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这段代码实现了主成分分析(PCA)的数据得分计算和特征向量提取。下面是代码的解释:: a" C u+ T& k/ @8 P
! h1 ?; B" m; {0 I( w$ R1.函数定义:
) ` t$ [( @4 y( ]8 `8 P3 [1 z
3 C A5 ^( k% Z, H
$ [+ X$ H& n% u _% Q7 f3 I% t2.函数名为PCA,接受两个输入参数:raw_data(原始数据)和T(保留率),并返回新数据。
5 ^4 T" Q7 c4 h8 Q; S
" q9 `9 e8 b) w/ a" L4 q) u7 A+ J7 _2 A# M
3.数据读取与标准化:
/ m0 u# x6 N* q0 D* p/ E
4 g! e% `8 l" v$ Z5 i6 m+ P5 @/ b: H' x2 S4 `( Y' L9 {
4.将原始数据raw_data赋值给变量A。* z9 V% g! v2 o/ r* ]; O
5.获取数据矩阵的尺寸,其中a表示行数,b表示列数。
) h! o! D' t; a5 {3 r* \/ A6.创建一个与原始数据大小相同的零矩阵SA。
w! O5 N, p. p7.使用循环将数据按列进行放置,并进行标准化(归一化),即将每列数据减去该列的均值,再除以该列的标准差。
$ ~. d% I" L: v3 L. l) |* [
2 c) H: x, E l; E6 K8 Y) l+ k4 x' _
8.求解相关系数:
9 I0 B! v! j) }& I
4 K( r' X6 ]& O8 ?3 U5 Y2 H5 Y
9.使用corrcoef函数计算归一化后的数据矩阵SA的相关系数矩阵CM。
9 T' Y Y- B- b0 E, r
# ?' b* H/ k3 s( k8 M! c& w
9 k; H' T# O8 X. w10.计算特征值和特征向量:
0 r9 `# q+ G" J2 A% t# o$ F
: `7 N/ l8 d' g0 A$ S
5 `; c1 I4 j \- E0 w3 T% Y7 g11.使用eig函数对相关系数矩阵CM进行特征值分解,得到特征向量矩阵V和特征值矩阵D。5 j) g7 v: H8 _/ K) P0 H
. j. ?( U r$ A" _
* b: [* Z6 y5 I, D: h12.提取特征值和计算贡献率:8 H! }' i9 n4 }4 B" }8 Z7 F( j6 m
. C" L/ A# p8 j5 Z; r' J; N2 s/ [
7 v8 U: O) R) Y) E. `13.创建一个零矩阵DS,其大小为b x 3,其中b为特征值矩阵D的列数。
{% W7 t7 H2 P- @+ Q) c14.将特征值矩阵D的对角线元素(特征值)赋值给DS的第一列。& ?) S' {! h8 K
15.对DS按照第一列的值进行从大到小排序。7 T. P4 i" q9 [( v c8 @. Y0 j
16.计算特征值的贡献率,将特征值除以所有特征值的和,并将结果赋值给DS的第二列。
$ I* m6 J8 Y+ u/ B8 A17.计算特征值的累计贡献率,对贡献率列进行累加,并将结果赋值给DS的第三列。 a6 a2 d. m' _
9 w5 n8 E; e; w- p! B3 [. Q) p+ L
+ S8 K% R, ]# S3 B18.确定保留主成分的数量:* X0 Y! e( p% V1 k
3 G2 m, T3 M3 T4 j8 S) B/ T- w/ x$ x8 l8 S/ \
19.找到累计贡献率大于等于设定的保留率T的索引位置。, J0 G1 f0 c/ J% i+ F+ O
20.提取第一个满足条件的索引(最小的保留主成分数量)并赋值给变量Com_num。
' X; e5 \ s+ U7 w1 g4 k( w# n S8 J9 j2 O
. r: o0 _1 f7 o: P' F: Z21.提取主成分对应的特征向量:
( ], o2 o" K: l. o+ q
' T, P' |! I% ]8 ^1 k# y3 i1 d7 S
3 |$ b& N0 w& l3 O' B( J22.将特征向量矩阵V的最后Com_num列反转(从最后一列开始取),得到主成分对应的特征向量矩阵PV。' o j9 G; ?. q% R7 N5 X) ]1 I3 [
9 A' q/ P2 |/ r: @9 z
. _$ T; e" t5 g5 F$ m23.计算在主成分上的数据得分:7 }7 X0 u& N2 Z
0 t$ B9 o( S) U' T2 D4 Q9 R: c- E+ ]$ Y6 {
24.将归一化后的数据矩阵SA与主成分特征向量矩阵PV相乘,得到在主成分上的数据得分矩阵data。
9 E$ H5 T0 {! G1 e8 |/ W" U. F. x. F* e! }# i* T
该函数的作用是对原始数据进行主成分分析,并返回在主成分上的数据得分矩阵。主成分分析用于降维和数据探索,它将原始数据转换为一组新的线性维度,其中每个维度都是原始数据维度的线性组合。这些新的维度(主成分)根据特征值的贡献率进行排序,保留贡献率较高的主成分。# c+ W$ j! I0 k. p* _! d
/ N) [8 A$ X% x! y2 O0 }; p6 y7 j& I7 b0 O% T0 d+ f. L: p6 L
~, G* Q1 j/ o3 }
1 P! e7 S/ T& f" v7 u9 O
4 l$ C1 j# e8 {* |) ~/ x$ [ |
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PCA.m
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zan
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