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【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录

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    [LV.7]常住居民III

    自我介绍
    数学中国浅夏
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    1#
    发表于 2021-11-24 16:50 |只看该作者 |倒序浏览
    |招呼Ta 关注Ta
                                                                【R】《R语言与数据挖掘》第三章上机记录" G+ N) k& X# m" w0 ]0 ^
    书籍:《R语言与数据挖掘》
    * y7 Y6 n* d2 [0 W# e; X#(1)查看数据集中CO2的变量名称,并将Treatment的名称更改为Treat
    * g9 ?+ B' W/ ^6 y: ~4 klibrary(reshape)
    ! {, u) W8 ~/ xCO2
    3 |" p, T5 J1 }' e+ ?& ~CO2 <- rename(CO2,c(Treatment = "Treat"))
    , x* r( e% E& q$ x2 k1 a/ t1 {5 |" l2 @/ Q9 o0 l: e8 u
    #(2)检验CO2中是否存在缺失值,若有,检测缺失值的位置并删除含有缺失值的行
    1 A5 y0 p+ G- X> anyNA(CO2)
    # ?, G: I( W; t, ?0 s; `$ V[1] FALSE
    : ?! ]% C1 X5 k& z7 k4 b! Z% I1 D#检测所在行:complete.case(CO2) 删除:CO2[comeplete.case(CO2),]( U+ W6 _. d  i2 ]1 w$ ~9 p
    8 p( c7 c, f; ^; a
    #(3)对变量utake按从小到大和从大到小排序,并对数据集CO2按照uptake排序(从大到小和从小到大)- P: Q5 c3 W( r' l" ]3 R) {
    #篇幅问题删除部分输出数据
    / m. r4 c9 [7 i7 l8 M& A> sort(CO2$uptake,decreasing = TRUE) #从大到小
    9 [( Q1 h7 a/ ?4 H# x' D [1] 45.5 44.3 43.9 42.9 42.4 42.1 41.8 41.4 41.4 40.6 40.3 39.7
    ) v9 H1 q1 D0 h. e9 m  I[13] 39.6 39.2 38.9 38.8 38.7 38.6 38.1 37.5 37.2 37.1 35.5 35.4
    / T1 Y& w/ t1 P9 Q[25] 35.3 35.0 34.8 34.6 34.0 32.5 32.4 32.4 32.4 31.8 31.5 31.1
    " J( t( P: q8 O1 i! i7 {2 c[37] 30.9 30.6 30.4 30.3 30.0 28.5 28.1 27.9 27.8 27.3 27.3 26.2
    9 z2 W% k5 G1 [8 k! q[49] 25.8 24.1 22.2 22.0 21.9 21.0 19.9 19.5 19.4 19.2 18.9 18.9
    * e. }& n7 o; a+ W( _/ K, }4 D7 ?> sort(CO2$uptake,decreasing = FALSE)
    2 X7 @1 \, D# b4 r3 f* ? [1]  7.7  9.3 10.5 10.6 10.6 11.3 11.4 12.0 12.3 12.5 13.0 13.6, G7 x2 p: C- d1 q% S2 u
    [13] 13.7 14.2 14.4 14.9 15.1 16.0 16.2 17.9 17.9 17.9 18.0 18.1
    , M9 }  x+ i. F' W[25] 18.9 18.9 19.2 19.4 19.5 19.9 21.0 21.9 22.0 22.2 24.1 25.8
    3 @5 M4 `9 W7 G+ p, P7 p/ r[37] 26.2 27.3 27.3 27.8 27.9 28.1 28.5 30.0 30.3 30.4 30.6 30.9
    . g0 P; F* @: C9 Z/ a[49] 31.1 31.5 31.8 32.4 32.4 32.4 32.5 34.0 34.6 34.8 35.0 35.3
    / C. t+ L; o! q: c$ ~5 E+ q. G- f. z* J! \" ?' m
    > CO2[order(CO2$uptake),]
    4 g3 Q3 L" f/ y1 I   Plant        Type      Treat conc uptake& j# I' L) l8 h
    71   Mc2 Mississippi    chilled   95    7.7: P7 K6 E; C( |+ A
    29   Qc2      Quebec    chilled   95    9.3- [8 h6 W/ P2 x# E  u
    64   Mc1 Mississippi    chilled   95   10.5
    * j; Q: u9 \, a+ W: `& [0 e43   Mn1 Mississippi nonchilled   95   10.6
    0 s. z, F5 E9 l! N* `; C4 T78   Mc3 Mississippi    chilled   95   10.6
    # l+ f4 O# [9 H5 H. v5 K$ f7 ?57   Mn3 Mississippi nonchilled   95   11.3' h9 `  s2 p0 F9 S' _' @0 _5 b, Q* Q
    - G: F& N. X  ?" Y) J) ~$ S0 L  m
    > CO2[order(-CO2$uptake),]. E$ b0 C5 D; d$ g5 L0 i
       Plant        Type      Treat conc uptake) Z" O, P1 S: y4 x4 i0 q/ x0 J
    21   Qn3      Quebec nonchilled 1000   45.5
    1 \; j4 @: z" {( K3 T/ u14   Qn2      Quebec nonchilled 1000   44.38 q' ~& [8 ]5 p1 L
    20   Qn3      Quebec nonchilled  675   43.92 Q# y: n+ H( c& F6 e$ y
    19   Qn3      Quebec nonchilled  500   42.9: g- C/ t, e2 ]5 K* y
    35   Qc2      Quebec    chilled 1000   42.4
    & k% V* v* F& b- H( i3 Q) M# [1 Q- s8 S) f% J/ }9 p
    #(4)将CO2随机分成两组数据,第一组和第二组比例为6:4! I/ v4 K) L5 s
    n <- sample(2,84,replace = TRUE,prob = c(0.6,0.4))
    ( r1 N( f, y7 V- u(sample1 <- CO2[n == 1,])$ f# m% x4 S! Y. A( _- ]' W
    (sample2 <- CO2[n == 2,]); T. A- I; Y1 y9 A' s: @/ N) W: `: T

    6 F3 G  c' P5 G/ g5 Q( z, E; q#(5)应用tapply()函数,计算不同植物(Plant)对应的uptake的平均值
    8 ^2 f$ ]( b7 ?. E- |4 Ytapply(CO2$uptake,CO2$Plant,mean)
    " K7 u( B+ F( e4 F
    % Z  y6 e# }# B; s( a* s#(6)应用aggegate()函数,计算不同植物(Plant)、不同类型(Type)对应的uptake的平均值! `5 y# g# D6 {+ S8 z3 Y& S
    aggregate(CO2$uptake,by = list(CO2$Plant,CO2$Type),FUN = mean)
    1 C7 f/ j5 E* D7 D( u5 u% |
    ( M/ Q! I1 i) Q#(7)应用lapply()函数,同时计算con和uptake的均值7 d# B2 L$ M3 Q
    lapply(c(CO2$conc,CO2$uptake),mean); |" |" C$ y/ i( g/ T, r
    $ k7 F+ a6 s6 h2 y9 L7 F1 m
    #(8)使用grep()函数,查找出植物名称(Plant)中含有”Qn“的行的位置,并将这些行储存于变量Plant_Qn中1 A8 c8 v( ?% a" {( |2 ]- ^
    Plant_Qn <- grep("Qn",CO2$Plant,fixed = FALSE)+ S( N/ `# E- D/ L3 F9 g
    Plant_Qn
    8 M& k% i, l1 Z* h; v" F: h1 j( T
    5 L2 a8 E. l( g#(9)使用gsub()函数,将CO2中植物名称(Plant)中的字符串”Qn“改为”QN“( H* @  N7 v1 i; d$ Z& X: s
    % k. c; O1 z# @1 y

      X& A% S) b& {9 e. w+ |0 s2 c#编写函数stat,函数同时计算均值、最大值、最小值、标准差、峰度、偏度
    ) f) @3 U/ x) r9 X#生成自由度为2的t分布的一百个随机数t,并通过stat函数计算……0 g, X6 T1 B( h5 r5 D1 E9 P
    gsub("[t]","t",CO2$Plant)0 {3 n! x' [" X' j. C4 }6 M
    / B5 V* [! k, P* w. E6 k
    library(fBasics)
    - q2 Y9 u; L. B3 ?5 `stat <- function(x). i! J0 s' i% T
    {2 @. Q+ g$ T  |1 f9 x5 g7 \! a
      if(!is.numeric(x))
    ) A7 K& j" I* S4 Q$ ~1 }  {
    3 Q3 B4 r" x) h: G0 W( r/ l    stop("the input data must be numeric!\n")
    0 `' {" d% D+ k1 m! U  }# @3 g8 {& j, g: T$ e
      if(length(x) == 1)( W1 d( N+ a) D' d; h
      {1 S' r1 |7 N; }( p6 K
        stop("can not compute sd for one number!\n")
    & G9 f  ?  x$ d4 |: E1 _+ B0 y. U  }
    ( V+ w$ N& g7 S0 i  f9 s  max1 <- max(x)
    + e! n2 P+ t. K, V3 W  min1 <- min(x)- p* r/ P3 q. T; t3 K, Y- z6 s
      mean1 <- mean(x)5 U) j( _; S) O" N. H/ [: J# P
      skewness1 <- skewness(x); F1 v- u9 e: W. _9 z. s5 o6 |
      kurtosis1 <- kurtosis(x): @/ f* x( o+ ~" {( e! P) _9 G. u
      answer <- c(max1,min1,mean1,skewness1,kurtosis1)
    : N& h, U% h/ y  return(answer)
    1 U" U  y. X4 `: y( _0 ^}
    : w6 e( P# h0 ]! q  m
    3 M) O5 q, ~2 Y6 a, \t <- rt(100,2)
    - y; u6 @/ }5 vstat(t)' T# z, g1 |- P* Z

    " G* l0 d' t. H2 W
    & F/ l" L; h  U1 B# B
    4 R6 Z! y0 B0 J8 P
    + f! M; t7 b, Z7 O8 k* `
    zan
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