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数学中国总编辑
TA的每日心情 | 衰 2016-11-18 10:46 |
|---|
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群组: 2011年第一期数学建模 群组: 第一期sas基础实训课堂 群组: 第二届数模基础实训 群组: 2012第二期MCM/ICM优秀 群组: MCM优秀论文解析专题 |
2#
发表于 2011-1-31 15:08
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- 偏最小二乘法的Matlab源码# X$ m0 _1 |! z# ?$ X
- 所谓偏最小二乘法,就是指在做基于最小二乘法的线性回归分析之前,对数据集进行主成分分析降维
( H1 f% k( D! H/ m @5 o - function [y5,e1,e2]=PLS(X,Y,x,y,p,q)
3 w: T\" z/ Z3 g: I - %% 偏最小二乘回归的通用程序+ v\" O( A8 y9 I' ^
- % 注释以“基于近红外光谱分析的汽油组分建模”为例,但本程序的适用范围绝不仅限于此
0 K8 n\" J0 v\" n2 F; F8 _+ w - %% 输入参数列表0 f `+ O5 p0 _) B
- % X 校正集光谱矩阵,n×k的矩阵,n个样本,k个波长9 t/ i4 G c4 C r1 B6 S9 l
- % Y 校正集浓度矩阵,n×m的矩阵,n个样本,m个组分
, `1 b2 ~# E6 ?$ A# o, _( i0 E - % x 验证集光谱矩阵0 @7 _( ]7 u8 h9 u8 Z6 e
- % y 验证集浓度矩阵
7 n3 Y\" ?/ _2 b1 p! B! I8 x) C- a - % p X的主成分的个数,最佳取值需由其它方法确定6 Q- \. ?; @/ \# ~* z
- % q Y的主成分的个数,最佳取值需由其它方法确定
! t$ n7 d: O* }' `1 g; R0 d - %% 输出参数列表
# f9 @* Z- w% q, \' z+ K( ^ - % y5 x对应的预测值(y为真实值)
0 \# d. B2 C' R6 c; Q - % e1 预测绝对误差,定义为e1=y5-y% w' H0 k6 Q0 p4 e- x8 u; L
- % e2 预测相对误差,定义为e2=|(y5-y)/y|
t! W3 o7 Z! o, P. k' M) S* g -
5 f+ f\" P# X8 |% \' E/ V& h8 F+ X - %% 第一步:对X,x,Y,y进行归一化处理
5 S8 I) u$ O+ K, R; K - [n,k]=size(X);! U0 v% F5 y9 V% x6 i# L4 @
- m=size(Y,2);
?4 j6 D: G6 ]/ u4 M! q# M - Xx=[X;x];\" P. p) d/ ?; B; V, _ M7 a
- Yy=[Y;y];
\" o2 v. t/ y\" U3 j+ U5 s2 c - xmin=zeros(1,k); t$ \* D6 \+ g2 o( g# z: `
- xmax=zeros(1,k);
' t% R9 u3 V4 S - for j=1:k7 r4 D0 r; W4 W
- xmin(j)=min(Xx(:,j));
2 R% W* j* [- `' _7 Q+ ^ - xmax(j)=max(Xx(:,j));) M( l. \ B0 H- S! p6 F% s
- Xx(:,j)=(Xx(:,j)-xmin(j))/(xmax(j)-xmin(j));5 L5 @ y% h7 k
- end. h8 `3 {. b' l\" {; \) Y
- ymin=zeros(1,m);
; o% {$ D4 C# I& n# C - ymax=zeros(1,m);2 q9 y/ q7 q, G6 b E( C6 A- B
- for j=1:m6 J% I' a/ A% X! w) @$ d8 X: M
- ymin(j)=min(Yy(:,j));& _* q# b/ v# X\" y6 W
- ymax(j)=max(Yy(:,j));' d9 G7 k! j; i2 c
- Yy(:,j)=(Yy(:,j)-ymin(j))/(ymax(j)-ymin(j));1 i$ j. H/ G+ ]9 b# `
- end
\" g, l4 @) f0 ?( n; h2 Z' K - X1=Xx(1:n,:);; L& w) g1 g! N0 S' J
- x1=Xx((n+1):end,:);
2 K3 H9 `! C: p+ s - Y1=Yy(1:n,:);8 o5 F; M+ _1 y3 F1 n
- y1=Yy((n+1):end,:);2 S2 D8 j, `5 f* r% m
- 7 e1 @3 t6 U6 g& G% r5 |
- %% 第二步:分别提取X1和Y1的p和q个主成分,并将X1,x1,Y1,y1映射到主成分空间 Q0 C' [1 Q- m9 o
- [CX,SX,LX]=princomp(X1);\" _, A, O& o1 E3 X& I2 b2 j
- [CY,SY,LY]=princomp(Y1);
& S+ S0 s8 s9 e; O( ]9 g4 C - CX=CX(:,1:p);' F+ P\" n- J' \
- CY=CY(:,1:q);7 }2 j0 x$ a\" k9 ~, L6 _9 F3 X
- X2=X1*CX;
# O* l& U) c# e: a' e - Y2=Y1*CY;
% E1 c, ?+ B/ l% F - x2=x1*CX;
e& F+ |. D' l% I& e - y2=y1*CY;
' f3 Q- ?9 Z' S j1 C7 p' o- x\" ? - \" F1 \: V, W% C
- %% 第三步:对X2和Y2进行线性回归
4 B$ X, z' v7 x9 ?' W\" _1 O - B=regress(Y2,X2,0.05);%第三个输入参数是显著水平,可以调整, B: i5 p) n' `1 l
-
5 C5 Q* L) F/ X8 W4 ?9 G& V - %% 第四步:将x2带入模型得到预测值y3
8 _9 s+ q: c: b( r ]) Y# ^6 l - y3=x2*B;/ T4 F5 U0 ]: b0 I. B$ q
-
0 V\" P\" |- l- P9 V, E# J1 g - %% 第五步:将y3进行“反主成分变换”得到y4
\" k! ^; }* r$ \\" f: `3 g, @4 e - y4=y3*pinv(CY);1 F/ p6 C% ~5 d8 f$ a. g: x
-
+ S7 m9 E4 ^ |1 a - %% 第六步:将y4反归一化得到y5
0 m% B3 g2 A- t6 N0 Q/ K3 s - for j=1:m, B F# ^3 `- Z% O, v
- y5(:,j)=(ymax(j)-ymin(j))*y4(:,j)+ymin(j);
( n4 v( }# D8 l) G+ Z* c( _ - end
: Q4 y' `& T: I1 ~, f7 `; { -
2 y/ `8 z7 q* |: l$ E- ? - %% 第七步:计算误差
% }7 X6 O9 Y2 b \6 w - e1=y5-y;
' U& o1 _, a' x: c1 R( p( _$ C& b - e2=abs((y5-y)./y);. j/ j\" ]- Z, C
- 9 `( t& t2 j4 S' Y
- function [MD,ERROR,PRESS,SECV,SEC]=ExtraSim1(X,Y). i0 \\" M! |8 R
- %% 基于PLS方法的进一步仿真分析3 G, Z( _/ O# D' V# t% `
- %% 功能一:计算MD值,以便于发现奇异样本
) A w2 M- j6 z( f( Q7 `9 t\" Y - %% 功能二:计算各种p取值情况下的ERROR,PRESS,SECV,SEC值,以确定最佳输入变量个数
, e, u+ T5 b0 m: _ - %%( }\" J4 |, x& K9 u: v( o
- [n,k]=size(X);
: }: O+ F$ ?% S$ i6 N6 ?8 O. u) ? - m=size(Y,2);; ~& m2 O# Q9 R# t% Q$ H, S
- pmax=n-1;+ f5 ^1 p* ~8 W% f* ]
- q=m; G5 V B/ v7 v\" l
- ERROR=zeros(1,pmax);
# q8 R6 Q( A& o( D - PRESS=zeros(1,pmax);0 A. K# y) `3 t
- SECV=zeros(1,pmax);8 I: r9 E4 y, M) S. H1 u6 W0 L\" b
- SEC=zeros(1,pmax);
9 V: }7 a- O) v - XX=X;8 ?5 K6 a% r) h
- YY=Y;
# K$ s/ V4 p* S& r' t0 D! o - N=size(XX,1);
1 Z& }4 [: {: }& o6 V) c - for p=1:pmax+ d# \ J+ W' y
- disp(p);
6 B/ N0 O1 n- R6 J0 ~7 E - Err1=zeros(1,N);%绝对误差2 f# O' }6 A& S# ^9 O* m2 v
- Err2=zeros(1,N);%相对误差
4 M# v$ ~1 J M' ~% X8 b - for i=1:N+ n! O9 U$ T Q+ H- U) D
- disp(i);* q& g) v$ o( W$ X# q+ P9 P6 u
- if i==1
, ?3 ]- `3 w6 u$ e* [2 N, B. ] - x=XX(1,:);5 x) b6 ], Q$ |) {9 s\" D; h
- y=YY(1,:);
! Y6 O3 b' X, D% d ^! w - X=XX(2:N,:);
) T( S: X. u6 } - Y=YY(2:N,:);3 x; J% T2 `& n; @\" z
- elseif i==N# \; O) n1 _3 w e! o9 u
- x=XX(N,:);7 L- A& S# Y) n2 s4 T
- y=YY(N,:);
. i) N, j4 F* ^# O4 G9 R - X=XX(1:(N-1),:);$ B& Q1 I5 I7 K. g3 K
- Y=YY(1:(N-1),:);
$ B2 z7 O# v: C$ R# I0 V } - else' y: b8 k$ O2 D1 R
- x=XX(i,:);
/ {) V+ I6 _! X. ] - y=YY(i,:);5 j% j7 X8 d' k
- X=[XX(1:(i-1),:);XX((i+1):N,:)];+ U* F9 I0 D; {\" Z2 M
- Y=[YY(1:(i-1),:);YY((i+1):N,:)];
1 w( [. I) ^) K+ q' M - end
8 ?+ X0 S- b+ f+ H# u$ C - [y5,e1,e2]=PLS(X,Y,x,y,p,q);) ~* s! m3 r X- E\" g& n( l
- Err1(i)=e1;
% D% v- a4 x W - Err2(i)=e2;
' P% y; Z. e% E+ ^0 I/ P2 H - end) G& m$ m+ Q3 n# N) K6 B1 R& t# @+ {1 b
- ERROR(p)=sum(Err2)/N;
# z* j& @. Q/ f2 V% `( e' n: C - PRESS(p)=sum(Err1.^2);
6 R\" y- r. r' v/ F! k - SECV(p)=sqrt(PRESS(p)/n);
* F: h1 R) b0 W\" }# y - SEC(p)=sqrt(PRESS(p)/(n-p));
3 O' V0 O1 c5 I- k& ^7 a: {9 M - end
8 C$ r/ Y( a+ K' K - %%
1 a: Q+ P/ k# g+ A1 s - [CX,SX,LX]=princomp(X);3 w9 b ]$ n5 P( u/ T( c
- S=SX(:,1:p);, F$ e2 m0 }( y7 p4 J( Y
- MD=zeros(1,n);
' v+ w* C\" W( u - for j=1:n* r, d( x2 l8 b2 U; Y) e
- s=S(j,:);
7 p+ H3 f3 W' ~: l - MD(j)=(s')*(inv(S'*S))*(s);
; c0 r) w# m s5 T) |- g - end
) _2 \! }- N w. e# S9 M/ |
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" `; t) N0 `4 p |
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