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TA的每日心情 | 开心 2023-7-31 10:17 |
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签到天数: 198 天 [LV.7]常住居民III
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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录
# m: B' |* @" x2 w& b% d书籍:《R语言与数据挖掘》
% y/ Z0 a( D8 W0 o Y1 v @#(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat1 J1 d! y8 z" g4 ]
library(reshape)
+ @ }5 U7 e% _" I) WCO25 ?: a8 o2 c5 u* X& C
CO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat"))
$ Y& Y$ Y- T. B8 `# a- Y3 B/ v: N& @. s
#(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行: O3 S, M3 H L5 e" F# p7 }" m( U
> anyNA(CO2)
; P4 d8 @3 l9 Q[1] FALSE8 z6 x1 d0 o; q6 b: X6 p5 @7 i# g; k) u
#检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]
5 ~5 ~, H- t; B9 }
4 R& s+ S5 N+ m#(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)
" L+ d. m9 N2 ? A) w; R/ r+ [. e#篇幅问题删除部分输出数据
! y* |; P+ X+ q$ L9 w* @> sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小8 C6 y# ` `3 c Q! Y
[1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.70 u1 Q3 Q/ |" V0 t# Z% ?6 C3 K
[13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.4" H/ y+ W% f8 H- j
[25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.18 G+ }0 @$ b7 S W G- W/ r& V# A* k
[37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2
# P' u- T, y) g[49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.9* I( h. B. a8 B9 o3 F: p# E
> sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)7 |3 r, j5 S# W1 _% B
[1] 7.7 9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.6
2 M Y0 L7 l2 N/ d# e! l+ Y/ M8 D[13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.18 g- W6 _0 K. i9 R( G- |: }: M
[25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.89 E7 y+ u: \' \
[37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.9
; A: o, ?6 @0 Z3 b3 Y) g" q[49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.33 a1 U4 h: p$ B: O2 D
7 L! X& T) Q' S: f; W) x' {9 O> CO2[order(CO2$uptake),]: o! s* H/ h6 T( v
Plant Type Treat conc uptake, S. ~- x! r* M7 q. W7 Q+ t
71 Mc2 Mississippi chilled 95 7.7' h+ z' {/ g1 h V+ k8 A& Q
29 Qc2 Quebec chilled 95 9.33 H& k7 q0 d4 T: d4 v& }9 K# M
64 Mc1 Mississippi chilled 95 10.5
& C5 H7 f' `3 @8 J- Y, O43 Mn1 Mississippi nonchilled 95 10.6% z0 C" M3 d F! i8 J
78 Mc3 Mississippi chilled 95 10.6
: M% {, {# ^& ^5 w- b* `& C& @8 \57 Mn3 Mississippi nonchilled 95 11.3
* ]' b) m* y7 a! i! } a; Q
o* U9 D9 i' F> CO2[order(-CO2$uptake),]! H9 L. V& _! c9 U$ s
Plant Type Treat conc uptake, g; p T0 R3 j( T I5 {
21 Qn3 Quebec nonchilled 1000 45.58 e/ d r3 v3 V# A% i( \
14 Qn2 Quebec nonchilled 1000 44.32 X2 Q8 z! j+ q( g+ b& u" R5 F, z. G) {
20 Qn3 Quebec nonchilled 675 43.91 ]/ ~% `, J* d
19 Qn3 Quebec nonchilled 500 42.9
" {$ j( S, h; S$ l35 Qc2 Quebec chilled 1000 42.4% P( A- K3 t) i$ J
% ]" z r# p3 O7 C9 ~: s+ ] z
#(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:4
3 d) M E) i m3 A# dn <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4))
: @, r0 B& p, S. _3 S( G8 o(sample1 <- CO2[n == 1,])5 I% X. h& @/ k& _
(sample2 <- CO2[n == 2,]): f; j+ Y: r4 l4 |4 q+ Q; E
& Z c6 T8 C: J K; U
#(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值6 E4 ]' R- F! h4 C
tapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)3 ^6 o$ I9 z" k1 I
8 W$ h, \* P2 M2 ?3 x9 V1 f2 W#(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值
+ u, i) `( H2 G, h/ P8 j5 gaggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)
* D: {; k3 v* S' }6 h9 Q' |
) q0 f3 S7 ^( Y: ^6 R#(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值
, q& a: N/ G% t, k( ]1 {8 xlapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean); {/ n- B0 S) ], ?) Z
$ j8 u/ A& n/ A( c$ ^7 h7 f7 w+ C
#(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中: j/ h* D/ u/ {3 A& J {
Plant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)! m& ]0 R: r! D a9 h# g( F4 S
Plant_Qn
# _+ }9 ]7 R7 O( N9 s/ v; Z9 D
! ?) s6 b* L; O) F# I) t% q#(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“
; p9 [5 w# z* P6 |% y+ j# Y; X
3 b1 X9 ?' r @* ~" K
2 s' y5 d( ]( R, w* {) P" F8 f. U2 A* k#编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度
. o! R- Y; o' D4 N/ o* `( T#生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……) y8 K( y. c' G* k: t
gsub("[t]","t",CO2$Plant)4 W9 ]( a% d$ R& k) d4 u
+ R% @- p/ E6 z7 @5 U$ r5 |* Olibrary(fBasics)3 K9 [# b P' W2 O" T, g B6 o2 A
stat <- function(x)7 d8 R/ x% a2 @# K$ v8 s. e6 T* E
{
$ h! V3 E0 } G, K if(!is.numeric(x))5 Q4 G" \) ` Y( t# j
{
" e) F9 ~4 x* z% y2 y" z$ E2 e stop("the input data must be numeric!\n")' g; L/ H$ d) ]- h
}
; x, q3 f6 E6 j' A if(length(x) == 1)
- P9 v/ ~1 J/ }5 ]2 a {
' v2 z5 D }/ Y! B stop("can not compute sd for one number!\n")
4 q2 |; _- u8 F& ? v) e }9 h$ u7 L7 r5 d: [& |
max1 <- max(x)
# X8 V- Q5 E1 M: m6 ^# T i9 D min1 <- min(x). b d( J& T( @. k4 }
mean1 <- mean(x); ?: p( ^ I1 {7 w9 C
skewness1 <- skewness(x)1 G" I& F+ u7 [, p3 R5 H
kurtosis1 <- kurtosis(x); Z; ]2 d' C7 o7 z5 w" A
answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)
! k' l8 c8 t" Q" c* ~ return(answer)3 u( a( f$ Y: i3 c8 ^, i
}( T2 m; p) @: D, J; j4 a' D7 ?
* N5 N* A O/ w
t <- rt(100,2)
; v: }* N* u2 u9 b6 {) @+ A- G5 Dstat(t)) m( s) [5 Q/ K& o3 k- R
0 [5 p: j7 c; I
5 C: v- y }+ j0 ^- v2 b
! }8 q i4 ]6 u0 H. I3 a) A
6 M. x/ @! w h, a' }% Q" Z |
zan
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