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TA的每日心情 | 开心 2023-7-31 10:17 |
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签到天数: 198 天 [LV.7]常住居民III
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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录( v5 X1 G# x5 @$ }
书籍:《R语言与数据挖掘》/ S b" W- n4 c0 [2 o, m5 N
#(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat
( G# Z" }6 b( D/ ? ], E1 hlibrary(reshape)
: N" K( W2 Z0 v$ S& E K6 e8 G& }CO2
1 H$ U) k2 |* S/ \8 M9 W: ]7 P# P' q6 gCO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat"))
6 [8 B* S+ P& c& X. L5 D* G! g4 I) B8 F
#(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行( }4 Y# o. t- q' g3 R- Q6 w- Y
> anyNA(CO2)
3 Y2 ?2 I' w+ d) c- ^& f[1] FALSE" Z' B% ?( q6 p' b5 C% T
#检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]' U% ]* r T$ p0 k
3 N" L4 L* Q9 x1 Z% A. @; R#(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)2 K( c/ y" N' y7 p
#篇幅问题删除部分输出数据- f- s! P" r" U6 e3 g3 O F1 m
> sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小) e, C3 s8 }" G
[1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.7/ M2 @- M; ~' @- G M0 @5 Q- p2 A
[13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.4
4 w8 Y/ ]8 n: V! o/ ~% ]+ A5 X$ E[25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.1
D2 @" k4 x3 W[37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2
: w. \& N5 M7 q# m: ~[49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.9& ^ a8 r$ [. u
> sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)
. |3 R& x; \1 h [1] 7.7 9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.6
$ |* y3 d) \0 |[13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.14 U# i6 \! ~3 z( \9 @
[25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.8& D0 k+ {# i* Z( A- ^" v: L# p& p8 g
[37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.9
; F: E9 p+ _- x. E- ^) ~[49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.34 V2 ^% \3 a4 l) G) `* p' [
4 p# T! S+ W8 M# Y% O
> CO2[order(CO2$uptake),]4 H1 _4 p$ q, p0 ^5 R
Plant Type Treat conc uptake
& h7 p3 N9 ]. a8 c+ [+ t- M71 Mc2 Mississippi chilled 95 7.7/ O* E" H4 T: z
29 Qc2 Quebec chilled 95 9.3
- p7 m- b6 ?7 K! W1 O5 E* R% z64 Mc1 Mississippi chilled 95 10.54 v" P- |" H( K* O: ~- _5 Z! E, A
43 Mn1 Mississippi nonchilled 95 10.6
5 z* W: V5 d" k% w78 Mc3 Mississippi chilled 95 10.64 g9 H; s( l) t
57 Mn3 Mississippi nonchilled 95 11.3$ `0 t8 b3 i, b. [+ }
! S( r; t7 t" z4 i) @' H4 ^6 o
> CO2[order(-CO2$uptake),]
% ^: K/ R) u3 \ Plant Type Treat conc uptake( ]. s6 {( |3 ?5 F: a4 h/ k. M9 c
21 Qn3 Quebec nonchilled 1000 45.56 ~5 K: r5 C5 I# S! J& }! Y
14 Qn2 Quebec nonchilled 1000 44.3+ i) q5 V' G7 q9 E( h2 v: d6 m& z
20 Qn3 Quebec nonchilled 675 43.9
$ `+ Z' Q$ l1 M$ t! f19 Qn3 Quebec nonchilled 500 42.9* z2 @& ~) k/ s1 s6 V3 Z
35 Qc2 Quebec chilled 1000 42.4! e, S% T" J3 l: w8 m
1 i$ T8 }: |, o( e' G, E' c+ Y' ~#(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:4# m# W% q( ]; j* V4 X: J
n <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4))7 Q$ R) _; P% ]/ I) }2 h9 K
(sample1 <- CO2[n == 1,])1 w$ [% y. `& y* e
(sample2 <- CO2[n == 2,])) @# f! g3 V6 ~" h! S
" u+ B, P: B6 m; z" {: i6 y* s
#(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值6 ~* J3 @; w9 E& q
tapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)
( C: d# s7 J, i8 Q; F+ c" z5 r" m4 p1 \* O
#(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值
; H0 A0 y8 O) r$ Naggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)4 k2 ~, p$ D' t' M. ~
8 l( R- F! P/ d
#(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值8 c, @, C6 u h3 q! I7 e
lapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean), q8 p; P" W* t% W8 c
- N2 ]5 J) W% J& v: z2 m0 ~3 k" Y#(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中+ R$ y5 P- X; u9 Q
Plant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)
- v |/ q: d& d# }Plant_Qn1 ^0 Q. t# G) a: h6 T$ O4 w. \
( \: e' J# s& N3 [ F6 h5 C
#(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“ G" ^2 u5 d/ M0 l1 n: g- e+ y3 C, ?
4 T+ F; Z! A1 p8 ?
4 R+ c6 E& ~4 G4 g% [' l
#编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度
) U+ {1 E4 K! b* z#生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……3 E. M _+ O. z. W2 a3 d- ^
gsub("[t]","t",CO2$Plant)$ D) F5 ^7 l6 Z r4 N# l) s5 X
7 m4 S; X$ H8 ?library(fBasics)
7 p! f4 b) i! W) E4 Q- [stat <- function(x)$ I6 `6 d" A- c8 E
{8 S) G2 h5 C. J, [+ G
if(!is.numeric(x))
0 m0 X9 K6 ]6 o* k9 h8 i% u {! X ^8 }5 p8 `1 d$ _8 {
stop("the input data must be numeric!\n")
8 h3 ^- |/ |/ c }3 f3 ?. S( z s
if(length(x) == 1); w' @& Z$ s5 D. y' ?
{, h% W6 o" A$ l" T
stop("can not compute sd for one number!\n") R+ |# _2 [2 D* @" t7 i
}; ^$ x0 Q' n4 E: h# ?
max1 <- max(x)
5 ?2 a5 w9 b# Y) B9 x% K' e6 g4 V min1 <- min(x)% H, j5 S I# O
mean1 <- mean(x)
5 B" [# o) x8 A) e& s# X. i skewness1 <- skewness(x)
[( U7 m0 M8 b% z kurtosis1 <- kurtosis(x)4 u5 N3 i) i; _; @7 i j% ?
answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)
& X7 g! x7 S' k% z: s6 ~7 W% [ return(answer)
+ w4 ^9 o# [. L/ L* J: v}
/ T2 S5 L k4 Q- W
5 A% D. `2 n W1 r; E; f% Ut <- rt(100,2)
6 |) Q8 Z( J# ]; ]5 _7 O, ?4 n' Rstat(t)
6 y2 V/ l( H5 Y
8 P/ T5 Z+ r' k1 I u- t8 P
; k- t8 |2 q0 Z8 I, E# ~9 E, }6 j9 G' F. N. K, }
t8 `$ ]$ c6 o. z
|
zan
|