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python 解决主成分分析 pca

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发表于 2024-3-21 11:03 |只看该作者 |倒序浏览
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主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)是一种常用的降维技术和数据预处理方法,它通过线性变换将高维数据映射到低维空间中,以找到数据中的主要特征。
' J5 i7 o1 z: U1 d: q* b6 W主成分分析的基本思想是将原始数据投影到一个新的坐标系中,使得投影后的数据具有最大的方差。这些新的坐标轴被称为主成分,而每个主成分都是原始特征的线性组合。主成分按照其所解释的方差贡献程度进行排序,最重要的主成分排在前面。, l3 C/ a& G: q$ @
主成分分析的步骤如下:! U4 v2 X+ k4 z3 N/ _

/ v2 R- m5 E1 h# u) G1.标准化数据:将原始数据进行标准化处理,使得每个特征的均值为0,方差为1。这样可以避免某些特征由于量级差异造成的影响。
  ~/ D% m8 a8 I4 N" m2.计算协方差矩阵:根据标准化后的数据计算协方差矩阵。协方差矩阵描述了不同特征之间的相关性。! F2 D/ ~; ^: b+ H" v
3.计算特征值和特征向量:对协方差矩阵进行特征值分解,得到特征值和对应的特征向量。特征值表示每个主成分所解释的方差,特征向量表示各个主成分的方向。0 F* w4 w0 o. ^3 u7 I( U
4.选择主成分:根据特征值的大小选择要保留的主成分的数量。通常选择保留累计贡献率较高的主成分。; u1 Z2 p' t9 [* |9 m* F# A! Q
5.数据转换:将原始数据投影到选定的主成分上,得到降维后的数据。2 O& J7 s9 s2 r& K. h

5 F! Z' x% c& q9 Q) D主成分分析的主要应用包括降维、可视化、特征提取和去除数据中的噪音。通过降低数据的维度,主成分分析可以简化数据集并去除冗余信息,从而提高后续分析的效率和准确性。  b, D5 ~* ]/ b4 N" J$ K
+ S4 o- V$ ^& F$ K
逐行解释代码的含义:* U6 C; F! s* v* r* j) `
import numpy as np
3 i  m0 X6 q7 v; E$ yimport pandas as pd
2 o2 q' S- ~9 r& sfrom sklearn.decomposition import PCA
! F- C4 s9 T4 J4 u8 Y5 c7 G( ?. f$ f: G
这些是导入所需的库。numpy用于数值计算,pandas用于数据处理,sklearn.decomposition中的PCA用于主成分分析。. E5 M# ^# n$ p/ T( l( u' Y0 x
df = pd.DataFrame({* d0 E: w7 T# }
    'x1': [149.5, 162.5, 162.7, 162.2, 156.5],: S" j0 `9 {+ ?# j1 d0 J
    'x2': [69.5, 77, 78.5, 87.5, 74.5],
, n3 G" @6 C7 I: `$ f+ @    'x3': [38.5, 55.5, 50.8, 65.5, 49]
0 c: ^' I' {' ~' g; r8 f( H, M1 p})5 s$ E( h  O2 `3 \" z6 A
2 t" q' B- V+ g/ X* \$ L5 ?
这里创建了一个数据帧df,包含了3个变量 x1、x2、x3 的观测值。数据集中每一列代表一个变量,每一行代表一个观测值。2 R  X1 t9 w& H
model = PCA().fit(np.array(df))" y/ r; n8 l$ A" f- O, f
( Q' G% L) ?3 A" s9 Z
这行代码创建了一个PCA对象,并使用fit方法拟合数据。fit方法将数据df作为输入,并根据数据计算主成分分析模型。
* Q* d. k* a9 @1 L" ^3 b6 _print('特征值:', model.explained_variance_)
) t$ ~4 y4 b& hprint('贡献率:', model.explained_variance_ratio_)" z0 Z7 Z  p7 [. M
print('各主成分的系数:', model.components_)& o/ K" R8 m0 b+ c2 ?$ {$ ^

# z& m* s& f5 s* [4 `/ c这几行代码分别打印了主成分分析模型的三个重要属性:0 v* ?2 s" M; v/ w  h2 K$ f" q1 X
% A, k1 q  V' s- y' o: H
1.explained_variance_:特征值,表示每个主成分的方差。
( i! O3 O6 f+ A. ^; a2.explained_variance_ratio_:贡献率,表示每个主成分的方差占总方差的比例。  F. }3 E3 j/ @4 \
3.components_:各主成分的系数,表示每个主成分在原始变量空间中的权重。
/ @. I! O2 P; g  F. j) p. I
* |7 Z. l2 q. Y( |7 S1 F. Gpca_df = pd.DataFrame(model.transform(np.array(df))), c( M% J: i7 ?8 j
pca_df.columns = ['F1', 'F2', 'F3']
  u6 N/ h8 |" n; P: apca_df/ L! h! M7 W1 i6 r

6 J( P! l8 ~8 F$ H  W7 t这几行代码使用model.transform方法将原始数据进行主成分转换,并将结果存储到一个新的数据帧pca_df中。pca_df包含三个列,分别命名为'F1'、'F2'、'F3',分别表示三个主成分的值。+ j' A6 K: i! ~) \
希望这个逐行解释对你有帮助!如果你还有其他问题,请随时提问。
) g$ ^2 N, h1 X5 H( d  P+ J, d# @, _, Q4 X& i
' _/ A+ v4 h6 {& u

29.pca.py

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