2020-2021美赛/小美赛题型预测相关文献——基 于 全 基 因 组 序 列 的 新 型 冠 ...

杨利霞

2020-2021美赛/小美赛题型预测相关文献——基 于 全 基 因 组 序 列 的 新 型 冠 状 病 毒SARS ⁃Co V⁃2多算法进化树分析傅奇，庄峙厦，黄华斌，何少贵，肖玉娟

新型冠状病毒（SARS⁃Co V⁃2）作为一种 RNA 病毒，具有高突变率的特征，自新型冠状病毒肺炎（COVID⁃19
）发生以来，病毒基因组已出现了一定程度的突变，可以通过进化分析对其进行分类，以辅助分析病毒感染源。由于时间较短，总体突变率仍然较低，利用单一算法构建的进化树结构可靠性不高。本文用 Paup、Mr Bayes 和 MEGA 软件，通过不同算法构建进化树，对目前 Gen Bank 中所有的 SARS⁃Co V⁃2 基因组进行了分析。不同算法所得到的多
个进化树中，部分序列分支结构相同或相似，且相应的病毒宿主间可能存在交集，通过比较分析多个树之间的相似
结构，可为病毒的来源提供参考信息。随着病毒的进化和基因组数据库的不断积累，预计利用多算法构建进化树去
筛选相同分枝结构的方法的有效性将逐步提升，可作为感染源分析的参考方法之一。