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[建模教程] 差分方程模型(四):遗传模型

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    1#
    发表于 2020-6-7 16:37 |只看该作者 |倒序浏览
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    1 常染色体遗传模型- d) z% ]! g7 R, F7 X
    常染色体遗传中,后代从每个亲体的基因对中各继承一个基因,形成自己的基因对, 基因对也称为基因型。如果我们所考虑的遗传特征是由两个基因 A 和 a 控制的,那么 就有三种基因对,记为 AA, Aa,aa 。例如,金鱼草由两个遗传基因决定花的颜色,基 因型是 AA的金鱼草开红花, Aa 型的开粉红色花,而 aa 型的开白花。又如人类眼睛 的颜色也是通过常染色体遗传控制的。基因型是 AA或 Aa 的人,眼睛为棕色,基因型 是aa 的人,眼睛为蓝色。这里因为 AA和 Aa 都表示了同一外部特征,我们认为基因 A 支配基因a ,也可以认为基因a 对于 A 来说是隐性的。当一个亲体的基因型为 Aa ,而 另一个亲体的基因型是aa 时,那么后代可以从aa 型中得到基因a ,从 Aa 型中或得到 基因 A ,或得到基因a 。这样,后代基因型为 Aa 或 aa 的可能性相等。下面给出双亲 体基因型的所有可能的结合,以及其后代形成每种基因型的概率,如下表所示。. ~. ^) I% {+ G1 Z

    / j1 b! f  m3 m+ O& M
    ! i5 t+ s# V! j# k9 T" V1 e, U. B
    例 5 农场的植物园中某种植物的基因型为 AA, Aa 和 aa 。农场计划采用 AA型的 植物与每种基因型植物相结合的方案培育植物后代。那么经过若干年后,这种植物的任 一代的三种基因型分布如何?
    , {! t0 d8 Z- \9 l; S* ]4 W: O, N* b
    (a)假设
    ! D; @1 U( s1 m" ^; |/ R; `  [3 v令n = 0,1,2,...。 / N) N9 }- N! |3 m

    , u7 Q) v0 j+ [% R% L( |5 O# Z6 r  k( ^- D7 U

    7 x, f" W$ m3 [- j$ S# v4 f; D! ^0 n2 [( M, N' w
    3 y! Z; [# m. C4 h) ^, l7 d( P
    (b)建模9 N$ t  j8 ]! ]. a+ v4 L! l; x
    : `* t  z; t1 S4 {. e$ E: v' b+ g
    $ V, y% H5 N' m; c
    0 T5 i" r1 @  o1 O/ _

    ) ~- I$ M( X* q8 N1 y6 N$ l3 n" B+ p8 T7 f, @. }% C0 ]# Z3 O- m

    * z0 }; L; S5 L8 i! ]. l编写如下 Matlab 程序:% v% [  a, ^- I) V/ o$ d2 ]; j: x

    2 ^: m, v$ g/ p9 Zsyms n a0 b0 c0: u: l- f# S1 V' @1 M
    M=sym('[1,1/2,0;0,1/2,1;0,0,0]');7 S# ^: i( r3 ]) B1 y/ B
    [p,lamda]=eig(M);. X' r! D$ t% `" }9 U! Z0 U
    x=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0];
    ) ^" Q+ k' r4 G4 m: Z2 |x=simple(x) 7 v% u* N" U9 C5 Q
    - q" z( A" X  Z) y' u% h1 U$ i9 A
    7 u& \: i9 m& v2 x" o& Z. D
    : f0 ]0 `( d# A. Z8 n: j

    即在极限的情况下,培育的植物都是 AA型。

    (c)模型的讨论

    若在上述问题中,不选用基因 AA型的植物与每一植物结合,而是将具有相同基因 型植物相结合,那么后代具有三种基因型的概率如下表所示。

    编写如下 Matlab 程序:

    & ?4 h: g$ F2 e  m% _
    syms n a0 b0 c08 r  i4 J6 z  q, O
    M=sym('[1,1/4,0;0,1/2,0;0,1/4,1]');# m& h' |6 n0 V* C( W
    [p,lamda]=eig(M);3 ~  ^3 [7 F) J5 s" k4 U9 D7 B
    x=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0];& ]- u# j: |4 M# ?* C) ?
    x=simple(x) / y! |2 T; |1 Q& J* o0 d

    . J% y! Y: }( L* |% O' A9 c) s' k/ r. ]4 `# j# a" s$ I* g

    : u2 o) L  {5 b& q# t2 常染色体隐性病模型9 j/ K+ O( v2 U/ W; n
    现在世界上已经发现的遗传病有将近 4000 种。在一般情况下,遗传病与特殊的种 族、部落及群体有关。例如,遗传病库利氏贫血症的患者以居住在地中海沿岸为多,镰 状网性贫血症一般流行在黑人中,家族黑蒙性白痴症则流行在东欧犹太人中间。患者经 常未到成年就痛苦地死去,而他们的父母则是疾病的病源。假若我们能识别这些疾病的 隐性患者,并且规定两个隐性患者不能结合(因为两个隐性患者结合,他们的后代就可 能成为显性患者),那么未来的儿童,虽然有可能是隐性患者,但决不会出现显性特征, 不会受到疾病的折磨。现在,我们考虑在控制结合的情况下,如何确定后代中隐性患者 的概率。( a+ Y3 j5 Q8 w: z# |% a

    2 A/ v1 A, r" Y% C(a)假设8 X, f. R, ^% z- e
    (i)常染色体遗传的正常基因记为 A ,不正常基因记为a ,并以 AA, Aa,aa 分别 表示正常人,隐性患者,显性患者的基因型。
    ; L, l9 p: Z9 Y+ V+ o! `5 b3 @' E$ R3 x

    2 M7 ~1 N" R0 c5 ], |, A7 y( x( I$ x1 R2 W  m8 O5 R9 {& @4 `
    (b)建模
    " B& i2 G9 c: B4 `9 _- u
    8 S& c- J% a* I7 D, b1 `+ U  j1 }4 k7 ?0 W0 r, G! u* w$ q3 w4 k

    $ c& {# j9 Z' @% k
    * F9 c7 j1 `. ~7 r3 K" Q6 O6 `" l5 _  T1 w% I
    8 _6 R. l8 i0 ^% D1 K
    (c)模型讨论8 _( Z7 r) u) P
    研究在随机结合的情况下,隐性患者的变化是很有意思的,但随机结合导致了非线 性化问题,超出了本章范围,然而用其它技巧,在随机结合的情况下可以把(24)式改写为
    ) R0 C% v4 {. v# P$ i
    1 ^& X$ C: U' b( F% B* H$ E8 O5 w) @  N- L- p6 I8 b

    6 I8 F& M$ p" L* x7 K下面给出数值的例子: 某地区有 10%的黑人是镰状网性贫血症隐性患者,如果控制结合,根据(24)式 可知下一代(大约 27 年)的隐性患者将减少到 5%;如果随机结合,根据(25)式, 可以预言下一代人中有 9.5%是隐性患者,并且可计算出大约每出生 400 个黑人孩子, 其中有一个是显性患者。' G; x, U3 [. F- _9 G4 l  A3 ^! c
    , u) p6 N$ d% ~, I, W: }9 K
    3   X − 链遗传模型" Z; O0 w* Y4 d) ^/ u" }
    X − 链遗传是指雄性具有一个基因 A 或a ,雌性具有两个基因 AA,或 Aa ,或 aa 。 其遗传规律是雄性后代以相等概率得到母体两个基因中的一个,雌性后代从父体中得到 一个基因,并从母体的两个基因中等可能地得到一个。下面,研究与 X − 链遗传有关 的近亲繁殖过程。
    7 @3 g! N1 I( s/ A: ^
    0 e$ n. ^& p& p2 u/ ]# e(a)假设
    & N  e5 H3 F! l3 Z* i0 _(i)从一对雌雄结合开始,在它们的后代中,任选雌雄各一个成配偶,然后在它 们产生的后代中任选两个结成配偶。如此继续下去。
    + h0 d, C3 S' R) u
    3 u) H" S/ K  \) A6 [(ii)父体与母体的基因型组成同胞对,同胞对的形式有 (A, AA) , (A, Aa) , (A,aa) , (a, AA) ,(a, Aa) ,(a,aa) 六种。初始一对雌雄的同胞对,是这六种类型 中的任一种,其后代的基因型如下表所示。5 O, N) T/ m+ H( T' @9 c7 E( p% x* C

    & {: ^, x! t- {+ u& j, O8 U8 K. X
    , h. T1 B( w4 P0 e6 C: W
    1 _$ t# A" r  p, r4 R
    2 ~' k: n$ R4 J+ ^8 e9 }/ x" b3 R7 R6 j2 _/ o+ F! c! l
    3 E1 A+ {/ f/ @9 i
    - |9 X4 ^; Z4 P# ]7 s6 R& z
    ; K8 I, _! P. x7 D. s. L: }
    编写如下 Matlab 程序:9 h7 N0 g% j( N. ?/ h7 |( F2 l( s

    / G' l9 T# w: esyms n a0 b0 c0 d0 e0 f0
      f: a; U) c: Z$ d4 nM=[1 1/4 0 0 0 0;0 1/4 0 1 1/4 0;0 0 0 0 1/4 0;
    1 I7 j; U/ z- M( o- D) B 0 1/4 0 0 0 0;0 1/4 1 0 1/4 0;0 0 0 0 1/4 1];
    3 Y2 \+ u! Q! }: v- A# k7 k8 TM=sym(M);4 p( k1 V3 |# A: o4 f0 Z- X8 l$ ?
    [p,lamda]=eig(M);
    7 l4 M+ q( y! c; N& p% e1 fx=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0;d0;e0;f0];5 h' K/ @# ~; c, @# T- k& f8 O
    x=simple(x)
    # \2 s1 M  P7 A& S: X
    9 F2 Y0 y% q; O2 G. ~) J2 U9 `) `由上述程序计算结果可以看出
    2 X3 H* @, X; M2 y& K! M
    7 E, V. n" Z+ Z9 t/ k2 U+ n$ D8 i" t4 }# L+ k( H$ ?

    2 f4 i+ |4 g! ]: o习 题
    4 n1 v6 t, {9 x3 o- }' Q0 [1. (汉诺塔问题)n 个大小不同的圆盘依其半径大小依次套在桩 A 上,大的在下, 小的在上。现要将此 n 个盘移到空桩 B 或C 上,但要求一次只能移动一个盘且移动过 程中,始终保持大盘在下,小盘在上。移动过程中桩 A 也可利用。设移动 n 个盘的次 数为  ,试建立关于  的差分方程,并求  的通项公式。. N! Q+ e( ]" [, a0 X

    # m9 u- d2 N" N  t6 c2 z4 ]* T2. 设第一月初有雌雄各一的一对小兔。假定两月后长成成兔,同时(即第三月) 开始每月初产雌雄各一的一对小兔,新增小兔也按此规律繁殖。设第n 月末共有  对 兔子,试建立关于  的差分方程,并求  的通项公式。
    " \) t+ F' |) x" ~9 S- c+ b) k6 c  j3 Y- r
    3. 在常染色体遗传的问题中,假设植物总是和基因型是 Aa 的植物结合。求在第n 代中,基因型为 AA, Aa 和 aa 的植物的百分率,并求当 n 趋于无穷大时,基因型分布 的极限。 3 V$ ~; K4 P& @, e9 U( }

    ) [- [: \% Z' B7 `3 I
    & o2 ]1 B9 f- Q0 h( f/ n# g
    : H7 ^0 ?1 }( R1 h; w+ A
    ( V5 ]7 M& x8 H) X, w————————————————2 y" @* c8 P! T) d% d3 k+ L. R
    版权声明:本文为CSDN博主「wamg潇潇」的原创文章,遵循CC 4.0 BY-SA版权协议,转载请附上原文出处链接及本声明。
    5 F/ z+ [6 S+ T! N8 @3 u原文链接:https://blog.csdn.net/qq_29831163/article/details/89646596( L/ T5 U7 W7 M0 U

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