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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录

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    [LV.7]常住居民III

    自我介绍
    数学中国浅夏
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    1#
    发表于 2021-11-24 16:50 |只看该作者 |倒序浏览
    |招呼Ta 关注Ta
                                                                【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录
    ! r5 i- K9 P" E% R$ Q; \书籍:《R语言与数据挖掘》9 j1 S/ w; y8 i
    #(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat1 n5 \2 M2 i# J; y1 X3 S
    library(reshape): s$ f* o' t' f! l9 G% _
    CO26 Y) q+ g+ _4 t$ h6 Z$ o9 h; `
    CO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat"))
    # G& c/ L( ?  j8 s2 a, n) o3 t  M* t0 M  r& x
    #(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行2 l' S) B5 m& U, G/ _4 ?
    > anyNA(CO2)
    + s, O0 G7 \+ i( U[1] FALSE. C; D: P2 V9 a$ S$ A; }( |
    #检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]
    # h( f0 I' B$ E. J
    ' |% U+ Z' N  E" |9 ~5 p) U#(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)
    ; |# t" q* _) \1 h#篇幅问题删除部分输出数据
    # h- `# h( {' ?" j9 j2 [> sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小/ w0 C# j, C/ b
    [1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.7
    " d' f' R2 n, Q2 R4 S[13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.4: Z6 g) ~. |1 a* R
    [25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.1
    3 z* Q) c/ }0 C7 ?* m[37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2' Y2 i& m: ], v6 l3 q0 f" h
    [49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.9
    # L: E- c' [; `> sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)
    7 x" j$ A8 y1 Q* \) I [1]  7.7  9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.60 i- [1 _* N9 I) s
    [13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.1
    9 _) ~4 A3 k$ t# |[25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.84 e; b0 \  N" A/ T% u9 }
    [37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.9- r2 M* T- P1 w& L, d9 s
    [49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.3& |* t- A6 x/ i1 ]/ `! J

    8 v6 l2 C4 S3 ?+ y6 O. z+ g> CO2[order(CO2$uptake),]8 ?# I- u+ x5 u0 k" G& N- F
       Plant        Type      Treat conc uptake' S  ^- k5 z, j  g3 f. Z2 [
    71   Mc2 Mississippi    chilled   95    7.74 C; n+ Y  f) A: \6 H5 e
    29   Qc2      Quebec    chilled   95    9.31 j9 U4 w) m' H  i
    64   Mc1 Mississippi    chilled   95   10.5
    , o+ x; H; Q+ L6 X- K3 ]6 }43   Mn1 Mississippi nonchilled   95   10.6
    * P( m" q0 c. @# |3 B78   Mc3 Mississippi    chilled   95   10.6) [' f/ w7 w0 V2 S" ^% O" w
    57   Mn3 Mississippi nonchilled   95   11.3- X: @+ m8 a/ h! R, S* W1 O

    9 e" j" Q: S* }& I. `) N> CO2[order(-CO2$uptake),]" `: ]0 C* c: a
       Plant        Type      Treat conc uptake
    2 Y, l# C+ B# H& {) z5 |9 q* i21   Qn3      Quebec nonchilled 1000   45.5
    . Z! d3 F% G) c/ y# ]6 q14   Qn2      Quebec nonchilled 1000   44.3
    + R+ E7 Z$ a- F, V0 x20   Qn3      Quebec nonchilled  675   43.9
    9 \3 D( |: R  O* y6 h19   Qn3      Quebec nonchilled  500   42.9  S! n+ N: w0 `
    35   Qc2      Quebec    chilled 1000   42.47 s( r% |. D4 A# x- i
    4 _8 W- W* v% d5 Q7 i, R1 s
    #(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:45 X' U3 w2 N% C. a+ w: l. o' ]
    n <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4))
    5 _1 Y0 S% x9 c(sample1 <- CO2[n == 1,])/ v/ u& b  h0 D' m  T% l
    (sample2 <- CO2[n == 2,])
    ; a2 C: |( T" f* |; z1 W- R6 x1 {. N3 ?+ y4 H
    #(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值
    7 t) T* I* T' f2 \7 Gtapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean): k8 d2 ?. }3 _) r: q9 z
    . y# K. _5 |% W( P3 h- N
    #(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值
    8 b# y/ t: `6 D* Z- I/ [/ E& vaggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)
    . O6 U+ M9 z# q* A& A+ B
    4 y2 {5 ~6 `. \. e) ]3 w3 T4 A9 _#(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值# I* J6 \; w$ y3 y$ E
    lapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean)+ N: T: p5 Q# k3 L

    9 J+ g7 }! H: F" k4 Q& K: v$ s! w#(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中
    * W( q( k! @1 S6 K; k) XPlant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)
    : C% e' o8 _$ W! E- w1 |Plant_Qn
    2 \8 R3 I" I2 A- E. g- i0 }; `
    " q3 E. W; J6 E# ^5 I2 R" N/ S6 q#(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“4 E/ u/ G/ W1 Y0 Y; r1 z

    2 s+ d2 h; y4 n: q" v2 v4 G  D; c, ^
    #编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度3 v" w. t- J, Z' k/ P, ?
    #生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……/ \$ w# r( B' u- x& X) f6 e
    gsub("[t]","t",CO2$Plant)
    + ^; d# _) a7 q
    / A' j$ L$ N; z! Hlibrary(fBasics)
    - R$ R* N, Q1 U! Ustat <- function(x)
    6 [( Y5 J  k6 M. g6 V{
    ' B$ H/ U" k6 ]" A% Y8 y1 P: t1 T  ]  if(!is.numeric(x))1 A2 ]6 ~) F' i5 ~
      {
    0 B/ r/ D$ J( _- I- }- S% l    stop("the input data must be numeric!\n")6 E1 v# U/ ~; a' }1 [
      }
    - J; k* Z& @  {2 O% w' G/ d5 t  if(length(x) == 1)
    0 @" N- N6 A4 y2 k0 ~0 T  {
    0 y8 i6 S' _. K. X" n$ s, r2 _! D    stop("can not compute sd for one number!\n")
    3 X; ^: g- u" N. U+ t& K  }
    % o  a$ `6 r8 ?$ u  max1 <- max(x)0 B+ |" o7 {: x3 t$ ^- |
      min1 <- min(x): L  t! e/ t% f
      mean1 <- mean(x)' H( Q+ v! m# ~" N
      skewness1 <- skewness(x)! [! E+ w; ^0 a& N+ ^* k
      kurtosis1 <- kurtosis(x)+ \* G0 [+ ~% t" b
      answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)5 D$ ^. o( \* I0 g+ {
      return(answer)$ @6 I2 @9 G& B" M( Y
    }
    ) O7 b4 ]" h7 y, ^
    - M6 V  [' Y  u9 pt <- rt(100,2)9 c% _: Y7 J- u4 e( I' v* E
    stat(t)
    * W5 m! z8 c. _) q6 p. I) t, T4 M- ]% V$ R2 a% q
    7 z* }6 F3 I8 y' T
    4 P+ ~: a1 B- q$ J, g0 D  t

    6 B6 }+ V6 U8 n
    zan
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