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数学中国总编辑
TA的每日心情 | 衰 2016-11-18 10:46 |
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群组: 2011年第一期数学建模 群组: 第一期sas基础实训课堂 群组: 第二届数模基础实训 群组: 2012第二期MCM/ICM优秀 群组: MCM优秀论文解析专题 |
2#
发表于 2011-1-31 15:08
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- 偏最小二乘法的Matlab源码3 O/ Z. A9 k% k# l' x' ?% m* j& k% x
- 所谓偏最小二乘法,就是指在做基于最小二乘法的线性回归分析之前,对数据集进行主成分分析降维
0 V8 a- d8 t& a; y - function [y5,e1,e2]=PLS(X,Y,x,y,p,q)9 s' K; j5 ~; Y' i9 A2 g- d5 w/ G
- %% 偏最小二乘回归的通用程序
6 H! ^1 B S4 l - % 注释以“基于近红外光谱分析的汽油组分建模”为例,但本程序的适用范围绝不仅限于此
9 T8 b9 ~, B- X! W; ~% p\" t - %% 输入参数列表+ J5 v2 }' Y- q5 M' h0 ~
- % X 校正集光谱矩阵,n×k的矩阵,n个样本,k个波长7 D; H* X9 Y6 Q; P6 h1 g
- % Y 校正集浓度矩阵,n×m的矩阵,n个样本,m个组分
9 {; {& \( `! p\" K: x7 ]: y - % x 验证集光谱矩阵
2 V, L3 a( t; g\" m0 G$ r* Q2 k, p - % y 验证集浓度矩阵
9 T! X& o0 w# _/ H - % p X的主成分的个数,最佳取值需由其它方法确定& H5 x* T: b: t6 T
- % q Y的主成分的个数,最佳取值需由其它方法确定! b+ T0 O* E: f2 X6 i\" [
- %% 输出参数列表
0 X5 }: T1 M0 b1 m% b i# \; ~, V - % y5 x对应的预测值(y为真实值)1 `5 h+ U9 H* }% h# p+ L
- % e1 预测绝对误差,定义为e1=y5-y' c4 J8 N5 @\" I( q$ N8 w\" c
- % e2 预测相对误差,定义为e2=|(y5-y)/y|
( R6 V$ h1 Q* ` f& q -
7 z2 H% @) W9 H! o4 V8 \ - %% 第一步:对X,x,Y,y进行归一化处理% o v) B U$ P& a6 W1 ^0 j
- [n,k]=size(X);) e' ]# O( l+ _5 |- V1 n6 U1 ]
- m=size(Y,2);( ?7 J0 f6 O; G0 @ d! d
- Xx=[X;x];4 I% m5 l6 r, R) ~, r
- Yy=[Y;y];
7 t$ ?\" R7 Z3 ~& a9 x0 m\" r - xmin=zeros(1,k);/ z' V( Y2 N9 {1 B+ M' J8 o
- xmax=zeros(1,k);
; J! X' k8 x# T( m. u1 y1 ^. t - for j=1:k
P, S# J0 T& S; R - xmin(j)=min(Xx(:,j));- V9 N8 h8 W1 @* B/ }
- xmax(j)=max(Xx(:,j));\" X+ }& Q) M% B# M( P9 ~2 n
- Xx(:,j)=(Xx(:,j)-xmin(j))/(xmax(j)-xmin(j));
5 Z$ ^& \( s\" `% ]2 ^( ^ - end* F# }; m( V- y
- ymin=zeros(1,m);6 w: E' t2 o' _8 k' o. p
- ymax=zeros(1,m);. p$ T# {# _( E9 v! E8 c, Y
- for j=1:m, a( ?. z\" H% Z8 q) f; V5 B% R
- ymin(j)=min(Yy(:,j));
1 ]6 h0 E( s8 e' i6 t - ymax(j)=max(Yy(:,j));$ K) p3 g9 z+ j# n
- Yy(:,j)=(Yy(:,j)-ymin(j))/(ymax(j)-ymin(j));
- K8 { v! V% H8 a - end T% V% e$ C( T) W0 ]8 C0 }
- X1=Xx(1:n,:);
1 c: _) x( c8 J( W$ a' h - x1=Xx((n+1):end,:); V* @2 D- m2 i9 l. o8 c w1 j
- Y1=Yy(1:n,:);
# k) o( l( J0 n7 h\" X. k/ X - y1=Yy((n+1):end,:);
\" k\" z# L# Y' V% w\" \9 S4 y/ F3 t - , ?0 d! m! s/ q4 L
- %% 第二步:分别提取X1和Y1的p和q个主成分,并将X1,x1,Y1,y1映射到主成分空间7 N* G: ?8 q' o1 @* r1 M; F0 }
- [CX,SX,LX]=princomp(X1);9 N\" }4 f+ D$ C3 i
- [CY,SY,LY]=princomp(Y1);6 W( W. `- N v. }' x! S
- CX=CX(:,1:p);! Y6 \* f; Z u$ i- r, ?) u
- CY=CY(:,1:q);& G: S( F0 C( M4 x' D
- X2=X1*CX;: Q! ^% z' j$ [# ]* x' ]& [
- Y2=Y1*CY;
1 g. Y3 S5 U6 y+ c8 O! Z - x2=x1*CX;/ E) z+ F9 a* q4 o, u/ J
- y2=y1*CY;& T, D% a' y9 q: F9 i; z
-
, H9 T% B8 t8 ? - %% 第三步:对X2和Y2进行线性回归
3 X3 ]0 R2 w: i1 H% c4 J/ ^( v% R - B=regress(Y2,X2,0.05);%第三个输入参数是显著水平,可以调整 c9 p( S+ s/ L/ f
- 7 o; X; I, @ A% b; m
- %% 第四步:将x2带入模型得到预测值y3
+ `! U7 N) T% L! |2 s' o - y3=x2*B;4 J: v `\" c0 n9 k
-
$ F# B, L3 L% j - %% 第五步:将y3进行“反主成分变换”得到y4# P; L0 U: ^! x B0 J
- y4=y3*pinv(CY);# r. g5 T- r# Z! F5 h3 R9 c
-
8 R# M* t, M1 F5 ^! j3 b - %% 第六步:将y4反归一化得到y5
% W9 h( ^# g. [$ Z, P% P7 e6 l$ e' W - for j=1:m
0 \) l& }( s% j* ^6 e, W - y5(:,j)=(ymax(j)-ymin(j))*y4(:,j)+ymin(j);
5 u7 O# y: l2 N- e; E1 v- s7 f - end% g- X7 P: s1 m, k9 J8 R, W% u( _
- : r5 t5 B. O# j1 ]- n
- %% 第七步:计算误差
6 ^! G% E+ a& y e0 \8 d - e1=y5-y;% F0 e7 Y- _. F: [( b6 ^7 F- a7 q
- e2=abs((y5-y)./y);' y* P\" r. m5 Q* K! C
-
* P% Y& }' g `( r- _, h' k - function [MD,ERROR,PRESS,SECV,SEC]=ExtraSim1(X,Y)# F; q+ N! A3 D& i6 g8 q3 l
- %% 基于PLS方法的进一步仿真分析
/ j' Y/ f/ n0 l7 R8 k - %% 功能一:计算MD值,以便于发现奇异样本\" m\" |' ]. D& n0 y5 _ D
- %% 功能二:计算各种p取值情况下的ERROR,PRESS,SECV,SEC值,以确定最佳输入变量个数, Q6 @ x* }5 E+ B2 t& E
- %%
2 d* G% H) S+ z# n; g3 i' E - [n,k]=size(X);$ _' v7 {# D% o( D6 X\" w* F, h
- m=size(Y,2);! l7 l9 j- j! G9 q6 H D8 Y5 y
- pmax=n-1;/ a( Q\" I2 ~& H3 {7 n
- q=m;
- z+ c* n( b0 ^* F. U& l6 J - ERROR=zeros(1,pmax);
. |% Q7 X) `5 a' r% Z+ v - PRESS=zeros(1,pmax);, |( b/ s! L2 q. B
- SECV=zeros(1,pmax);5 i0 R! e2 A5 u
- SEC=zeros(1,pmax);
( q1 g8 J- v- o - XX=X;
' @2 {4 W, L9 M4 S, Q - YY=Y;
' N. Y; Z& O. d - N=size(XX,1);
- Q! b; o8 n\" K0 ?3 e7 q8 B - for p=1:pmax
3 {4 j3 j5 T2 u! h. H8 u) Y9 v - disp(p);
5 O; R$ q; K: @ - Err1=zeros(1,N);%绝对误差
6 G0 ^( i& v. x% Y - Err2=zeros(1,N);%相对误差' n) y& W) P3 a5 U6 [
- for i=1:N0 ]9 l1 r: G9 L$ K! @: A
- disp(i);; i' S6 x: c5 A
- if i==1
* o; C- w* W, G - x=XX(1,:);
4 d- v# w/ x2 f2 B. e - y=YY(1,:);
- N# l$ \ ^ ^* M' P% h! M - X=XX(2:N,:);5 l\" A+ Z( Y+ ]1 K
- Y=YY(2:N,:);7 G0 O( W\" J+ V
- elseif i==N0 _9 q\" ^( w% R: M# I
- x=XX(N,:);
) c+ E/ R1 f, B5 u' v( F - y=YY(N,:);
% _5 X2 b- A* I - X=XX(1:(N-1),:);
p, Q' w: C) x! P# C - Y=YY(1:(N-1),:);
5 H4 @! G# F+ Y0 m8 R' C) h+ J3 s - else
+ u- x. Y\" c, O6 i& Q, D - x=XX(i,:);
& D. m4 d& ]5 x- ^ - y=YY(i,:);
( w7 B% y; A' |+ A9 `% d - X=[XX(1:(i-1),:);XX((i+1):N,:)];& o/ D7 L# c) J' y5 w
- Y=[YY(1:(i-1),:);YY((i+1):N,:)];
* Z% \8 Q# B! } k - end- \5 T% I- y+ y! N$ z ?; l3 o7 E# E7 g
- [y5,e1,e2]=PLS(X,Y,x,y,p,q);# [% g9 R( g' @1 w5 S0 j$ d
- Err1(i)=e1;9 b# d$ g: O- C r2 l
- Err2(i)=e2;
3 r% k/ V2 F; i - end4 v/ A2 W4 L7 j, ^) K& m5 i
- ERROR(p)=sum(Err2)/N;* R, R2 t+ u% `- z9 l
- PRESS(p)=sum(Err1.^2);
6 ~& s# v* t/ j9 O. ? - SECV(p)=sqrt(PRESS(p)/n);
' b7 S& d% i7 Y# P\" W: H - SEC(p)=sqrt(PRESS(p)/(n-p));
( h: F2 q. I$ x3 K7 F% Q) _5 r1 U- k - end
1 h) H1 X: G3 k! \5 v2 q/ J, ` - %%: R\" Q( i @: Z* M2 t
- [CX,SX,LX]=princomp(X);
/ j+ l! L# _ ~) ?( k* [8 q; e - S=SX(:,1:p);
0 ?1 v$ s8 K( m7 o' g - MD=zeros(1,n);
# S+ j' p- x8 j% L! B - for j=1:n( B: j7 q$ I: P0 d$ h
- s=S(j,:);
# P4 |9 h6 u6 |# j\" b- q - MD(j)=(s')*(inv(S'*S))*(s);) [0 k% `' R* p* W
- end+ ^4 F+ j+ {0 ^! M6 u$ A& {$ |
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