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数学中国总编辑
TA的每日心情 | 衰 2016-11-18 10:46 |
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群组: 2011年第一期数学建模 群组: 第一期sas基础实训课堂 群组: 第二届数模基础实训 群组: 2012第二期MCM/ICM优秀 群组: MCM优秀论文解析专题 |
2#
发表于 2011-1-31 15:08
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- 偏最小二乘法的Matlab源码
0 O9 F2 m' a' ~$ S$ o) w/ r+ g - 所谓偏最小二乘法,就是指在做基于最小二乘法的线性回归分析之前,对数据集进行主成分分析降维
1 z\" {5 P) S5 t+ t) `# f - function [y5,e1,e2]=PLS(X,Y,x,y,p,q)0 x1 c# I# C$ K- @( J% @
- %% 偏最小二乘回归的通用程序
+ J3 ]4 v+ n8 ~4 B: j0 J- s* Z- U9 c - % 注释以“基于近红外光谱分析的汽油组分建模”为例,但本程序的适用范围绝不仅限于此3 }, }5 k2 n+ S1 E! c, j' e
- %% 输入参数列表
1 z3 A; \( ^+ R! }& G' h - % X 校正集光谱矩阵,n×k的矩阵,n个样本,k个波长
$ c+ Z, x9 N! j( r2 i# c3 M - % Y 校正集浓度矩阵,n×m的矩阵,n个样本,m个组分\" [; ^6 Z- u, U1 s8 h9 R) P( a& ~5 K$ ~+ C7 M
- % x 验证集光谱矩阵
# y- d+ v$ ?# A$ h; `7 a+ b5 j - % y 验证集浓度矩阵* R8 T5 G% u8 n2 G- g\" X
- % p X的主成分的个数,最佳取值需由其它方法确定; {3 c: X! @* e; A2 R! x
- % q Y的主成分的个数,最佳取值需由其它方法确定
/ V. z( e$ | E2 E - %% 输出参数列表! Z; M' x+ R9 ^; i) H3 m, ]: ?
- % y5 x对应的预测值(y为真实值)\" _1 L: H. d9 J# p- D# S
- % e1 预测绝对误差,定义为e1=y5-y
5 c2 c- S4 I7 _. A: d7 i, g - % e2 预测相对误差,定义为e2=|(y5-y)/y|
9 y1 b/ O! i d5 T0 ~0 i$ ?1 \ - / z* m1 Y' n9 @
- %% 第一步:对X,x,Y,y进行归一化处理
: R/ `6 B& h6 O$ U9 Y# F - [n,k]=size(X);
- s6 t& u3 _. D- }5 [) C: J - m=size(Y,2);
0 P4 B% A) ^/ K0 _ - Xx=[X;x];7 ~4 K# i+ B ?% M k
- Yy=[Y;y];
( X3 o; H1 Z% S( ]1 Y% A - xmin=zeros(1,k);
1 @' r( L0 X/ V! A5 H+ A4 v - xmax=zeros(1,k);
5 k; v\" N( R! d |$ T1 Q - for j=1:k
/ m3 a8 w2 i4 w! H- Q6 V\" J - xmin(j)=min(Xx(:,j));; X; s; |: B8 _% I
- xmax(j)=max(Xx(:,j));0 _\" e\" Y8 u3 Q4 ]7 C
- Xx(:,j)=(Xx(:,j)-xmin(j))/(xmax(j)-xmin(j));
2 b6 a7 w$ f9 } - end1 I! H% ^' s9 p7 T2 ~& C
- ymin=zeros(1,m);
5 ^5 I$ n8 H5 q' m( l5 Q- F8 n - ymax=zeros(1,m);
5 O# ^/ v\" o& k$ M# Q ?0 I - for j=1:m
$ L4 I ^4 |' }- m\" H J: r: u - ymin(j)=min(Yy(:,j));
8 j- h/ G9 W6 p+ E P0 a - ymax(j)=max(Yy(:,j));- H$ v5 a; [: p V1 y, r
- Yy(:,j)=(Yy(:,j)-ymin(j))/(ymax(j)-ymin(j));
7 x\" ^8 [% \' k8 j9 s. o - end
0 E* T# {+ A+ V$ b4 {' b# ` - X1=Xx(1:n,:);
% K5 F8 a$ V. n - x1=Xx((n+1):end,:);
1 I' s, T2 K# | - Y1=Yy(1:n,:);2 b7 z v& U7 K# {: M5 W: a5 N) Y
- y1=Yy((n+1):end,:);
7 L, T* G1 C9 w9 N2 @+ P -
0 E* u' u% |5 L/ g- J W. M! l - %% 第二步:分别提取X1和Y1的p和q个主成分,并将X1,x1,Y1,y1映射到主成分空间. q, d8 A- b! L: {9 X. l
- [CX,SX,LX]=princomp(X1);' f: |4 C j* r
- [CY,SY,LY]=princomp(Y1);
8 q8 }& U- J$ M l m - CX=CX(:,1:p);% `& ?, U\" r2 h9 g
- CY=CY(:,1:q);8 S p& s3 s) A2 j- F( z+ d) k
- X2=X1*CX;
7 ?\" I\" a' g6 x& n$ D Q7 |8 j M - Y2=Y1*CY;3 b% K; z( O+ S D/ `
- x2=x1*CX;
7 h$ N3 t7 Z3 D0 j - y2=y1*CY;4 W& F\" ]- a& d( Z0 N8 @
-
/ t\" ^7 a$ G+ u3 }8 t/ r$ d2 [ - %% 第三步:对X2和Y2进行线性回归
/ q3 K; {\" P/ e\" R7 c+ M6 c3 W - B=regress(Y2,X2,0.05);%第三个输入参数是显著水平,可以调整
; i; f- y# b( w$ t* k -
x$ e# w7 c$ h2 r# `, ~5 | - %% 第四步:将x2带入模型得到预测值y30 C1 [2 K* X J9 M5 K; D0 n
- y3=x2*B; r0 ]! x m$ x
- & B+ D6 T5 _ N2 l4 O
- %% 第五步:将y3进行“反主成分变换”得到y4* R$ t( f1 T/ _5 Z$ k! u$ w
- y4=y3*pinv(CY);( d5 J9 [& i: {! K# x
- 4 v7 i' h- L) @( N k: {
- %% 第六步:将y4反归一化得到y5& [+ h7 [# B' E8 C! M
- for j=1:m\" n. C: _$ n* M# k a\" W/ ^
- y5(:,j)=(ymax(j)-ymin(j))*y4(:,j)+ymin(j);/ [* S4 Z. r* X\" d& C1 y
- end( e7 B9 r! k! T2 T; u. L
-
9 J: `9 w' H5 M: S# j - %% 第七步:计算误差
1 ^\" y; Y; t3 M- \: U7 i\" }( G0 ?# k - e1=y5-y;
\" c\" u. u\" h8 F2 ^ - e2=abs((y5-y)./y);
: K9 J+ e5 }# M6 R -
7 O9 O. h$ e# I) U - function [MD,ERROR,PRESS,SECV,SEC]=ExtraSim1(X,Y)
1 ~2 l7 t2 Z2 C$ _\" g - %% 基于PLS方法的进一步仿真分析
6 t+ z$ _9 Y1 d: l - %% 功能一:计算MD值,以便于发现奇异样本
8 _$ g% e+ c5 W7 j7 j; Y - %% 功能二:计算各种p取值情况下的ERROR,PRESS,SECV,SEC值,以确定最佳输入变量个数/ V\" _. {% R\" j, R
- %%2 J9 k; Z2 F' b% d
- [n,k]=size(X);; l6 M( ~# O8 x' X5 z# v
- m=size(Y,2);4 g) p# @2 I, O5 E
- pmax=n-1;
/ [1 C2 z: E* v, Q: J# | - q=m;
$ W9 c5 \- Y t+ @\" R6 o5 X - ERROR=zeros(1,pmax);
3 K5 |1 x! S- |- J/ h9 @ - PRESS=zeros(1,pmax);5 `/ ?: N. X, P l
- SECV=zeros(1,pmax);
' _. D( |% L+ t U7 z# |' k& T - SEC=zeros(1,pmax);
% C* y4 M* W1 q; y! Q' ?( ~$ R, I - XX=X;
( R8 ^3 o% h9 i( r) R - YY=Y;
; m* y' K; }2 a) t4 e' ~6 { - N=size(XX,1);
3 c: R, A; l\" n$ ^ - for p=1:pmax/ n\" v. u5 }5 r4 _6 s' R
- disp(p);\" S: c' c\" P4 x9 [
- Err1=zeros(1,N);%绝对误差
6 ?; m7 o9 d6 L% G4 P( Z - Err2=zeros(1,N);%相对误差
6 L! L# J' x- n( t+ x0 o - for i=1:N
. Y1 {4 S) W5 P - disp(i);+ V* U+ c- p- ^* D( y: |- g7 E
- if i==1
4 Q5 P3 p( R- q6 ? - x=XX(1,:);9 u0 M\" [. D. d; G
- y=YY(1,:);: y& o- H! e, v- G
- X=XX(2:N,:);
7 d* U0 w; a& O' Y- { - Y=YY(2:N,:);$ r: t8 d1 p% T+ V- h
- elseif i==N. I, @; T+ u* J2 u2 X D
- x=XX(N,:);+ w\" l0 x1 l- l* ?, S; c
- y=YY(N,:);
: U) P$ \, ^2 U+ E- T+ L - X=XX(1:(N-1),:);
z% |/ v5 l# F - Y=YY(1:(N-1),:);- H# v- M/ }# D- _! K* @( G5 Y
- else. H% f8 j& P7 \\" j8 X& k
- x=XX(i,:);
' N0 E& j8 v& F9 _ - y=YY(i,:);% Z7 O! y9 m i: V- |/ ]% I, }) @( g8 o
- X=[XX(1:(i-1),:);XX((i+1):N,:)];
9 D, B5 i' B1 v) F - Y=[YY(1:(i-1),:);YY((i+1):N,:)];+ F. Y4 e3 Q\" P! i' u# P
- end9 a* d* s7 k1 j( N8 J# M
- [y5,e1,e2]=PLS(X,Y,x,y,p,q);8 t x3 i+ n2 |: f7 _
- Err1(i)=e1;
C! b) P# d/ F; i- G* p - Err2(i)=e2;% ]- D: U3 x0 Z
- end$ f+ c6 y4 x& h+ k8 f: ^
- ERROR(p)=sum(Err2)/N;
\" G9 ~. x8 \* b |! x$ Z' a$ c - PRESS(p)=sum(Err1.^2);# x! W4 _$ R+ f
- SECV(p)=sqrt(PRESS(p)/n);: f\" n( X8 Q( A
- SEC(p)=sqrt(PRESS(p)/(n-p));
# d3 ?; D( @; ^% F6 l4 ^8 L5 P) i - end
, V( j9 Y6 Q, ^/ V: r\" j - %%! r) y) c0 p% M& b\" V
- [CX,SX,LX]=princomp(X);% s# o8 E% J% n
- S=SX(:,1:p);
& m9 W8 [0 v9 B& O, h. P( K P - MD=zeros(1,n);
. r4 q, D2 {: O& X: c' k& Q; c7 h; o - for j=1:n
' T- K* [/ m* p) C# s$ o9 Z - s=S(j,:);% H1 M _% M+ r+ E5 e% c% D/ I' v( T
- MD(j)=(s')*(inv(S'*S))*(s);
e0 F9 l5 m$ u! p. N* @ - end; Z; w+ B U! _2 I' g, p
复制代码 [9 \4 e( Y2 W" Z, o. i
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