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[个人总经验] 一般线性模型(GLM)的相关思考

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发表于 2015-4-1 13:57 |只看该作者 |倒序浏览
|招呼Ta 关注Ta
最近遇到一个问题,如果因变量为一个连续变量(如胰岛素水平),主要考察的变量为分组变量(如正常血糖组,前糖尿病组,糖尿病组三组),现在的目的是想看调整多种变量(包括多个连续性变量和分类变量)后,胰岛素水平是否一致。/ O) X8 j' {" b/ Q& D# o5 h
: M% W4 ?3 M# v# y& h: o

8 h; t. b: d" _& M1 w/ E- J7 s6 ?一开始的思路想到的是采用GLM进行协方差分析来解决。5 s" b, ^. C3 F4 p9 j1 o

& Y( {8 E6 |2 a, L9 m& p: G5 J; }+ O但是有觉得似乎不是很对,因为经典的协方差分析通常只考虑一个连续变量(协变量)和一个分组变量,同时协变量和分组变量只有不存在交互的时候(经典协方差分析的前提)才能使用协方差分析。6 H) k# N, q: y! J% ^; `7 i1 q9 e( Y
针对我目前的问题,如果想调整多个连续性变量和分类变量,这种方法能否再叫协方差分析?如果可以认为是协方差的思想,用不用检验协方差分析的前提(如协变量与分组变量之间的交互)?多个连续性变量和分类变量存在时,该前提应该怎么检验?
0 n. M: }0 J5 E( p
% a1 I, j( \- Z! U通过跟别人交流之后,有一句话非常受用:线性模型其实最重要的不在于用的方差分析还是协方差分析,而主要是检验残差是否符合线性的几个条件。
- f3 j( a& G, {: s' g& m7 R
. z6 ^0 U3 ?2 E受到该启发后,认真再复习GLM的相关资料,得到更加重要的总结如下(来自高惠璇SAS/STAT软件使用手册,实际是SAS8.2的User's guide的中文版,但是目前SAS 9.2,9.3的User's guide关于GLM模型的介绍中已经删去了这么经典的总结,实在可惜,倒让人看不到GLM的真正长处了):
' F" j$ y6 @7 G/ k. v8 G如果X1-X3,Y1-Y2为连续性变量,Y3为分类变量,a-c为分类变量,time为时间变量,目前我们熟悉的模型可以简单概括如下:0 J( B* c6 D- X
(1) y1= x1    简单回归$ H7 B) j& D- v, h5 F( s
(2) y1= x1 x2 x3  多重回归(multiple regression)
% H0 u( I( v8 v4 K8 Z. t(3) y1 y2=x1 x2   多元回归(multivariate regression)
+ ~0 Q/ r  G' g0 |# m(4) y1= a   单因素方差分析! E  m& F) v/ D; U
(5) y1= a b   (析因设计的)主效应分析
2 i: A/ y9 ~2 w) S: C% E(6) y1= a b  a*b (析因设计的)主效应加交互项分析
+ j5 N  D- g( Q, a. n3 R3 v. ~1 {(7) y1= a x1   协方差分析
0 j2 C$ F: X4 {% M) c(8) y3= a   单因素logistic回归4 w7 ?9 x8 J0 F; Z
(9) y3= a b c x1 x2 x3   多因素logistic回归' m5 n9 t5 H" Y5 G9 H  n( F# C
(10) y3(time) =a   单因素cox回归  H7 m+ i/ f. t
(11) y3(time) = a b c x1 x2 x3  多因素cox回归, m$ [  g8 U" x2 p4 c: ?" L

* w* v- `* r1 N5 u- P- V, C/ t4 f# j1-7采用SAS的一般线性模型GLM都能实现,而1-9采用SAS的广义线性模型GENMOD都能实现,具体验证详见后面举例
- |$ v! U. k: g; T7 D( f$ R& X% W  |
再次回到开始的问题:掌握上述的基本思路后,因为因变量为连续变量,所以采用线性模型肯定是对的。如果因变量可以认为是正态的,那采用一般线性模型是合理的。所以现在的关键问题是:如果调整多个变量(包含分类和连续变量)后看不同分组间因变量(连续变量)是否仍有差异时,能否再称为协方差分析?我目前认为应该是可以的,但是事实上我们遇到这种情况后,并不再去强调它是协方差的思想,而只是回到线性模型分析的最初的起点,也即是检查残差是否符合线性的基本条件即可。4 `2 h! O3 u/ n* S- x% j2 i* u, R
% @0 I: l# I+ `6 X
但是现实中,我们在使用GLM解决前面遇到的类似问题时,只是简单地用了,而很多时候我们都没有认真去检验残差是否符合这个条件,这可能是我们滥用GLM的表现之一,因为我们更多只关注模型的参数是否有意义,而不去关心对结果“无关紧要”的前提条件。
$ o- Q& ?3 x3 [% g& z/ R" w( U2 [5 S! ?) k9 p: U
再次思考一个问题,上述列举的1-7模型,在GLM中并没有特定的选项指定是哪一种模型,而采用一种表达方式。由此,可以进一步深入概括一句话,GLM模型,对于上述列举的1-7模型并没有本质区别,唯一的区别只是模型中自变量的属性和数量不同。但是我们对1-7模型的叫法却不相同。而其原因是我们对事物的认识是一个由浅到深的过程,之前我们认为他们是不同的7件事情,随着认识的加深,发现原来这些问题可以用一个方式表达出来。而SAS的GENMOD则更能说明这一问题。现在还没有一个模型能把上述模型1-11用一种表达方式表示,但是COX回归在抛开基线生存函数之后剩下的部分也是线性模型,所以说不定哪天真的能够把上述所有模型用一种表达方式表示出来。到时候更应该相信人们对事物的认识绝对是一个由浅到深的过程啦。& b5 w2 {" b( J/ @: l" ~
" d" _6 Y* C2 x9 D0 Q) n
附:GLM与GENMOD在协方差分析结果的比较: _/ E! e# S  I1 L" W
   data drugtest; 2 t5 `; p, F2 c0 ?4 i' y
      input Drug $ PreTreatment PostTreatment @@;
* c$ ~; X3 l. k& Z* i9 r; e; i      datalines;
7 A( H( ]. K+ j; [) v+ {   A 11  6   A  8  0   A  5  2   A 14  8   A 19 11 5 n. _( F! O$ d
   A  6  4   A 10 13   A  6  1   A 11  8   A  3  0
1 F  y" x- u' _* h   D  6  0   D  6  2   D  7  3   D  8  1   D 18 18
8 O  V$ x5 f& z: ?; F   D  8  4   D 19 14   D  8  9   D  5  1   D 15  9
/ M- K5 R2 j6 n9 S   F 16 13   F 13 10   F 11 18   F  9  5   F 21 23
) \$ ^; P" @# X* O% R* m! y2 V. O   F 16 12   F 12  5   F 12 16   F  7  1   F 12 20 0 ~6 A) [, _. j6 b  [- J. [
   ; 9 c0 u+ ^% n% E& L% o8 c4 ~; @) _

' T7 s7 n3 s, C+ |6 o% A  o" s   proc glm;
' I  q* c# d. u) r8 _  \      class Drug;
8 z' Y7 }  Q7 C* x2 {  C      model PostTreatment = Drug PreTreatment / solution; 1 @2 V* O; i. O* G, ]
      lsmeans Drug / stderr pdiff cov out=adjmeans;
' w3 m$ w5 ^9 I; R2 J) \   run; " G5 a+ h. j- f9 O/ O

0 P( s) {- T! o) g" @   proc genmod data=drugtest;
3 B/ c) E+ O8 W1 b      class Drug; , E( y+ k! X4 [! c
      model PostTreatment = Drug PreTreatment / dist=NOR link=ID obstats type1; 9 ^: \' e4 |0 Z# i5 ]
   run; * ^# l6 ?0 ]) @
, k1 D, ]! I( n) h+ {
   proc print data=adjmeans;
% T" Y* A. z6 b* I& q' G4 R4 K! J   run;$ q  h& u7 ?  r6 x" b* P: A$ w

5 l$ ?* S. Q5 T+ e: e
" p, b$ K+ n7 a6 x: q9 A  E& B
8 @4 r) N$ W+ H$ h0 ]
zan
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飘过

3 ?4 ?- }( j& L) S" R( p学习了,总结的真好,特别是那句关于前提的提醒8 ]$ D* }3 F4 B$ l& L
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    0 i5 o6 p5 H' H8 i+ C5 O) w0 s学习了,,“我们更多只关注模型的参数是否有意义,而不去关心对结果“无关紧要”的前提条件
    5 s" R6 }4 r- [! f( d) u”这句话是该提醒了很多人啊,个人感觉不要只知道应用,还要知道原理,所以说理论性的东西还是不可缺的,,谢谢楼主了哈,,
    % m: }/ C, O; M0 B
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    2015-4-1 17:42
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    [LV.1]初来乍到

    自我介绍
    @

    $ f. e" h  R- ^3 |' r* F深入浅出,简练的表达,传达了复杂的内容。
    5 ~$ f) M- G- B. S9 w% Q貌似目前好多著者、师者都缺少这种思考与总结,有的书、课件就是靠东拼西凑来的。
    7 W  }0 R7 e0 b* d5 T
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