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主成分分析(PCA)进行特征提取

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发表于 2023-8-20 17:19 |只看该作者 |倒序浏览
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这段代码实现了主成分分析(PCA)的数据得分计算和特征向量提取。下面是代码的解释:3 J  ]' `( I( c

& a9 G/ W* V) X1 R$ Q1.函数定义:6 d7 R9 l: e; C1 m" m

) q4 ~$ Q6 w2 x: L* M! U% r, f, N8 o" V# W& w
2.函数名为PCA,接受两个输入参数:raw_data(原始数据)和T(保留率),并返回新数据。
- x- |3 D, P2 z8 c5 i) x+ N0 S+ @* G; e; N& d$ u

6 B- ]" P4 o" C3 p4 \3.数据读取与标准化:. \1 F  j% Y# _2 a! {

( e4 [9 f; ]" \3 Y( ]2 P+ G' S! i- h9 y' A2 d
4.将原始数据raw_data赋值给变量A。
2 w9 d- r- T2 ?7 R% i0 L; K5.获取数据矩阵的尺寸,其中a表示行数,b表示列数。' Q% B% d5 Y- @! t2 A+ u# N+ U
6.创建一个与原始数据大小相同的零矩阵SA。
7 s+ _# T5 m; ^) N, }1 B) W  T7.使用循环将数据按列进行放置,并进行标准化(归一化),即将每列数据减去该列的均值,再除以该列的标准差。+ D2 f0 u$ Y9 }( W( G
2 B1 ^* y7 s) ~# q* w9 p

1 c7 p3 k) K. f/ J8.求解相关系数:
! q8 N7 r% \8 O3 z) T
' j0 P) G; U8 a/ e6 q* ~# p$ x9 t9 I% |
9.使用corrcoef函数计算归一化后的数据矩阵SA的相关系数矩阵CM。
1 s- X+ o$ f2 L4 i3 G. u8 O( w' p
' |5 y- u9 s* }+ x, n
10.计算特征值和特征向量:
" z) K& e1 Q3 M+ M/ \  x* Z7 W4 d  z5 z3 w$ ]" {
; ?. G5 P# s" ?8 `* S- A, V# {
11.使用eig函数对相关系数矩阵CM进行特征值分解,得到特征向量矩阵V和特征值矩阵D。
; X* e- c0 B' I. B1 W% p! H  g# L8 |) A- l# j. E: ~

' E, Z5 }& u9 P12.提取特征值和计算贡献率:8 I3 x- f. A& _- l6 u0 r3 z6 `" o

! y: T/ {) Y1 M- G* D2 G. R$ J9 Z- T+ F
13.创建一个零矩阵DS,其大小为b x 3,其中b为特征值矩阵D的列数。
. v5 }7 M% U4 U& J8 {1 ~2 z+ p14.将特征值矩阵D的对角线元素(特征值)赋值给DS的第一列。
* I4 Q2 h" I% Y; w! q15.对DS按照第一列的值进行从大到小排序。
- O9 ]7 ~3 [- G# d2 L( w7 }16.计算特征值的贡献率,将特征值除以所有特征值的和,并将结果赋值给DS的第二列。
( ~4 ?5 n+ x9 ~4 o9 s$ M. r4 E17.计算特征值的累计贡献率,对贡献率列进行累加,并将结果赋值给DS的第三列。: l, Z6 O6 `8 m$ z( i" ~) S$ I
1 ~' E8 C0 t& r  g* \

$ A- K! [, ^* d6 x. H1 [& i7 K( G18.确定保留主成分的数量:
3 v8 {- B9 @! K
$ L3 y: b$ ?# S2 V4 ?1 e6 f, v, \/ a6 Z; w1 |" F5 a
19.找到累计贡献率大于等于设定的保留率T的索引位置。
: }+ \& Z7 O- n  V& p4 u20.提取第一个满足条件的索引(最小的保留主成分数量)并赋值给变量Com_num。
  Z0 _. g. V& J, ]+ `6 }. e: Z- B9 h! @* S
1 K) T% [; {& U+ i
21.提取主成分对应的特征向量:
) G& v; ~; k( \; C& i. b$ g1 P8 u/ c0 H6 w3 p( V

9 n  h) K; t; T5 b( \, B22.将特征向量矩阵V的最后Com_num列反转(从最后一列开始取),得到主成分对应的特征向量矩阵PV。
$ R" I& g1 u+ |5 N6 W+ C. I
- p( }* e7 j% z$ j! ]5 J5 g2 d, ?
23.计算在主成分上的数据得分:
3 q; m8 Q' N" F$ h& r1 o
, J) i/ P4 M. r/ n: m/ B
1 }3 C1 I* X( o, z' O" q/ @- P- A24.将归一化后的数据矩阵SA与主成分特征向量矩阵PV相乘,得到在主成分上的数据得分矩阵data。9 S# n$ `' n; I( S. p# ^- I. l6 k
  i* x4 J0 k( x/ Z
该函数的作用是对原始数据进行主成分分析,并返回在主成分上的数据得分矩阵。主成分分析用于降维和数据探索,它将原始数据转换为一组新的线性维度,其中每个维度都是原始数据维度的线性组合。这些新的维度(主成分)根据特征值的贡献率进行排序,保留贡献率较高的主成分。
: Z8 Y1 ?0 z2 C3 c
7 [% N1 Q2 F4 w( n" @1 s* T9 m# s4 y3 m7 u2 d# n, v

2 U( ]" |6 g6 d! d+ s! U: T7 ]7 ?, m* ^* c2 Q

! M' ^: V# {  e1 X

PCA.m

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