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[个人总经验] 一般线性模型(GLM)的相关思考

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发表于 2015-4-1 13:57 |只看该作者 |倒序浏览
|招呼Ta 关注Ta
最近遇到一个问题,如果因变量为一个连续变量(如胰岛素水平),主要考察的变量为分组变量(如正常血糖组,前糖尿病组,糖尿病组三组),现在的目的是想看调整多种变量(包括多个连续性变量和分类变量)后,胰岛素水平是否一致。
0 v# N: E+ f* D8 G+ K7 W  K! x; x. ]7 Y* \$ I3 i
6 x. _# W. q2 C6 d6 r
一开始的思路想到的是采用GLM进行协方差分析来解决。* K& |4 ~. R0 W
4 _+ W2 W' F6 J; C4 [% H/ [
但是有觉得似乎不是很对,因为经典的协方差分析通常只考虑一个连续变量(协变量)和一个分组变量,同时协变量和分组变量只有不存在交互的时候(经典协方差分析的前提)才能使用协方差分析。; O' I/ ?5 B6 I/ Q1 Z9 [1 W) t8 `
针对我目前的问题,如果想调整多个连续性变量和分类变量,这种方法能否再叫协方差分析?如果可以认为是协方差的思想,用不用检验协方差分析的前提(如协变量与分组变量之间的交互)?多个连续性变量和分类变量存在时,该前提应该怎么检验?
5 P" U' l8 P- I2 M, W. O6 |
* D' G2 c1 p& C9 h) u0 \通过跟别人交流之后,有一句话非常受用:线性模型其实最重要的不在于用的方差分析还是协方差分析,而主要是检验残差是否符合线性的几个条件。: _. D4 z) a( ~: i1 ~
  ~/ }% U6 O6 u2 I
受到该启发后,认真再复习GLM的相关资料,得到更加重要的总结如下(来自高惠璇SAS/STAT软件使用手册,实际是SAS8.2的User's guide的中文版,但是目前SAS 9.2,9.3的User's guide关于GLM模型的介绍中已经删去了这么经典的总结,实在可惜,倒让人看不到GLM的真正长处了):
  Q, I9 }% A( n: s+ X9 d如果X1-X3,Y1-Y2为连续性变量,Y3为分类变量,a-c为分类变量,time为时间变量,目前我们熟悉的模型可以简单概括如下:
" ~$ G4 Z$ V4 f4 u(1) y1= x1    简单回归8 R! f& f- G7 ~, g
(2) y1= x1 x2 x3  多重回归(multiple regression); W( Q/ a* ]: W/ ?6 s
(3) y1 y2=x1 x2   多元回归(multivariate regression)" l2 ~% B. O: p. q
(4) y1= a   单因素方差分析
* b0 U' H6 D# h. Z* `/ `( s" @(5) y1= a b   (析因设计的)主效应分析5 j' _) I% u; A0 K
(6) y1= a b  a*b (析因设计的)主效应加交互项分析. h( A' A  q. J# t9 G
(7) y1= a x1   协方差分析
5 |: `+ q2 F- P# b(8) y3= a   单因素logistic回归- C! f' _1 o9 S$ o1 E
(9) y3= a b c x1 x2 x3   多因素logistic回归
& c( b$ K! c1 g, I$ E(10) y3(time) =a   单因素cox回归# D% H7 }  W3 d; A
(11) y3(time) = a b c x1 x2 x3  多因素cox回归
& v, ~+ ], ^: c8 j) f2 A; ~6 [6 Y3 v. b
1-7采用SAS的一般线性模型GLM都能实现,而1-9采用SAS的广义线性模型GENMOD都能实现,具体验证详见后面举例
% S+ c+ r1 }4 j- D! S9 o" }( ]7 Y
再次回到开始的问题:掌握上述的基本思路后,因为因变量为连续变量,所以采用线性模型肯定是对的。如果因变量可以认为是正态的,那采用一般线性模型是合理的。所以现在的关键问题是:如果调整多个变量(包含分类和连续变量)后看不同分组间因变量(连续变量)是否仍有差异时,能否再称为协方差分析?我目前认为应该是可以的,但是事实上我们遇到这种情况后,并不再去强调它是协方差的思想,而只是回到线性模型分析的最初的起点,也即是检查残差是否符合线性的基本条件即可。
4 y$ ^3 B+ ?) D# ^
% }" k% k7 a- V但是现实中,我们在使用GLM解决前面遇到的类似问题时,只是简单地用了,而很多时候我们都没有认真去检验残差是否符合这个条件,这可能是我们滥用GLM的表现之一,因为我们更多只关注模型的参数是否有意义,而不去关心对结果“无关紧要”的前提条件。
, \) A$ \! M' b, B; N, Y
! o7 S& N0 u* v: w再次思考一个问题,上述列举的1-7模型,在GLM中并没有特定的选项指定是哪一种模型,而采用一种表达方式。由此,可以进一步深入概括一句话,GLM模型,对于上述列举的1-7模型并没有本质区别,唯一的区别只是模型中自变量的属性和数量不同。但是我们对1-7模型的叫法却不相同。而其原因是我们对事物的认识是一个由浅到深的过程,之前我们认为他们是不同的7件事情,随着认识的加深,发现原来这些问题可以用一个方式表达出来。而SAS的GENMOD则更能说明这一问题。现在还没有一个模型能把上述模型1-11用一种表达方式表示,但是COX回归在抛开基线生存函数之后剩下的部分也是线性模型,所以说不定哪天真的能够把上述所有模型用一种表达方式表示出来。到时候更应该相信人们对事物的认识绝对是一个由浅到深的过程啦。
3 ]0 }. Y& s7 l0 }) |9 f2 @- m: `; s2 A7 w3 `
附:GLM与GENMOD在协方差分析结果的比较8 e8 c$ A4 z* e. S
   data drugtest;
. Q) J" X( u( E# i  e      input Drug $ PreTreatment PostTreatment @@;
. c) e4 C6 ?1 f' z9 @( C7 s$ i2 ~% x9 g      datalines;
# @3 ?- R/ [6 q2 Y) `* N   A 11  6   A  8  0   A  5  2   A 14  8   A 19 11
% [/ i9 K' _; c8 W# C2 n   A  6  4   A 10 13   A  6  1   A 11  8   A  3  0 # ]+ F& @$ b: A/ N
   D  6  0   D  6  2   D  7  3   D  8  1   D 18 18 4 i# f3 F" _( h
   D  8  4   D 19 14   D  8  9   D  5  1   D 15  9
, j* H$ }3 a% I! f8 b; C   F 16 13   F 13 10   F 11 18   F  9  5   F 21 23 , ^. c' }4 m5 a' X3 m
   F 16 12   F 12  5   F 12 16   F  7  1   F 12 20 - \0 _" o! L. [
   ;
; R4 D$ j: d. z# A! a/ }( N7 B5 t" v* y. U6 E# G  n. Z
   proc glm;
. d# Q: {. Y) g0 ]& u      class Drug; 7 Q+ N; j% H$ t: @
      model PostTreatment = Drug PreTreatment / solution;
( ~, r# M. e% m2 \      lsmeans Drug / stderr pdiff cov out=adjmeans; ) B2 f8 t/ f. J8 r& z
   run;
6 {* I' i9 Y% ^5 E2 z) j3 [2 {( C: @
   proc genmod data=drugtest; : k1 O3 B9 X$ K4 z9 E5 C; W
      class Drug; ) X( n, c8 f$ Z! A7 `  x) X* m
      model PostTreatment = Drug PreTreatment / dist=NOR link=ID obstats type1; , @& R# ?+ C% N! O5 H
   run; . `9 b7 o6 M3 L% E$ M( @1 F7 `6 ~

3 o5 D" c$ w6 R! Q$ r) c' c$ P   proc print data=adjmeans; 9 V  U) z. f# m) |9 }( X
   run;
" {4 n$ ]$ C( {. L9 G, o& v; x3 J5 J! a" S* Q% n
3 G3 g! g7 y0 H% m- E" L( g

# K: B# }! I* C, Z( ]* B$ T$ I1 M
zan
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& i" G) Y5 A* }9 i学习了,总结的真好,特别是那句关于前提的提醒
( h2 @5 l# G4 ^, Q4 ^- p+ n6 m
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    拒绝一切
    8 z4 `" f8 S0 R. @2 p4 o
    学习了,,“我们更多只关注模型的参数是否有意义,而不去关心对结果“无关紧要”的前提条件
    9 u/ [% O# F  H/ \! Y) R”这句话是该提醒了很多人啊,个人感觉不要只知道应用,还要知道原理,所以说理论性的东西还是不可缺的,,谢谢楼主了哈,,
    $ W6 X: I. `9 v# l, Z  m* b
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    [LV.1]初来乍到

    自我介绍
    @
    6 Z3 @9 K; S6 ]" I" d
    深入浅出,简练的表达,传达了复杂的内容。! O' }1 n. H- f9 X$ [, q! a
    貌似目前好多著者、师者都缺少这种思考与总结,有的书、课件就是靠东拼西凑来的。
    3 W' |7 [* V% J* ~0 ^
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