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数学中国总编辑
TA的每日心情 | 衰 2016-11-18 10:46 |
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群组: 2011年第一期数学建模 群组: 第一期sas基础实训课堂 群组: 第二届数模基础实训 群组: 2012第二期MCM/ICM优秀 群组: MCM优秀论文解析专题 |
2#
发表于 2011-1-31 15:08
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- 偏最小二乘法的Matlab源码 `. T6 O5 g: S! I
- 所谓偏最小二乘法,就是指在做基于最小二乘法的线性回归分析之前,对数据集进行主成分分析降维3 j! i5 A; p6 v3 C6 ]% H
- function [y5,e1,e2]=PLS(X,Y,x,y,p,q)
6 \6 n& k8 E' H) p8 d$ ^8 M0 c - %% 偏最小二乘回归的通用程序
1 r; n W, K& A7 K7 y d$ h4 J - % 注释以“基于近红外光谱分析的汽油组分建模”为例,但本程序的适用范围绝不仅限于此2 `3 Y' P5 h, J3 k
- %% 输入参数列表
: n# [2 T& t( ]8 m/ }/ V5 @ - % X 校正集光谱矩阵,n×k的矩阵,n个样本,k个波长. h+ j+ y8 F! S$ a8 `
- % Y 校正集浓度矩阵,n×m的矩阵,n个样本,m个组分
+ M3 P4 o6 T( a- V* v' q - % x 验证集光谱矩阵; C; O7 k) y4 w
- % y 验证集浓度矩阵\" w) ] c1 u2 Q9 S6 ~( m
- % p X的主成分的个数,最佳取值需由其它方法确定1 @- w3 l6 o9 v( p9 Q
- % q Y的主成分的个数,最佳取值需由其它方法确定
. Q, z a5 K9 O; i! b* i - %% 输出参数列表
; z+ T! O* p7 I - % y5 x对应的预测值(y为真实值)$ w$ B$ s Z' E
- % e1 预测绝对误差,定义为e1=y5-y
; f/ `$ |# _, q6 S* M8 D - % e2 预测相对误差,定义为e2=|(y5-y)/y|
4 j' b/ r; ]4 K9 N; Z0 G -
) X+ C3 g. q7 x# K$ G2 k3 I B - %% 第一步:对X,x,Y,y进行归一化处理
6 J/ @2 J4 x7 ?/ R0 m - [n,k]=size(X);
( m) K4 e$ J# u0 C) S! m - m=size(Y,2);3 N\" d7 p; r& b/ E E
- Xx=[X;x];
3 a9 j( t6 G& L' u8 K! L( l\" j - Yy=[Y;y];6 W: L* I$ X( I( s9 G
- xmin=zeros(1,k);
' n1 \# U; N2 K' v9 V( i1 x8 s; C - xmax=zeros(1,k);
6 z9 R& \0 ^- g0 r) p9 ? - for j=1:k
* X3 E; w7 I5 H& D - xmin(j)=min(Xx(:,j));
1 z% S2 p, ]2 B* L$ ]/ A D g - xmax(j)=max(Xx(:,j));
; B/ q0 P; [0 W - Xx(:,j)=(Xx(:,j)-xmin(j))/(xmax(j)-xmin(j));
- O# a2 W. d! t' @ - end
! [$ G1 i0 f, w! b - ymin=zeros(1,m);
5 B) Z4 T\" X3 f+ [7 s- ^\" R - ymax=zeros(1,m);
y; @\" W; K; W# B0 q\" F* H - for j=1:m
/ H/ _7 D* P4 h/ h( \$ U' X - ymin(j)=min(Yy(:,j));, m; R$ _- c$ O* v- U0 `( d1 d* I
- ymax(j)=max(Yy(:,j));: G7 u5 q% b/ @5 u8 H4 v3 e\" P E
- Yy(:,j)=(Yy(:,j)-ymin(j))/(ymax(j)-ymin(j));1 X0 w) Z- i\" |, J% P4 a
- end
2 `. Y3 K, b, n+ X\" ]0 R - X1=Xx(1:n,:);, J9 d\" W3 S, h6 K% t
- x1=Xx((n+1):end,:);9 u- c* a; z2 a4 \* @
- Y1=Yy(1:n,:);
+ E- M' ^* A- @! s\" K( e* C8 K - y1=Yy((n+1):end,:);, `1 h- i5 b8 X4 B: K C
- ! Q* R- X. J$ ?% V; f
- %% 第二步:分别提取X1和Y1的p和q个主成分,并将X1,x1,Y1,y1映射到主成分空间2 G% t6 k) k2 N6 e
- [CX,SX,LX]=princomp(X1);
6 r0 L\" ^ f# K; Z- ?& R; X- @ - [CY,SY,LY]=princomp(Y1);
1 X1 K2 k$ z' p7 q1 C1 ? - CX=CX(:,1:p);
7 ?1 C* M; Y3 {% m - CY=CY(:,1:q);
$ R. N& w: y& c - X2=X1*CX;
/ F- \: P4 S, h8 D - Y2=Y1*CY;
' J2 P' y! B, B$ v - x2=x1*CX;; f6 b8 B0 z+ S8 m- l7 o
- y2=y1*CY;
( S2 U2 Y+ @, r5 C6 W# H4 p - & M) V* H5 q0 B; U
- %% 第三步:对X2和Y2进行线性回归
5 k$ b* K# e\" G ] - B=regress(Y2,X2,0.05);%第三个输入参数是显著水平,可以调整3 }& `# `. n5 Y6 f\" }1 F& S
- 8 A, n, B8 c4 c& Q. u
- %% 第四步:将x2带入模型得到预测值y3
: l# w8 \- L( H- G; { - y3=x2*B;
; ?# Z( Z, U5 j3 C8 s -
: ~# o' x* U) a& P3 _ - %% 第五步:将y3进行“反主成分变换”得到y41 [9 P+ R6 z- o, g! q% j3 `% N
- y4=y3*pinv(CY);
\" x0 N: d6 x5 T, F$ N -
% j: W4 _3 h& K+ a$ D1 ?\" B - %% 第六步:将y4反归一化得到y5
7 d( F. o& ]- p. D5 M. s - for j=1:m3 F0 f0 ~: b+ U: z# \& U' E
- y5(:,j)=(ymax(j)-ymin(j))*y4(:,j)+ymin(j);( Y, v6 W+ m! F0 |& }3 j. M- @
- end
\" H# ~+ x# ^, _6 ] -
5 @& [; i& @; q# n: f! Q - %% 第七步:计算误差- `4 `* t/ o) r, W# }
- e1=y5-y;7 Z\" f3 k4 o0 c: O$ M\" ~\" Y! }
- e2=abs((y5-y)./y);9 }& M6 W g- i6 D' {4 H
-
[# [& l1 E\" H* N# M - function [MD,ERROR,PRESS,SECV,SEC]=ExtraSim1(X,Y)
. f7 U9 c. e0 n - %% 基于PLS方法的进一步仿真分析
1 Q- X1 J' Y5 z - %% 功能一:计算MD值,以便于发现奇异样本
. b; C% C: S. ]; X! f5 W0 t% \ - %% 功能二:计算各种p取值情况下的ERROR,PRESS,SECV,SEC值,以确定最佳输入变量个数
- W% y4 E z; |7 C* n - %%
! `2 f/ t5 {9 J$ @* w6 j3 U6 \ - [n,k]=size(X);
' @' a ?6 x) Q# S0 U - m=size(Y,2);5 q3 G; c% X& Q! w7 j
- pmax=n-1; o6 B$ {! R0 F
- q=m;
u$ o, y( ^1 |9 x - ERROR=zeros(1,pmax);
: Q( y+ u7 X3 v6 R+ E - PRESS=zeros(1,pmax);% o0 s6 b M) m6 b
- SECV=zeros(1,pmax);' g' v+ j; @ r) w+ l
- SEC=zeros(1,pmax);6 L/ y0 b4 _; F% m: |
- XX=X;' q3 C! m5 k# }# [. q) c' p+ V
- YY=Y;
1 B& t5 n7 S5 _0 h\" P5 w7 W - N=size(XX,1);( L+ b+ m- Q1 F. l/ h; z7 ]
- for p=1:pmax
3 l% `; e% \. I4 b, ~5 t. |( a - disp(p);: m8 K( V( Q0 G! ?' X, |5 E
- Err1=zeros(1,N);%绝对误差# G& F\" n) Z- ]' G, V0 E
- Err2=zeros(1,N);%相对误差7 E n1 O* i4 |\" I
- for i=1:N
+ t( F# m. |$ i' N - disp(i);8 N2 x9 [2 ^8 a; h% }! g
- if i==1
1 v8 y8 l* y9 ^# q m- l - x=XX(1,:);* {# Z. Q# K3 ^5 t
- y=YY(1,:);
8 p2 @\" D\" h1 i% J. g& \ - X=XX(2:N,:);; g+ y4 g\" c+ l' n: [' J
- Y=YY(2:N,:);
O5 Q' c, X6 ^ _; L - elseif i==N+ v g9 B\" b( m/ J: c3 V7 Y! N
- x=XX(N,:);# _/ P+ w+ P' X3 [6 X
- y=YY(N,:);
+ t0 j0 b& Q% B - X=XX(1:(N-1),:);
6 w+ n- g4 l: \( k\" y x - Y=YY(1:(N-1),:);
* X: S1 o9 T\" u+ w7 I4 V, m - else
7 o\" L3 k1 {. K - x=XX(i,:);
0 v) R# C. o5 [1 ]# _ - y=YY(i,:);( X4 y+ H) N% P2 P$ a7 N# r4 ?
- X=[XX(1:(i-1),:);XX((i+1):N,:)];, v: V, z\" ~6 e, T2 _
- Y=[YY(1:(i-1),:);YY((i+1):N,:)];
/ @5 Q* B7 \ P\" t1 [) h - end
\" {) H3 s3 {, f! G( e& g9 x - [y5,e1,e2]=PLS(X,Y,x,y,p,q);% g) r `; T7 L @% J5 c& Q3 n' e
- Err1(i)=e1;
1 ^+ q8 a7 D- g - Err2(i)=e2;
) C# Q5 h5 R\" s* R a - end' Y# m+ K* g; _, o* v8 C9 M2 e
- ERROR(p)=sum(Err2)/N;
. x( Q l: Z3 ~! H& X# C5 |4 P - PRESS(p)=sum(Err1.^2);8 Q) n4 I$ q, Q6 I% _1 S
- SECV(p)=sqrt(PRESS(p)/n);
9 x6 g6 k5 G8 f$ m9 G7 \# L - SEC(p)=sqrt(PRESS(p)/(n-p));
% I$ d& |3 p5 U! @1 P0 X - end
% m0 Y; T! I2 x- V2 ]. O - %%% p; _- L! ?& o7 ]
- [CX,SX,LX]=princomp(X);% y' x, K; B$ A, y9 d/ ?
- S=SX(:,1:p);
# b! R6 \* O9 i0 P! i8 H& H6 c - MD=zeros(1,n);, ~- t8 v! N6 ]. W- X* ~2 }; U8 S
- for j=1:n
4 \ ?# x2 r; x; j* ] - s=S(j,:);
+ B' i6 m$ O/ l - MD(j)=(s')*(inv(S'*S))*(s);
& \( s0 T; f8 B: h o - end
5 G5 W) x T, J* b+ w; d+ y3 F
复制代码 " x, K6 v4 f5 T4 l( J4 o8 X
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