:03 |只看该作者 |倒序浏览
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主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)是一种常用的降维技术和数据预处理方法,它通过线性变换将高维数据映射到低维空间中,以找到数据中的主要特征。: g" T* @3 M5 N  X9 U
主成分分析的基本思想是将原始数据投影到一个新的坐标系中,使得投影后的数据具有最大的方差。这些新的坐标轴被称为主成分,而每个主成分都是原始特征的线性组合。主成分按照其所解释的方差贡献程度进行排序,最重要的主成分排在前面。
- V/ k! l; B6 Z: l主成分分析的步骤如下:
- M9 y: h( \$ x0 c' c- h0 X' Z8 z; A
1.标准化数据:将原始数据进行标准化处理,使得每个特征的均值为0,方差为1。这样可以避免某些特征由于量级差异造成的影响。
* \1 v: ?7 h7 G2.计算协方差矩阵:根据标准化后的数据计算协方差矩阵。协方差矩阵描述了不同特征之间的相关性。% v1 z- a; w4 @& R2 j
3.计算特征值和特征向量:对协方差矩阵进行特征值分解,得到特征值和对应的特征向量。特征值表示每个主成分所解释的方差,特征向量表示各个主成分的方向。/ A# R2 w- i+ |/ T
4.选择主成分:根据特征值的大小选择要保留的主成分的数量。通常选择保留累计贡献率较高的主成分。
9 J+ M0 I4 e/ s) c1 N1 o: {5.数据转换:将原始数据投影到选定的主成分上,得到降维后的数据。2 a9 _! T+ d. \$ w" h( T) V- U9 [
$ Y+ U" B& Y7 p* N* i. U7 ~1 c3 y( F
主成分分析的主要应用包括降维、可视化、特征提取和去除数据中的噪音。通过降低数据的维度,主成分分析可以简化数据集并去除冗余信息,从而提高后续分析的效率和准确性。
( K% b% f4 e  O, [
, z5 Y9 k5 }! ^6 A8 N/ r逐行解释代码的含义:
  H8 [' O, U& ]7 W  f! i/ Timport numpy as np, a' w# \# J7 h+ x; h2 F  ^
import pandas as pd
" `" \6 o2 {0 Ifrom sklearn.decomposition import PCA) P: _' l% J: |* M& @( ^4 V0 y

9 m5 I5 K( t0 h7 ?6 M& F' |; f这些是导入所需的库。numpy用于数值计算,pandas用于数据处理,sklearn.decomposition中的PCA用于主成分分析。
' N; K8 m: F7 `* X6 b0 Y% y. {1 _df = pd.DataFrame({6 C; [3 Q- y9 v  n# v5 ^( d% i
    'x1': [149.5, 162.5, 162.7, 162.2, 156.5],
, X- O" G2 d) j    'x2': [69.5, 77, 78.5, 87.5, 74.5],  Z) u: C6 P$ h: W
    'x3': [38.5, 55.5, 50.8, 65.5, 49]
, o, \: }" q2 g4 h3 f})/ [$ _7 G5 A( P1 _; h
, V* A, P+ X! B# b1 R' G- O
这里创建了一个数据帧df,包含了3个变量 x1、x2、x3 的观测值。数据集中每一列代表一个变量,每一行代表一个观测值。; M* b/ y+ U' t* b* A2 U
model = PCA().fit(np.array(df)): e, h1 z2 H: R1 D7 O

9 A6 u* Q2 P6 n" X' E这行代码创建了一个PCA对象,并使用fit方法拟合数据。fit方法将数据df作为输入,并根据数据计算主成分分析模型。9 u- G8 Z5 r) n) J/ k3 ^1 t& {. ~2 W; q; n
print('特征值:', model.explained_variance_)
! W/ e( o8 o! r0 E% ^- hprint('贡献率:', model.explained_variance_ratio_)6 U. H7 _& b1 i5 r, p! M
print('各主成分的系数:', model.components_)
( `: U$ i# ~2 L0 v. l9 u5 l2 M
7 b" u' \, d, U# `( S2 O2 X1 F这几行代码分别打印了主成分分析模型的三个重要属性:
3 M' @% i! `2 U, }  g( j- g1 O4 I- z' ^. Z# e
1.explained_variance_:特征值,表示每个主成分的方差。
3 G: D* Z  n2 `1 I+ |* S4 }2.explained_variance_ratio_:贡献率,表示每个主成分的方差占总方差的比例。
) E( A% a6 _6 n1 U9 ^% N3.components_:各主成分的系数,表示每个主成分在原始变量空间中的权重。8 t2 E: m! j7 B" v
8 [- e/ _$ t$ T1 H- V0 L
pca_df = pd.DataFrame(model.transform(np.array(df)))
, z# ~) n: B* I6 {# x7 T( v2 hpca_df.columns = ['F1', 'F2', 'F3']; |9 b6 l* Y6 K% m( d2 z
pca_df
6 Z# y0 j2 g7 H3 F' {9 i( E& H* Y: q
这几行代码使用model.transform方法将原始数据进行主成分转换,并将结果存储到一个新的数据帧pca_df中。pca_df包含三个列,分别命名为'F1'、'F2'、'F3',分别表示三个主成分的值。# H) d( k, ?2 r1 t( x
希望这个逐行解释对你有帮助!如果你还有其他问题,请随时提问。
0 y" W- M0 z& R$ z' `( {, u, j; a3 t2 {, C9 r' l
8 `) X' f' U, a: V

29.pca.py

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