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[个人总经验] 一般线性模型(GLM)的相关思考

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发表于 2015-4-1 13:57 |只看该作者 |正序浏览
|招呼Ta 关注Ta
最近遇到一个问题,如果因变量为一个连续变量(如胰岛素水平),主要考察的变量为分组变量(如正常血糖组,前糖尿病组,糖尿病组三组),现在的目的是想看调整多种变量(包括多个连续性变量和分类变量)后,胰岛素水平是否一致。% l4 H" p) b( g% t
7 o4 w) y0 P; |7 @9 J7 j: Z; ?8 X2 q' ?

; A' {' G4 G" u5 C一开始的思路想到的是采用GLM进行协方差分析来解决。( Z2 J4 R0 {) o& D4 g

+ }) A- u3 ~' k0 `  x+ H' k但是有觉得似乎不是很对,因为经典的协方差分析通常只考虑一个连续变量(协变量)和一个分组变量,同时协变量和分组变量只有不存在交互的时候(经典协方差分析的前提)才能使用协方差分析。; z1 ?. |% j; e3 T3 l
针对我目前的问题,如果想调整多个连续性变量和分类变量,这种方法能否再叫协方差分析?如果可以认为是协方差的思想,用不用检验协方差分析的前提(如协变量与分组变量之间的交互)?多个连续性变量和分类变量存在时,该前提应该怎么检验?
  j7 e& f: D8 p. }
% P$ m7 R) p7 J# G5 p6 N1 V1 `通过跟别人交流之后,有一句话非常受用:线性模型其实最重要的不在于用的方差分析还是协方差分析,而主要是检验残差是否符合线性的几个条件。
. \: a7 P/ J3 h' g; n+ m2 o9 M: k1 Z# }- ?+ {) u
受到该启发后,认真再复习GLM的相关资料,得到更加重要的总结如下(来自高惠璇SAS/STAT软件使用手册,实际是SAS8.2的User's guide的中文版,但是目前SAS 9.2,9.3的User's guide关于GLM模型的介绍中已经删去了这么经典的总结,实在可惜,倒让人看不到GLM的真正长处了):
) U3 S8 E8 G  ~如果X1-X3,Y1-Y2为连续性变量,Y3为分类变量,a-c为分类变量,time为时间变量,目前我们熟悉的模型可以简单概括如下:6 k( ?" p  u2 x' H  {& Y3 X
(1) y1= x1    简单回归) a2 V0 f/ |1 G+ h7 A
(2) y1= x1 x2 x3  多重回归(multiple regression)& l' h9 K0 F1 v8 X1 O% J
(3) y1 y2=x1 x2   多元回归(multivariate regression)
! ^; J, h  y& d" g5 A! D* ?. ^(4) y1= a   单因素方差分析4 _% p. y4 y' W& ^' S& s, R
(5) y1= a b   (析因设计的)主效应分析, @! [; j) B/ |# x2 \& w- G* I$ f. R: N
(6) y1= a b  a*b (析因设计的)主效应加交互项分析
" ]* q/ ]* O& J9 M  `9 V(7) y1= a x1   协方差分析( H( {/ c6 {3 t# p4 t- J, t$ x
(8) y3= a   单因素logistic回归/ }9 k8 A3 b: g8 g# e
(9) y3= a b c x1 x2 x3   多因素logistic回归
. p) @) V& x6 z) j  d/ O( ^(10) y3(time) =a   单因素cox回归/ {4 F+ a" a' C4 n/ J/ G
(11) y3(time) = a b c x1 x2 x3  多因素cox回归7 d; V( |: n/ N" k

" r; j! e- g; M" l/ J  t1-7采用SAS的一般线性模型GLM都能实现,而1-9采用SAS的广义线性模型GENMOD都能实现,具体验证详见后面举例3 g1 h5 Q" C: ?8 R! A
3 L1 G2 w* j5 x0 g7 k- t
再次回到开始的问题:掌握上述的基本思路后,因为因变量为连续变量,所以采用线性模型肯定是对的。如果因变量可以认为是正态的,那采用一般线性模型是合理的。所以现在的关键问题是:如果调整多个变量(包含分类和连续变量)后看不同分组间因变量(连续变量)是否仍有差异时,能否再称为协方差分析?我目前认为应该是可以的,但是事实上我们遇到这种情况后,并不再去强调它是协方差的思想,而只是回到线性模型分析的最初的起点,也即是检查残差是否符合线性的基本条件即可。
# O, Z$ e7 I; L5 X2 W% K2 S2 g2 n# N) ~& V- R9 q) u' H, A
但是现实中,我们在使用GLM解决前面遇到的类似问题时,只是简单地用了,而很多时候我们都没有认真去检验残差是否符合这个条件,这可能是我们滥用GLM的表现之一,因为我们更多只关注模型的参数是否有意义,而不去关心对结果“无关紧要”的前提条件。
  c* {, q3 C% l5 b# F/ s9 t; f. C5 C* U# u# t+ q
再次思考一个问题,上述列举的1-7模型,在GLM中并没有特定的选项指定是哪一种模型,而采用一种表达方式。由此,可以进一步深入概括一句话,GLM模型,对于上述列举的1-7模型并没有本质区别,唯一的区别只是模型中自变量的属性和数量不同。但是我们对1-7模型的叫法却不相同。而其原因是我们对事物的认识是一个由浅到深的过程,之前我们认为他们是不同的7件事情,随着认识的加深,发现原来这些问题可以用一个方式表达出来。而SAS的GENMOD则更能说明这一问题。现在还没有一个模型能把上述模型1-11用一种表达方式表示,但是COX回归在抛开基线生存函数之后剩下的部分也是线性模型,所以说不定哪天真的能够把上述所有模型用一种表达方式表示出来。到时候更应该相信人们对事物的认识绝对是一个由浅到深的过程啦。) s8 _+ k# l& g' T

# E4 d/ |, i* M2 C附:GLM与GENMOD在协方差分析结果的比较
$ T3 v  [* q  e   data drugtest; , X5 S6 m8 ?$ B6 S
      input Drug $ PreTreatment PostTreatment @@;
$ g" t. d4 ~1 X. e& U7 _      datalines;
3 q3 B0 t. J7 r6 V6 B4 A2 h   A 11  6   A  8  0   A  5  2   A 14  8   A 19 11
  x) l7 Z: J% |# _   A  6  4   A 10 13   A  6  1   A 11  8   A  3  0
3 C4 [6 o2 C- z. ~' q   D  6  0   D  6  2   D  7  3   D  8  1   D 18 18 8 f* K$ V+ P: t& c& F# z
   D  8  4   D 19 14   D  8  9   D  5  1   D 15  9
% D' j" X0 J( S- a" P" s   F 16 13   F 13 10   F 11 18   F  9  5   F 21 23
- ^1 a( t9 ]  r+ g' s- F   F 16 12   F 12  5   F 12 16   F  7  1   F 12 20
. f; ~* R: b* v   ;
5 N/ z' h4 k3 r5 u2 `4 t; ?4 f) Q0 \% O/ ~4 W
   proc glm;
, F, T% y) H3 n% D* [  g8 S5 _      class Drug; 3 o9 I) {3 q, y5 D% P8 k2 l) I% ]9 T+ [( v
      model PostTreatment = Drug PreTreatment / solution;
" v$ S# N8 M% C  }& ]9 n  B: W      lsmeans Drug / stderr pdiff cov out=adjmeans;
; b5 g" ?3 ]9 W$ U: C   run;
$ M2 Y. _5 Y! E. {8 R
- H, C5 `) \& Z$ P   proc genmod data=drugtest;
3 w- U. m1 u5 O1 L( p      class Drug; ! C1 y; Q' y8 n+ ~4 V4 b
      model PostTreatment = Drug PreTreatment / dist=NOR link=ID obstats type1; / Q, k! L& r  ~5 d8 y5 I: X: F. J5 X
   run;
4 A( Z* W" a. e" B) ^0 p; E' u. ^3 i
   proc print data=adjmeans; & v: ]) @3 L, L0 b. |" S
   run;
' I' `! ]9 S6 g0 E8 X. m" @
, m" t( J1 Y! s. T
/ N1 D5 R: }8 i! d6 j
: m* k" [) r$ W3 ?8 |9 i
zan
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    开心
    2015-4-1 17:42
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    [LV.1]初来乍到

    自我介绍
    @

    # r' i$ Q6 N7 _! }; A/ w深入浅出,简练的表达,传达了复杂的内容。; s) s: E$ V: l
    貌似目前好多著者、师者都缺少这种思考与总结,有的书、课件就是靠东拼西凑来的。; M9 j6 r/ t% c( M4 q4 s
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    郁闷
    2015-4-7 17:06
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    [LV.1]初来乍到

    自我介绍
    拒绝一切
    # W5 s0 P" b8 @* T: V
    学习了,,“我们更多只关注模型的参数是否有意义,而不去关心对结果“无关紧要”的前提条件7 [& |4 P6 C2 K3 V! I8 u
    ”这句话是该提醒了很多人啊,个人感觉不要只知道应用,还要知道原理,所以说理论性的东西还是不可缺的,,谢谢楼主了哈,,& {4 ?* Y& d4 F
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    飘过

    9 @" D3 h6 h' ?/ c- s" i/ |' E& e学习了,总结的真好,特别是那句关于前提的提醒
    6 ]' G% a) S/ M4 }
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