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关于matlab代码矢量化的理解

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    [LV.1]初来乍到

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    1#
    发表于 2010-10-5 09:32 |只看该作者 |倒序浏览
    |招呼Ta 关注Ta
    代码矢量化是matlab的精髓,其基本特点是运行速度快和代码简洁,它是如何实现的?
    # `3 f& h" O, T( j+ `$ D1 G( t& ~7 g7 h/ M% {
    按我的理解,代码矢量化的本质就是设计专门的函数对数组元素集中运算,这样可提高运行速度,同时兼有代码简洁的特点。7 P% x; X2 L- R7 n( {# C( |7 B, }

    2 o: h' u. c) W  F. Q4 u. I! K( |# x对matlab的理解比较肤浅,但也确实看不出有更深意义的东西,望解惑。' X; S# J/ z0 e% N4 _. B

    3 X6 S' D) d. T大家有什么看法,愿畅所欲言。5 D) ^2 m, K; ~; G7 Y
    zan
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    [LV.1]初来乍到

    本帖最后由 forcal 于 2010-10-12 21:46 编辑
    $ Y- Z9 e; W: m9 r+ [
    1 ]. _# E/ Z0 `: H  a" G0 Q我正在练手设计的FcMath库也打算以矩阵运算为基础,设计一些专门的函数对数组元素集中运算,运行效率确实有所提高(甚至有些涉及矩阵的算法比matlab还快),代码也简洁了,但不知这是不是矢量化?
    ) g/ M5 G' D  q4 Z# v! R3 t/ L) f+ M; v8 x& H
    脚本运行效率应该取决于函数调度效率、对象管理效率和函数内部算法的实现。
    , H/ c2 b7 `( I% s! e) C" W8 z# L# K( e: J1 c6 D# y
    我感觉,matlab的函数调度效率较低,对象管理效率这个不好说,但一些函数内部的设计比较优秀。故有些Forcal代码比matlab快,而有些慢。
    ' j6 y4 `. ~8 A1 u
    . r) ]3 m) p- }- `. \. Y以下例子体现了Forcal和matlab的效率差别所在。. r1 J: }( U% y0 t7 r% d& L
    1 d& M* Z3 g  B! f0 s
    这个matlab程序段是网友lin2009 给出的,理论结果是每个元素均为275000。
    1. clear all
      / L% N( }3 U+ B5 v+ A5 j- `% [
    2. clc. {0 s5 m+ Y* X2 [$ k( X  e! o1 C
    3. tic
      2 \6 e\" ^( E7 N& I
    4. k = zeros(5,5); % //生成5×5全0矩阵! O* K/ L: e/ U3 u
    5. % 循环计算以下程序段1000 00次:
      * E\" i- l+ i, n+ @
    6. for m = 1:1000 00& X1 Y1 I2 }6 M
    7.     a = rand(5,7);
      $ a) f3 ~' p, ?3 \. x
    8.     b = rand(7,5);%//生成5×7矩阵a,7×5矩阵b,用0~1之间的随机数初始化
      1 V5 W7 r* T0 j
    9.     k = k + a * b + a(1:5, 2:6) * b(2:6, 1:5) - a(:, 7) * b(3, :);
      ! m# {8 L+ j% m& o& m
    10. end$ B( @3 b- `+ x3 V+ t4 ^; F
    11. k9 j% ?) f* v\" m' g& N
    12. toc
    复制代码

    : t" s. j( P- p+ A/ {( |% j5 VForcal代码1:运行稍快的代码,比matlab约快10%吧?
    ( }; x0 x- X- N
    1. !using["math","sys"];
    2. 9 q% |' A' I: i
    3. mvar:, b$ Z( Z6 r/ f
    4. t0=clock(),
    5. * W\\" [\\" Z8 l\\" l
    6. oo{k=zeros[5,5]},
    7. # g/ w/ \5 g) S+ G0 g3 d. \, o
    8. i=0,((i++)<100000).while{% ^& M, f! l8 {4 F7 t
    9.   oo{2 _0 e. _% _# _
    10.     a=rand[5,7], b=rand[7,5],
    11. 7 G3 M$ W, X7 M7 O3 E
    12.     k.oset[k+a*b+a.subg(0,4:1,5)*b.subg(1,5:0,4)-a.subg(neg:6)*b.subg(3:neg)]$ [  N& k2 h0 L$ ^
    13.   }. o% L' S, H\\" ]! K9 q
    14. },
    15. ( ]$ H9 a) S8 t) `% P
    16. k.outm(),
    17. % C& p) Q! f0 ^% V2 u+ ~+ B: i! O
    18. [clock()-t0]/1000;
    在我的电脑上运行时间为3.344秒。6 z9 y! ]$ e2 ]; o* O
      V( l% _9 b$ ^2 w4 ]
    Forcal代码2:比较好看些的代码,似乎也比matlab稍快吧?. |- `: j2 e# ^0 k
    1. !using["math","sys"];8 S' t  a2 m, ~% w/ k4 c' p
    2. (:t0,k,i,a,b)=* O1 {% l; Y6 p8 o
    3. {) O( V' A* c* t! T- o
    4.   t0=clock(),$ a\\" \1 \* @+ d5 P5 x8 x/ K+ Q
    5.   oo{k=zeros[5,5]},
    6. 5 g$ ^; a3 C* R2 H
    7.   i=0,((i++)<100000).while{' y8 {. t: M, U7 S# \
    8.     oo{9 b' V6 X' ]0 g0 y8 Z4 U8 e2 A
    9.       a=rand[5,7], b=rand[7,5],
    10. 5 w, Q/ J) o; }. h
    11.       k.=k+a*b+a(0,4:1,5)*b(1,5:0,4)-a(neg:6)*b(3:neg)# e2 X7 R  U1 T- [
    12.     }
    13. $ Z: L* R& w  V
    14.   },
    15. ) W$ R7 e7 `8 C* `, M
    16.   k.outm(),1 }, `\\" L; v) b# |6 E1 l
    17.   [clock()-t0]/1000# b+ y* L) |. W( Y! M, x& B, q& b. G
    18. };
    在我的电脑上运行时间为3.579秒。3 y& X. f0 c1 ?: e
    - L: m1 n( v. `' o" N; ~% k. N5 {
    例子2:
    * p: v& {: I/ g0 ~一段程序的Forcal实现:
    9 l8 g1 A" }0 v! i% W
    1. //用C++代码描述为:
      . ~, h2 Q7 s+ t- R
    2. s=0.0;  
      % q- h: u- ?* ]\" ~$ t5 Y
    3. for(x=0.0;x<=1.0;x=x+0.0011)  1 j# v+ `5 x- I  P; c
    4. {: ^1 s7 u' }% W; X& N- H
    5.   for(y=1.0;y<=2.0;y=y+0.0009)
      % `2 M) Q& U4 O& [; J  \
    6.   {  e  ], t% r4 U3 |
    7.   s=s+cos(1-sin(1.2*x^(y/2)+cos(1-sin(1.2*y^(x/2)))));0 \+ n5 L# z  F' b* i
    8.   }6 y& j2 Q6 W% s
    9. }  
    复制代码
    结果:
    ( v% e1 u8 C$ r1008606.649474418 H/ ^/ h$ S1 Y4 q3 n2 _
    0.609 //时间' E5 B( k7 f# o6 j5 J1 a
    * p) n" v6 R/ e- f4 c
    这个matlab程序段是网友yycs001给出的。: [& }3 z+ ^0 g
    1. %file speedtest.m; ~; g& r: M8 N\" T/ v
    2. function speedtest6 F: f# S' d* d& O- f' @. k
    3. format long# F- S3 T6 V; H- v
    4. tic
      4 N4 X. J; }5 C4 n# U% N
    5. [x,y]=meshgrid(0:0.0011:1,1:0.0009:2);: I2 `9 }6 L- W2 b$ |! n
    6. s=sum(sum(cos(1-sin(1.2*x.^(y/2)+cos(1-sin(1.2*y.^(x/2)))))))
      2 {5 K2 b5 J4 v6 g6 l/ J
    7. toc
    复制代码

    4 U- d, ^7 {0 ~1 eForcal代码1:**数组求和函数Sum,完全矢量化的代码4 Q% [/ r0 f: p* c+ f% {
    1. !using["math","sys"];
    2. : T5 G- ~) H9 Y6 g
    3. mvar:3 z3 ~. Z& ?3 ]3 n: b  H1 W4 T5 Y
    4. t=clock(),
    5. 5 A$ D/ }3 y' d3 b/ d4 N& u
    6. oo{3 S' L2 Y4 W$ V8 ~8 p1 s* b$ o
    7.   ndgrid[linspacex(0,1,0.0011),linspacex(1,2,0.0009),&x,&y],
    8. 8 s; ?6 u: W# f' N
    9.   Sum[Cos(rn(1)-Sin(rn(1.2)*x^(y/rn(2))+Cos(rn(1)-Sin(rn(1.2)*y^(x/rn(2)))))),0]
    10. ) u3 ~6 `/ X; o- i
    11. };0 X1 O( t/ P, I! `6 a
    12. [clock()-t]/1000;
    结果:
    ) M4 q) W" B8 o- M1008606.64947441; F1 E* {3 c& q% ]' g2 v  K/ f. r  w
    0.625 //时间
    6 _" x+ h" V% |/ a# r8 P" S
    % ?* g) V* @& I4 n3 e4 Y; H或者这个,与上面效率差别不大:8 O1 B. D. a: K
    1. !using["math","sys"];/ u/ }3 a+ S& h3 o5 x* C
    2. mvar:! l2 p9 s. n% ^* E6 c6 N6 q
    3. t=clock(),/ n, h: g, ~( G& Y' m\\" [) B; R
    4. oo{! a2 F8 q! b- n1 K/ D4 J
    5.   ndgrid[linspacex(0,1,0.0011),linspacex(1,2,0.0009),&x,&y],% M4 d5 n! n0 p# t& o4 T* ?
    6.   Sum[Sum[Cos(rn(1)-Sin(rn(1.2)*x^(y/rn(2))+Cos(rn(1)-Sin(rn(1.2)*y^(x/rn(2))))))]]( Y! V9 h% b) `* @. z/ i: P- r$ L
    7. };, y4 b  R: O4 |. Y
    8. [clock()-t]/1000;
    ' ~8 S' A6 l% t# }. G% N6 C
    Forcal代码2:求和函数sum,非矢量化代码
    / N; [$ c$ t6 ?. p5 o" @; o
    1. f(x,y)=cos(1-sin(1.2*x^(y/2)+cos(1-sin(1.2*y^(x/2))))); 7 c9 F% U0 Q- N) _9 p) o  ?
    2. sum["f",0,1,0.0011,1,2,0.0009];
    复制代码
    结果:
    . k' _6 y1 c) g! z0 k1008606.64947441
      j* _" J# `. `' n, Z0.719 //时间
    ! m' j% u; S/ B/ i7 B6 O' l* `" F. y
    Forcal代码3:while循环. m2 I0 V& k. Z) w* F) Z2 U, d
    1. mvar:5 f. u4 }+ Y8 x4 G3 H
    2. t=sys::clock();
      ( ^) g- B3 \( e
    3. s=0,x=0,
      2 b0 b  h0 I1 s
    4. while{x<=1,  //while循环算法; 1 e) T6 Q& ~+ z# N6 p9 Y& O2 q
    5.    y=1, ' K$ k; O3 V0 l( B1 {
    6.    while{y<=2,
      . Z5 b/ O0 @2 F1 T5 l! c
    7.        s=s+cos(1-sin(1.2*x^(y/2)+cos(1-sin(1.2*y^(x/2))))),
      ( p; k( f7 Z& i! A- C\" [% S
    8.        y=y+0.0009 \" H2 m/ W( d8 G- h' N
    9.       },
      9 g3 L; {' N) ?( T; i' l
    10.    x=x+0.0011
      / p\" A- n8 s' W7 k( r) y) `
    11. },
      % H) h& M1 d' q% p1 b. h: Z
    12. s;
      1 \: _. w. w! i
    13. [sys::clock()-t]/1000;
    复制代码
    结果:! r: f. R' Y  k' A% y$ J
    1008606.64947441
    - Q! W* ?5 J4 F, n, R  _! V4 T0.734 //时间
    , I; {% g( i9 \1 y( y! J; W8 H9 ^$ n& ^% c: V" m4 D
    大家可下载OpenFC进行测试:http://www.forcal.net/xiazai/forcal9/openfc32w.rar
    1 y2 ]3 x4 N- \' }* b7 D: h( _4 J7 ~* ?* m6 c
    注意Forcal的矢量化代码第一次运行有时效率较低。" q! K6 N5 U8 ^7 ?1 [* l  N0 i
    : J; b- V* P* i+ D8 \
    例子1中Forcal和matlab都是矢量化代码,但matlab跑不过Forcal。该例子的特点是函数调用频繁,临时变量生成多,但矩阵很小,矩阵的各种函数运行时耗时较少。故说明Forcal函数调用+变量管理效率优于matlab。$ [1 E( |# A, Q5 ^
    ; g. Y: O) d$ a5 O4 K
    例子2中Forcal的矢量化代码是最快的,但与matlab的矢量化代码相比仍有差距。该例子的特点是函数调用少,临时变量也少,但矩阵大。故说明Forcal的各种矩阵函数Sin、Cos及矩阵的加减运算等函数的内部设计不及matlab。' k5 X) D7 f3 r. m$ Y
    1 F0 ^6 n1 c  Y
    如能在函数内部设计上下点功夫,例子2超越matlab也是可能的。在这方面,期待高手们的指点。! S  R. t* R; O. [. w

    + Y' O& C, a* P5 m( y如果例子2速度也超越了matlab ,matlab矢量化的神秘面纱就揭开了。
    2 i1 f: v3 ^8 B4 o- R  H# V# j
    - }6 y' n+ @2 Y3 i4 T: l+ j2 O顺便说一下,例子1如果用C++的运算符重载来实现,速度将比Forcal慢一些,也就是说,在涉及运算符重载时,脚本的效率有时比C++还要高些。
    4 W) H, @# K; N% E4 J
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    参考:http://bbs.emath.ac.cn/thread-2709-1-1.html
    3 q- s# M8 U8 }
    8 G: [( T  H! c6 M) l5 O# y. C4 A+ l我在多个帖子中有不同说明,但将这些说明再集中到一个帖子中比较麻烦,大家相互参考一下,看能否把这个问题解决了。
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