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[个人总经验] 一般线性模型(GLM)的相关思考

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发表于 2015-4-1 13:57 |只看该作者 |倒序浏览
|招呼Ta 关注Ta
最近遇到一个问题,如果因变量为一个连续变量(如胰岛素水平),主要考察的变量为分组变量(如正常血糖组,前糖尿病组,糖尿病组三组),现在的目的是想看调整多种变量(包括多个连续性变量和分类变量)后,胰岛素水平是否一致。+ ]. n8 Y! w2 V  }' h: \

! \( P- B  K, F6 S
3 }/ p: }/ E# \一开始的思路想到的是采用GLM进行协方差分析来解决。
3 f- v, e. _1 _0 A* j8 G, }! c  B" \; P  _7 k8 o/ m# _/ C
但是有觉得似乎不是很对,因为经典的协方差分析通常只考虑一个连续变量(协变量)和一个分组变量,同时协变量和分组变量只有不存在交互的时候(经典协方差分析的前提)才能使用协方差分析。) F$ E7 w( R- |! ~$ l
针对我目前的问题,如果想调整多个连续性变量和分类变量,这种方法能否再叫协方差分析?如果可以认为是协方差的思想,用不用检验协方差分析的前提(如协变量与分组变量之间的交互)?多个连续性变量和分类变量存在时,该前提应该怎么检验?
$ y6 W/ {0 @, G! n
6 h  _1 t# h  W0 m通过跟别人交流之后,有一句话非常受用:线性模型其实最重要的不在于用的方差分析还是协方差分析,而主要是检验残差是否符合线性的几个条件。" v8 u7 j4 `% o

6 }2 ~! k6 v& a* H/ H受到该启发后,认真再复习GLM的相关资料,得到更加重要的总结如下(来自高惠璇SAS/STAT软件使用手册,实际是SAS8.2的User's guide的中文版,但是目前SAS 9.2,9.3的User's guide关于GLM模型的介绍中已经删去了这么经典的总结,实在可惜,倒让人看不到GLM的真正长处了):
0 v! W. x7 `4 p+ d4 Y& k3 @2 R如果X1-X3,Y1-Y2为连续性变量,Y3为分类变量,a-c为分类变量,time为时间变量,目前我们熟悉的模型可以简单概括如下:
& H$ f) e; C# H  _4 o(1) y1= x1    简单回归
/ K# `- i3 b1 }3 f(2) y1= x1 x2 x3  多重回归(multiple regression)
, s1 t1 j# l: {! u. S0 i(3) y1 y2=x1 x2   多元回归(multivariate regression)
; T9 J8 K' |+ W) N  I& v6 h(4) y1= a   单因素方差分析) _2 |2 p7 m7 z5 l/ t
(5) y1= a b   (析因设计的)主效应分析* K8 n: Q' O; k; w, W6 w' R( Q0 ?
(6) y1= a b  a*b (析因设计的)主效应加交互项分析
& W( v$ `4 l) k+ F! P/ y(7) y1= a x1   协方差分析4 p( U; r3 z  V; x( l) F* {" t
(8) y3= a   单因素logistic回归  @; o5 N- j- ?2 _) D5 `8 q) w
(9) y3= a b c x1 x2 x3   多因素logistic回归
5 E7 m0 ~$ n4 N$ W9 b# B(10) y3(time) =a   单因素cox回归8 J) Z& l" f& j" z& X* }+ t
(11) y3(time) = a b c x1 x2 x3  多因素cox回归
0 x  N3 N9 e" A9 S1 q& a4 d# g; F' O+ Z7 _& z9 ^
1-7采用SAS的一般线性模型GLM都能实现,而1-9采用SAS的广义线性模型GENMOD都能实现,具体验证详见后面举例
, f& _2 h$ m4 b) \( ~2 ~8 N  E# d. R0 }4 Q; S; F" f
再次回到开始的问题:掌握上述的基本思路后,因为因变量为连续变量,所以采用线性模型肯定是对的。如果因变量可以认为是正态的,那采用一般线性模型是合理的。所以现在的关键问题是:如果调整多个变量(包含分类和连续变量)后看不同分组间因变量(连续变量)是否仍有差异时,能否再称为协方差分析?我目前认为应该是可以的,但是事实上我们遇到这种情况后,并不再去强调它是协方差的思想,而只是回到线性模型分析的最初的起点,也即是检查残差是否符合线性的基本条件即可。1 Q3 I9 i8 r; c& c4 Z* D( K- Z

+ |/ {/ c! m( ?' g# J但是现实中,我们在使用GLM解决前面遇到的类似问题时,只是简单地用了,而很多时候我们都没有认真去检验残差是否符合这个条件,这可能是我们滥用GLM的表现之一,因为我们更多只关注模型的参数是否有意义,而不去关心对结果“无关紧要”的前提条件。
1 j' M. v7 \, Q" G# U* @2 u! p
- }9 @. _2 z+ n  I. _- i再次思考一个问题,上述列举的1-7模型,在GLM中并没有特定的选项指定是哪一种模型,而采用一种表达方式。由此,可以进一步深入概括一句话,GLM模型,对于上述列举的1-7模型并没有本质区别,唯一的区别只是模型中自变量的属性和数量不同。但是我们对1-7模型的叫法却不相同。而其原因是我们对事物的认识是一个由浅到深的过程,之前我们认为他们是不同的7件事情,随着认识的加深,发现原来这些问题可以用一个方式表达出来。而SAS的GENMOD则更能说明这一问题。现在还没有一个模型能把上述模型1-11用一种表达方式表示,但是COX回归在抛开基线生存函数之后剩下的部分也是线性模型,所以说不定哪天真的能够把上述所有模型用一种表达方式表示出来。到时候更应该相信人们对事物的认识绝对是一个由浅到深的过程啦。: A' s! {: Z$ ~4 B

6 r0 q: I3 N. E附:GLM与GENMOD在协方差分析结果的比较4 m8 D/ R8 A! ^& r4 L& f
   data drugtest;
+ ?9 g" {$ r4 r# a- y# s      input Drug $ PreTreatment PostTreatment @@;
. V/ \0 L4 ]2 r/ \      datalines;
; ^- w- \9 a4 f' R! e! f4 c) s   A 11  6   A  8  0   A  5  2   A 14  8   A 19 11 9 d- E+ D/ ]( q2 @+ i/ c
   A  6  4   A 10 13   A  6  1   A 11  8   A  3  0 9 k5 f+ T0 L# u5 J5 v. j- ?7 G8 d5 J& T
   D  6  0   D  6  2   D  7  3   D  8  1   D 18 18
; |" g3 x/ w8 d& S% b   D  8  4   D 19 14   D  8  9   D  5  1   D 15  9   N7 |1 j8 u7 o5 k$ p
   F 16 13   F 13 10   F 11 18   F  9  5   F 21 23
/ x" S2 x) O4 e   F 16 12   F 12  5   F 12 16   F  7  1   F 12 20
5 E! N7 N6 I5 C* A4 l3 d, F2 ]   ; * N  @$ j+ ~4 U! o9 R( I/ Y7 l7 w  y8 ]

4 {; D5 X7 W( Q+ O   proc glm; ; A2 h) d+ U3 t& s" u3 m! l1 \
      class Drug; ( Z1 `! v% z6 V& \
      model PostTreatment = Drug PreTreatment / solution;
: L. ~5 T) }4 P; v2 u; o      lsmeans Drug / stderr pdiff cov out=adjmeans; + b# f$ L4 g2 \6 e( h
   run;
( p1 p( L) _! U4 s$ w1 E4 e; e  K6 @8 Z
   proc genmod data=drugtest;
: S9 R& w& _- p( Z! A' w5 C3 E' `5 I      class Drug;
" r# [; c0 T7 W8 X. J      model PostTreatment = Drug PreTreatment / dist=NOR link=ID obstats type1;
1 g) P8 I) p9 p6 [9 T5 y) X   run; 1 `9 D1 f% K6 Z8 j3 t# v
' G5 P1 t2 v- F5 D, X5 R! J: _( f
   proc print data=adjmeans;
4 w- Y. ^# [1 ?! m   run;' l' W% h% @& c! [! R* ?' @" |/ ~
' w5 r: h* y3 b% Y
( q# ^* Q/ b" o3 }+ R5 Z) F& A* ~

* [: `" q+ i# `& _/ ?# F* L
zan
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飘过

' X5 f  N. D; L0 Y学习了,总结的真好,特别是那句关于前提的提醒
  [) S  k. J, \2 f3 a: _
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    拒绝一切

    : H4 W) `9 T1 y! S/ w8 ]学习了,,“我们更多只关注模型的参数是否有意义,而不去关心对结果“无关紧要”的前提条件  `+ @9 S3 T2 ^; i
    ”这句话是该提醒了很多人啊,个人感觉不要只知道应用,还要知道原理,所以说理论性的东西还是不可缺的,,谢谢楼主了哈,,
    9 x. y  D+ }% B. Q
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    [LV.1]初来乍到

    自我介绍
    @

    # g2 ~% s1 b0 M* {6 ]$ i0 X0 I深入浅出,简练的表达,传达了复杂的内容。# F6 G; q1 L7 n& H1 v* f9 _- p
    貌似目前好多著者、师者都缺少这种思考与总结,有的书、课件就是靠东拼西凑来的。
    2 ?6 ^, [  z' U# c8 M  c+ r& g
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