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python 解决主成分分析 pca

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发表于 2024-3-21 11:03 |只看该作者 |倒序浏览
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主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)是一种常用的降维技术和数据预处理方法,它通过线性变换将高维数据映射到低维空间中,以找到数据中的主要特征。+ ]. ]1 s! o3 x% X$ I8 \
主成分分析的基本思想是将原始数据投影到一个新的坐标系中,使得投影后的数据具有最大的方差。这些新的坐标轴被称为主成分,而每个主成分都是原始特征的线性组合。主成分按照其所解释的方差贡献程度进行排序,最重要的主成分排在前面。
: V8 s( Q. Q+ h: s' x, u, X主成分分析的步骤如下:
" R) m6 {* x) R' w) ^- F/ p3 |7 A! j7 \+ F: b. A: y
1.标准化数据:将原始数据进行标准化处理,使得每个特征的均值为0,方差为1。这样可以避免某些特征由于量级差异造成的影响。: [& g0 F$ `% t
2.计算协方差矩阵:根据标准化后的数据计算协方差矩阵。协方差矩阵描述了不同特征之间的相关性。
1 T9 k0 q$ P; ]7 m) b0 h) V6 R3.计算特征值和特征向量:对协方差矩阵进行特征值分解,得到特征值和对应的特征向量。特征值表示每个主成分所解释的方差,特征向量表示各个主成分的方向。
8 B4 c0 V$ a: y& C: R7 u) S4.选择主成分:根据特征值的大小选择要保留的主成分的数量。通常选择保留累计贡献率较高的主成分。
/ @. z* R& p+ U5.数据转换:将原始数据投影到选定的主成分上,得到降维后的数据。8 h9 ^4 g$ F6 `% h; C: ?
7 w1 v# G! g. h
主成分分析的主要应用包括降维、可视化、特征提取和去除数据中的噪音。通过降低数据的维度,主成分分析可以简化数据集并去除冗余信息,从而提高后续分析的效率和准确性。- @: a1 A2 t1 i" r- S
8 e  W; i5 @/ E
逐行解释代码的含义:7 w2 r( l- y7 v& J8 ^, M9 |" `
import numpy as np
4 ~9 j% M9 e0 @8 x  M9 i: |1 Dimport pandas as pd+ J3 y0 Y# A1 w8 m: |
from sklearn.decomposition import PCA
( `/ L! x6 q. |$ V, M$ n
# m& |, M: U  z% j- I) C7 E这些是导入所需的库。numpy用于数值计算,pandas用于数据处理,sklearn.decomposition中的PCA用于主成分分析。+ Y0 j& s5 S* M7 C, }% `
df = pd.DataFrame({
2 d% H' R2 z3 ~: L( h6 T1 h3 l    'x1': [149.5, 162.5, 162.7, 162.2, 156.5],! b2 {7 w- b8 l$ U$ F
    'x2': [69.5, 77, 78.5, 87.5, 74.5],5 X# B! ?2 V) d2 \1 A" S$ d, \
    'x3': [38.5, 55.5, 50.8, 65.5, 49]+ j( B- \( M4 L5 C
})
" [8 k; U( @( a& F+ I/ e1 Z4 a% r; S8 e  W# ~
这里创建了一个数据帧df,包含了3个变量 x1、x2、x3 的观测值。数据集中每一列代表一个变量,每一行代表一个观测值。3 Q& F# |3 d) h0 B4 C" e  ?
model = PCA().fit(np.array(df))
* G/ m5 @7 n4 P& g- l  u4 q  K+ I0 g' g; J; a) J; X: S/ _0 d( e) |/ p
这行代码创建了一个PCA对象,并使用fit方法拟合数据。fit方法将数据df作为输入,并根据数据计算主成分分析模型。
& m: _! {; D& S% iprint('特征值:', model.explained_variance_)# H  i" _9 a3 Q* p4 x% f0 S0 Y
print('贡献率:', model.explained_variance_ratio_)
: V  B2 k/ Z* N% r% k& iprint('各主成分的系数:', model.components_), T3 }0 [* P4 M/ n. S

! _7 d# u7 c+ e) `; \# [4 R这几行代码分别打印了主成分分析模型的三个重要属性:4 S! l$ }9 g1 y5 k

4 H6 K6 Y- N0 R- B# E/ b# k1.explained_variance_:特征值,表示每个主成分的方差。
/ f2 O& ]& b( \. W; C& ^& k$ e2.explained_variance_ratio_:贡献率,表示每个主成分的方差占总方差的比例。
6 k  j, Z& y' R. h) l* Z: d7 ^+ }3.components_:各主成分的系数,表示每个主成分在原始变量空间中的权重。* c( [6 b( V0 X2 [7 G

. a+ v  g7 e8 r! r: gpca_df = pd.DataFrame(model.transform(np.array(df)))
! A( Z$ n! B" {" }; ppca_df.columns = ['F1', 'F2', 'F3']
4 \/ ~% v% }2 O; v# P- \pca_df$ y3 Q: y) A) C2 c, ?* `0 Z  k' u

' \" D' f5 o7 M这几行代码使用model.transform方法将原始数据进行主成分转换,并将结果存储到一个新的数据帧pca_df中。pca_df包含三个列,分别命名为'F1'、'F2'、'F3',分别表示三个主成分的值。! G$ E! Z" i+ I3 L9 a
希望这个逐行解释对你有帮助!如果你还有其他问题,请随时提问。* D+ ?4 {1 f6 w6 Z- u$ a
& R/ y% [4 r4 h4 t- Y
3 p6 C2 E+ A) e1 p! P9 ^2 J

29.pca.py

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