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关于matlab代码矢量化的理解

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    [LV.1]初来乍到

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    1#
    发表于 2010-10-5 09:32 |只看该作者 |正序浏览
    |招呼Ta 关注Ta
    代码矢量化是matlab的精髓,其基本特点是运行速度快和代码简洁,它是如何实现的?
    ' i/ M2 P- m( Z3 M3 [  s0 U) H4 M1 a, `! y8 T( G3 ~0 |
    按我的理解,代码矢量化的本质就是设计专门的函数对数组元素集中运算,这样可提高运行速度,同时兼有代码简洁的特点。
    5 e6 u& a, [, o+ R2 w( [$ ]- W
    6 o: k7 d$ u5 ~对matlab的理解比较肤浅,但也确实看不出有更深意义的东西,望解惑。- G2 g6 Y( X% a
    & u2 x! L& g2 m1 J9 Y" ~( v6 J
    大家有什么看法,愿畅所欲言。3 n' l+ v' s# F& R7 `1 M
    zan
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    参考:http://bbs.emath.ac.cn/thread-2709-1-1.html
      R4 l+ ~1 O+ l4 B
    6 ]' n; Q% I% j5 I" [; U我在多个帖子中有不同说明,但将这些说明再集中到一个帖子中比较麻烦,大家相互参考一下,看能否把这个问题解决了。
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    本帖最后由 forcal 于 2010-10-12 21:46 编辑
      v; f5 X7 t( c) h# s
    $ e1 x- e( u% P6 i) ?我正在练手设计的FcMath库也打算以矩阵运算为基础,设计一些专门的函数对数组元素集中运算,运行效率确实有所提高(甚至有些涉及矩阵的算法比matlab还快),代码也简洁了,但不知这是不是矢量化?& a2 \5 O+ W) @+ F3 N' u

    $ W5 L( u% _$ {2 c5 [8 Z1 F脚本运行效率应该取决于函数调度效率、对象管理效率和函数内部算法的实现。
    5 [& y4 t/ e& J! Y9 @" |, n  s" f  A1 E3 |, b9 i# U" Q4 J
    我感觉,matlab的函数调度效率较低,对象管理效率这个不好说,但一些函数内部的设计比较优秀。故有些Forcal代码比matlab快,而有些慢。7 o' i& M. l( D6 v

    ! @/ b+ ]: f$ P* @. J以下例子体现了Forcal和matlab的效率差别所在。
    0 l# c3 O! z& W& f0 ?' q( o
    ! b, K4 ^# i4 C+ `这个matlab程序段是网友lin2009 给出的,理论结果是每个元素均为275000。
    1. clear all- B- l6 R& ]% p# T1 X
    2. clc7 [- b, \! s7 n+ |0 G
    3. tic. N8 Y; T' x- O9 @/ |' K
    4. k = zeros(5,5); % //生成5×5全0矩阵
      5 q1 ?$ n6 f. w- Y  k( ]\" ?' e
    5. % 循环计算以下程序段1000 00次:$ S2 ^1 G- k. @/ I
    6. for m = 1:1000 003 P) z5 {2 j* b5 I0 a9 u
    7.     a = rand(5,7);+ I2 x) i  R\" t\" Z9 z
    8.     b = rand(7,5);%//生成5×7矩阵a,7×5矩阵b,用0~1之间的随机数初始化) Z$ t: Z/ v. I4 t
    9.     k = k + a * b + a(1:5, 2:6) * b(2:6, 1:5) - a(:, 7) * b(3, :);$ o/ E) i  W6 d- |( ]
    10. end
      : ?1 |$ w( L, K) A
    11. k7 V; s! I* v0 |
    12. toc
    复制代码

    ( M! R6 x/ Z% ^9 ^: jForcal代码1:运行稍快的代码,比matlab约快10%吧?
    / V- S. _, m. r5 A
    1. !using["math","sys"];9 Z* n9 X! P0 l$ X! ~# Y
    2. mvar:
    3. 0 P( Z6 g* K* I) A3 c$ @8 T
    4. t0=clock(),+ `1 J/ Y& g, L7 ?; {2 K
    5. oo{k=zeros[5,5]},: g) r3 I1 l8 F7 T7 e4 t/ C8 X
    6. i=0,((i++)<100000).while{! I9 o: R% W' i
    7.   oo{; b8 [8 _4 o: g( z\\" p
    8.     a=rand[5,7], b=rand[7,5],
    9. + m5 r7 U9 t3 b' W
    10.     k.oset[k+a*b+a.subg(0,4:1,5)*b.subg(1,5:0,4)-a.subg(neg:6)*b.subg(3:neg)]
    11. ( P& O! A  ~) P( H
    12.   }
    13. ) ~  l) e* C. @! Z. J/ X/ U
    14. },$ l. O4 w3 D\\" K+ B; @) m- x3 H5 \
    15. k.outm(),( ~+ |+ t. u$ a\\" h  F
    16. [clock()-t0]/1000;
    在我的电脑上运行时间为3.344秒。
    4 H+ I( ^2 K) b) I# \8 d8 |1 _5 {. S- x5 {
    Forcal代码2:比较好看些的代码,似乎也比matlab稍快吧?$ J" Q  ?6 n5 o1 o3 p: F7 j( i: h
    1. !using["math","sys"];1 S' e7 @6 Z; r) d( W2 d
    2. (:t0,k,i,a,b)=
    3. 4 U& e! ?, S3 u$ l7 F
    4. {$ ~4 `2 _+ `# U; H5 X6 n
    5.   t0=clock(),  Q# `/ Q7 e( ?7 p4 J
    6.   oo{k=zeros[5,5]},
    7. 4 m. ]  ~1 ^\\" F- w( M9 f) F
    8.   i=0,((i++)<100000).while{
    9. 2 S& n* T) h6 W7 _* k5 B
    10.     oo{5 w8 T4 r1 l$ N
    11.       a=rand[5,7], b=rand[7,5],* u( W) g% `% g1 ^+ L* L3 y
    12.       k.=k+a*b+a(0,4:1,5)*b(1,5:0,4)-a(neg:6)*b(3:neg)! {7 W- n3 L3 q2 N8 H8 Z8 C) b2 W! S
    13.     }* b$ ~# M8 w6 j! ?
    14.   },! ?% k; x0 E6 m8 q6 m+ o
    15.   k.outm(),
    16. . q\\" ]8 B# r- ~1 b
    17.   [clock()-t0]/1000
    18. 4 d$ E, X' }6 z, o3 y\\" S4 e
    19. };
    在我的电脑上运行时间为3.579秒。" X& t. d  l% ~$ }& M
    " A3 {. m- A$ a$ V
    例子2:
    * ?. {/ ?$ |# o$ C. b一段程序的Forcal实现:
    " Z/ D! o+ p, G/ m
    1. //用C++代码描述为:* e8 ~9 m3 l# x: X. T
    2. s=0.0;  , P5 q/ X1 v$ q6 P# X9 g
    3. for(x=0.0;x<=1.0;x=x+0.0011)  / ~6 N, c  p5 b6 C$ V
    4. {
      + Y4 ~/ z3 ]' \+ y& ?* h( X  b8 O
    5.   for(y=1.0;y<=2.0;y=y+0.0009)$ X* K0 u. w) C
    6.   {$ V$ n1 F: j) n# n\" \% A; {9 }
    7.   s=s+cos(1-sin(1.2*x^(y/2)+cos(1-sin(1.2*y^(x/2)))));
      5 F' i- @8 ?8 O( s
    8.   }0 x' Z3 ~0 s\" H* q: C9 E2 K
    9. }  
    复制代码
    结果:
    2 P- t( _$ H9 O1008606.64947441
    5 U  m! o. m% `: C: N0.609 //时间
    ) p1 _" Z1 @4 [! ?( D2 F  u
    6 R8 F8 Z& _1 B/ f- x这个matlab程序段是网友yycs001给出的。
    ) ]0 Z1 a, F" g% K. w
    1. %file speedtest.m2 p0 U( X- u8 N' p: w* b
    2. function speedtest8 U; p, a6 q' \7 n\" ]
    3. format long
      ( c' m: Z6 d0 `+ B
    4. tic
      * I! ]9 R, c: t- Q+ Z
    5. [x,y]=meshgrid(0:0.0011:1,1:0.0009:2);- l$ e: h3 X% i* i2 p$ E
    6. s=sum(sum(cos(1-sin(1.2*x.^(y/2)+cos(1-sin(1.2*y.^(x/2)))))))
      / \) h- m- K: P\" `; ]& _9 C4 f/ V
    7. toc
    复制代码
    4 q4 t* q. e  s/ o0 z
    Forcal代码1:**数组求和函数Sum,完全矢量化的代码  Z* B* g- S' R' G' c( t& {
    1. !using["math","sys"];
    2. ; J9 S/ c* H, p+ j7 L
    3. mvar:
    4. $ C) k! F/ V! B# e\\" \  R
    5. t=clock(),5 T) S0 m8 ~; b
    6. oo{
    7. 8 _& D& r$ I- k$ |& b
    8.   ndgrid[linspacex(0,1,0.0011),linspacex(1,2,0.0009),&x,&y],
    9. , T\\" I( \& J3 Q7 t) m
    10.   Sum[Cos(rn(1)-Sin(rn(1.2)*x^(y/rn(2))+Cos(rn(1)-Sin(rn(1.2)*y^(x/rn(2)))))),0]
    11. + P) X; R, O$ T# v9 w: H% r
    12. };7 g' a8 y6 g. ?: w, t
    13. [clock()-t]/1000;
    结果:
    ; a! L" U: \) p) V1008606.64947441
    / ~. |% h1 B2 S# r0 G0.625 //时间
    4 H7 Y$ D7 C, j
    & g% M1 @0 T( {' y& B5 k( B- d或者这个,与上面效率差别不大:
    & {2 [2 S& `/ _- h
    1. !using["math","sys"];: H0 C+ I3 E/ v6 |& H, x
    2. mvar:
    3. 1 |6 _3 U\\" F% n& U6 j; z+ x% Q2 r
    4. t=clock(),& W9 \% S0 o3 m
    5. oo{! C1 Z! s! x* G. L; O9 |8 H
    6.   ndgrid[linspacex(0,1,0.0011),linspacex(1,2,0.0009),&x,&y],: m# F6 |7 u5 n# H4 i\\" n) y: q
    7.   Sum[Sum[Cos(rn(1)-Sin(rn(1.2)*x^(y/rn(2))+Cos(rn(1)-Sin(rn(1.2)*y^(x/rn(2))))))]]8 o& Q( \; h+ r& r4 S3 S
    8. };
    9. ' T% V. L/ S5 S\\" J
    10. [clock()-t]/1000;

    + o, D! H' k, r4 R/ IForcal代码2:求和函数sum,非矢量化代码
    . ^4 c% z# |+ y1 O: [
    1. f(x,y)=cos(1-sin(1.2*x^(y/2)+cos(1-sin(1.2*y^(x/2)))));
      0 H) G- T, y( ]1 M
    2. sum["f",0,1,0.0011,1,2,0.0009];
    复制代码
    结果:/ v3 z, }3 Z( D4 Q
    1008606.64947441& `$ i5 M0 d3 x4 p+ l9 A" a; \
    0.719 //时间
      S2 k3 p2 q" d& c9 ^+ d
    , x' `0 a/ p6 s/ {Forcal代码3:while循环* {" `; T% X: F5 u8 m" t$ M
    1. mvar:4 J5 x9 K' a4 U$ j2 i% F8 c
    2. t=sys::clock();) ]0 V4 t/ @/ X9 y) I
    3. s=0,x=0,
      ; d8 m+ U4 r6 T2 m0 h# E
    4. while{x<=1,  //while循环算法;
      - B  y1 F/ q  J+ w& C* l
    5.    y=1,
      \" \( t* H# i& L  ^) S
    6.    while{y<=2,
      : `: q2 L3 t6 d
    7.        s=s+cos(1-sin(1.2*x^(y/2)+cos(1-sin(1.2*y^(x/2))))), ) R9 s5 \. Q1 h% r
    8.        y=y+0.0009
      ' x; k* }: q( \6 ]- T0 X2 V
    9.       }, 9 ?( ^) C% f! c8 V2 o\" @
    10.    x=x+0.0011 . s8 @: m% K; f\" ?6 s& L$ Y& D0 N
    11. }, & E  h4 m. n% }) q$ J
    12. s;2 l\" h1 M! ]; d; Q+ j
    13. [sys::clock()-t]/1000;
    复制代码
    结果:+ L' i- u" V% X7 a) d
    1008606.64947441
    " R! j. ]. `( p  }9 b" {7 ^8 Z$ u0.734 //时间
    5 T6 w9 o# Q7 M4 y3 F$ w9 h' z! {/ Z  ?; I" w, k' R7 \$ {
    大家可下载OpenFC进行测试:http://www.forcal.net/xiazai/forcal9/openfc32w.rar. D& F4 P$ r! Q+ N$ H

    4 Z2 `& `) k* r$ y/ E1 O9 q注意Forcal的矢量化代码第一次运行有时效率较低。
    . x- l& U: b- _+ X
    1 f1 E# [$ N" o例子1中Forcal和matlab都是矢量化代码,但matlab跑不过Forcal。该例子的特点是函数调用频繁,临时变量生成多,但矩阵很小,矩阵的各种函数运行时耗时较少。故说明Forcal函数调用+变量管理效率优于matlab。
    3 @  Y5 U% c& N' _% o, ]; _- _! S6 u
    例子2中Forcal的矢量化代码是最快的,但与matlab的矢量化代码相比仍有差距。该例子的特点是函数调用少,临时变量也少,但矩阵大。故说明Forcal的各种矩阵函数Sin、Cos及矩阵的加减运算等函数的内部设计不及matlab。
    9 C  H7 V5 G8 W+ t; }* _! R' u- w6 g( p
    如能在函数内部设计上下点功夫,例子2超越matlab也是可能的。在这方面,期待高手们的指点。
    # Z' G, Y) n* @8 Z$ X. \
    8 {5 G6 Q% W+ K- F' ]9 u. ?# u/ M如果例子2速度也超越了matlab ,matlab矢量化的神秘面纱就揭开了。7 f4 N. g& d* h1 U9 C

      Y: E/ {( E- z9 a+ J1 ^顺便说一下,例子1如果用C++的运算符重载来实现,速度将比Forcal慢一些,也就是说,在涉及运算符重载时,脚本的效率有时比C++还要高些。

    * A% c& ?# ]$ v
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