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TA的每日心情 | 开心 2023-7-31 10:17 |
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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录9 e; {$ B* @% E" l7 }+ S
书籍:《R语言与数据挖掘》
0 ?7 I8 e$ j+ z+ V% V#(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat
: a7 [% {# u5 R& w$ W! Blibrary(reshape)
+ J8 l+ o$ L( P2 A9 ICO21 U2 Y1 _5 S2 @2 s! D% S1 G
CO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat"))* _8 Y) H! |% R& A8 M
4 V# h3 q' d' \" U#(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行
8 t2 o2 c! b: }" G6 y> anyNA(CO2)9 d" Y6 S( Z* X ?- S- j
[1] FALSE
4 l4 i' ?; F; x/ m7 n3 k#检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]4 B4 E2 o: D7 E. X M; _8 [
- c) S/ t5 V9 z
#(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)
, ^0 Q1 R/ l6 s& c* y$ H#篇幅问题删除部分输出数据: Q5 M% h7 \+ S3 f1 k4 i
> sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小
- X( j+ `# @6 ~! z P/ m2 U [1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.71 j' J% Q, n$ |. Q1 M
[13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.4
7 J& w& [9 N( h' g+ [# m# K[25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.1. m$ s8 I8 U; g& c; j) K9 i
[37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2
' {6 _- i, R8 |. w$ T8 X[49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.9
8 K7 O. S- L% X2 N$ J4 t/ E+ v> sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)8 K. n$ s- {) m5 U, I
[1] 7.7 9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.6! H8 G5 t G" L6 q8 E) `2 C5 y2 n. Z
[13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.1
1 Y7 j8 X9 f) {0 Z" L[25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.8) g2 ]) M0 ]1 G# B
[37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.9$ a2 ^, t8 B+ g; T
[49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.3
* k7 q: D' {5 J/ Z- |& M2 y
5 d& T5 d$ u7 R' U; ^3 B> CO2[order(CO2$uptake),]
1 l* g) V$ ~1 V; Z3 h Plant Type Treat conc uptake. p2 l8 ?& |6 q" _$ d% A0 [- e1 n7 q
71 Mc2 Mississippi chilled 95 7.7& I% b4 ]7 O% }, t5 _- `) c( S D
29 Qc2 Quebec chilled 95 9.3
8 E4 Y. @, U. F64 Mc1 Mississippi chilled 95 10.5
7 y* L5 q6 P# e: d43 Mn1 Mississippi nonchilled 95 10.6
: Q5 m* \0 {- u4 S78 Mc3 Mississippi chilled 95 10.6
9 l) H7 `& P9 {5 W57 Mn3 Mississippi nonchilled 95 11.3) q, y4 o& ?! U) W2 R
. B* }! d( Z3 S% P: ^! `: [3 _
> CO2[order(-CO2$uptake),]
r Y+ \7 l. P Plant Type Treat conc uptake( S$ k6 B6 Y- \8 u
21 Qn3 Quebec nonchilled 1000 45.5
" A% Q; U2 c# Z1 P14 Qn2 Quebec nonchilled 1000 44.3) K3 X) Z% b6 p) U! D# Z: }
20 Qn3 Quebec nonchilled 675 43.9& o6 c+ I3 o0 f
19 Qn3 Quebec nonchilled 500 42.9
. O0 ^# d' S* j& U35 Qc2 Quebec chilled 1000 42.4+ G$ F; Q, F' S6 w# q
' r; h g! Q" ?) O$ K8 G#(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:4% x+ r# O8 C* G! K
n <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4))9 A( `5 P. l: a9 s- x( B
(sample1 <- CO2[n == 1,])
) |& u6 D3 p8 @3 x(sample2 <- CO2[n == 2,])
; u; I2 ]2 D3 u1 ~- S; g
$ t/ O$ L# w8 |1 d4 X#(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值
9 L' Z2 U( ^" [; Z' ]8 B& X% ctapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)
& T/ ?) ^2 r. A+ b$ O4 e
, p3 V5 E9 P9 |7 N+ c" U#(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值3 ]% q7 ~" J2 u) [+ y* i. Q& L! i
aggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)$ Q, t2 }7 g5 j# j" ~
: |3 K4 i. G5 E+ R( a; V! h
#(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值
, F2 G4 Q& Y- d. \lapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean)
/ E! R8 i4 ]! B$ q% ^% f1 l: E5 o' q8 K2 z% g. ?" e$ f* D; S
#(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中
8 Y) K5 v3 |; J* o4 F: B$ lPlant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)
7 w, P: s3 ?, S9 L$ J v& A$ M, oPlant_Qn' H6 q2 m* F, L+ b+ k+ {4 J
1 l' B0 g& N' D; } z8 t
#(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“
" ]# X- j3 b4 T# c' ]' s6 W7 H0 O$ @4 ~; p6 k8 Y9 O ~( ~3 r+ m
R; e1 y& Q' ?$ P#编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度
; n% E1 V3 d* f#生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……: ~* _5 r7 ~ {. v5 j: I5 v4 I
gsub("[t]","t",CO2$Plant)
+ B u# j4 ?* [1 b
- o+ Z3 v& R8 }1 y! }# glibrary(fBasics)& q7 Z: R9 k% ^& m& G: H4 j( `" _
stat <- function(x)7 N x5 e' b4 |3 ^5 e1 z$ O$ o
{8 R( I' |* N$ V `; K C
if(!is.numeric(x)), ]+ j% s, a9 S7 e2 B
{; s' L; O7 B: U3 v. O7 Y7 G1 Q! M
stop("the input data must be numeric!\n")7 [ P- `5 r7 q Y8 r1 T8 m9 d
}
2 E" [/ N) ~" U, s. N* ]2 i# V3 W if(length(x) == 1)
1 I! P: @* |* D: X% I {: Q+ c" ?; P; G. }+ O3 S- O7 v
stop("can not compute sd for one number!\n")% a U# \. U& P
}) h4 m2 k: Y* q2 k3 p$ V1 p* X' {
max1 <- max(x)( g6 @3 [% ?5 @, \/ M! d
min1 <- min(x)3 D3 i2 i% E8 n4 t* ~$ I- N' H5 E
mean1 <- mean(x)8 t {" i& @5 G) p( ~
skewness1 <- skewness(x)
! T2 G. x! f% l$ S9 c9 f: j5 ` kurtosis1 <- kurtosis(x)
# _! B# J( R9 c- _, [ answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)# P( c3 R8 Z, f7 k
return(answer)" _" Z7 Z, p9 |: F
}
; s) c' g) r% P& x$ n
3 E& E; D- v. ]: z4 o' N. Jt <- rt(100,2)
: u" h7 d: ?* W8 @; g* z. Qstat(t)
( D! {, O: [+ [ ]3 d
4 h5 D( Y$ O- D- f6 ` o0 {0 h" [/ Z0 C9 r/ `
5 K- n$ W# F( [
" Q0 j+ r' h$ E |
zan
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