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数学中国总编辑
TA的每日心情 | 衰 2016-11-18 10:46 |
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群组: 2011年第一期数学建模 群组: 第一期sas基础实训课堂 群组: 第二届数模基础实训 群组: 2012第二期MCM/ICM优秀 群组: MCM优秀论文解析专题 |
2#
发表于 2011-1-31 15:08
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- 偏最小二乘法的Matlab源码. U# v2 V1 W. N
- 所谓偏最小二乘法,就是指在做基于最小二乘法的线性回归分析之前,对数据集进行主成分分析降维
: A0 u2 V8 M: ]8 ~! I+ s - function [y5,e1,e2]=PLS(X,Y,x,y,p,q)$ z1 q7 P' R$ P0 j2 D& ]( T7 ~' y
- %% 偏最小二乘回归的通用程序! r1 u2 G2 f\" D7 [3 Z* h
- % 注释以“基于近红外光谱分析的汽油组分建模”为例,但本程序的适用范围绝不仅限于此
; ?, u: B3 c+ g. I - %% 输入参数列表
5 s( R1 q6 b3 h' e - % X 校正集光谱矩阵,n×k的矩阵,n个样本,k个波长6 P. V2 V) Q9 @8 H, V
- % Y 校正集浓度矩阵,n×m的矩阵,n个样本,m个组分8 V6 R% g' h3 R- t6 Q6 t1 F8 Z2 A
- % x 验证集光谱矩阵* t, u4 R+ r' ~/ }' y8 @9 p R) p
- % y 验证集浓度矩阵
+ m: }- J+ Q, v. v6 a - % p X的主成分的个数,最佳取值需由其它方法确定
0 v* p5 Q' E( I2 Q; j! S4 f# P - % q Y的主成分的个数,最佳取值需由其它方法确定
) q2 v+ o* ^; l$ _: c - %% 输出参数列表
8 Q7 R v! O7 V\" k\" g - % y5 x对应的预测值(y为真实值); c. {' j\" [) f, g. Y j5 L
- % e1 预测绝对误差,定义为e1=y5-y
, {4 Q. N$ [& i - % e2 预测相对误差,定义为e2=|(y5-y)/y|8 |7 e O2 ^( C
- 3 s! h# I4 m. `! B) `
- %% 第一步:对X,x,Y,y进行归一化处理8 F* @/ r, s( E3 S* O
- [n,k]=size(X);6 X; U1 F. M f
- m=size(Y,2);
$ T. _3 m, \' d U* M2 X0 g - Xx=[X;x];
7 y3 t5 A8 O\" Y\" w5 J1 x. m9 I - Yy=[Y;y];( S0 Y- u' u V7 q
- xmin=zeros(1,k);
+ u/ b3 F/ G& n\" }2 _ - xmax=zeros(1,k);2 x# |& S5 \; _! s/ k
- for j=1:k
. I6 H( F! A& ] - xmin(j)=min(Xx(:,j));
' b9 l+ s7 }7 O7 g: y% h0 u6 v- y - xmax(j)=max(Xx(:,j));
0 {' F& v ~# W8 l/ G+ Q - Xx(:,j)=(Xx(:,j)-xmin(j))/(xmax(j)-xmin(j));
! F2 ~# u/ b H - end2 g' T9 @; ]# E2 B' d
- ymin=zeros(1,m);
\" z\" f) `; f& M7 U: S/ t - ymax=zeros(1,m);* p5 e0 u6 w$ W) {! n* e/ f! h. P
- for j=1:m
0 {4 d$ [5 A; H - ymin(j)=min(Yy(:,j));
0 D3 m. \0 W: a8 w, m - ymax(j)=max(Yy(:,j));
- j0 H9 E6 D J! u4 m4 X( f\" K5 f6 W - Yy(:,j)=(Yy(:,j)-ymin(j))/(ymax(j)-ymin(j));
) `& n( @+ a- h4 w$ }* X- L: i \ - end
2 ?9 w( B6 q0 I* y6 ?7 C% F - X1=Xx(1:n,:);) Y$ n* E' F* A0 W; x6 S6 Z
- x1=Xx((n+1):end,:);
0 p) Y/ D' T# u+ \( `5 | - Y1=Yy(1:n,:);: F' R0 M; a' E6 H) X
- y1=Yy((n+1):end,:);3 C; z\" |+ P0 ?4 Z5 R. j6 s
-
; y6 j3 S% u* _& C$ I8 f1 ~5 r) x$ F - %% 第二步:分别提取X1和Y1的p和q个主成分,并将X1,x1,Y1,y1映射到主成分空间. w, W6 u\" y: g: M3 O% P- C
- [CX,SX,LX]=princomp(X1);
( b' `, A, v, {: ~ - [CY,SY,LY]=princomp(Y1);
. Q+ O) @/ z( g8 s7 F - CX=CX(:,1:p);
) G1 Z* M5 {* y - CY=CY(:,1:q);6 s3 a3 g& Z) \\" {5 s9 l5 P
- X2=X1*CX;
, M* { O' m: Z% u. d - Y2=Y1*CY;
v; i B5 ]2 c\" W7 S: o4 A! h+ e1 M - x2=x1*CX;' n1 k7 X; Q A4 b2 R w
- y2=y1*CY;6 V0 u# ?: u! U) E7 d2 _( c4 I
- $ i; T7 K# X3 }5 `# P/ d; j
- %% 第三步:对X2和Y2进行线性回归* B: K( I% P4 O7 G
- B=regress(Y2,X2,0.05);%第三个输入参数是显著水平,可以调整
* T2 |: ~4 z1 N6 N- x/ `; | - 2 Z% @- H# \& J, Y- z1 K
- %% 第四步:将x2带入模型得到预测值y3
/ f3 a* o* ~8 r/ ~6 A - y3=x2*B;
0 {4 P/ G* W+ e9 o8 \: v7 U - 8 V! l! a: o8 P+ h\" s; c
- %% 第五步:将y3进行“反主成分变换”得到y4
% C* D2 U( F u& ^' k5 O' j7 Z - y4=y3*pinv(CY);! a' W- a; d8 S: J0 j
-
$ }4 l' Z6 [8 p- y) X) V0 B - %% 第六步:将y4反归一化得到y5
2 T$ ]# A* N0 [+ v2 c& e - for j=1:m
1 j( A. B; {9 h\" f& |. y. x - y5(:,j)=(ymax(j)-ymin(j))*y4(:,j)+ymin(j);
% w( T( g5 Q7 w - end' l\" i9 d( @/ n. d% g- w8 Y% E
- ) l, o6 ~- [ X4 b& U
- %% 第七步:计算误差
4 A& C6 G5 z# E, V - e1=y5-y;
) O1 L' g- P# `2 Q# ~' \ - e2=abs((y5-y)./y);8 N! V7 m$ l$ i
- 7 X3 {+ k8 r8 j. _
- function [MD,ERROR,PRESS,SECV,SEC]=ExtraSim1(X,Y)+ Z% W2 d/ ]( W. v) |9 e' }/ ^
- %% 基于PLS方法的进一步仿真分析
# y! g* b, h4 t/ q0 f; Z% S6 Y, i - %% 功能一:计算MD值,以便于发现奇异样本
) G% y5 t1 T& p- o\" g# C6 [- E R - %% 功能二:计算各种p取值情况下的ERROR,PRESS,SECV,SEC值,以确定最佳输入变量个数
( Z% \4 {( ?( C/ g# c - %%
; G) B+ Z* Q* \- Z3 p - [n,k]=size(X);
+ X4 v) @; i1 `5 {* n5 M( u8 S - m=size(Y,2);
- {# J; Z+ W) l0 M\" ]* O$ O - pmax=n-1;4 Y8 D* Q. B7 b* N\" a5 e6 }) l/ ]
- q=m;. C* D+ E8 P# i. ~3 e) G B
- ERROR=zeros(1,pmax);
/ b- D' D0 `\" `% O - PRESS=zeros(1,pmax);, B' F' ^+ q8 L/ t3 T' v0 l* Q
- SECV=zeros(1,pmax);
; s0 k3 G0 N0 B3 `& t8 ^+ B - SEC=zeros(1,pmax);4 f1 N\" Q, K. o3 D
- XX=X;
\" J6 l; D. { L9 @) p - YY=Y;
v B, X+ r3 I* U+ a - N=size(XX,1);
8 W8 \* y3 ?* c8 Z. @* h& d) \ - for p=1:pmax
1 y' E# d& v% H: [% D - disp(p);5 W& ?- Z# L2 Q# j
- Err1=zeros(1,N);%绝对误差9 Z# s8 X+ B3 X6 G: l3 D3 g2 j% t0 f+ l
- Err2=zeros(1,N);%相对误差
; e1 ?. V- h: @& o1 C# m - for i=1:N% P& q0 l# ]$ A5 T0 Z) A\" Z1 t
- disp(i);
6 h% X, h8 l. V3 H7 y - if i==1
) y. U L8 S* i - x=XX(1,:);
$ H& K3 F: }6 @+ ^) F0 z - y=YY(1,:);
' U G0 G( G' G$ s - X=XX(2:N,:);
$ Q- e) T2 w7 i; N2 `' o - Y=YY(2:N,:);; f9 e; _\" p8 ]0 [2 \- e
- elseif i==N% ?& @3 X- C. i, B, s' z1 J9 T
- x=XX(N,:);/ T. i. }- V5 z% t7 e
- y=YY(N,:);2 ~\" o2 S Q, j+ A/ @0 O
- X=XX(1:(N-1),:);
\" T2 H% Z$ F9 K8 c - Y=YY(1:(N-1),:);
w/ E, R/ A$ c% C+ G+ k, d, b! o - else$ P: A8 B, I; A3 n( G1 N
- x=XX(i,:);
9 ]2 m. h+ P* `$ g - y=YY(i,:);1 F! O! P+ _0 B# P
- X=[XX(1:(i-1),:);XX((i+1):N,:)];
4 m1 l$ p0 w' c; s. H - Y=[YY(1:(i-1),:);YY((i+1):N,:)];
9 q9 @ R$ ]# _* ]1 @- m4 D - end
* z0 B6 W! Z+ R. _( l# s; Y - [y5,e1,e2]=PLS(X,Y,x,y,p,q);6 q7 b# n) B, f
- Err1(i)=e1;( _4 m# @1 R' l' p
- Err2(i)=e2;% g d3 ~4 Z& ]0 ]6 }
- end; A; {& R) v7 l6 o- H
- ERROR(p)=sum(Err2)/N;
5 _1 z) g) C7 p\" Z2 J7 [7 U. l - PRESS(p)=sum(Err1.^2);
\" T$ h: D1 h3 ]5 P5 ~0 E6 t$ s7 v- ? - SECV(p)=sqrt(PRESS(p)/n);7 D# b& O; [3 a. [; h
- SEC(p)=sqrt(PRESS(p)/(n-p));
0 c/ Q* f) Z1 \5 V3 p) H - end
8 i# `8 Q$ k2 b7 e& l, s, u* w - %%
( q9 C6 u8 v2 I- G/ F - [CX,SX,LX]=princomp(X);
9 e& l$ \$ |, t - S=SX(:,1:p);
% E* L! i$ I% @: c' x\" S$ ? - MD=zeros(1,n);
\" h, o8 u9 o3 A/ {0 Q& N - for j=1:n
+ ?: ^! ^' k5 ?\" i\" t - s=S(j,:);& w/ Y8 P: Z0 V
- MD(j)=(s')*(inv(S'*S))*(s);; M% F\" a* c6 }: e
- end; [2 x' S% _3 T4 t& c
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! k8 f; g* B8 ?3 v8 j" y |
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