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[建模教程] 差分方程模型(四):遗传模型

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    发表于 2020-6-7 16:37 |只看该作者 |倒序浏览
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    1 常染色体遗传模型
    4 D5 y* H! C4 U. A4 Q) o* w常染色体遗传中,后代从每个亲体的基因对中各继承一个基因,形成自己的基因对, 基因对也称为基因型。如果我们所考虑的遗传特征是由两个基因 A 和 a 控制的,那么 就有三种基因对,记为 AA, Aa,aa 。例如,金鱼草由两个遗传基因决定花的颜色,基 因型是 AA的金鱼草开红花, Aa 型的开粉红色花,而 aa 型的开白花。又如人类眼睛 的颜色也是通过常染色体遗传控制的。基因型是 AA或 Aa 的人,眼睛为棕色,基因型 是aa 的人,眼睛为蓝色。这里因为 AA和 Aa 都表示了同一外部特征,我们认为基因 A 支配基因a ,也可以认为基因a 对于 A 来说是隐性的。当一个亲体的基因型为 Aa ,而 另一个亲体的基因型是aa 时,那么后代可以从aa 型中得到基因a ,从 Aa 型中或得到 基因 A ,或得到基因a 。这样,后代基因型为 Aa 或 aa 的可能性相等。下面给出双亲 体基因型的所有可能的结合,以及其后代形成每种基因型的概率,如下表所示。8 r; [0 `2 C+ a- m0 T0 B
    ) C% o! _$ S# T4 Q4 Z9 h
    : g) c( d4 `* P# [2 }- g4 A
    + a9 p2 w! f3 P' g) ?
    例 5 农场的植物园中某种植物的基因型为 AA, Aa 和 aa 。农场计划采用 AA型的 植物与每种基因型植物相结合的方案培育植物后代。那么经过若干年后,这种植物的任 一代的三种基因型分布如何?9 F- T, c. U! E, b2 D6 M4 ^

    4 w' E( S0 R/ x+ C(a)假设
    7 |6 Z9 v' w. w3 z& J令n = 0,1,2,...。
    / G' Y! q  B, a
    9 a3 ~6 z, W" c
    6 V* Q5 d) g3 r& F% Q' |6 v% _  q( h) [! ~* z! q% j. I& A
    ) U, V% c. q, t4 T1 T
    9 \4 f, l) i" |1 D( q1 b
    (b)建模
    0 q' J- i/ ?- p  f3 \6 P5 m/ b& H4 T% W  Z4 J! i( a
    ! \" E4 p+ c0 c  C  W7 J

    # _! F6 s  X6 {1 }* |1 O- N! w# d- q

    1 Q% T( c6 i. c
    ( [3 c7 \* I/ P5 _, j编写如下 Matlab 程序:! i# Q) ^4 v+ m  g! o( M* q1 G
    / u) P, j8 o" `# P+ H2 K
    syms n a0 b0 c0: X" A( ^* [- g; u1 ~2 \5 C
    M=sym('[1,1/2,0;0,1/2,1;0,0,0]');& S: V4 p$ v8 g  R# E- i: y) J( \
    [p,lamda]=eig(M);6 j1 i$ H; `; j3 b
    x=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0];# t" W& y2 d7 q# j- i
    x=simple(x)
    * D$ c  n0 k+ ]4 b) z; V# m+ v5 g9 a# Q# g+ k' Q! f. l3 s5 N) A

    4 I% m) l/ m, h  `6 s
    0 l, f, z+ a9 K$ u% Y" P$ b5 q

    即在极限的情况下,培育的植物都是 AA型。

    (c)模型的讨论

    若在上述问题中,不选用基因 AA型的植物与每一植物结合,而是将具有相同基因 型植物相结合,那么后代具有三种基因型的概率如下表所示。

    编写如下 Matlab 程序:


    3 o8 P! X1 q6 J* i0 |syms n a0 b0 c0# M  v( L9 L8 [: n
    M=sym('[1,1/4,0;0,1/2,0;0,1/4,1]');+ P# Y4 f+ s) M0 N7 E
    [p,lamda]=eig(M);: E- {' K2 h$ _! B; f
    x=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0];/ {& c$ \7 X% v, j. f/ A
    x=simple(x) # t+ I: [7 t9 F* Z. H6 a

    & J+ w1 I1 `( z9 l: J; ^3 ?+ s
    ( ]4 T0 r) U4 o7 i$ F  v! C: k$ F7 @; v& ?, G: x+ V. s
    2 常染色体隐性病模型
    7 g6 {, r. I6 |9 Z  ]) P现在世界上已经发现的遗传病有将近 4000 种。在一般情况下,遗传病与特殊的种 族、部落及群体有关。例如,遗传病库利氏贫血症的患者以居住在地中海沿岸为多,镰 状网性贫血症一般流行在黑人中,家族黑蒙性白痴症则流行在东欧犹太人中间。患者经 常未到成年就痛苦地死去,而他们的父母则是疾病的病源。假若我们能识别这些疾病的 隐性患者,并且规定两个隐性患者不能结合(因为两个隐性患者结合,他们的后代就可 能成为显性患者),那么未来的儿童,虽然有可能是隐性患者,但决不会出现显性特征, 不会受到疾病的折磨。现在,我们考虑在控制结合的情况下,如何确定后代中隐性患者 的概率。
    ) |; L7 Q% P4 {# n3 ~4 c+ F, h$ d2 E" a% p# S
    (a)假设
    , F( f1 }! F' S8 @$ s( R7 H) P1 _( U* z(i)常染色体遗传的正常基因记为 A ,不正常基因记为a ,并以 AA, Aa,aa 分别 表示正常人,隐性患者,显性患者的基因型。
    , {: n3 a7 O. c+ E7 Y/ t
    / W0 a7 k: k# Z% S/ ~% N( Y6 g; G' p# z9 ~8 e) n; ?3 P
    . p" `6 g. `0 L, |/ A5 X3 z
    (b)建模
    4 r( R2 \. t1 J4 V" x; w6 g6 n
    5 J4 @6 }+ e; a' O" @+ S! v5 y5 |
    + \. {* E' Z7 ^6 q' L
    . l% ]4 n" @+ K$ p
    / B$ w2 t" Q& c! I/ A. `9 J. Q# c  V' O) {8 }) o+ ^9 h
    : V  |: U' u' J9 M
    (c)模型讨论' f! [! L- Q' R+ v
    研究在随机结合的情况下,隐性患者的变化是很有意思的,但随机结合导致了非线 性化问题,超出了本章范围,然而用其它技巧,在随机结合的情况下可以把(24)式改写为" g% E' K- D3 O1 |& K
    7 s& F5 K0 y$ e4 F+ Q

      j& o4 W0 M% A
    + O4 f" y! y: P) l9 G$ D1 j3 n" A* [下面给出数值的例子: 某地区有 10%的黑人是镰状网性贫血症隐性患者,如果控制结合,根据(24)式 可知下一代(大约 27 年)的隐性患者将减少到 5%;如果随机结合,根据(25)式, 可以预言下一代人中有 9.5%是隐性患者,并且可计算出大约每出生 400 个黑人孩子, 其中有一个是显性患者。0 S# b$ b: q4 m) g: \3 F
    - M5 N  N" d+ `$ S& u
    3   X − 链遗传模型- c) ~4 f2 H7 c) b! S0 t2 w+ t! w
    X − 链遗传是指雄性具有一个基因 A 或a ,雌性具有两个基因 AA,或 Aa ,或 aa 。 其遗传规律是雄性后代以相等概率得到母体两个基因中的一个,雌性后代从父体中得到 一个基因,并从母体的两个基因中等可能地得到一个。下面,研究与 X − 链遗传有关 的近亲繁殖过程。
    / B' m' S) v* y1 z8 s7 o4 b8 p3 c# e' }
    (a)假设
    5 I! u! r4 o. N3 @3 q) Z5 {(i)从一对雌雄结合开始,在它们的后代中,任选雌雄各一个成配偶,然后在它 们产生的后代中任选两个结成配偶。如此继续下去。0 ?9 _% S* {  |

    4 @& U/ l2 c/ Y/ S5 x. T1 _( I0 l/ Z(ii)父体与母体的基因型组成同胞对,同胞对的形式有 (A, AA) , (A, Aa) , (A,aa) , (a, AA) ,(a, Aa) ,(a,aa) 六种。初始一对雌雄的同胞对,是这六种类型 中的任一种,其后代的基因型如下表所示。3 H' E  [) P4 N' D& L: R* w) ^. a
    % v5 t  I2 x2 ?% C* E
    4 e, H0 a: a; N5 M

    ( l* w% S# T* e- t3 t% {+ z- z1 g, J+ C5 d$ Y9 [& J
    # W3 d1 K4 R5 }! o3 [, Z$ G
    # x+ S6 n# V/ ^- q6 H7 v3 y
    * N( a" T, `! L' v/ q8 d

    / `" E6 O0 L7 d1 [; ]编写如下 Matlab 程序:
    , h7 Q4 j( Y2 M( H) C
    7 H8 _8 P0 J' x" f- jsyms n a0 b0 c0 d0 e0 f0
    * q. h, S. v' [1 F  _- eM=[1 1/4 0 0 0 0;0 1/4 0 1 1/4 0;0 0 0 0 1/4 0;8 J- b! X! k# Y; N& |6 R4 f
    0 1/4 0 0 0 0;0 1/4 1 0 1/4 0;0 0 0 0 1/4 1];% H6 F' A3 C9 C+ j/ D
    M=sym(M);8 {8 q! ?6 v1 n1 E+ ?
    [p,lamda]=eig(M);
    ( V" K8 t4 Q- o$ r- T5 a' jx=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0;d0;e0;f0];2 [. j5 q" Y( X
    x=simple(x)
    " O" _7 s- c! Q- g7 C* q0 P3 I
    2 u+ G* L1 J! p9 u2 s由上述程序计算结果可以看出
    5 u$ R3 j% T% `& g* c4 z+ y) S: i# s
    4 q& G; m+ z7 {7 |, D/ ]. c
    1 J* p# H8 C2 d$ p  o, j7 ]! u8 O4 _9 Q
    习 题
    : N4 d  X  Q) Q2 R  K% K5 F4 y. l' ?+ q1. (汉诺塔问题)n 个大小不同的圆盘依其半径大小依次套在桩 A 上,大的在下, 小的在上。现要将此 n 个盘移到空桩 B 或C 上,但要求一次只能移动一个盘且移动过 程中,始终保持大盘在下,小盘在上。移动过程中桩 A 也可利用。设移动 n 个盘的次 数为  ,试建立关于  的差分方程,并求  的通项公式。
    ! A% c" E4 t6 I' S; M3 A8 }& F/ g7 T, y3 n
    2. 设第一月初有雌雄各一的一对小兔。假定两月后长成成兔,同时(即第三月) 开始每月初产雌雄各一的一对小兔,新增小兔也按此规律繁殖。设第n 月末共有  对 兔子,试建立关于  的差分方程,并求  的通项公式。
    ' w- P8 d* W" R; ~) K& G" X% [& q
    3. 在常染色体遗传的问题中,假设植物总是和基因型是 Aa 的植物结合。求在第n 代中,基因型为 AA, Aa 和 aa 的植物的百分率,并求当 n 趋于无穷大时,基因型分布 的极限。
    0 E3 g# E8 H! D+ |: {( e9 B% h' P* y  B! M: Y! J; \

    4 V' x; D) R1 D5 x5 ~3 S) D9 c5 S" g/ \/ z) L) F1 g$ |

    8 t! e. ^7 `( z  ~————————————————
    ' F0 ^/ _1 ?. ^版权声明:本文为CSDN博主「wamg潇潇」的原创文章,遵循CC 4.0 BY-SA版权协议,转载请附上原文出处链接及本声明。
    0 F1 u% S; F4 X  A, G9 B原文链接:https://blog.csdn.net/qq_29831163/article/details/89646596
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