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TA的每日心情 | 开心 2020-11-14 17:15 |
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随着人类的进化,人们为了揭示生命的奥妙,越来越重视遗传学的研究,特别是遗 传特征的逐代传播,引起人们更多的注意。无论是人,还是动植物都会将本身的特征遗 传给下一代,这主要是因为后代继承了双亲的基因,形成自己的基因对,基因对将确定 后代所表现的特征。下面,我们来研究两种类型的遗传:常染色体遗传和 x − 链遗传。 根据亲体基因遗传给后代的方式,建立模型,利用这些模型可以逐代研究一个总体基因 型的分布。& Y) g9 f! v0 u4 \8 z1 h; w
" b) d/ u, h; ^* \) D. Z, q4 O# K1 常染色体遗传模型3 N; u1 ?! v: J" R$ I
常染色体遗传中,后代从每个亲体的基因对中各继承一个基因,形成自己的基因对, 基因对也称为基因型。如果我们所考虑的遗传特征是由两个基因 A 和 a 控制的,那么 就有三种基因对,记为 AA, Aa,aa 。例如,金鱼草由两个遗传基因决定花的颜色,基 因型是 AA的金鱼草开红花, Aa 型的开粉红色花,而 aa 型的开白花。又如人类眼睛 的颜色也是通过常染色体遗传控制的。基因型是 AA或 Aa 的人,眼睛为棕色,基因型 是aa 的人,眼睛为蓝色。这里因为 AA和 Aa 都表示了同一外部特征,我们认为基因 A 支配基因a ,也可以认为基因a 对于 A 来说是隐性的。当一个亲体的基因型为 Aa ,而 另一个亲体的基因型是aa 时,那么后代可以从aa 型中得到基因a ,从 Aa 型中或得到 基因 A ,或得到基因a 。这样,后代基因型为 Aa 或 aa 的可能性相等。下面给出双亲 体基因型的所有可能的结合,以及其后代形成每种基因型的概率,如下表所示。6 K, {/ f3 d, D4 n7 X
% H6 E4 }4 x. u% C+ j1 w+ C! _
, J* K. P7 g- ] j3 m0 q4 q
: G+ w" \* ]1 e6 M; [' |7 t2 |例 5 农场的植物园中某种植物的基因型为 AA, Aa 和 aa 。农场计划采用 AA型的 植物与每种基因型植物相结合的方案培育植物后代。那么经过若干年后,这种植物的任 一代的三种基因型分布如何?
1 h; | r( F L! P1 d. \0 I4 E% q
(a)假设
6 `5 T5 z9 v: K/ {令n = 0,1,2,...。
+ G- K5 P- j: }. }" U |( U0 S, L2 P+ r# o7 l, |, h6 g: j
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: V1 S G2 [% B: T
. C! S3 D( `+ \' M9 F# t; _1 n(b)建模
% A5 U7 E2 z0 U! P" s+ `& j1 A9 B. G1 Z# z) M
/ u- J7 P: w. C$ e
8 d' j- l, p5 G' y1 _ # J0 x! Y2 ?, T! h5 m
5 Z# ~( s. }) q# X
编写如下 Matlab 程序:
/ w, l( h) ` s. X( d& \
& y! h q% P) b' J* Zsyms n a0 b0 c0
* \5 d' k/ M: Q, n# x3 @. G& ]1 fM=sym('[1,1/2,0;0,1/2,1;0,0,0]');4 a4 H# O0 a9 c h6 D+ b; g) Q2 {- a
[p,lamda]=eig(M);4 a/ U4 t4 m8 j4 [
x=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0];/ J8 s( R) \8 O' d2 R
x=simple(x)
D- K+ T& V; ]" N9 [6 K$ G/ i) C* U2 D
![]()
S7 o& \; x9 c3 H- Q
% q2 V" G; F1 H3 `5 v即在极限的情况下,培育的植物都是 AA型。 (c)模型的讨论若在上述问题中,不选用基因 AA型的植物与每一植物结合,而是将具有相同基因 型植物相结合,那么后代具有三种基因型的概率如下表所示。 ; r: @# N6 C9 S
3 ^! T- d' Z* d
s. A- L* x, U
编写如下 Matlab 程序:, g0 V+ f4 f+ p/ [$ C
# _5 h- w( C. |5 V( ~1 g$ b
syms n a0 b0 c08 y% k8 d7 w* E- ]# v
M=sym('[1,1/4,0;0,1/2,0;0,1/4,1]');2 p! U, o4 k0 G
[p,lamda]=eig(M);
; x; h" _2 B, l6 B* Zx=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0];
H _7 k/ k1 A; m: r c, d( p, ox=simple(x) ) Y6 N1 H+ ^% R* {" ?
L1 l1 Y6 {5 z; t% w
7 X* V- B* G$ p) x/ D# T/ t$ k
8 P* c; W" }7 r' ~% |; y) I
x. Z2 ^- U1 Y/ c0 p: t o8 N2 常染色体隐性病模型5 E/ m3 {, r# X! A4 o, a" ~9 ~
现在世界上已经发现的遗传病有将近 4000 种。在一般情况下,遗传病与特殊的种 族、部落及群体有关。例如,遗传病库利氏贫血症的患者以居住在地中海沿岸为多,镰 状网性贫血症一般流行在黑人中,家族黑蒙性白痴症则流行在东欧犹太人中间。患者经 常未到成年就痛苦地死去,而他们的父母则是疾病的病源。假若我们能识别这些疾病的 隐性患者,并且规定两个隐性患者不能结合(因为两个隐性患者结合,他们的后代就可 能成为显性患者),那么未来的儿童,虽然有可能是隐性患者,但决不会出现显性特征, 不会受到疾病的折磨。现在,我们考虑在控制结合的情况下,如何确定后代中隐性患者 的概率。/ i1 c l$ U4 Y% V
' N1 ]7 i2 b/ F) j3 p' G(a)假设
: \+ a% Y4 a/ J( N: T# O/ i% |(i)常染色体遗传的正常基因记为 A ,不正常基因记为a ,并以 AA, Aa,aa 分别 表示正常人,隐性患者,显性患者的基因型。
$ C2 S; x$ w9 G9 @8 i2 R7 N2 w: H) Y2 @/ C2 y
![]()
$ ~6 a0 m1 g Q, @/ i3 i4 k
( I% `! q: B: c( W4 B- J5 J8 r (b)建模6 S( v3 R' F) c4 m
" C: ]' ]+ q3 s ]5 g. R- R, H![]()
6 c* R5 P" t) q! s: n+ C0 q& q: q& z# m7 v; ~
![]()
5 F" J3 c; m( P0 v! f0 J) `; H% K5 l5 P
(c)模型讨论( B9 I- T6 E& r O
研究在随机结合的情况下,隐性患者的变化是很有意思的,但随机结合导致了非线 性化问题,超出了本章范围,然而用其它技巧,在随机结合的情况下可以把(24)式改写为2 }* \* X% `8 d" D# s
1 W- }; t. O7 O0 c [8 d ) G6 x. k8 Q! \9 B& D
" q- S0 S& w# t' E4 n8 V
下面给出数值的例子: 某地区有 10%的黑人是镰状网性贫血症隐性患者,如果控制结合,根据(24)式 可知下一代(大约 27 年)的隐性患者将减少到 5%;如果随机结合,根据(25)式, 可以预言下一代人中有 9.5%是隐性患者,并且可计算出大约每出生 400 个黑人孩子, 其中有一个是显性患者。- b4 ]" K W3 W& L4 [& {. U# @& A
1 q* P3 _, f4 ]! g q5 G H! q5 Z3 X − 链遗传模型
6 t/ H' ?, l, M: G. P- C( sX − 链遗传是指雄性具有一个基因 A 或a ,雌性具有两个基因 AA,或 Aa ,或 aa 。 其遗传规律是雄性后代以相等概率得到母体两个基因中的一个,雌性后代从父体中得到 一个基因,并从母体的两个基因中等可能地得到一个。下面,研究与 X − 链遗传有关 的近亲繁殖过程。7 K5 [" }5 w' t
, Y; L( [" a" f) j) h(a)假设9 w8 b- Y' z& r" H9 z; c
(i)从一对雌雄结合开始,在它们的后代中,任选雌雄各一个成配偶,然后在它 们产生的后代中任选两个结成配偶。如此继续下去。# u- U% Z" c' H8 \
- z' D. C0 E/ W u, N
(ii)父体与母体的基因型组成同胞对,同胞对的形式有 (A, AA) , (A, Aa) , (A,aa) , (a, AA) ,(a, Aa) ,(a,aa) 六种。初始一对雌雄的同胞对,是这六种类型 中的任一种,其后代的基因型如下表所示。3 w/ O: C* u, }) Z! Y: x& R
7 W/ C0 o8 _; ^3 ?: H7 a5 S& o) e( e& o& n! g5 E9 F* ~
![]()
w2 _" R2 G( [; c# |5 U- z' C4 G# H8 V4 O0 w+ x
![]()
- S G- P5 @0 i
3 o2 Q( q1 C0 ]4 Y, W, R6 M2 K) u![]()
4 N. \) f: }% f( H8 j# B; [% h9 s! \. L- r3 W5 c
编写如下 Matlab 程序:
$ x/ f' e! w8 ?2 G' U' }5 t& i4 F' ] |. i% G( q
syms n a0 b0 c0 d0 e0 f0
3 f: F+ w( c, o7 E2 jM=[1 1/4 0 0 0 0;0 1/4 0 1 1/4 0;0 0 0 0 1/4 0;
+ ?* M" {) C) Z& ^. L 0 1/4 0 0 0 0;0 1/4 1 0 1/4 0;0 0 0 0 1/4 1];: ^2 y! F3 @+ i
M=sym(M);9 i7 C$ i/ n; w3 L8 S& k
[p,lamda]=eig(M);
# N. E ], M ] i/ T: L0 l. p; cx=p*lamda.^n*p^(-1)*[a0;b0;c0;d0;e0;f0];
5 L: Y& ~: J2 P& v( Lx=simple(x) / v8 i& w* j" ~+ `% s
; d& N3 l0 _( P" ?" Z2 m6 _
0 P* L1 T% ?3 X* `& i y
由上述程序计算结果可以看出
# Y6 `$ S+ U( V% a$ G1 A( r" M/ _9 {% b7 }' A: Z0 q( A
$ {, ~* Z; W) }
- {( ]- E% `* I' M, P8 s+ H
. g( b# ^7 {) X, z! {7 p% t9 ]
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