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TA的每日心情 | 开心 2023-7-31 10:17 |
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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录
) h& S; f6 l! g8 `3 e书籍:《R语言与数据挖掘》
7 C k2 q( H# o0 J8 z#(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat0 W9 J. Q6 ?$ T, U N2 J2 v$ B
library(reshape)5 ?3 `5 E' Q9 @1 U: H/ d. D+ s5 G
CO23 n' G3 Q8 O0 x( Y, N/ a
CO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat")): H, H9 _. V1 O5 d1 v2 \+ V0 y
# R5 I- e, u1 g0 \8 Q
#(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行
, j- u4 p7 D/ c0 l# f1 \2 O> anyNA(CO2)
1 H/ p5 f8 ?4 s* X! f; s' k6 y[1] FALSE" H4 I3 g& C8 f
#检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]% Q- u8 V" t* |4 C, u
) N0 l; h3 ?7 V2 s1 O1 J
#(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)
2 U+ S" l3 V! E& {6 j8 {" A#篇幅问题删除部分输出数据. I. E S5 w% f2 u
> sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小; r& D* j6 X: I# T* g8 }0 |: {
[1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.7
* B" k: R# D3 E" h[13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.4
+ W; T. |4 X* Y' M& [2 c$ g[25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.14 L. }) \( ~ S
[37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2* m1 T! `2 q! M- S9 t3 ^
[49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.92 N( P- i4 G/ s8 z- C
> sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE); E+ I4 L" F* T- T8 K! M
[1] 7.7 9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.68 n7 O9 \* }& c+ D6 N7 \1 H- o
[13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.15 e5 N& N% q- v2 t
[25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.89 d8 C- ?8 Y- D8 n4 Q! _( q
[37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.9
1 c* F0 P+ _9 E1 \. q# L8 Z) V' Z[49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.3
- g* W5 W" H$ r$ y
5 P& q" V* ?5 w* L0 r: O" o$ B> CO2[order(CO2$uptake),] D9 P" c! L: @/ ?# z& ^& O% M
Plant Type Treat conc uptake! l3 b- L, C/ A* f8 B
71 Mc2 Mississippi chilled 95 7.7
1 p( Q1 p; ]+ G0 ^8 N0 K5 p* o% B29 Qc2 Quebec chilled 95 9.3* M# x$ X. @6 x3 x
64 Mc1 Mississippi chilled 95 10.50 w/ X- d7 c" E- x8 a( h ]* j
43 Mn1 Mississippi nonchilled 95 10.6
6 S5 V) C9 C8 I: k' b6 P! Y78 Mc3 Mississippi chilled 95 10.68 R2 l8 A3 \5 C& V2 V9 c( m
57 Mn3 Mississippi nonchilled 95 11.3# _$ r2 }' T8 w w' L! M9 F% F
6 x$ h) w; B5 q& @4 K& c# q B& y8 B
> CO2[order(-CO2$uptake),]
: g7 a7 ~+ a- b& s% R0 h Plant Type Treat conc uptake, ?8 s! V" y% b0 y) Q" U
21 Qn3 Quebec nonchilled 1000 45.5
$ h$ p, r8 F5 X' _14 Qn2 Quebec nonchilled 1000 44.3
$ A/ B0 L( b5 A7 I* R$ x/ q& b# b: X: I20 Qn3 Quebec nonchilled 675 43.91 h+ ~# X/ E: h5 g
19 Qn3 Quebec nonchilled 500 42.9
8 o; `6 r P9 n7 M8 R. J2 v, s& w% c35 Qc2 Quebec chilled 1000 42.4
2 [0 {/ L; `. ]% {- L4 m. i3 E- z) V6 M$ q
#(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:4& u2 d$ o" _( @
n <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4))* O( f$ m# p5 w! O s/ t
(sample1 <- CO2[n == 1,])
1 o5 d* C+ h( l, V6 A$ @(sample2 <- CO2[n == 2,])
4 [: g6 k( L2 r8 b( }' V1 k0 ?
4 l+ G6 m7 M; x6 a#(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值
9 L: u1 G5 B" u0 stapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)# B+ X. v: k8 ]/ N" v& O
% G' O$ P A( o#(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值' C% C! c! t+ L1 c
aggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)8 q3 M% X( n+ {, P8 c
$ D3 y+ c! p% t2 o: R9 [9 ~$ M; k
#(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值
+ t, h5 j( _, X a. L, X [ M% ~lapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean)
1 @8 B) }) [2 j+ ]- t% }9 x' s: D# V4 b
#(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中0 l2 W# v7 H C* u8 ^
Plant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE). j1 B- G. i+ h) u5 ^; C
Plant_Qn' G6 n+ X: _- N. Q
# }( ]# B8 i/ j0 _#(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“% E9 {# Z: P3 c; }* w; Y0 z
$ \% Q- v; p4 i, X4 \+ o3 S1 d, s% Y. Z6 T4 o& }
#编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度* S. J, t/ ?# d* U) t
#生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……
% Y- }6 k2 M" ~7 M) U: w; ngsub("[t]","t",CO2$Plant)' d7 K0 Y0 P* }3 J
0 M5 ]8 Q/ n9 `1 ]) Tlibrary(fBasics)% [- t& q$ Z& I- D s# S
stat <- function(x), |7 t3 Z# H5 e! L8 e" e8 c
{5 `9 d; D$ q I
if(!is.numeric(x)) W3 T% H M$ M+ {/ ]9 j' ~
{ F8 D/ d1 u1 D% v$ z
stop("the input data must be numeric!\n") l( Z" s7 G3 F; W( t( Z
}
) N1 T: Y* y6 F9 } if(length(x) == 1)
+ Y( T) P" J( e! h9 A {+ B: K9 h" O- T* y& e/ Y- _
stop("can not compute sd for one number!\n")
. d: w" I9 d' Y! {- I. K/ ]3 q }) e |) w4 h7 [" D+ L3 k0 w
max1 <- max(x), [5 c8 r" [" ~* z, M
min1 <- min(x)
4 P3 s( f, V' s* w& f, m2 _9 Z mean1 <- mean(x)
% i7 a+ H2 x& D6 n skewness1 <- skewness(x)- L- a, T$ V% l7 @- H
kurtosis1 <- kurtosis(x): q+ g: g' E5 x8 Y c
answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)
. c; W6 L# c: z ~3 i1 v% j) Y return(answer)
* Q* O3 J; x# P" F _}
" a8 d% b3 `" u Y. e5 `6 U
* j! O( {% ^& c, g, r; @1 [. q! bt <- rt(100,2)
5 g# e. s- T% z! astat(t)- f1 {1 X3 A: n( L, w
3 r1 e2 k+ s6 K0 Y" W) G x* m# L" G4 X% V
& u* S4 T0 x- }( c9 }" k0 R6 Z) p s3 S% s
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zan
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