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数学建模中的传染病模型及其编程求解

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    发表于 2020-5-17 09:59 |只看该作者 |倒序浏览
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    问题的提出
    8 W! l2 z6 D- ?1 o% P% f6 S! k9 ^医生们发现,在一个民族或地区,当某种传染病流传时,波及到的总人数大体上保持为一个常数。即既非所有人都会得病也非毫无规律,两次流行(同种疾病)的波及人数不会相差太大。如何解释这一现象呢?试用建模方法来加以证明。4 \" o8 m5 G& x' M  e
    0 Q! l' Y4 \# _. v
    指数模型6 j- P' J" T& b+ ^
    定义已感染人数为i(t) i(t)i(t),假设每个病人单位时间有效接触(足以使人致病)的人数为λ \lambdaλ,那么,在时间段Δt \Delta tΔt内,病人的增量可以用如下的公式进行计算
    ' c+ B! Z' s# v, m: L3 Oi(t+Δt)−i(t)=λi(t)Δt i(t+\Delta t) - i(t) = \lambda i(t)\Delta t
    - \. a9 W) ~& N+ {; K- n* Hi(t+Δt)−i(t)=λi(t)Δt
    4 n4 K( R$ s) g* Y4 ?0 ^: [
    ; a, q- t( M0 Z& o0 z8 p) s# w将i(t) i(t)i(t)移到等式的右边,我们得到如下的递推公式) O" l/ k" e& s1 [. r
    i(t+Δt)=i(t)+λi(t)Δt i(t+\Delta t) = i(t) + \lambda i(t)\Delta t$ j  T4 T2 T, B  E5 _2 U
    i(t+Δt)=i(t)+λi(t)Δt- Z, \) E. c1 t+ g* p4 T4 t2 S
    4 O% l% I( n! S2 F, J- g1 l1 P
    以上递推公式意味着,我们可以通过当前时刻的病人人数和致病参数λ \lambdaλ,计算得到Δt \Delta tΔt时间后的病人人数,将以上思想在Python中进行实现,代码如下。
    ( X6 p3 Z" H2 x  j) |1 X2 L* U/ m$ _6 P/ S3 U$ A% g  ?
    import matplotlib.pyplot as plt
    ' R7 M. Y" V' m4 w* E9 [, I%matplotlib inline
    $ |8 @5 q' h! U& GdeltaT = 0.01$ t% V7 a: E  Q+ g( j! E
    lamb = 2  O& N7 s5 W8 Y1 k5 `
    i_list = []
    3 P9 w1 y$ Q4 qi0 = 0.08; # 初始有8%的人患病5 r# d& f& i1 q; n  m' O
    i_list.append(i0)
    # T0 b% }, j0 t- ZTot_Time = 10
    / k( C+ \- ^( `# B, f& a0 R, KTotStep = int(Tot_Time/deltaT)
    5 N1 _; L% y. u+ E: E1 M##
    * [# z% ^! q* T" e& Y9 Bfor i in range(TotStep):4 c" x: f( S  `; E
        i_new = i_list[-1] + lamb * i_list[-1] * deltaT7 `: W1 j8 [9 v. [6 U) h+ C
        i_list.append(i_new), N  V7 x: P& K$ T/ l9 k# x6 ?
    plt.plot(i_list)) j* C! M, N& ?: M( l7 X: F

    8 s  O, O0 Y) ]- g3 Y6 b1 |将以上代码在Jupyter Notebook中运行,得到病人人数的变化趋势见下图,从中我们可以看到病人的增长是指数级的,在短短十天后,已经有3000万人患病!这显然不符合实际情况的,那么问题出在哪里了呢?
    2 n+ w3 ~& X. q7 I
    - j8 d% A" Q8 E6 R8 b- e
    1 G0 F. d5 z  C实际上,若病人解除的是病人,并不能够使病人再次患病,实际上以上的算法导致了重复计数现象的发生。解决办法:必须区分已感染者和未感染者。& Z* [, z& r/ L
    & L) r0 `3 `% v) D! T% n6 E! c
    SI模型
    7 A0 i5 Y* @1 s现在我们将人群分成两个群体:已感染者(病人,Infected)和未感染者(健康者,Suspect),该模型称为SI模型,模型假设:- n" @; r7 o- R. j" ^0 [# I5 f

    . k  f" s6 P. ~在研究时间内,不考虑死亡率和出生率,即总人数N NN不变,病人和健康人的比例分别为i(t) i(t)i(t)和s(t) s(t)s(t)
    6 e; P8 _7 g& H- P4 H每个病人在单位时间内有效接触并致病的人数为λ \lambdaλ,且只有接触健康人才会致病,称λ \lambdaλ为日接触率: e0 ^" Y  q( E- I0 H
    仿照指数模型里面的建模方法,在时间段Δt \Delta tΔt内,病人的增量可以用如下的公式进行计算4 S( U! t$ g0 m2 G6 U
    ; w) W5 Z$ `9 s( B! F) v) r! p1 p
    N[i(t+Δt)−i(t)]=[λs(t)]Ni(t)Δt N[i(t+\Delta t)-i(t)]=[\lambda s(t)] N i(t) \Delta t
    ) |2 g. ?5 }8 e2 Z: K1 [4 [N[i(t+Δt)−i(t)]=[λs(t)]Ni(t)Δt* W+ i8 v2 T* `0 o8 T- M' a) y

    . l. R+ p6 T) T3 ~消去N NN,再将i(t) i(t)i(t)移到等式的右边,我们得到如下的递推公式) c/ p/ w7 O0 }+ U) P7 V
    i(t+Δt)=i(t)+λi(t)s(t)Δt i(t+\Delta t) = i(t) + \lambda i(t)s(t)\Delta t
    : y: C7 @2 {1 N9 Ni(t+Δt)=i(t)+λi(t)s(t)Δt
    0 _& D; E: c. P+ `3 k1 s
    : n$ W' b% d% f* J% v) m, p. x2 k# V1 y同样地,我们可以通过当前时刻的病人人数和致病参数λ \lambdaλ,计算得到Δt \Delta tΔt时间后的病人人数,将以上思想在Python中进行实现,代码如下:
    , X. Y9 O) n: k: {8 R2 z% [6 `6 u9 q9 P3 Z
    import matplotlib.pyplot as plt
    / n" H+ X2 Y# N- a9 t1 ?& K3 |%matplotlib inline, Y4 E+ ^6 w( `# d7 J! ^
    deltaT = 0.01. u+ O) \/ k2 A9 Q3 l* V; R1 Y7 B' Z
    lamb = 2+ d6 Q9 C, F+ u3 }4 f
    i_list = []
    - A/ h. e9 `1 Y3 }( L  ps_list = []
    * M7 _$ l( [+ |' _2 ?: y* Bi0 = 0.08; # 初始有8%的人患病
    9 u: Q5 z" S% c* bi_list.append(i0)# N9 @, Z* g  K( a  `: i6 x
    s_list.append(1 - i0)
    0 W: h- p8 m7 A) H, uTot_Time =5) S  v$ x( A+ \8 L  X
    TotStep = int(Tot_Time/deltaT)
    " F) {+ z( j+ A" s## / Z  x" a# l9 X& m! Q( H2 |# n
    for i in range(TotStep):
    . p# ^: n/ Z6 v+ Q7 `: \    i_new = i_list[-1] + lamb * i_list[-1] * deltaT * s_list[-1]
    5 u! D8 z' V8 g" g3 l# x8 H* i+ Q    i_list.append(i_new)- D4 T- W) c/ w; L) J' d7 J4 k* Q7 H
        s_list.append(1- i_new)
    - ~) @5 A  M; C& ZTime = [i * deltaT for i in range(TotStep + 1)]
    / A/ }. [) Y( v, d" `! S8 tplt.plot(Time,i_list)( v( h8 s! L* \& y% A* U
    plt.plot(Time,s_list)# {8 ^. L9 @. v! ~  A9 v) A
    plt.title("SI",fontsize = 20)
    & c, h% O7 x4 G' q) S# xplt.xlabel("Time")
    ' O; X; H1 I/ q" Oplt.ylabel('i(t)')
    9 }3 I+ {$ ]) y% O" P0 Z: F6 q5 ?8 E; d6 r& Q( p% n
    从SI模型我们可以看到,病人比例不再会出现"指数爆炸"的情况,在t→∞ t \rightarrow \inftyt→∞时最大患病比例为1。在SI模型中,病人数量的增长曲线是一个典型的S型曲线,又称为Logistic曲线,该曲线在生物学上经常被用来描述物种的增长模。
    8 ]1 I; v8 L# ?7 g$ w3 Y: H
    / O. @* W  E7 L1 S6 k% F然后,SI模型的结论告诉我们,无论λ \lambdaλ多么小,最终人群都会患病,这显然也是不符合实际情况的。
    . A& L# _$ }4 }+ M+ P/ N; g9 d- ]1 M————————————————: o" R! L" H  D% T; {
    版权声明:本文为CSDN博主「任公子ha」的原创文章,遵循CC 4.0 BY-SA版权协议,转载请附上原文出处链接及本声明。" Q, D  V- g: u# r/ Z0 n
    原文链接:https://blog.csdn.net/baidu_26746963/article/details/939183836 z& F' i  B, `$ g8 [

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