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关于matlab代码矢量化的理解

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    [LV.1]初来乍到

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    1#
    发表于 2010-10-5 09:32 |只看该作者 |正序浏览
    |招呼Ta 关注Ta
    代码矢量化是matlab的精髓,其基本特点是运行速度快和代码简洁,它是如何实现的?
      I) e# {) @8 V3 x$ {7 x7 x: i+ c" C; p! ?  p1 [8 v% P1 j/ m; ]
    按我的理解,代码矢量化的本质就是设计专门的函数对数组元素集中运算,这样可提高运行速度,同时兼有代码简洁的特点。, y( w, f, v7 @! K
      r* O7 C4 [& m9 P  n- c  ^
    对matlab的理解比较肤浅,但也确实看不出有更深意义的东西,望解惑。
    , g3 l& w" T! }
    ' W! |5 Q/ l) F9 }. h2 m8 h大家有什么看法,愿畅所欲言。
    / I7 O$ @  g* O1 ?, V" f! c3 m3 B. O" x
    zan
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    参考:http://bbs.emath.ac.cn/thread-2709-1-1.html. L! X, s8 m8 o, _* I
    & z, o. J  o7 x! g0 V' G/ S1 D
    我在多个帖子中有不同说明,但将这些说明再集中到一个帖子中比较麻烦,大家相互参考一下,看能否把这个问题解决了。
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    [LV.1]初来乍到

    本帖最后由 forcal 于 2010-10-12 21:46 编辑 ; J) x) q( [% O3 a3 M

    . q9 M2 _$ j- F4 |+ w, Q1 w4 T我正在练手设计的FcMath库也打算以矩阵运算为基础,设计一些专门的函数对数组元素集中运算,运行效率确实有所提高(甚至有些涉及矩阵的算法比matlab还快),代码也简洁了,但不知这是不是矢量化?
    8 T- |5 @6 `8 b, O1 C2 C# b0 ~2 Y. F
    8 ^- Y1 q% T8 |9 W0 V' X6 T脚本运行效率应该取决于函数调度效率、对象管理效率和函数内部算法的实现。
    * t. z5 e/ A: J: J% o& q# G; C" F
    我感觉,matlab的函数调度效率较低,对象管理效率这个不好说,但一些函数内部的设计比较优秀。故有些Forcal代码比matlab快,而有些慢。
    ' V) u9 k  Z5 X6 p; r2 e0 }. p9 g  k- Y' t, W. A
    以下例子体现了Forcal和matlab的效率差别所在。- o3 W1 |& V! a! i6 ?! \

    ; }8 R7 c$ _. u3 m5 G% {4 }2 J: O% o' v这个matlab程序段是网友lin2009 给出的,理论结果是每个元素均为275000。
    1. clear all
      ! p8 K' `\" o; x- {  A5 _3 f( C
    2. clc+ |: ^6 K1 o. T( h+ t9 k
    3. tic
      / k, s# @0 G* ^
    4. k = zeros(5,5); % //生成5×5全0矩阵* N1 |& H( B. G! R5 q# x
    5. % 循环计算以下程序段1000 00次:
        }0 q1 v3 y7 Z2 s6 S
    6. for m = 1:1000 00
      2 d3 z2 q7 k) z
    7.     a = rand(5,7);( k\" u+ L) U$ r\" H' a
    8.     b = rand(7,5);%//生成5×7矩阵a,7×5矩阵b,用0~1之间的随机数初始化
        A0 U2 t, z8 M% F0 a9 |
    9.     k = k + a * b + a(1:5, 2:6) * b(2:6, 1:5) - a(:, 7) * b(3, :);' k  d- U6 R$ O+ C
    10. end- M' U# b  R, @- z+ u
    11. k  x, y# C9 s0 ~& z# c# @% \1 I) ?
    12. toc
    复制代码
    3 j! f$ O2 p& Z3 F% o3 Z  ]
    Forcal代码1:运行稍快的代码,比matlab约快10%吧?, A; [1 f9 U' s
    1. !using["math","sys"];
    2. , g# ?\\" T) D7 t! |0 s$ p) m9 o
    3. mvar:6 o$ ^5 \8 T* ^) z; B7 X
    4. t0=clock(),4 K( T- O7 q, [. W( B5 |1 n' {\\" H
    5. oo{k=zeros[5,5]},
    6. 6 g5 J8 j( L# _. {
    7. i=0,((i++)<100000).while{
    8. 0 K3 _+ p$ z* |! n& u* a! O3 |
    9.   oo{: A2 v, v2 v) p1 I. N
    10.     a=rand[5,7], b=rand[7,5],
    11. ; q5 }; B' R! c. Z8 a% K  v
    12.     k.oset[k+a*b+a.subg(0,4:1,5)*b.subg(1,5:0,4)-a.subg(neg:6)*b.subg(3:neg)]
    13. + T1 w. {+ J, s4 {$ y4 Q' N0 _
    14.   }0 V; J- n3 \& V' F
    15. },
    16. $ X5 b3 G- t) x( M  A
    17. k.outm(),( I- k& m; [7 h+ U; r& ^
    18. [clock()-t0]/1000;
    在我的电脑上运行时间为3.344秒。0 J# h7 n( Z. k  i
    / r( s) F. L7 x; [' X  K" y
    Forcal代码2:比较好看些的代码,似乎也比matlab稍快吧?# A# F5 }" ]3 m3 n* {
    1. !using["math","sys"];. ?0 I$ Z# {. M3 Y9 b( e! W! X
    2. (:t0,k,i,a,b)=* f. d7 R8 b\\" |- w' U
    3. {9 }. r- k! X2 |
    4.   t0=clock(),
    5. + |5 y3 x: T. `: L9 |
    6.   oo{k=zeros[5,5]},
    7. 7 E\\" G\\" t: v' }. K$ T
    8.   i=0,((i++)<100000).while{+ D  {1 K8 ^% S/ t6 Y& k  l
    9.     oo{- T/ w2 {; Q! A8 \( l
    10.       a=rand[5,7], b=rand[7,5],+ ]7 X4 m, M: k\\" }7 [
    11.       k.=k+a*b+a(0,4:1,5)*b(1,5:0,4)-a(neg:6)*b(3:neg)
    12. 0 K6 ?. r+ N5 i( o3 N
    13.     }
    14. $ c0 C\\" ?6 p5 [6 ]
    15.   },
    16. 9 U$ G1 d1 e* _* f$ v* }
    17.   k.outm(),$ p0 F: u. y\\" h: Y
    18.   [clock()-t0]/10005 V$ ^7 Z; R! f/ f% M% n' B9 H
    19. };
    在我的电脑上运行时间为3.579秒。
    + q0 r% g6 |- t+ l. G% e$ _8 K! `1 A! B2 N4 M/ [6 J! N
    例子2:
    - e% W- k% v. d; c一段程序的Forcal实现:
    7 D/ ?- b4 A  `" q) J
    1. //用C++代码描述为:: C5 p  l1 p9 E
    2. s=0.0;  
        M; Z0 o; I# U9 i. w) z
    3. for(x=0.0;x<=1.0;x=x+0.0011)  
      ) Y; }7 |1 L\" m$ U$ Y# \( g
    4. {8 j+ g, y. {* T9 a
    5.   for(y=1.0;y<=2.0;y=y+0.0009)
      7 m( M- g, j\" w3 q, ~0 K! K5 H: \
    6.   {
      & m9 R2 W7 `0 a( }4 E9 z. u
    7.   s=s+cos(1-sin(1.2*x^(y/2)+cos(1-sin(1.2*y^(x/2)))));  j) G% N, |( b1 s+ C
    8.   }; v( [( P% P* k. G
    9. }  
    复制代码
    结果:
    " R4 x" x$ }! @8 k; h1008606.64947441% h" M2 _. [4 C! J3 j$ }- W. S6 z
    0.609 //时间
    & E( W2 Y7 r" W
    , S! a8 M0 [8 A这个matlab程序段是网友yycs001给出的。2 t9 W9 g! V8 \9 m* ~. N1 t3 @' w5 T
    1. %file speedtest.m# o. V2 n9 z/ z6 x, K6 B
    2. function speedtest+ f: E' Z  U3 Z* Z4 c
    3. format long
      , i: R2 N% o% Z1 T2 T  G7 x
    4. tic9 T( Q* Z& Z\" z( m0 W
    5. [x,y]=meshgrid(0:0.0011:1,1:0.0009:2);3 N* ]* }' N; L
    6. s=sum(sum(cos(1-sin(1.2*x.^(y/2)+cos(1-sin(1.2*y.^(x/2)))))))0 Y  j5 \5 g2 {/ w2 g
    7. toc
    复制代码
    1 x  M; c8 \3 I7 H( H2 P+ k
    Forcal代码1:**数组求和函数Sum,完全矢量化的代码* O( W# i0 d" a9 M$ D
    1. !using["math","sys"];! v. ^4 C. H9 N
    2. mvar:
    3. \\" b  B. t4 K& H' D7 I
    4. t=clock(),! E6 i4 v. H! E1 x5 E, V& S! j& g3 F
    5. oo{( a# j. L# }$ g, w
    6.   ndgrid[linspacex(0,1,0.0011),linspacex(1,2,0.0009),&x,&y],
    7. / v8 _1 Z* A: R% F2 q% t
    8.   Sum[Cos(rn(1)-Sin(rn(1.2)*x^(y/rn(2))+Cos(rn(1)-Sin(rn(1.2)*y^(x/rn(2)))))),0]2 R% q, I' k  i6 o
    9. };0 H* s- C5 \- \( r
    10. [clock()-t]/1000;
    结果:
    : Y; B7 h) E0 g1008606.64947441
    ! F: N7 _. k: T7 A8 S$ n0.625 //时间
    0 _. X7 ~. x5 _9 z) K* v' L0 X4 K$ p1 I! q# o; `5 Y( v
    或者这个,与上面效率差别不大:
    ' ]4 }5 U" u" S3 L/ q$ I( [
    1. !using["math","sys"];
    2. ( \' n# X: j7 e5 _0 c& E/ R
    3. mvar:( D7 |# N0 O; O- l, ]$ d1 Y  U
    4. t=clock(),
    5. ( f- w! l( K. X( @1 `$ N\\" ?3 O1 W
    6. oo{
    7. + I2 }+ y0 s& [) Q+ Q
    8.   ndgrid[linspacex(0,1,0.0011),linspacex(1,2,0.0009),&x,&y],
    9. \\" m% I. g& g\\" ?8 K. [) n8 J
    10.   Sum[Sum[Cos(rn(1)-Sin(rn(1.2)*x^(y/rn(2))+Cos(rn(1)-Sin(rn(1.2)*y^(x/rn(2))))))]]
    11. , x. P7 L\\" |: M, f, C: ~3 w# C+ m
    12. };9 w, {: w* n6 u5 V) J1 \& K: F7 r& s5 B% L
    13. [clock()-t]/1000;

    ' p( G0 w9 ~- B6 _* s0 x' OForcal代码2:求和函数sum,非矢量化代码
      N& Y* ^  _+ S0 h) ^
    1. f(x,y)=cos(1-sin(1.2*x^(y/2)+cos(1-sin(1.2*y^(x/2))))); . k# j- ?: w. \! T7 i
    2. sum["f",0,1,0.0011,1,2,0.0009];
    复制代码
    结果:
    % `+ K9 Z/ H. y1 n, D( z9 L1008606.64947441
    " ]3 v, G8 ^* Y0.719 //时间% S+ s6 a7 x+ l5 \$ X

    $ e7 y9 y: u3 ]/ `5 @Forcal代码3:while循环
    6 ?% P& k; }4 l
    1. mvar:
      ; J( V- P\" w\" k1 O5 n
    2. t=sys::clock();9 L8 t- X7 P5 z, [3 P
    3. s=0,x=0,
      - P$ N$ d7 T\" L( W. N4 J% C
    4. while{x<=1,  //while循环算法; - j& ~8 @* ~0 s: T\" V
    5.    y=1, 7 r0 N$ T# o) \+ I
    6.    while{y<=2, 9 Z2 E1 _6 l5 L) \
    7.        s=s+cos(1-sin(1.2*x^(y/2)+cos(1-sin(1.2*y^(x/2))))), ' R4 ^6 }' H& h9 `3 E8 r
    8.        y=y+0.0009
      ' \7 L, N# O$ k1 H6 ~
    9.       }, ( a+ O\" Z1 b/ Q\" G- ?7 ~1 y! Y! I' O
    10.    x=x+0.0011
      8 l9 F% C5 Y% B! w' t
    11. }, ( p0 g4 g6 q, U! o' u9 M! q4 A
    12. s;8 G3 j9 M8 y# U9 H  U
    13. [sys::clock()-t]/1000;
    复制代码
    结果:
      ^" b; G. w' l8 Z. u8 A) u% F- L1008606.64947441
    ' g/ h" H, d$ R) w0.734 //时间' @7 ~: f. t# ]

    8 [5 P% ~( c5 V* U2 X, F) \大家可下载OpenFC进行测试:http://www.forcal.net/xiazai/forcal9/openfc32w.rar
    $ [8 X. s' M7 r! h8 V5 v, {8 b( @3 O
    ! Y; t# T. \# {1 [7 j. R注意Forcal的矢量化代码第一次运行有时效率较低。
    ; Y2 ?. j, e7 `, e1 H. r' g/ C- a7 _# D8 O+ l' ?1 o6 X* ]
    例子1中Forcal和matlab都是矢量化代码,但matlab跑不过Forcal。该例子的特点是函数调用频繁,临时变量生成多,但矩阵很小,矩阵的各种函数运行时耗时较少。故说明Forcal函数调用+变量管理效率优于matlab。6 ~. f  f5 g- u# w2 N, D

    , z9 O) g/ w) t3 Q/ d例子2中Forcal的矢量化代码是最快的,但与matlab的矢量化代码相比仍有差距。该例子的特点是函数调用少,临时变量也少,但矩阵大。故说明Forcal的各种矩阵函数Sin、Cos及矩阵的加减运算等函数的内部设计不及matlab。
    & f  ?4 Q' q& M, L# N8 t
    - o: f. V" I% z! q1 w8 {/ ]- P如能在函数内部设计上下点功夫,例子2超越matlab也是可能的。在这方面,期待高手们的指点。7 Y+ [6 W2 U( _& E- {( i/ j

    % _3 E3 M" _# h- c如果例子2速度也超越了matlab ,matlab矢量化的神秘面纱就揭开了。
    - q( E2 A  F+ [2 ^; a1 l8 g- G& v0 ~2 `1 f
    顺便说一下,例子1如果用C++的运算符重载来实现,速度将比Forcal慢一些,也就是说,在涉及运算符重载时,脚本的效率有时比C++还要高些。
    7 R! `; R, \' B: u0 }  i5 `
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