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TA的每日心情 | 开心 2023-7-31 10:17 |
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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录
% F& U$ a1 m$ \6 ~- H书籍:《R语言与数据挖掘》
, U4 b# q+ T$ L0 }6 O#(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat
B5 G9 C+ C9 b) z1 Alibrary(reshape)2 H2 C- Z) R5 D# S! V
CO2% y0 o5 o. x L2 b3 P
CO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat"))( ~, k) v" K5 g# N& g) b% J% i
' c9 S! J: a/ U f0 U* `#(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行/ ?( ^6 P* N( {. F" Y- q
> anyNA(CO2)4 Y! ^, }7 H Y# R7 F) w( k
[1] FALSE
: } h4 f t4 u+ ~' V/ ^#检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]: ~ l3 h/ {* o c9 h5 j
: d' {. i# P. h5 N& @& U( U1 g#(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)8 o. V! G" _, M! ?
#篇幅问题删除部分输出数据$ ]. k0 I4 h/ l0 w. Z U
> sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小
+ S, ?5 U1 A# c! x1 d, J$ n [1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.78 _; N ~% k% j- l
[13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.4, q; n, `0 _6 F
[25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.1
5 X G1 @! Y6 Y- C9 [2 H$ b% h! h[37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2
8 o5 Z+ ^0 U0 h6 g7 L4 {[49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.9, e& G7 `$ d: g' s3 P2 m9 W
> sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE). U! i3 x8 g. B4 j1 O N: {6 V7 J* v
[1] 7.7 9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.63 |, V4 E' g' V6 g# ~; }
[13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.1
" `. M# \5 h, r( s' e[25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.8
! [' j5 H* b+ t* p3 r[37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.95 }: o8 O8 O- n
[49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.31 k) L# p, c; u% [8 F2 z
( Y9 o/ ]$ ]) w A& A% ]. V
> CO2[order(CO2$uptake),]2 I- X3 Q& Z2 ^0 f. {
Plant Type Treat conc uptake, j a9 k2 N- j) B
71 Mc2 Mississippi chilled 95 7.7
1 }6 A3 l3 V2 S+ A, ?29 Qc2 Quebec chilled 95 9.3: M s( ^; T0 Y8 Q! _9 F
64 Mc1 Mississippi chilled 95 10.5 n. M. m% D/ o; ]) I' Y
43 Mn1 Mississippi nonchilled 95 10.6" P& u+ h6 X$ x' a6 N
78 Mc3 Mississippi chilled 95 10.6
- s. C3 ~3 Z3 C& o" ]9 u! X57 Mn3 Mississippi nonchilled 95 11.3' ?0 c" ]. h# D" ~; e
2 Y2 |6 F( K0 b8 y
> CO2[order(-CO2$uptake),]* r6 z. o) R+ Y; N0 |# {1 M# e: v
Plant Type Treat conc uptake
8 i1 y/ H& h# w& f+ K+ t$ H3 H21 Qn3 Quebec nonchilled 1000 45.5
0 J8 H I8 u& W( v0 ^14 Qn2 Quebec nonchilled 1000 44.3
0 x+ x8 @& {. m20 Qn3 Quebec nonchilled 675 43.9
3 e- l! S9 A: v% `; |* p% h19 Qn3 Quebec nonchilled 500 42.9
/ q* p# R7 d3 H+ Y35 Qc2 Quebec chilled 1000 42.4! f; H5 s( Z/ y2 e" ?2 u& M1 K, W
9 M2 p* G0 Q8 I0 k
#(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:46 W7 ~' p4 ?/ g7 c5 o
n <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4)). m4 n) ^- ?* T- h% o
(sample1 <- CO2[n == 1,])
/ ?& N: C2 w& O2 d" N* K(sample2 <- CO2[n == 2,])
" B2 K8 O" [% G1 o; _) N5 e3 h/ D& i+ d2 ~7 ^% [ y. K4 A
#(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值( x2 J) ]" K# m, f* \
tapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)
1 o/ s7 c7 r# I# m( ^" B* H, a3 N3 i' ?3 k) B% j, R% M& ^
#(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值
) A- G z9 a! Q: Aaggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)
6 {' \- ?) X! k6 w5 c D5 J
. m* J* z7 |7 p7 G* V#(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值% z0 X/ Q6 S- O l( i; h% _9 C: r
lapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean)1 P1 q( q' h" S& N' A6 X$ U
- z6 w7 P' V9 K1 k. E#(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中
0 Q7 A3 b& |- U& E0 YPlant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)/ Y% e) G i( Y! y0 A
Plant_Qn
: K4 B* O1 Y# R6 \
. l4 o; X: z" ~+ Q/ T: Y#(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“
8 D( \7 r2 @- T+ `; ^
! J' J; r, g4 ]! L. [; Y" @; u7 n! @+ ]& M# v' T
#编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度 C3 p" c; j7 f5 l* W, M6 }# ^
#生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……
3 u" s$ [' Z6 v6 ggsub("[t]","t",CO2$Plant)
9 r( ~1 ?3 D1 w) C( }5 O K6 p
9 l" d( h: o3 f9 dlibrary(fBasics)
! R7 m. {& Z! }: m* q0 c2 Tstat <- function(x)5 q0 S0 t. a3 L3 ?8 |
{; A9 v6 Y: y# s. k( U+ I
if(!is.numeric(x))
- Q4 j1 m% X3 q. g9 G. b" P {( V/ f/ L' b- A. Z7 n1 s1 C5 M
stop("the input data must be numeric!\n")6 S% m' T% _& o z# T
}4 {9 ]" r3 b9 ], h
if(length(x) == 1)
. j# z) D' G# K2 n2 u {
; ~( {5 |7 @, g+ }+ b stop("can not compute sd for one number!\n")
& p% S: S. p) |( K }: b) M0 W% R$ O- S. L- I. N
max1 <- max(x)
A' r" ], D8 D% I min1 <- min(x)9 {# i2 z; S _" d5 V7 I$ f2 a
mean1 <- mean(x)
0 Z% p- L0 X3 l& o; R# T; Y skewness1 <- skewness(x)
/ W3 H( B7 a! g kurtosis1 <- kurtosis(x)5 x. V, C5 @' b7 B4 h+ [, A
answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)" v W" _) {& F. D5 [1 r
return(answer)! l( n9 {) r3 A. d: z( \/ Y" s! K
}
. `' ?! z0 t ?+ R) t4 P2 B
@8 t7 F& e# ]0 s( ft <- rt(100,2)
) ~% M5 u* V3 e9 n3 }4 {stat(t)
, _6 s9 y( @4 }- [6 C0 L
- \% E& l' g/ U7 a" u8 b& a+ I% k& w$ u, p0 N' u
: j" b) w# B$ x+ K+ _" }1 e
6 L4 L) v7 H5 y; y; i |
zan
|