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TA的每日心情 | 开心 2023-7-31 10:17 |
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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录
+ d. z' F- w- P6 m; w/ n书籍:《R语言与数据挖掘》
3 z! ~. i+ l2 m#(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat
1 p: H# v( [& \" x' Q# b; ylibrary(reshape)
7 l! L4 V7 D. F' r, }7 kCO23 k& d M; v! ]1 r% o, V0 [- o
CO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat"))4 P; \ `0 v& s9 \: K6 Q/ a
4 }* j: L; M" k#(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行
! @& _4 O5 |# O2 q% p3 R5 F> anyNA(CO2)
/ z3 [/ y G1 g: Y8 j$ T: R[1] FALSE/ l7 ~( x' K- E; x
#检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]& x' {% J9 Y+ X: w3 e& u: F! n
: K/ \& R) J5 K+ O$ Q& {#(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)7 U4 O) V+ c8 t% f6 S/ C0 M
#篇幅问题删除部分输出数据
4 E! q6 Y# G/ o% S' Q4 X> sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小
/ O+ @% \8 s" W( T9 k [1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.7
( k" ^8 P6 A5 U+ \[13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.4: @ C, Y) O" E; G* h4 I: |
[25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.1
! x) E1 R. S" u4 c- U! n9 o3 B[37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2: @0 N3 }" b# F/ p
[49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.9
) d; x6 G$ H$ {; j3 G" @> sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)( { G/ P! ]( d8 q: h0 c
[1] 7.7 9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.6( j7 ^, s. [# K! a
[13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.1
% _. Z. t% k$ K- s, K7 l[25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.8
8 K% C$ S3 [# j7 N" Y: a: A8 {[37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.9
* m: M0 S, I. D0 J; u7 _% p/ }0 e[49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.37 X# U, M# s5 \! _+ K7 h/ j2 Y: z
# P! O: z7 j+ n7 l( u* \> CO2[order(CO2$uptake),]
+ G" i. @7 Y* K; w& x6 o, N& u6 _ Plant Type Treat conc uptake
5 E6 [7 O( J* d$ u, }5 C71 Mc2 Mississippi chilled 95 7.70 }+ t ]7 Q9 r$ }2 o
29 Qc2 Quebec chilled 95 9.3$ A" r$ j3 N& V( S4 _
64 Mc1 Mississippi chilled 95 10.5
# w8 h7 v9 O2 F/ w) p7 P43 Mn1 Mississippi nonchilled 95 10.6
6 O5 Y6 R3 z9 \78 Mc3 Mississippi chilled 95 10.6
$ h# U) T; ~# a; N4 a0 m7 c8 Q57 Mn3 Mississippi nonchilled 95 11.3! c8 T1 v& K9 `7 m1 }/ Z) H# _
9 g0 n8 [- Q- n+ ~: y
> CO2[order(-CO2$uptake),]
7 K7 e5 F9 h& a. L! j3 w5 L) e- | Plant Type Treat conc uptake
0 g+ M+ g L, G( ]; m( g' s% g5 R21 Qn3 Quebec nonchilled 1000 45.5
( b5 w* U& U+ \5 H% e14 Qn2 Quebec nonchilled 1000 44.3
3 M T/ e4 `3 [+ L' |6 \; A20 Qn3 Quebec nonchilled 675 43.9
6 g+ W" D- N. e$ [19 Qn3 Quebec nonchilled 500 42.94 C/ h- G4 ~/ B+ {) t
35 Qc2 Quebec chilled 1000 42.42 ]' q; ^: ^2 T
) N7 l6 K8 d$ Y! P
#(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:4
4 H" H$ ], H& jn <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4))
3 ~/ @8 A) q& U/ r* F( `. w* t3 e(sample1 <- CO2[n == 1,])9 b' i t' q3 W, e! r& |/ `
(sample2 <- CO2[n == 2,])
3 R1 t, V0 t* w8 i
3 X# \& e$ ~. S4 v#(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值. O, i0 j) }' C4 N) P7 g9 O+ @
tapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)% G2 V u+ F3 d! m1 m$ {5 H+ N
# M) ], [) Y& d6 k& K#(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值
" \: q h: @: Paggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)* }8 u0 M! ^5 F# V" i% V8 y
9 h" f5 j, B! A8 M" q X( b& v
#(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值, K$ P, B" r* B9 b3 `$ w
lapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean), s# [' k; K9 c S
! r9 I2 v" K/ O4 o
#(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中- h2 `8 L/ k* E7 o2 S
Plant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)) j4 |( X2 S1 S( P0 ] ^
Plant_Qn2 y2 m1 @ O& m5 ~! A
" e$ [# m! L9 L9 ^9 p
#(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“0 {# W; [9 Q6 W* m
5 J" c5 j1 o( T7 `0 g$ U
, r8 N3 t9 T/ u( l% j#编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度
, Q/ f) n0 P) p# W#生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……
7 F4 W- l! g5 c H, pgsub("[t]","t",CO2$Plant)
/ h0 j9 w; s- H0 m+ P; a" e
% O t2 q5 m/ blibrary(fBasics)0 Z" \3 q. G5 k" H# j5 x
stat <- function(x)5 S5 n: s1 ~+ R. {/ i" |
{
2 j7 d) k- k# _% _, C8 ` if(!is.numeric(x)): H g( X5 \# u8 {. ^$ F
{
6 k+ ^5 h1 X' J q d stop("the input data must be numeric!\n")& y2 v) k" l8 W K. ~' C5 a3 |* w
}
" Z3 Y& @) p7 T* E2 y if(length(x) == 1)9 a# u& D& D% U- r
{
6 b, o6 b' S) C. T$ U stop("can not compute sd for one number!\n") f+ m( ~/ ]" @4 O
}3 l2 I# f7 N9 f
max1 <- max(x)8 I+ }) Z2 @, T3 Q, i8 W
min1 <- min(x)* X% ?+ M2 Z; a$ E
mean1 <- mean(x)
, f6 F: a+ r, Z* O+ f. S+ f1 o skewness1 <- skewness(x)- V7 w4 {) Q7 F( `" d# m0 H+ o
kurtosis1 <- kurtosis(x)
: k0 j$ z+ J& u1 B3 W answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)( T7 Q% f6 _* O5 I$ V- T- C, T! r
return(answer)
, U/ y' u4 Q) ^2 l+ R" J; c}
- C. k5 U7 I5 D$ Q2 J% W' A2 U% x
# i- v' |; \1 G" |# n' f9 gt <- rt(100,2)
' C; O3 ^6 w8 u/ estat(t)! j0 m* v: S1 G+ Y( `: E2 T% l
~$ E3 w8 Z0 Y ^, N' L P% q
* ^/ \$ I, Q2 k7 e5 `
' Z% K( H6 m. Q( a" f( p- E
; j: s6 p$ t* }1 U0 L2 m7 A |
zan
|