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偏最小二乘法&matlab实现

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    发表于 2011-1-31 15:01 |只看该作者 |倒序浏览
    |招呼Ta 关注Ta
    请问有谁弄过偏最小二乘法吗?有程序和具体例子提供不?感激不尽。
    zan
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    1. 偏最小二乘法的Matlab源码9 F1 z8 M7 X/ P' Q$ e0 t
    2.     所谓偏最小二乘法,就是指在做基于最小二乘法的线性回归分析之前,对数据集进行主成分分析降维0 I9 z  a$ A$ ^! R* w
    3. function [y5,e1,e2]=PLS(X,Y,x,y,p,q)% w* |+ q# s6 R' `8 R: I
    4. %% 偏最小二乘回归的通用程序
      ' k) |1 W4 V6 |  {
    5. %  注释以“基于近红外光谱分析的汽油组分建模”为例,但本程序的适用范围绝不仅限于此' r& H* }& C+ Q- F2 m8 j
    6. %% 输入参数列表+ i& V; D$ _/ k' M& ?% v# N. g, d
    7. % X        校正集光谱矩阵,n×k的矩阵,n个样本,k个波长. G( n5 G8 A, x3 z( C& S! Q  t
    8. % Y        校正集浓度矩阵,n×m的矩阵,n个样本,m个组分
      7 t5 V& Y5 B. p* ^. `) Z4 T
    9. % x        验证集光谱矩阵1 Q) E* r% e7 c3 k! U4 }, \! g3 F
    10. % y        验证集浓度矩阵
      7 j6 m, t& [1 R; E; D' @% q, H$ c
    11. % p        X的主成分的个数,最佳取值需由其它方法确定
      % T7 e* S6 B7 I5 n9 U& b
    12. % q        Y的主成分的个数,最佳取值需由其它方法确定
      9 x7 ?, f6 \$ M( r' C6 F% q
    13. %% 输出参数列表
        H6 l9 G: T$ p0 ^/ p4 o, A
    14. % y5       x对应的预测值(y为真实值)  d1 l' O. H5 |
    15. % e1       预测绝对误差,定义为e1=y5-y3 z- s7 R. e8 E4 N8 I; r+ L( C
    16. % e2       预测相对误差,定义为e2=|(y5-y)/y|
      ) _( v- I: \, D7 M
    17. 5 W& u$ a! A, F1 c& D! [  ]
    18. %% 第一步:对X,x,Y,y进行归一化处理5 W, M. b& o: C# n  z- i' C* ~& d
    19. [n,k]=size(X);
      8 |, x0 g) j% E9 g
    20. m=size(Y,2);
      - |- ]* ]4 u- {3 `8 G- H+ I
    21. Xx=[X;x];1 J2 l, T' Y0 B$ r0 ^! q
    22. Yy=[Y;y];
      ; H0 w; L\" L# s
    23. xmin=zeros(1,k);
      - U' R: U' ?0 M. X0 N' z* o. B
    24. xmax=zeros(1,k);
      / L$ K/ j* B. O
    25. for j=1:k
      ' T3 y\" P) Z6 G/ ~7 X
    26.     xmin(j)=min(Xx(:,j));
      $ U% U9 H# K6 h+ E+ G
    27.     xmax(j)=max(Xx(:,j));9 J3 X( j& U( I2 w, l
    28.     Xx(:,j)=(Xx(:,j)-xmin(j))/(xmax(j)-xmin(j));% f1 _9 {3 l+ y- V/ K( d+ c7 \
    29. end
      - ?9 e' x- ^9 j2 G6 G
    30. ymin=zeros(1,m);) F4 X& Q3 m! ?* d, s: i3 _- U
    31. ymax=zeros(1,m);
      0 w* b2 f+ l! @. _) @$ D7 S
    32. for j=1:m
      ; x# @2 Y  e0 S( X7 [\" c
    33.     ymin(j)=min(Yy(:,j));) m) v2 ?+ G. T
    34.     ymax(j)=max(Yy(:,j));
      & }9 {  R* U) u
    35.     Yy(:,j)=(Yy(:,j)-ymin(j))/(ymax(j)-ymin(j));9 B9 L' {. O* S, g
    36. end
      4 I8 P/ n( }0 ~, H; D
    37. X1=Xx(1:n,:);% y9 N+ e( X' O: i
    38. x1=Xx((n+1):end,:);* S\" w4 \, x( X. l
    39. Y1=Yy(1:n,:);/ ?$ x! M  Z; ^, Z+ J: ~% ?
    40. y1=Yy((n+1):end,:);
      1 |5 r0 R\" O4 `+ o; ?' `6 y

    41. / S4 N2 o# n3 n; q5 m4 t\" w; |
    42. %% 第二步:分别提取X1和Y1的p和q个主成分,并将X1,x1,Y1,y1映射到主成分空间2 q0 x) `. A# ~8 a/ B/ N
    43. [CX,SX,LX]=princomp(X1);
      , f8 f9 ~- |/ e; G
    44. [CY,SY,LY]=princomp(Y1);
      2 Y  p' r) m0 \6 b1 p
    45. CX=CX(:,1:p);! {8 p\" U- P5 R  u
    46. CY=CY(:,1:q);0 U# c5 G2 D; h\" Q  A& t2 W
    47. X2=X1*CX;* e# [- O) u2 I0 [% w+ H4 g
    48. Y2=Y1*CY;
      ; q  N% }+ H2 X
    49. x2=x1*CX;2 N5 X4 r4 r) q2 }( G! s
    50. y2=y1*CY;
        @. j9 h\" i9 v1 n
    51. : W7 k# }3 }9 L% B: b. g) [( j/ q
    52. %% 第三步:对X2和Y2进行线性回归
      * h7 ~# W\" l/ q$ f( ]/ i; u# n0 x
    53. B=regress(Y2,X2,0.05);%第三个输入参数是显著水平,可以调整
      0 I) w2 y1 w5 M& q! R4 l
    54. \" O, ~( x/ V! M\" `: v
    55. %% 第四步:将x2带入模型得到预测值y3
      0 l. Z+ ]! Q\" a- ?3 N8 X+ T
    56. y3=x2*B;
      8 K* s0 ^3 n1 ?9 |, }- \

    57. 9 D\" B# G( P( A0 D: L3 `6 j/ Y
    58. %% 第五步:将y3进行“反主成分变换”得到y48 r1 [% B5 V& D
    59. y4=y3*pinv(CY);
      , t4 G- V, X3 S) V5 b
    60. / ~6 w, x3 ~. p% k\" T% l$ ?; U
    61. %% 第六步:将y4反归一化得到y5
      1 _( t% q) F  q\" z; e: ]
    62. for j=1:m
      & N$ J, [. m2 F' i
    63.     y5(:,j)=(ymax(j)-ymin(j))*y4(:,j)+ymin(j);, P/ Q8 c0 c! Z6 \  q! g9 T
    64. end7 R; b\" x1 `$ b& Y' j

    65. 1 t/ R& u3 o\" Y9 e% r
    66. %% 第七步:计算误差6 ~  i# S; J1 D8 M\" G( N
    67. e1=y5-y;! H. U7 H: E4 ^9 x  d# I1 ?' r0 O/ O
    68. e2=abs((y5-y)./y);
      ! B* N; k, z4 [) o8 c# R7 b: ^

    69. 8 t. s# e* o* y  ~/ {$ ]+ H
    70. function [MD,ERROR,PRESS,SECV,SEC]=ExtraSim1(X,Y)4 V; ]  X$ j9 K' w) w
    71. %% 基于PLS方法的进一步仿真分析
      0 w+ x( u% X/ ]+ E/ g1 F8 b1 t& {
    72. %% 功能一:计算MD值,以便于发现奇异样本9 Y1 P3 Z9 v( ^  _7 k
    73. %% 功能二:计算各种p取值情况下的ERROR,PRESS,SECV,SEC值,以确定最佳输入变量个数
      - [2 e- [9 L6 h! C( f* p
    74. %%
      : y4 Z3 H: D) C# S) \1 `
    75. [n,k]=size(X);7 V. H0 b# ~; G
    76. m=size(Y,2);
      + e& l- Q  v* C\" g8 \7 K
    77. pmax=n-1;
      ) I! |5 ^/ P7 }+ P) L
    78. q=m;
      7 u9 q. a! E! e- U% H9 ^' \) a
    79. ERROR=zeros(1,pmax);
      % p2 }) j! O3 G' w3 c( Q
    80. PRESS=zeros(1,pmax);
      3 A' T9 q* Q+ [2 @* U0 Z: Q& O
    81. SECV=zeros(1,pmax);( u2 S/ }4 j( S* C+ J2 \\" F3 s
    82. SEC=zeros(1,pmax);
      ; ~3 x2 r% A0 q- v
    83. XX=X;: w1 a- o- I& ~# t+ I3 h
    84. YY=Y;
      7 H- r4 [  Z# K5 u9 m\" h
    85. N=size(XX,1);4 Q) D7 A- b, p6 _3 r
    86. for p=1:pmax, P- \) W2 o% u2 R7 H6 x$ b4 i
    87.     disp(p);+ ?\" }- P, X' s* Y7 c3 D5 R  a
    88.     Err1=zeros(1,N);%绝对误差; b+ V% A- U& q3 a3 z5 D% o5 M
    89.     Err2=zeros(1,N);%相对误差5 P: f$ D7 O5 E& r0 K
    90.     for i=1:N% A. q; U% d: P% v; w7 g9 I- }
    91.         disp(i);, E$ k  o2 W1 S$ [: g0 K. j
    92.         if i==1: Z; X! O9 N! b( x' O$ O- B
    93.             x=XX(1,:);
      : W3 W( e+ d9 ]1 ?/ C: g
    94.             y=YY(1,:);( d1 i  U/ ~! R9 b
    95.             X=XX(2:N,:);
      ' \. O4 B9 L$ b% y0 B
    96.             Y=YY(2:N,:);) p: m' D6 M\" t
    97.         elseif i==N& d2 B\" `+ K3 \# I\" B, I0 R
    98.             x=XX(N,:);
      * j/ b4 J4 N\" f6 S! `) i& z1 ]& u
    99.             y=YY(N,:);4 [6 h8 T- T+ u* B/ g: T7 B9 b
    100.             X=XX(1:(N-1),:);& X! e7 r: Z6 k3 y8 h: ?& P
    101.             Y=YY(1:(N-1),:);  [1 L6 }5 j7 t0 ]1 B
    102.         else+ k& S7 g0 ~! L& @. p' k
    103.             x=XX(i,:);
      % i3 Y  s3 ~# r/ F\" T: H  ]+ K4 y
    104.             y=YY(i,:);; Z3 m( `0 ^& s* z
    105.             X=[XX(1:(i-1),:);XX((i+1):N,:)];
      0 a1 A9 z9 T5 p0 u: E
    106.             Y=[YY(1:(i-1),:);YY((i+1):N,:)];% V1 ^( w6 r- f8 f, Y! J\" @6 R
    107.         end
      + e9 M9 T  v! Z% u' J
    108.         [y5,e1,e2]=PLS(X,Y,x,y,p,q);
      7 ^/ T; V, Y, a  Y2 n, j* |7 @* S
    109.         Err1(i)=e1;
      ; U5 F6 j3 o$ b1 K- s' P
    110.         Err2(i)=e2;  I  f+ Z& q9 e( }# J
    111.     end/ h9 r6 r9 E- c4 H0 H3 v
    112.     ERROR(p)=sum(Err2)/N;
      / f% ?\" f  n# n+ w$ M# w2 ?/ P, w5 w
    113.     PRESS(p)=sum(Err1.^2);9 B2 B\" m0 U4 Q+ ~; z, l
    114.     SECV(p)=sqrt(PRESS(p)/n);  }; V+ ^# @; Q( K) F7 ^. Z8 u) n
    115.     SEC(p)=sqrt(PRESS(p)/(n-p));\" ]* B5 E  O: J% P8 p
    116. end/ }+ m4 b2 u  m( H# n$ x. S& j6 g
    117. %%
      ; H3 q* Y% n1 \1 Y% j. N. G5 x
    118. [CX,SX,LX]=princomp(X);\" V1 j$ Y2 n+ J) j. _* g
    119. S=SX(:,1:p);+ K: X$ _! c0 @( B
    120. MD=zeros(1,n);/ ]# C7 |8 H- a0 Q% b; ]6 N! C
    121. for j=1:n* ^( C% _. P, m; z2 L, O/ R
    122.     s=S(j,:);
      2 ?, |: G; a  K0 F4 Z
    123.     MD(j)=(s')*(inv(S'*S))*(s);
      ) |# b4 ^- O) I- R9 N! o2 \: |. t
    124. end, Y9 k* d0 q( k/ o
    复制代码

    ) E0 s' g) N/ M
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    回复 厚积薄发 的帖子7 i' P1 f1 w8 z. @$ E) U+ L

    8 F$ K' ~3 q1 z7 [, y  H4 L谢谢你啊。你真是太即使了。但是你能不能把你的代码发到我的邮箱呢?我复制了结果都是乱码。241733089@qq.com, C1 x2 Y9 }; J7 ~2 R3 H
    我想用这个程序做关于客户忠诚度的预测,不知道你有接触过吗?
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    回复 maizhonghai 的帖子2 G6 d( d9 s, H) Q4 U

    ' X! @* d0 S4 D9 i 未命名.jpg , R1 F- Y% g# C) ^! i% d" `5 A
    # o+ I9 O6 z5 H# N
    请点击复制代码,然后粘贴到写字板,不要粘贴到记事本
    7 J" }- C( C* ~, X; |& J
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    回复 厚积薄发 的帖子! d8 C% R0 N5 i; ?
    ) Y0 h& \. M6 N5 X+ S# l- D
    喔,好的谢谢。我看下里面是多少个M文件先。有疑问再问你。非常谢谢
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    回复 厚积薄发 的帖子7 L( A. _  u$ A( a; d  b, T

    8 A; [, R) ~0 a8 h! Q你好,你里面好像没个function都紧接着几步。是不是都是归类为一个m文件?
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    回复 厚积薄发 的帖子# }- A$ x( [( Q$ V6 H
    ) _  i* @/ M6 `! Q; I1 V
    你好,我不知道你原题的X x Y y是个什么矩阵。不是很懂用这个程序。好人。你帮忙下嘛
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