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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录

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    [LV.7]常住居民III

    自我介绍
    数学中国浅夏
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    1#
    发表于 2021-11-24 16:50 |只看该作者 |倒序浏览
    |招呼Ta 关注Ta
                                                                【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录4 _/ a$ R% M  m& T. |
    书籍:《R语言与数据挖掘》
    7 M4 }( k3 d; _3 i  ~#(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat4 z: `  O  J% _" C/ I8 C
    library(reshape)
    . g# u" l3 m+ z/ I, B. H8 Z+ uCO2
    , P/ u5 Q' P  m7 y3 iCO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat"))$ ~8 [3 `, i6 A/ x' e/ V7 G, ^
    ' h% y% n( m6 T7 U
    #(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行; Z9 C" F( w% I9 [3 |
    > anyNA(CO2)3 {* u( ^  n9 u5 G, o' V
    [1] FALSE
    - L+ Z) e/ Z. W( X2 p- E8 K#检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]
    7 H, a3 I1 m+ R* m6 h% n" q1 g7 |; a! a
    #(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)
    # b0 L1 J  a7 P/ Y, V2 k#篇幅问题删除部分输出数据9 _- E- n; k; w4 }
    > sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小
    6 Z, @' m! u: I9 q% H [1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.7
    1 a5 r5 W: y4 f[13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.4
    7 C: e) @1 J. P[25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.1# s" q! h2 m; s) ?& s
    [37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.25 x! Z* O9 G- ?2 O& V7 ^0 k; q4 u
    [49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.9
    . j9 p% H( }. U6 \* X, a' E/ H8 g> sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)
      f# C6 v  a/ r) f, g3 q [1]  7.7  9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.6
    + \. |! z5 \' X' h. F: O1 c[13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.1! c5 B% b( F2 c
    [25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.8& @6 z2 W% s4 D$ S& i
    [37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.9  s+ d  W$ n6 _- f2 X
    [49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.3  z2 A% n2 n2 d7 b

    ( h  |$ u2 y7 \4 L7 E& W> CO2[order(CO2$uptake),]
    % A2 f% ]4 l- [% v   Plant        Type      Treat conc uptake* S' ^( C; w+ D/ Z, M9 Z8 `
    71   Mc2 Mississippi    chilled   95    7.7
    2 \' l' r2 ]# u/ f" s29   Qc2      Quebec    chilled   95    9.3& ]) x  d* @2 w: e1 _
    64   Mc1 Mississippi    chilled   95   10.5
    ! Y% a; [) N9 ?& `+ B0 V4 H. e43   Mn1 Mississippi nonchilled   95   10.6
    ( h$ r8 |# Y+ c8 j3 v8 J0 @78   Mc3 Mississippi    chilled   95   10.6: L) }8 M" y) W4 F2 o% T7 W- V1 w
    57   Mn3 Mississippi nonchilled   95   11.3
    ! d4 D, D: S4 u, E. E/ N  T' V* A# ^* G& Z% S
    > CO2[order(-CO2$uptake),]
    0 B4 S! a; K, ?# d5 b6 Y   Plant        Type      Treat conc uptake
    & U3 Y+ g" T- [" ^3 d+ T& |, O21   Qn3      Quebec nonchilled 1000   45.5
    2 `! k3 R8 ^) @  j14   Qn2      Quebec nonchilled 1000   44.3& o9 h' A3 D0 H( ~- p( j
    20   Qn3      Quebec nonchilled  675   43.96 `0 y1 e& k! ^7 e' C( z" n' F
    19   Qn3      Quebec nonchilled  500   42.9
    + e8 x9 z" h9 |5 G1 M/ `; a35   Qc2      Quebec    chilled 1000   42.4
    . ?7 E5 H( v6 |$ T
    - u+ X. h5 T2 F0 V9 Z#(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:4
    ) a4 ~& A! ?, @0 S% O0 In <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4)), V" j7 ~6 E& C) ]9 }
    (sample1 <- CO2[n == 1,])
      |1 ?% `) m" t' Q(sample2 <- CO2[n == 2,])
    , F3 L- ?- S5 G, w/ x) k9 [3 J
    & {: y2 Z( I" E( d- m' @8 }8 q#(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值
    6 ~; j* {+ Q0 l# S8 x/ atapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)
    4 k/ e/ y, w, i* e
    : z' l9 g3 ?3 ]7 Q( l  y#(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值1 S7 u8 w8 W% g5 m2 g
    aggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)7 }( h+ H5 _3 L  e

    & q9 i$ ]0 |2 ?; O* w$ X#(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值
    # \. v% Q, G9 |2 X: ^' ~* j, slapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean)( Q: c% M* {& w3 l

    $ P# }# j: n) A/ R3 T#(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中, W0 D* O' H3 [. b
    Plant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)1 j6 v, k4 m. g* @  \
    Plant_Qn4 F' n% h% o; j3 T6 D$ _6 d

    & O2 n' o$ A+ ?2 ]0 U& u% ~( X#(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“: Z  q$ ?% j+ g; `- x

    7 F6 ?6 A/ S2 E+ T# [, U+ m6 ?2 ~/ w, ?5 I$ a  Z! r1 k
    #编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度3 Z- k5 Q4 o; Y! e
    #生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……1 t+ P( `9 X7 E) Y9 k
    gsub("[t]","t",CO2$Plant)
    / Q0 q, d4 s% e8 S& R% C/ _6 R" i) a2 ^6 n+ s7 V9 G
    library(fBasics)' B' H* N" m- B" p
    stat <- function(x)
    * \% Q- Y) h: Y: C" j+ L0 L7 d{
    $ U. X0 t- a/ D0 b" l( M  if(!is.numeric(x))
    1 J% y: G* O- I: Z# |3 t# E, ?, _7 D  {6 n2 B: k/ ^% e- h1 X& q, m
        stop("the input data must be numeric!\n")
    7 G' J" y( o& c# h  }2 b  D$ Y& m( `
      if(length(x) == 1)
    ) }0 N3 H6 k9 _! p  {6 W6 f# H" U* D* m& P7 D
        stop("can not compute sd for one number!\n")( ~0 z0 x& q' @% S5 g
      }/ [7 v( B  U& i# o+ U* V, Q% J
      max1 <- max(x): k6 [, b9 N6 ]6 E
      min1 <- min(x)) g6 F, K) j% Z; g
      mean1 <- mean(x)
    5 n; d- b; s* c. P  skewness1 <- skewness(x)8 D* ~  [9 x. l0 M
      kurtosis1 <- kurtosis(x)" G$ v# C3 n% J" B
      answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)
    6 \; J# }: f  N3 W" p  return(answer)& X9 e, x  z" a3 ~' n3 M9 Q
    }7 g. P, H/ t) w
    " h$ Y  l* ?0 a; G+ J
    t <- rt(100,2)
    8 K: v: ~" c  i( X( T/ ~) [stat(t)4 I, ]2 d* h) Z9 P1 J
    $ S. f9 W6 c2 a) |( x+ d6 G
    * X+ ^8 A+ ^4 p3 {0 Y

    8 A: d& K" T, X! o) B, C* [
    # d! U9 _; N: V3 x' x9 G. g
    zan
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