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数学中国总编辑
TA的每日心情 | 衰 2016-11-18 10:46 |
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群组: 2011年第一期数学建模 群组: 第一期sas基础实训课堂 群组: 第二届数模基础实训 群组: 2012第二期MCM/ICM优秀 群组: MCM优秀论文解析专题 |
2#
发表于 2011-1-31 15:08
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- 偏最小二乘法的Matlab源码
\7 b2 |% w' l. B& w - 所谓偏最小二乘法,就是指在做基于最小二乘法的线性回归分析之前,对数据集进行主成分分析降维+ I- i- A3 b3 ^3 P) u: W3 I
- function [y5,e1,e2]=PLS(X,Y,x,y,p,q)
3 |. d& w1 J5 x/ _ - %% 偏最小二乘回归的通用程序; @$ a3 W0 T2 V4 b; [ }8 W, B
- % 注释以“基于近红外光谱分析的汽油组分建模”为例,但本程序的适用范围绝不仅限于此
! v0 [/ q+ G\" e0 i3 S - %% 输入参数列表6 _0 k0 I$ u: _6 I; \. F% d( E
- % X 校正集光谱矩阵,n×k的矩阵,n个样本,k个波长3 R6 B5 m& x B9 u7 ^+ _/ X. }9 R
- % Y 校正集浓度矩阵,n×m的矩阵,n个样本,m个组分
) ^8 q( A. t' K. C - % x 验证集光谱矩阵
/ b9 r C X; E: T$ u$ c4 S\" f - % y 验证集浓度矩阵- w0 Z! M! V# q# b; r6 [
- % p X的主成分的个数,最佳取值需由其它方法确定
$ w q( t) o6 W- P1 F9 U - % q Y的主成分的个数,最佳取值需由其它方法确定
: _6 G2 }5 {' b - %% 输出参数列表 T: A1 g/ u( j/ @4 V# g+ o* [0 Y
- % y5 x对应的预测值(y为真实值)% D/ N7 S: G9 H5 f
- % e1 预测绝对误差,定义为e1=y5-y% I! P% E) S8 l/ v0 _3 ?. J+ ~
- % e2 预测相对误差,定义为e2=|(y5-y)/y|' m5 H( }/ y, I! q
- 7 k& B: |0 g2 U. h/ j
- %% 第一步:对X,x,Y,y进行归一化处理5 C6 N9 Z3 A3 h+ Y* E
- [n,k]=size(X);) W: S; s$ x7 B* p) E& n
- m=size(Y,2);/ W& t6 [- m; u( W( U
- Xx=[X;x];
\" E7 r& {/ F2 D+ t m0 H - Yy=[Y;y];
0 |9 ~+ a2 I, m! I\" D - xmin=zeros(1,k);/ c5 z m9 S# O7 A5 l4 V9 n
- xmax=zeros(1,k);1 g1 A8 o* V% \% M
- for j=1:k3 }: v2 O2 ]0 u\" Z* t2 J4 J/ d
- xmin(j)=min(Xx(:,j)); J. [4 v; j4 b6 V- L& Z! i4 ?
- xmax(j)=max(Xx(:,j));1 p( y+ q! F! D\" `: J) m. T
- Xx(:,j)=(Xx(:,j)-xmin(j))/(xmax(j)-xmin(j));
4 P/ Y2 B2 ^\" u& g - end& M7 i% }2 a. i0 j
- ymin=zeros(1,m);' U; H3 r2 _3 Y& ]$ I: {
- ymax=zeros(1,m);
3 S& ?1 W0 k6 Z7 j - for j=1:m
( S3 J- B- D\" q& A3 T - ymin(j)=min(Yy(:,j));+ [, O, i4 t2 z8 N3 n
- ymax(j)=max(Yy(:,j));* {! e/ {; S. [0 ]1 M! ?5 y
- Yy(:,j)=(Yy(:,j)-ymin(j))/(ymax(j)-ymin(j));
( p\" d& Z3 K( ]6 b( i* ~, w, O6 x% R4 F - end* F$ k t: K. M
- X1=Xx(1:n,:);
5 I6 ]5 t; _5 G1 s' M Y - x1=Xx((n+1):end,:);
1 b9 N% f# i/ c; t - Y1=Yy(1:n,:);6 f5 a W; f& n2 t- c
- y1=Yy((n+1):end,:);
! d/ {. W4 c; _! l2 t -
+ k3 H2 T/ g1 W* p$ u/ F - %% 第二步:分别提取X1和Y1的p和q个主成分,并将X1,x1,Y1,y1映射到主成分空间( k3 o6 Z, A7 r: x: v. `1 {
- [CX,SX,LX]=princomp(X1);
; O1 g; W |: S. d& t8 m - [CY,SY,LY]=princomp(Y1);: M) Y6 W5 n% B! ^6 b/ m. e( g7 q
- CX=CX(:,1:p);7 k8 x3 K3 {1 a\" g
- CY=CY(:,1:q);
6 L, j, }) u3 M7 F5 l - X2=X1*CX;# a# H% e# j. H& C4 u
- Y2=Y1*CY;
. |1 B$ ?0 \0 h5 v( {5 F4 }( @/ w - x2=x1*CX;% H0 ]& I8 b7 r; O/ p
- y2=y1*CY;* J& l6 d! L6 x+ H6 E
-
\" i2 x4 P# t O - %% 第三步:对X2和Y2进行线性回归 ^0 }6 l& |5 z9 E B! ^- G
- B=regress(Y2,X2,0.05);%第三个输入参数是显著水平,可以调整! H\" R1 P$ M4 k8 |
- . |9 h/ H; T& M1 q4 c+ t0 u/ Y
- %% 第四步:将x2带入模型得到预测值y3! u+ D& a3 G0 z
- y3=x2*B;
+ J# G\" C: k- u7 I# I - ; ^/ E+ W9 T/ i% a+ V8 w$ L
- %% 第五步:将y3进行“反主成分变换”得到y4$ P& F Y5 s7 L( Z; h8 p4 F0 ^$ g
- y4=y3*pinv(CY);
8 {, N/ t7 T+ u$ C. o8 { - 8 j3 w# W. s6 g' p% W
- %% 第六步:将y4反归一化得到y5
4 S$ {' [\" G t' g - for j=1:m, A8 Y: U\" B/ b\" p+ C
- y5(:,j)=(ymax(j)-ymin(j))*y4(:,j)+ymin(j);/ J' K _, \8 S5 @3 q8 i: z: S/ v
- end
% @& Y: b. L\" N, k -
& O. M) e0 i+ `( ?) B/ W: B+ ` - %% 第七步:计算误差\" R0 g' ]/ X+ C2 R0 ~8 {% e. W
- e1=y5-y;- ~9 M/ [2 @3 v$ y* U
- e2=abs((y5-y)./y);
9 E8 @* m& p) \. \9 k1 U -
& _\" B1 {2 o6 m1 R. U; f( p% Y; X. @ - function [MD,ERROR,PRESS,SECV,SEC]=ExtraSim1(X,Y)) @2 }9 M1 W9 @3 z' o/ H% ?
- %% 基于PLS方法的进一步仿真分析6 T0 L0 S) p( Y2 I6 A2 i
- %% 功能一:计算MD值,以便于发现奇异样本6 T2 O3 N4 U4 d1 X
- %% 功能二:计算各种p取值情况下的ERROR,PRESS,SECV,SEC值,以确定最佳输入变量个数
# L. C7 W\" C& x - %%
4 B2 E+ G: r* j - [n,k]=size(X);
! ] y\" r/ @5 r\" B* t - m=size(Y,2);, x4 U0 X4 u6 {6 Q
- pmax=n-1;
4 L% h3 }\" u F8 ^+ t, d: X - q=m;
6 H' E\" O& V5 ^4 R6 s, b0 S - ERROR=zeros(1,pmax);7 Y( a l {7 C9 u* `* S t$ r
- PRESS=zeros(1,pmax);+ P* l* `6 v- y2 S' a# N( o
- SECV=zeros(1,pmax);
0 l\" e, N( W' w3 l: t( u2 e - SEC=zeros(1,pmax);8 S4 r) q! U( q0 {# L3 \\" H* [
- XX=X;: M2 [- o: ^& N! Z7 J
- YY=Y;) H9 S& `+ |& b8 ^! b. v9 G
- N=size(XX,1);& |' h' y* X$ z+ T* G
- for p=1:pmax9 U* U+ X0 p( ]1 o5 d( ^
- disp(p);7 b5 A1 H: R, e& f! n) m3 |
- Err1=zeros(1,N);%绝对误差
1 n\" G5 r% ]3 O6 j% Q' B\" o - Err2=zeros(1,N);%相对误差& e- W9 b! X7 V0 H' C6 C: g5 p
- for i=1:N3 ]# X3 {8 n1 g; E' h& P3 J
- disp(i);5 j7 K! N+ Z; d# @6 I
- if i==1( h\" W\" d( w: q }+ M3 P) ~
- x=XX(1,:);6 P# p\" h3 J. ?: W' W; ~5 w
- y=YY(1,:);9 E3 e/ u5 Z9 Z2 j! N- C/ p+ i
- X=XX(2:N,:);
) W6 F+ E* H/ G7 b - Y=YY(2:N,:);\" B* Y9 ?% j* o+ s5 c% f
- elseif i==N M0 z& S$ ~; z/ q7 f& U g* F
- x=XX(N,:);0 F\" u$ n* T; _4 E2 c
- y=YY(N,:);$ {; q6 i* T1 N( @. A; q
- X=XX(1:(N-1),:);+ o# [- b/ y' T5 ^0 E# ~' Q i
- Y=YY(1:(N-1),:);
( p `8 R2 c, p- }8 a - else
$ p2 }/ i$ ?' x$ G u% L6 F - x=XX(i,:);6 ?& g2 A. J) h% l6 ]' U
- y=YY(i,:);* p: k( d: l( C- `& ?: z: y
- X=[XX(1:(i-1),:);XX((i+1):N,:)];, E. r# {4 V+ l7 B
- Y=[YY(1:(i-1),:);YY((i+1):N,:)];4 b6 R5 H/ ?\" v/ t
- end
) R( }/ `8 V$ p( G - [y5,e1,e2]=PLS(X,Y,x,y,p,q);
: |7 e+ V/ t! O3 T - Err1(i)=e1;
& `7 C9 l6 q# q! c, |\" O4 \ - Err2(i)=e2;' Y) l1 ^9 e; [# M. q; D1 H% M' {
- end9 P$ w/ Z4 g\" i# L! g3 f
- ERROR(p)=sum(Err2)/N;
% j1 Q# ]6 T& b$ ^% A - PRESS(p)=sum(Err1.^2);+ v4 I2 ~! t& ]6 J
- SECV(p)=sqrt(PRESS(p)/n);% B; I. g$ s& V4 e# P% r* v# X
- SEC(p)=sqrt(PRESS(p)/(n-p));
% y* |) _4 A' U; W C- X+ |4 W. c - end3 X! m, s; T( B& r8 Q
- %%+ a; f. a6 O; C0 B- Q: `
- [CX,SX,LX]=princomp(X);/ l% d2 P. v% \! K# D. A; Y
- S=SX(:,1:p); W V. l; {+ }- q& y
- MD=zeros(1,n);
l7 O, w; N+ r: J - for j=1:n. b- r# W4 R! w& K& `' c
- s=S(j,:);
\" }) N$ `( \! T: s - MD(j)=(s')*(inv(S'*S))*(s);
' E6 u# U8 M1 D6 n- a - end
0 `# r. p* j$ K4 l1 s
复制代码 ; I* ~# Y" n; n5 }$ [
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