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主成分分析(PCA)进行特征提取

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发表于 2023-8-20 17:19 |只看该作者 |倒序浏览
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这段代码实现了主成分分析(PCA)的数据得分计算和特征向量提取。下面是代码的解释:- u. e0 J! F% O: V
8 ~; a" f( @9 T2 p' k( s, l& E. X
1.函数定义:, O0 e1 ?' T5 @" v" R3 \- d

; c) e% w  U& |4 w* k* k2 Z5 s  E9 m8 ?6 X# |; f$ K
2.函数名为PCA,接受两个输入参数:raw_data(原始数据)和T(保留率),并返回新数据。
# ?/ v$ e5 t2 u; Q9 s5 C) `  @( y; A. W5 q$ ?+ n* o

6 h; L, A2 q& j9 {, \+ J7 x8 w+ [3.数据读取与标准化:9 r2 V9 A2 p) l6 l2 T2 Y

( B/ q1 e& m  p! `* W. q6 P6 O
+ V( A9 i" h# R7 q4.将原始数据raw_data赋值给变量A。* I! S0 z% i% C1 b
5.获取数据矩阵的尺寸,其中a表示行数,b表示列数。7 ^+ y  |2 H0 l6 B
6.创建一个与原始数据大小相同的零矩阵SA。0 S; y% Y- N7 h
7.使用循环将数据按列进行放置,并进行标准化(归一化),即将每列数据减去该列的均值,再除以该列的标准差。
1 g+ i4 {( n5 u6 y* E3 v3 c, ^$ o
( |/ S/ o% C" i  E8 g0 V3 p3 K
! D& y( A. w! W: e$ u3 |8.求解相关系数:
" I6 Y) }6 k4 T4 Q; H8 ~% x1 Q/ U: g
  f* ?( P6 d6 u. Q) u$ x$ x7 `& Z6 ^  G
9.使用corrcoef函数计算归一化后的数据矩阵SA的相关系数矩阵CM。! Z  z& ^' A0 _& w# b3 R% P
! P  b7 O: l9 w
- E; I" h* P) O+ U5 V1 ~4 c
10.计算特征值和特征向量:* f* A+ @  [. {2 d: _1 s

# i  A2 A( R# U
4 @  I. ~3 ~- i! K* w. c11.使用eig函数对相关系数矩阵CM进行特征值分解,得到特征向量矩阵V和特征值矩阵D。9 z: V8 \- H9 K7 U

' G* O- i' ]" d& w
0 Y; J# c# \( Q% Q  Y1 j7 f12.提取特征值和计算贡献率:
0 {  r# R( d/ p
% K% O  a# {2 d
% F% a& i; z2 H" d! l( S4 }: z13.创建一个零矩阵DS,其大小为b x 3,其中b为特征值矩阵D的列数。
- t: Y) u$ B1 z/ p14.将特征值矩阵D的对角线元素(特征值)赋值给DS的第一列。, D: B6 _0 x# a% T
15.对DS按照第一列的值进行从大到小排序。
0 s4 ~3 l8 A- @4 M: e& ]16.计算特征值的贡献率,将特征值除以所有特征值的和,并将结果赋值给DS的第二列。# w$ {( g3 j$ K) y* n# o$ @! n
17.计算特征值的累计贡献率,对贡献率列进行累加,并将结果赋值给DS的第三列。5 b' W- @3 Q  c8 D" j8 i; D2 l

3 L# [: c; _7 ^- w* \' z" r) q
& |% @7 ?6 g. ?18.确定保留主成分的数量:: ^" ]  Y: e5 B6 h4 y9 P& r
8 G( ~. O% X: r! V5 N( p. C
6 R" m1 U+ _  D! ~* @% y* d0 S
19.找到累计贡献率大于等于设定的保留率T的索引位置。
% Z- j( L  L+ m20.提取第一个满足条件的索引(最小的保留主成分数量)并赋值给变量Com_num。
! j3 B3 v9 {* F* u# ~5 x- p' S* Q8 m+ p* z5 q9 Z
# m( A# b6 q! m. z3 d/ S, A
21.提取主成分对应的特征向量:4 c) E* a# n* T* g2 X& p

7 R  A- T+ }: R8 o
+ I6 _2 \" |: Q6 b0 P  U( W% {$ `- _22.将特征向量矩阵V的最后Com_num列反转(从最后一列开始取),得到主成分对应的特征向量矩阵PV。, H$ c8 c$ {$ t. j" d% _

2 k$ G, k+ w- c
6 l3 m3 D% T; M3 w. U23.计算在主成分上的数据得分:
' F9 b+ R2 {4 V2 f, t5 @' Q4 D4 m1 h' r3 f) }2 Q

; O6 q) T$ H0 ^! L2 e* u& D24.将归一化后的数据矩阵SA与主成分特征向量矩阵PV相乘,得到在主成分上的数据得分矩阵data。
0 V4 K* \& v7 \$ Z: E7 e  Q2 y- b" A9 L5 l: }: _0 b- v3 P
该函数的作用是对原始数据进行主成分分析,并返回在主成分上的数据得分矩阵。主成分分析用于降维和数据探索,它将原始数据转换为一组新的线性维度,其中每个维度都是原始数据维度的线性组合。这些新的维度(主成分)根据特征值的贡献率进行排序,保留贡献率较高的主成分。
& A9 A% |8 r8 e6 V- }1 e  ]0 H! F. F" S/ @- {, S+ d
# t; `' ^8 g4 v) R! r* U
- h8 s7 F- c8 O9 W5 m" W

7 V1 S9 ^  M; U5 d& T8 T1 ~9 A. c; u( y" ?3 j, ]$ W. T" a

PCA.m

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