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python 解决主成分分析 pca

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发表于 2024-3-21 11:03 |只看该作者 |倒序浏览
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主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)是一种常用的降维技术和数据预处理方法,它通过线性变换将高维数据映射到低维空间中,以找到数据中的主要特征。$ ?- P' r! \7 I4 \
主成分分析的基本思想是将原始数据投影到一个新的坐标系中,使得投影后的数据具有最大的方差。这些新的坐标轴被称为主成分,而每个主成分都是原始特征的线性组合。主成分按照其所解释的方差贡献程度进行排序,最重要的主成分排在前面。8 ?: ~8 w0 t$ H
主成分分析的步骤如下:
! R9 G: s, h6 m9 i: V& D2 W/ M6 r( V3 X) v8 }
1.标准化数据:将原始数据进行标准化处理,使得每个特征的均值为0,方差为1。这样可以避免某些特征由于量级差异造成的影响。/ P# b, @: C0 Q2 _
2.计算协方差矩阵:根据标准化后的数据计算协方差矩阵。协方差矩阵描述了不同特征之间的相关性。
' @0 x7 _( Q$ y  Q3.计算特征值和特征向量:对协方差矩阵进行特征值分解,得到特征值和对应的特征向量。特征值表示每个主成分所解释的方差,特征向量表示各个主成分的方向。0 \7 G* g6 ~6 N; u0 \) p$ C
4.选择主成分:根据特征值的大小选择要保留的主成分的数量。通常选择保留累计贡献率较高的主成分。
& L# }, z/ n- H/ e5 J3 y5 D. _8 w5.数据转换:将原始数据投影到选定的主成分上,得到降维后的数据。$ V. Z' k$ {0 }6 |4 S
4 {' Q7 {( T! Q* x
主成分分析的主要应用包括降维、可视化、特征提取和去除数据中的噪音。通过降低数据的维度,主成分分析可以简化数据集并去除冗余信息,从而提高后续分析的效率和准确性。
/ _& \; W) s& h, t7 z
  T" {" b: p! Z% ?1 J7 @逐行解释代码的含义:0 J( _- L& M; u8 h& l6 {
import numpy as np
) c/ n0 l/ A" K8 iimport pandas as pd
% ?, \( R8 l6 X# gfrom sklearn.decomposition import PCA
& \5 Z$ Z0 G9 z( c$ b
, t8 o' f: n- \+ f- N. K* f/ j这些是导入所需的库。numpy用于数值计算,pandas用于数据处理,sklearn.decomposition中的PCA用于主成分分析。
  e: K; n! h/ k4 bdf = pd.DataFrame({6 l6 M5 U( @# i. Y! g
    'x1': [149.5, 162.5, 162.7, 162.2, 156.5]," ~" v+ Q: @: Y# ~/ t& y
    'x2': [69.5, 77, 78.5, 87.5, 74.5],
. m: a) o. R6 R: ~# N; k  i    'x3': [38.5, 55.5, 50.8, 65.5, 49]1 c3 y; t) P  m$ w9 g
})
+ B! i/ g+ c: ]" N3 g- Z6 B, ^  K: ?4 M4 c
这里创建了一个数据帧df,包含了3个变量 x1、x2、x3 的观测值。数据集中每一列代表一个变量,每一行代表一个观测值。
9 h. E9 y- O" q" j& U) F' vmodel = PCA().fit(np.array(df))
! [! o4 z( `1 x+ ?% d" h, b" ?3 e
8 [5 g1 i6 \* k0 q( E这行代码创建了一个PCA对象,并使用fit方法拟合数据。fit方法将数据df作为输入,并根据数据计算主成分分析模型。
+ p3 c, \; b/ v, r4 Uprint('特征值:', model.explained_variance_)
& S0 g' j' A. a5 O! C# p: Q$ \print('贡献率:', model.explained_variance_ratio_). ]( e$ V' ]! D, ^$ l
print('各主成分的系数:', model.components_)
. L: r2 x' m! S+ U- y: `% C$ e: t; F$ _' f
这几行代码分别打印了主成分分析模型的三个重要属性:% D5 X1 Y# V  S
& [2 c$ m5 K! W. E
1.explained_variance_:特征值,表示每个主成分的方差。
+ B9 W; J2 i" i" Y! [. S2.explained_variance_ratio_:贡献率,表示每个主成分的方差占总方差的比例。- y, O# S- [/ B- ]$ a- o6 q
3.components_:各主成分的系数,表示每个主成分在原始变量空间中的权重。1 |, l9 ?" P( F8 g$ K' t
8 d% y; r# W8 {8 U% x
pca_df = pd.DataFrame(model.transform(np.array(df)))
* o: G( X8 T( gpca_df.columns = ['F1', 'F2', 'F3']$ F! Y8 K. k; O0 a# m; q* u! o
pca_df
( \5 x4 j5 {" q# Z9 b; P0 B: p
% @# [6 e% ?3 g5 c* q这几行代码使用model.transform方法将原始数据进行主成分转换,并将结果存储到一个新的数据帧pca_df中。pca_df包含三个列,分别命名为'F1'、'F2'、'F3',分别表示三个主成分的值。/ G0 M$ |' e3 X' x3 A) e8 Q& ]
希望这个逐行解释对你有帮助!如果你还有其他问题,请随时提问。
9 p4 e. ?: c$ K" D1 z) W
# M, p1 e5 t! _* Y2 g& t( e+ W
$ T% A+ T7 _8 S4 S& I; R0 }  [. q

29.pca.py

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