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TA的每日心情 | 开心 2020-11-14 17:15 |
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1 常染色体遗传模型
6 ~ ?' c: S! W: n常染色体遗传中,后代从每个亲体的基因对中各继承一个基因,形成自己的基因对, 基因对也称为基因型。如果我们所考虑的遗传特征是由两个基因 A 和 a 控制的,那么 就有三种基因对,记为 AA, Aa,aa 。例如,金鱼草由两个遗传基因决定花的颜色,基 因型是 AA的金鱼草开红花, Aa 型的开粉红色花,而 aa 型的开白花。又如人类眼睛 的颜色也是通过常染色体遗传控制的。基因型是 AA或 Aa 的人,眼睛为棕色,基因型 是aa 的人,眼睛为蓝色。这里因为 AA和 Aa 都表示了同一外部特征,我们认为基因 A 支配基因a ,也可以认为基因a 对于 A 来说是隐性的。当一个亲体的基因型为 Aa ,而 另一个亲体的基因型是aa 时,那么后代可以从aa 型中得到基因a ,从 Aa 型中或得到 基因 A ,或得到基因a 。这样,后代基因型为 Aa 或 aa 的可能性相等。下面给出双亲 体基因型的所有可能的结合,以及其后代形成每种基因型的概率,如下表所示。" l: v8 W2 \- A1 H2 a! N
0 K2 \4 P! ?6 K( s+ G- x
![]()
" {9 e; u- ]7 z& N" J/ S- I2 b) Z9 X. J& A9 i* Q
例 5 农场的植物园中某种植物的基因型为 AA, Aa 和 aa 。农场计划采用 AA型的 植物与每种基因型植物相结合的方案培育植物后代。那么经过若干年后,这种植物的任 一代的三种基因型分布如何?0 G) {! N; a7 D
" b4 J" N( L9 r. _: S- `9 p
(a)假设
! p3 H1 {+ `2 `, z令n = 0,1,2,...。
% Z p3 k' j# ?/ Z( h
' t4 N2 Y! ^* H4 @' c8 ~( ^![]()
9 @$ r' E) F+ C1 e* e6 k% L- b
. E2 k! q( S$ W# z( [% }
. M e' K0 }4 b) d1 s1 _# o) o6 s6 L% B1 a, ]
(b)建模
! T6 q( E2 }' [5 f
% H0 E5 Y; w4 s# ] O" T 7 c2 e9 F+ e8 u- A+ R
! [/ z0 k" H+ V9 b3 U
![]()
3 z, g8 ]+ R* w1 ~4 `% g: Y8 p
8 D% q) [% p! @0 y( a2 c6 U2 @! [ R% c3 t2 X# R$ ^
编写如下 Matlab 程序:
( F' q/ B) ]' U4 q
# V7 l( H- R4 |; c2 csyms n a0 b0 c04 n ?, J' d' C$ v
M=sym('[1,1/2,0;0,1/2,1;0,0,0]');
' ~ @& E) E% m9 W! L: _# g" |3 s1 e[p,lamda]=eig(M);
R( V4 `8 E Zx=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0];
4 l% f! J% w+ o' y7 Z& Q5 T: l Sx=simple(x)
% J* B% l$ N" g0 _* d3 |! ]* i$ }: W0 q( Q# \/ I
![]()
0 F3 `% b7 E; ?# R- z3 f4 N; H: a6 Y9 u) H4 ?- h9 m/ G
即在极限的情况下,培育的植物都是 AA型。 (c)模型的讨论若在上述问题中,不选用基因 AA型的植物与每一植物结合,而是将具有相同基因 型植物相结合,那么后代具有三种基因型的概率如下表所示。 ![]()
编写如下 Matlab 程序: & t/ [* \/ }5 s4 |7 O" n
syms n a0 b0 c0" m8 @1 g3 @+ I" G9 ]# `( m8 \
M=sym('[1,1/4,0;0,1/2,0;0,1/4,1]');
) l- u' E# Q0 _+ n0 t" e; ?4 K[p,lamda]=eig(M);
, ?6 ~, R" D2 T+ U" Qx=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0];
" S5 r0 B$ `# P) L0 L2 n3 Ix=simple(x)
g4 M+ g. G+ H0 _
y0 z f% w1 i& _8 s4 g) {# b % b( J& Y' g# l
8 Z% ^, s. h0 K! b% h
2 常染色体隐性病模型
2 S8 w" Y# `+ O, r0 i- P+ b! E现在世界上已经发现的遗传病有将近 4000 种。在一般情况下,遗传病与特殊的种 族、部落及群体有关。例如,遗传病库利氏贫血症的患者以居住在地中海沿岸为多,镰 状网性贫血症一般流行在黑人中,家族黑蒙性白痴症则流行在东欧犹太人中间。患者经 常未到成年就痛苦地死去,而他们的父母则是疾病的病源。假若我们能识别这些疾病的 隐性患者,并且规定两个隐性患者不能结合(因为两个隐性患者结合,他们的后代就可 能成为显性患者),那么未来的儿童,虽然有可能是隐性患者,但决不会出现显性特征, 不会受到疾病的折磨。现在,我们考虑在控制结合的情况下,如何确定后代中隐性患者 的概率。9 u7 S9 F! \ A) \) \1 I+ |0 S
( _5 V" H) X( p(a)假设
' P" Y- G O C0 D(i)常染色体遗传的正常基因记为 A ,不正常基因记为a ,并以 AA, Aa,aa 分别 表示正常人,隐性患者,显性患者的基因型。* B/ F9 Y' n/ |) T( L
; r4 I6 y4 Z9 I/ ^, l# n
) d3 m, e: l& M% I
3 ~% N$ l& _" j% W5 J% \* c9 b
(b)建模
' X4 e3 \$ s b
# G0 N$ f* g9 n6 z , W+ S/ x0 f+ J+ ?5 ~
6 L' u) { l3 P' F! k+ B4 I8 w* Z
2 g( a5 L1 c% k
4 p7 a4 C. W5 ]! ^
) A9 H, D# b% Z6 X" t1 x0 J* y(c)模型讨论
- e' Y! P8 q4 X. D% L" ~研究在随机结合的情况下,隐性患者的变化是很有意思的,但随机结合导致了非线 性化问题,超出了本章范围,然而用其它技巧,在随机结合的情况下可以把(24)式改写为+ p" I" f% l7 |4 `0 E# w
7 N+ c, p, E6 F G% |3 J
![]()
4 Y5 b) D. N. m% ]2 _( c. b6 [$ P3 _
下面给出数值的例子: 某地区有 10%的黑人是镰状网性贫血症隐性患者,如果控制结合,根据(24)式 可知下一代(大约 27 年)的隐性患者将减少到 5%;如果随机结合,根据(25)式, 可以预言下一代人中有 9.5%是隐性患者,并且可计算出大约每出生 400 个黑人孩子, 其中有一个是显性患者。! J2 x0 q# g6 j5 | w: ?) m
5 B- l7 a9 ]- b# O& O! h& ^3 X − 链遗传模型
" G4 z/ {8 z: XX − 链遗传是指雄性具有一个基因 A 或a ,雌性具有两个基因 AA,或 Aa ,或 aa 。 其遗传规律是雄性后代以相等概率得到母体两个基因中的一个,雌性后代从父体中得到 一个基因,并从母体的两个基因中等可能地得到一个。下面,研究与 X − 链遗传有关 的近亲繁殖过程。; F3 ?) E; a1 J8 N) L1 x
X. r5 v' f- U5 \# f+ K$ o$ ?/ u(a)假设
6 u4 c# a0 Q9 S, Z(i)从一对雌雄结合开始,在它们的后代中,任选雌雄各一个成配偶,然后在它 们产生的后代中任选两个结成配偶。如此继续下去。
0 [4 y! ? @- V0 l3 l8 I1 I- C1 C$ Y4 b1 ~+ ]2 M* ?+ P1 K; T) }
(ii)父体与母体的基因型组成同胞对,同胞对的形式有 (A, AA) , (A, Aa) , (A,aa) , (a, AA) ,(a, Aa) ,(a,aa) 六种。初始一对雌雄的同胞对,是这六种类型 中的任一种,其后代的基因型如下表所示。# l& @+ g: f- o8 O. C6 Y; O6 J, V
! d2 I, P4 J+ ^9 R) z+ g$ G! M. U. p6 `) v- [
![]()
# Z) S/ t( x, t& U; F- x5 a4 j }5 n" | E) j( j7 K
![]()
$ J# s9 V" z0 Q$ `: K& w: }# D* `& F; e
![]()
7 x" I1 X+ H* n0 i7 ]+ C; U9 H, p6 u8 c2 r* N ^! q: J# U
编写如下 Matlab 程序:* S( e5 l% q* d! W' i
, e, W. _4 H# G% P# Zsyms n a0 b0 c0 d0 e0 f0. V$ ~) n, Q% u7 C, y3 M) j$ t
M=[1 1/4 0 0 0 0;0 1/4 0 1 1/4 0;0 0 0 0 1/4 0;6 E) X( \1 y0 Q2 E, ^
0 1/4 0 0 0 0;0 1/4 1 0 1/4 0;0 0 0 0 1/4 1];
% z9 M8 |6 h# I1 c( FM=sym(M);* v, R; k5 L8 F" \7 V
[p,lamda]=eig(M);9 h p; G) W) f
x=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0;d0;e0;f0];7 k* Q% e+ f) t" a# z
x=simple(x)
; L$ P) [5 z- y% v
" m/ y1 L% l$ K# A7 h0 B由上述程序计算结果可以看出7 C) s& e. B9 l5 }: @$ i% K
- B2 m# m+ w& n; Q% L" c: L![]()
& |( o, N# r+ H. i+ f0 |/ p( w# U4 L& U+ ?( K
习 题3 r# E# ^9 R: i) T8 V# S
1. (汉诺塔问题)n 个大小不同的圆盘依其半径大小依次套在桩 A 上,大的在下, 小的在上。现要将此 n 个盘移到空桩 B 或C 上,但要求一次只能移动一个盘且移动过 程中,始终保持大盘在下,小盘在上。移动过程中桩 A 也可利用。设移动 n 个盘的次 数为 ,试建立关于 的差分方程,并求 的通项公式。0 k# H' _2 ], ^
1 e% ?4 l e7 B
2. 设第一月初有雌雄各一的一对小兔。假定两月后长成成兔,同时(即第三月) 开始每月初产雌雄各一的一对小兔,新增小兔也按此规律繁殖。设第n 月末共有 对 兔子,试建立关于 的差分方程,并求 的通项公式。' p W: H) w% u6 Y& r. t) t- ^
( Y1 E$ u: H% B
3. 在常染色体遗传的问题中,假设植物总是和基因型是 Aa 的植物结合。求在第n 代中,基因型为 AA, Aa 和 aa 的植物的百分率,并求当 n 趋于无穷大时,基因型分布 的极限。
2 m- D& Z L9 g/ |! Q* i. F; t
9 r9 U, d4 @7 h, Z
3 i4 M0 I0 p: ^3 o; ?2 `+ o {9 C" K
2 s6 i- D' c' e& d2 h$ e4 O
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' W4 j5 o" V4 `( N X, z
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