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TA的每日心情 | 开心 2020-11-14 17:15 |
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问题的提出4 c# X! o/ `/ D% D. k+ K
医生们发现,在一个民族或地区,当某种传染病流传时,波及到的总人数大体上保持为一个常数。即既非所有人都会得病也非毫无规律,两次流行(同种疾病)的波及人数不会相差太大。如何解释这一现象呢?试用建模方法来加以证明。
( l! j1 y7 ~. ]; x$ F- D& F
* {9 X4 q5 H6 a. h7 u! K8 x, \指数模型
8 U! V: {- w2 S) f, U定义已感染人数为i(t) i(t)i(t),假设每个病人单位时间有效接触(足以使人致病)的人数为λ \lambdaλ,那么,在时间段Δt \Delta tΔt内,病人的增量可以用如下的公式进行计算
]/ ]: A$ F0 q% Oi(t+Δt)−i(t)=λi(t)Δt i(t+\Delta t) - i(t) = \lambda i(t)\Delta t9 l/ y9 i7 h9 \5 e
i(t+Δt)−i(t)=λi(t)Δt9 N' O8 n- l2 C* k
( ]* l+ I' Z z9 e% V0 B
将i(t) i(t)i(t)移到等式的右边,我们得到如下的递推公式5 u1 N) n9 _* K# j+ |% w) p
i(t+Δt)=i(t)+λi(t)Δt i(t+\Delta t) = i(t) + \lambda i(t)\Delta t2 ]' w0 H6 v5 K7 r
i(t+Δt)=i(t)+λi(t)Δt
: o/ ~9 L/ K+ z6 ?* _' r m/ M4 T; n8 @
以上递推公式意味着,我们可以通过当前时刻的病人人数和致病参数λ \lambdaλ,计算得到Δt \Delta tΔt时间后的病人人数,将以上思想在Python中进行实现,代码如下。
) B$ ]4 c5 g M2 p) K! n& t8 B# }# ?
import matplotlib.pyplot as plt8 N! ]$ |1 O( ^. z
%matplotlib inline1 z8 R, j1 n* `2 }' ~8 X+ {
deltaT = 0.018 E5 e* f$ ^7 |6 D: w
lamb = 2
! A/ d& {% g1 T6 T$ }. |( ji_list = []- O C0 J2 M5 F; t8 {& {8 ]) E
i0 = 0.08; # 初始有8%的人患病' f h8 u( U! D" t* ]
i_list.append(i0)8 Q/ C( y! x4 P9 ]# ~1 l
Tot_Time = 10
9 U# ^! g- _: H: U. pTotStep = int(Tot_Time/deltaT)' D# `& T6 g7 y, E
##
3 ]) a7 b- C% _9 w3 \& Bfor i in range(TotStep):# G' z* \, S" v$ U- ^; p
i_new = i_list[-1] + lamb * i_list[-1] * deltaT
7 I9 C* G$ r b, v7 Q9 Y i_list.append(i_new)
7 E0 K5 u8 l! ~) t% S9 c7 Nplt.plot(i_list)% P" G) Y* x8 B. P8 J9 i
- J4 y e! x- w% h
将以上代码在Jupyter Notebook中运行,得到病人人数的变化趋势见下图,从中我们可以看到病人的增长是指数级的,在短短十天后,已经有3000万人患病!这显然不符合实际情况的,那么问题出在哪里了呢?- H z" }2 N' G3 f
3 u J! [ a* L* |3 n& m0 K+ q3 p' e' J9 D
实际上,若病人解除的是病人,并不能够使病人再次患病,实际上以上的算法导致了重复计数现象的发生。解决办法:必须区分已感染者和未感染者。
# W, [, X5 y* w3 o4 V3 ?2 C+ z: w: y6 d
SI模型7 k0 f1 F% y9 G1 g' M& J
现在我们将人群分成两个群体:已感染者(病人,Infected)和未感染者(健康者,Suspect),该模型称为SI模型,模型假设:% H) y" ^/ q8 p3 e
9 o: p" Z7 e) K# J8 h% s. m
在研究时间内,不考虑死亡率和出生率,即总人数N NN不变,病人和健康人的比例分别为i(t) i(t)i(t)和s(t) s(t)s(t)
/ a; f- W+ ]' l6 ?; C" b6 D+ w每个病人在单位时间内有效接触并致病的人数为λ \lambdaλ,且只有接触健康人才会致病,称λ \lambdaλ为日接触率
5 T; E/ z% s3 T3 \& l5 C仿照指数模型里面的建模方法,在时间段Δt \Delta tΔt内,病人的增量可以用如下的公式进行计算 l b8 S+ e; Q3 ~1 F
7 Q9 n; j3 k0 @" T
N[i(t+Δt)−i(t)]=[λs(t)]Ni(t)Δt N[i(t+\Delta t)-i(t)]=[\lambda s(t)] N i(t) \Delta t
' }3 v- ?1 K& jN[i(t+Δt)−i(t)]=[λs(t)]Ni(t)Δt
( `2 K+ `+ z: N* ?5 z) a e( |
7 E% |$ q; N, h消去N NN,再将i(t) i(t)i(t)移到等式的右边,我们得到如下的递推公式
8 ~4 }& }$ P' N9 O" f# ]i(t+Δt)=i(t)+λi(t)s(t)Δt i(t+\Delta t) = i(t) + \lambda i(t)s(t)\Delta t
6 F$ {9 y, t0 u1 Y" Z0 f# D8 Q: X7 Fi(t+Δt)=i(t)+λi(t)s(t)Δt
! o/ z. v) {& S' h* i7 Q* Q' ^- q" T% O8 Z" C: y
同样地,我们可以通过当前时刻的病人人数和致病参数λ \lambdaλ,计算得到Δt \Delta tΔt时间后的病人人数,将以上思想在Python中进行实现,代码如下:* S3 _; `" n+ E- B& |% |3 M9 }9 u
1 ?# v) ] Q0 l: @
import matplotlib.pyplot as plt$ j& F# a" i2 d3 F
%matplotlib inline# }$ P% o, U0 C
deltaT = 0.01
d) @# V2 c, ]; V0 l/ D# r/ Ylamb = 2
& t3 V% q0 `% Ai_list = []( Q4 D+ S9 Q. v; T" Q |6 n8 @
s_list = []" n! ^8 H8 p. B0 W! k* i
i0 = 0.08; # 初始有8%的人患病
9 e, N5 M% k8 z9 i. v2 F" Ni_list.append(i0)
! q4 P9 \6 [' G& }. p5 m( Bs_list.append(1 - i0). ?( \6 A; i n7 O" l
Tot_Time =5; K3 G5 D% J% ]# m/ ]$ b
TotStep = int(Tot_Time/deltaT)
: L& K( R+ l0 g3 i9 c## ) X1 ?* {6 Z- r9 c3 V4 m. }5 E% s
for i in range(TotStep):
8 e2 l& f0 |2 W2 L, {- ? i_new = i_list[-1] + lamb * i_list[-1] * deltaT * s_list[-1]& H# F, w+ w- M# Y0 S
i_list.append(i_new)9 Y& ?3 a/ G, i
s_list.append(1- i_new)
* U1 _, t, ?/ |& U3 XTime = [i * deltaT for i in range(TotStep + 1)]
) L R/ r1 F" `& P2 \) Kplt.plot(Time,i_list)
: `# o! Z7 \: Z8 r) G8 Mplt.plot(Time,s_list)
6 l* U. s3 U# o2 pplt.title("SI",fontsize = 20)
/ v& k8 ^9 i0 k& h7 N6 m! ]3 Aplt.xlabel("Time")2 @2 U) ]$ p- S% ]; a/ z5 \
plt.ylabel('i(t)')4 g. G& J" K0 T d
; o( J [0 |6 ?$ a2 A- {2 D3 _从SI模型我们可以看到,病人比例不再会出现"指数爆炸"的情况,在t→∞ t \rightarrow \inftyt→∞时最大患病比例为1。在SI模型中,病人数量的增长曲线是一个典型的S型曲线,又称为Logistic曲线,该曲线在生物学上经常被用来描述物种的增长模。
" G4 ~# ~9 _3 P5 J& E+ w. L. Z
/ A2 j/ R4 h9 v, j8 \然后,SI模型的结论告诉我们,无论λ \lambdaλ多么小,最终人群都会患病,这显然也是不符合实际情况的。
# q7 h6 e) h9 Y) Z4 g6 b————————————————" G& ]1 \/ A5 d+ q
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# @: j, {/ s B1 D原文链接:https://blog.csdn.net/baidu_26746963/article/details/93918383" J: }; A( G' n& }2 j2 E
1 w5 {0 e( y4 @' [) ^2 ^! G' o+ M) ~8 x( c" \
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