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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录

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    [LV.7]常住居民III

    自我介绍
    数学中国浅夏
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    1#
    发表于 2021-11-24 16:50 |只看该作者 |倒序浏览
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                                                                【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录0 J& i6 A( p* ]: D2 I/ ?7 o- ^
    书籍:《R语言与数据挖掘》
    0 }# U- C# w& T& @6 ~* P0 k2 F6 T* p#(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat- ~; v2 a2 V1 g7 p# [3 g- o) ^, b
    library(reshape); S$ M# Y. N% X  r: P  R6 T
    CO22 h! ~+ f) ]1 c! K# ^
    CO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat"))7 x; `; R% `# t. |) n  [

    - y# h+ f! x+ h0 y#(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行
    " l- @' G5 @9 r. Y+ C7 x2 D& t$ W> anyNA(CO2)& p0 F& s8 ^) r) _2 o
    [1] FALSE
    ! W; u* B" G% p" G) j#检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]
    0 B5 R' B8 u" P( U5 v6 ?4 d4 N$ M1 U# J) U$ j: P. O2 e) J
    #(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)+ \; Y/ s# b; Q" d! w
    #篇幅问题删除部分输出数据
    4 k$ f# m) d. i% f* w: i, y> sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小8 \7 s- D+ O' Z* _6 S) N2 t
    [1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.7
    ! F" a$ o! M7 }9 y$ _0 P, g[13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.49 Z4 r* P" X0 {- [- h
    [25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.17 f1 Q# l- W8 `2 V
    [37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2) d9 x2 D9 w: F/ w$ o
    [49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.9
    0 @6 ?& \. o" U/ c2 ?) ]6 {% K> sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)
    * b% a$ c$ i4 F [1]  7.7  9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.6
    : I1 n1 u' O+ R2 T3 S2 K[13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.1
    / `8 v4 p) Y" K- K; z9 k9 G0 [" \[25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.80 L! M; {; N# E; f
    [37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.95 r5 @9 v" F5 [0 Y0 K( d
    [49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.3
    5 n) h5 L+ c. h
    5 n. `, E/ Q/ c9 j6 ?> CO2[order(CO2$uptake),]3 }9 e" c' V4 M  F0 @! V6 l! L
       Plant        Type      Treat conc uptake& k, ~4 E# T  Z8 h5 T; S  ]
    71   Mc2 Mississippi    chilled   95    7.7
    4 `: E1 |2 q0 W* l. Z* [6 b29   Qc2      Quebec    chilled   95    9.3
    0 ~& w3 h8 Y6 l7 r64   Mc1 Mississippi    chilled   95   10.55 a3 [5 I. k4 `8 Q
    43   Mn1 Mississippi nonchilled   95   10.6
    ) y! J- y! @/ b1 E, E7 }6 X78   Mc3 Mississippi    chilled   95   10.6
    9 L$ ]3 @' ?& I! E1 I& y2 `! [57   Mn3 Mississippi nonchilled   95   11.3( z( s. P, G  H% A
    5 t' F; L# V1 U' U; \* s
    > CO2[order(-CO2$uptake),]
    - l8 H0 o1 c; n. r) Q- j   Plant        Type      Treat conc uptake
    3 g# ^! \, Z! H) R21   Qn3      Quebec nonchilled 1000   45.5
    1 v7 C* V/ w' c14   Qn2      Quebec nonchilled 1000   44.3
    9 F; S1 n& p1 G20   Qn3      Quebec nonchilled  675   43.9
    $ k3 ~3 J' M2 N2 ^- m19   Qn3      Quebec nonchilled  500   42.9
    ! j4 x) s# i9 N) y3 c35   Qc2      Quebec    chilled 1000   42.4! k# A; W( ]& f2 [% t

    8 \5 _7 P4 ], s5 Q  N#(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:4* p4 p! ]: l' ?9 i4 {
    n <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4))( ]% ?: N( n& D* _7 r$ L4 E+ c9 @
    (sample1 <- CO2[n == 1,])
    : Z8 j2 i; Z* Y(sample2 <- CO2[n == 2,])
    - G3 A  l2 V9 I# C' a& O/ ?0 J! Q0 p0 F0 N: O
    #(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值
    7 B; x) ?/ c3 t; Ttapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)
    / N( R0 ?( l2 j% D- o! P: J; f' t$ M: U/ k0 J- P& d& D+ U# v
    #(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值  c3 u7 u1 d- f8 a5 o
    aggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)! l! i' b+ u' e2 u* _  e

    % `. ^& x' T% [8 d9 }- ^/ e#(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值$ y" M, m& g+ y1 j1 |: L
    lapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean)# x& f5 G" d  l5 {2 ]

    9 e- Q4 ^: `# Z* D% V; `0 y' {#(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中/ }) r4 B4 r/ G7 I. m: g5 s( t% ~
    Plant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)
    - O5 Z0 ?' K* p0 i: gPlant_Qn  J% ~1 ^! w& i3 Z! J' j" T
    2 k! s* x8 D( N# L
    #(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“- g* b( `- f- h, h2 \9 j

    " Z* j* O, ~, y4 F! J9 m- `; @& C  o! I8 ~. f: J
    #编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度1 ^- c$ T6 m6 O0 |8 E% F. @8 x
    #生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……/ K% Y- P& e6 ~' H8 |" \
    gsub("[t]","t",CO2$Plant)1 I# d0 h; ?$ I) U( e# y7 R

    9 n9 k: }4 L; `$ k2 @4 Wlibrary(fBasics)' I3 L9 H! r3 v6 ?4 V* o& o. `
    stat <- function(x)
    2 p# q0 a0 [+ T! D( l5 m, \$ r{
    ! Y( L# Q) m) p* l" k& A  if(!is.numeric(x))
    - _4 W; T: U; A  {
    1 F- P7 ~3 N) g- O. B    stop("the input data must be numeric!\n")
    " X5 Z1 ^- W2 M* m+ U+ w  }- B- G; \0 J7 H9 K6 Q6 s- v6 L4 o
      if(length(x) == 1)8 C: V5 I# O6 V. j
      {
    6 f( q8 u5 H6 g7 j7 S0 _: d; `4 J    stop("can not compute sd for one number!\n")
    & C; K' k. |4 w% U  }
    % A, W% H3 B( B) Y% j  max1 <- max(x)/ d' I9 n: V0 O
      min1 <- min(x)
    - s' G# }$ c4 o7 A# J- a$ {; `! R  mean1 <- mean(x)
    5 `! M( ?$ ~; y2 S; d! K3 ^  skewness1 <- skewness(x)/ E, Y2 q+ s5 m/ l: i0 P
      kurtosis1 <- kurtosis(x)- R5 i2 I; F: [+ X" h7 g2 _) b
      answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1); L& V3 D5 j! @1 u' ^# G! I
      return(answer)
    7 |5 \+ E% O$ \* [; `3 X}3 D8 ~* g; }9 \# V  ^) }
    4 c" |+ v7 x$ s9 f
    t <- rt(100,2)6 ?2 M' }' p% _* O0 K
    stat(t)( ^% l6 P0 j0 X& }
    8 {7 A+ z5 T" l5 @

    5 G) S$ Q) V: w  F- }, C; L; b; k$ C; K3 B( @: b- |
    , m7 k! z2 U  y& ?9 e3 b
    zan
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